SlideShare a Scribd company logo
1 of 50
М.А. Волошина СУНЦ НГУ  200 8 Спецкурс Генетика  9.10.2008   Теория вероятности в генетике
[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
Почему законы генетики – вероятностные? ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
Случайное событие ,[object Object],Эксперимент, испытание Нельзя предсказать!
Случайное событие ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],А много   –   можно!
Вероятность получить двойку на экзамене?   Множество возможных событий 2 3 4 5
Множество возможных событий ,[object Object],[object Object],[object Object]
Множество возможных событий Элементарное событие 2 3 4 5
Вероятность ,[object Object],[object Object],P *   (Х)  =   m N Частота события Х –
[object Object],[object Object],[object Object],P  (¬ X )  =  1 –  P  ( X ) 0  ≤  P   ≤  1
[object Object],P  ( X )  =  1 –  P  (¬ X )  ,[object Object],[object Object],1 –  P  (не знает ни одного)
Множество возможных событий Элементарное событие ,[object Object],[object Object],[object Object],2 3 4 5
В генетике большую роль играют  равновероятные  события
Равновероятные исходы ,[object Object],[object Object],P  (Х)  = m n
Равновероятные исходы? Множество возможных событий ,[object Object],1 2 или встречу – или не встречу
Каждая ячейка  –  ¼   потомков АА аа А а А а Решетка Пеннета Р (гетерозигота) = ? Р (какая-нибудь гомозигота) = ? А F 2 1 : 1 А а а 1 : 1 Гаметы  ♀ Гаметы  ♂ А а аа А а АА
Вероятность наступления двух независимых событий одновременно:  X   и   Y   Независимыми  называются события, наступление одного из которых никак не влияет на то, случится второе или нет.  ,[object Object],(пересечение множеств  X  и  Y )
Правило умножения Вероятность наступления двух  независимых  событий  X   и   Y  одновременно  равна  произведению  их вероятностей: P (X и Y)  =  P (X) × P (Y) ,[object Object],P (X) P (Y) 1 1
Задача ,[object Object],1 раз ½ ½ 2 раз ½ ½ 3 раз ½ ½ 1 /8 =
Задачи ,[object Object],[object Object],[object Object]
Задача ,[object Object],А a   В b   Cc Dd  ×  аа  bb cc dd   Р  ( А_   В_   C _  D _ )  = ?  Р  ( аа  bb cc dd   )  = ?  Доминантный фенотип по 4 признакам Рецессивный фенотип по 4 признакам 1 16 1 16 1 8
Вероятность того, что произойдет хотя бы одно из событий  X   или   Y X Y X Y X  ∩   Y (объединение множеств  X  и  Y ) Несовместные события  Не могут произойти одновременно. Пересечение множеств   X   ∩   Y  =  Ø Совместные события  Могут произойти одновременно. Пересечение множеств  X   ∩   Y   ≠  Ø
Вероятность того, что произойдет хотя бы одно из событий  X   или   Y X Y X Y X  ∩   Y (объединение множеств  X  и  Y ) Несовместные события  Генотип по одному гену:  особь не может быть одновременно гетерозиготой  Аа  и гомозиготой  АА  по тому же гену . Совместные события  Генотип по генам  А  и  В. Возможны любые сочетания :   АА  Bb, aa BB…
Правило сложения Вероятность того, что произойдет хотя бы одно из событий  X   или   Y P (X  или  Y) = P (X)  +  P (Y) – P (X  и  Y)   X Y X  ∩   Y Чтобы не считать дважды
Вероятность того, что произойдет хотя бы одно из событий  X   или   Y P (X  или  Y) = P (X)  +  P (Y) – P (X  и  Y)   X Y X Y = + –
Для несовместных событий правило сложения упрощается P (X  или  Y) = P (X)  +  P (Y) X Y
Задача ,[object Object],1 монета 2 монета А Р Р Р А А А Р ¼ ¼ ¼ ¼ ½ =
