Recommended
More Related Content
Viewers also liked
Viewers also liked (13)
Similar to Трансляция
Similar to Трансляция (15)
More from tophisopam
Трансляция
- 11. РНК в клетке DNA Proteins mRNA rRNA tRNA miRNA snRNA snoRNA SRP 7S RNA 7SK RNA
- 12. РНК в клетке DNA Proteins mRNA rRNA tRNA miRNA snRNA snoRNA SRP 7S RNA gRNA 7SK RNA
- 13. РНК в клетке DNA Proteins mRNA rRNA tRNA miRNA snRNA snoRNA SRP 7S RNA gRNA 7SK RNA ncRNA
- 14. РНК в клетке DNA Proteins mRNA rRNA tRNA miRNA vault RNA snRNA snoRNA SRP 7S RNA gRNA 7SK RNA ncRNA
- 15. РНК в клетке DNA Proteins mRNA rRNA tRNA miRNA vault RNA snRNA snoRNA SRP 7S RNA gRNA 7SK RNA ncRNA cRNA
- 16. РНК в клетке DNA Proteins mRNA rRNA tRNA miRNA vault RNA snRNA snoRNA SRP 7S RNA gRNA 7SK RNA ncRNA cRNA RNAse P
- 17. RNA vs DNA
- 18. RNA vs DNA Бактериофаг øR1-37 использует в своей ДНК дезоксиуридин вместо дезокситимидина
- 19. Вторичная и третичная структура РНК • Вторичная структура - совокупность комплементарных взаимодействий • Третичная структура - 3D-атомарная структура
- 20. Вторичная структура РНК • G≡C (3 Н-связи) • A=U • G=U
- 21. Вторичная структура РНК • G≡C • A=U (2 Н-связи) • G=U
- 22. Вторичная структура РНК • G≡C • A=U • G=U (2 Н-связи)
- 23. Вторичная структура РНК G G A U U G C C G G A U A A U G C A G C U U INTERNAL LOOP HAIRPIN LOOP BULGE STEM DANGLING ENDS 5’ 3’
- 25. Pseudoknots - псевдоузлы Структуры, в которых петля шпильки сама образует шпильку
- 26. Вопрос: • Что будет, если длина шпилек в псевдоузле будет, скажем, 12 нуклеотидов?
- 27. Адапторная гипотеза (1955) • Между мРНК и белками существует адаптор, ставящий в соответствие генетическую информацию и аминокислоты Francis Crick (1916-2004)
- 28. Трехбуквенный код (1953) • 20 аминокислот • 4 нуклеотида • 1-битный код: 4 варианта • 2-битный код: 16 вариантов • 3-битный код: 64 варианта Георгий Гамов (1904-1968)
- 29. Трехбуквенный код (1953) • 20 аминокислот • 4 нуклеотида • 1-битный код: 4 варианта • 2-битный код: 16 вариантов • 3-битный код: 64 варианта Георгий Гамов (1904-1968) 64 намного больше чем 20!
- 31. Универсальный генетический код 61 смысловой триплет. Но у человека только 38 разных тРНК. Как такое может быть?!
- 32. Отклонения от генетического кода • Митохондрии, некоторые бактерии и простейшие
- 33. Неканонические аминокислоты • Cеленоцистеин (UGA) • Селенометионин (AUG) • Пирролизин (UGA)
- 35. Модифицированные нуклеотиды в тРНК • 2’-O-methyl (A, C, U, G) • m7G, m1G, m2G, m2,2G, m5C, m3C • I, ψ,W, rT, D • 4-Ac-A • ... http://modomics.genesilico.pl/
- 36. Неканонические структуры в РНК
- 37. Неканонические пары в тРНК http://bps.rutgers.edu/bps
- 38. G-Quadruplex • Внутримолекулярные и межмолекулярные • Теломеры • Промоторы • мРНК
- 39. Неорганические ионы в структуре тРНК
- 40. Стабильные тетралупы • GNRA-tetraloop • Стабилизируется стекинг- взаимодействиями
- 41. TAR HIV-1
- 42. Triple contact in TAR
- 43. Как 38 тРНК могут «обслуживать» 61 кодон?!
