19. 下準備
aとgだけ使っている さらに a,gが混ざる部分
地点の全パターン コード化 のみに注目
めばちこ g,0,0,0 K
g,g,0,0 J バターン間の距離定義
(今回は任意に設定)
g,g,g,0 I
g,g,a,0 H
g,a,0,0 G H G F E D C
g,a,a,0 F H 0 0.2 0.4 0.6 0.8 1
a,a,g,g E G 0.2 0 0.2 0.4 0.6 0.8
a,g,0,0 D F 0.4 0.2 0 0.2 0.4 0.6
a,a,g,0 C E 0.6 0.4 0.2 0 0.2 0.4
a,a,0,0 B D 0.8 0.6 0.4 0.2 0 0.2
ものもらい
a,0,0,0 A C 1 0.8 0.6 0.4 0.2 0
dist0<-
read.table("clipboard",header=T,row.names=1)
19
20. イメージ図
H G F E D C
ものもらいを使う.
H 0 0.2 0.4 0.6 0.8 1
けど,めばちこも使
G 0.2 0 0.2 0.4 0.6 0.8 う.後,めぼいとっ
F 0.4 0.2 0 0.2 0.4 0.6 てのもあるよ. C:a,a,g,0
E 0.6 0.4 0.2 0 0.2 0.4
D 0.8 0.6 0.4 0.2 0 0.2 距離0.8 い (141.66, 46.43)
C 1 0.8 0.6 0.4 0.2 0
距離0.2
G:g,a,0,0 あ 距離0.6
D:a,g,0,0
(141.03, 46.06) う
(141.21, 45.24)
めばちこをよく使
う.けど,ものも ものもらいを使う.け
らいも使うね. ど,めばちこも使うよ.
20
21. 下準備
loc code x y
71646 G 141.66 45.43
72458 G 141.21 45.24
#クラスターa,gを含むデータの地点番号
72495 G 141.14 45.18
と分類コードの行列をsimccにいれる.
170805 H 142.14 43.99
simcc<-
172775 G 141.89 43.54
read.table("clipboard",header=T,row.na
173910 G 142.26 43.48
mes=1)
174554 G 141.36 43.24
174755 D 141.89 43.24
・・・
739144 C 130.36 32.43
740625 G 134.14 33.96
740875 G 134.64 33.88
750289 D 135.74 33.86
833511 G 131.29 31.81
21
22. いよいよネットワーク!!
• snaパッケージ ※参照:library(help="sna")
• ネットワークを描くには,データを行列(もしくはリスト)の形にしなけ
ればならない
D
頂点の名前
A B C D E F
A 0 1 0 0 1 1 A E
B 1 0 0 1 0 1
頂点の名前
頂点の名前
C 0 0 0 0 1 0
C
D 0 1 0 0 1 0
E 1 0 1 1 0 0 F
B
F 1 1 0 0 0 0
22
26. しかし,解釈までの道
描画!! のりはまだまだ遠い…
H G F E D C H G F E D C
H 0 0.2 0.4 0.6 0.8 1 H 0 0.2 0.4 0.6 0.8 1
G 0.2 0 0.2 0.4 0.6 0.8 G 0.2 0 0.2 0.4 0.6 0.8
F 0.4 0.2 0 0.2 0.4 0.6 F 0.4 0.2 0 0.2 0.4 0.6
E 0.6 0.4 0.2 0 0.2 0.4 E 0.6 0.4 0.2 0 0.2 0.4
D 0.8 0.6 0.4 0.2 0 0.2 D 0.8 0.6 0.4 0.2 0 0.2
C 1 0.8 0.6 0.4 0.2 0 C 1 0.8 0.6 0.4 0.2 0
(ものもらい, めばちこ) (ものもらい, めばちこ)
(めばちこ,ものもらい) (めばちこ,ものもらい)
thresh=0.8 thresh=0.5
同じコード地点同士のみにエッジを張る 同じクラスター同士のみにエッジを張る
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