- 44. Wobble-гипотеза (F.Crick, 1966) • Объясняет, почему тРНК меньше, чем кодонов
- 46. Неканонические пары в кодон- антикодоновом взаимодействии
- 47. 3 tRNASer - 6 триплетов
- 48. Кто заметил ошибку на предыдущем слайде? :)
- 49. Аминоацил-тРНК синтетазы • Некоторые ARSase могут деацилировать неправильно ацилированные тРНК
- 50. У вас должны были возникнуть вопросы:
- 51. У вас должны были возникнуть вопросы: • К какому концу тРНК пришивается аминокислота?
- 52. У вас должны были возникнуть вопросы: • К какому концу тРНК пришивается аминокислота? • Как аминоацил тРНК синтетаза распознает свою тРНК?
- 53. Identity Elements Изменяя identity elements, можно обмануть ARSase - и она начнет навешивать не ту аминокислоту
- 54. Созревание тРНК N. equitans • Две половинки тРНК закодированы в разных генах на разных хромосомах
- 55. RNAse P • RNP - рибонуклеопротеин • RNAse P - рибозим • Но! RNAse P из митохондрий человека не содержит RNA
- 56. Процессинг тРНК • tRNA вырезается из транскрипта (Pol III) • У архей и эукаритот в tRNA еще есть интрон
- 57. Аминоацил-тРНК • На 3’-конце всех тРНК находится ССА-триплет • Он не закодирован в ДНК, а довешивается пост- транскрипционно
- 58. Процессинг рибосомных РНК 18S rRNA 5.8S rRNA 28S rRNA 45S 41S 20S and 32S Mature rRNAs 47SETS1 ITS1 ITS2 ETS2
- 59. Сравнение прокариотических и эукариотических рибосом
- 60. Центрифугирование в градиенте сахарозы Коэффициент седиментации (S): зависит от формы частицы зависит от массы частицы
- 61. Сборка рибосомы • Умение разбирать и собирать рибосому позволило локализовать на ней многие важные участки
- 62. 23S rRNA
- 63. 23S rRNA
- 64. Структурный анализ рибосом • 2000 - 70S из Thermus thermophilis, 3Å • 2000 - 70S из Thermus thermophilis, 3,3Å • 2000 - 50S из Haloarcula marismortui, 2,4Å • 2001 - 30S из Thermus thermophilis с IF1, 3,2Å • 2004 - 80S из Saccharomyces cerevisiae со связанным eEF2, 11,7Å, cryo-EM • 2009 - 80S из Thermomyces lanuginosus, 8,9Å, cryo-EM • 2010 - 80S из Triticum aestivum, 5,5Å, cryo-EM • 2011 - 80S из Saccharomyces cerevisiae, 3Å • 2011 - 40S из Tetrahymena thermophila со связанным с ней eIF1, 3,9Å • 2013 - 60S из Tetrahymena thermophila со связанным с ней eIF6, 3,5Å • 2013 - 80S из Trypanosoma brucei, 5Å, cryo-EM • 2013 - 80S из Saccharomyces cerevisiae со связанным eIF5B, 6,6Å cryo-EM • 2013 - 40S из Oryctolagus cuniculus со связанными с ней eIF2, eIF3, DHX29, 11,6Å cryo-EM
- 65. Рибосома E.coli (конец 80-х)
- 66. Thermus thermophilis 70S (Yusupov et. al, 2001)
- 67. Каталитический центр рибосомы «сделан» из РНК?
- 68. 50S ribosome
- 69. 3 участка связывания тРНК на рибосоме E: Exit site for free tRNA P: peptidyl-tRNA A: aminoacyl-tRNA!
- 70. • Инициация: тРНК связывается с Р-сайтом • Элонгация: тРНК связывается с А-сайтом
- 71. Элонгация трансляции. Шаг 1. • Инициаторная Мет- тРНК в Р-сайте • А-сайт свободен
- 72. Элонгация трансляции. Шаг II. • P-сайт занят пептидил-тРНК • В А-сайт связывается новая аминоацил-тРНК
- 73. Элонгация трансляции. Шаг III. Транспептидация. • тРНК в Р-сайте без аминокислоты, но пептид - в Р-сайте • тРНК в А-сайте связана с пептидом
- 74. Элонгация трансляции. Шаг IV. Транслокация. • Рибосома перемещается по мРНК • В Е-сайте - деацилированная тРНК • В Р-сайте - пептидил-тРНК • А-сайт пустой
- 76. Конец