[object Object],Задача из 13-ой международной олимпиады ,[object Object],Равнозначна задаче:
Задача из 13-ой международной олимпиады. Решение. 27  / 4 4 рец дом дом дом 27  / 4 4 дом рец дом дом ¾  ∙   ¼   ∙   ¾   ∙   ¾ дом дом рец дом ¼   ∙   ¾   ∙   ¾   ∙   ¾ дом дом дом рец Р 4 ребенок 3 ребенок 2 ребенок 1 ребенок
Задача из 13-ой международной олимпиады. Решение. P  =   27  ⁄  4 4  ∙ 4  =  27  ⁄  4 3   = =  27   ⁄  64  =  42 %
Задача ,[object Object],[object Object]
Решение задачи ,[object Object],[object Object],P (X  или  Y) = P (X)  +  P (Y) – P (X  и  Y)   События совместные! ,[object Object],Можно проще: 1 – « НЕ   X  или  Y » =  ½  +  ½   –  ½   ∙ ½ =   ¾
Решение задачи (продолжение) ,[object Object],Для правила умножения  не имеет значения, совместные события или нет!   –  поэтому так считать проще.  Р ( ХОТЯ БЫ ОДНО ПОПАДАНИЕ )   = 1  –   Р ( НИ ОДНОГО ПОПАДАНИЯ ) 1 16 P   =   1  – 1 16 =   15 16
Задача ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
Решение задачи ,[object Object],[object Object],[object Object],Генотип здорового ребенка  аа В_   и ¼ События совместные! ½   +  ½   –  ½   ∙ ½   =  ¾ Генотип слепого ребенка   А_  _ _  или   _ _  bb Другой вариант решения:
Определение  коэффициента родства  (процента одинаковых генов) у родственников
[object Object],[object Object],[object Object]
[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],Вероятность найти тот же ген у
Процент общих генов у родственников Рассмотрим произвольный ген  а   родителя . В нем два аллеля –  а 1   и  а 2 .   Определим для каждого из них вероятность того, что ребенок имеет тот же аллель.  Для  а 1   она равна  ½  . Для  а 2  –тоже. Значит, для любого аллеля любого гена вероятность совпасть с геном ребенка равна  ½ Родитель - ребенок Коэффициент родства (доля общих генов)  а 1 а 2 а 3 а 4 Р = ?
Для аллеля  а 1  нашего ребенка вероятность, что его брат  ⁄ сестра получат тот же ген  =  ½ .  То же для аллеля   а 2  ->  для любого гена. Процент общих генов у родственников Брат – сестра (сибсы) Коэффициент родства  =  ½ Ребенок, для которого мы определяем процент общих генов с любым сибсом а 1 а 2 а 3 а 4 а 1 а 3 Р = ?
Процент общих генов у родственников Половину генов каждый ребенок получил от общего родителя. Для этих генов вероятность оказаться одинаковыми Р =  ½ .   ( аллель   а 1 ) Вторая половина генов  ( а 3 )  у них от разных родителей, а значит ничего общего не имеет, Р=0. Полусибсы (только один родитель общий) Коэффициент родства полусибсов  =  ½   ∙   ½   =   ¼ а 1 а 2 а 3 а 4 а 1 а 3 Р = ? а 5 а 6
Другой способ вычисления Полусибсы (только один родитель общий) Коэффициент родства полусибсов  =  ½   ∙   ½   =   ¼ а 1 а 2 а 3 а 4 а 1 а 3 Р = ? а 5 а 6 ½ ½ Рисуем все пути, связывающие этих родственников.  Умножаем вероятности иметь общий ген на каждой веточке  Почему здесь действует правило умножения вероятностей?
Процент общих генов у родственников Какова вероятность, что внук имеет ген бабушки  а 1  ?  Бабушка  ⁄  дедушка –  внуки Для второго аллеля бабушки  а 2  – то же самое. ½   – что его родитель получил этот ген, и  ½  – что он получил этот ген от родителя.  Так как должны произойти  оба события  – правило умножения:  Р =  ½ ∙ ½  =  ¼   Коэффициент родства =  ¼ а 1 а 2 Р = ? ½ ½
а 1 а 2 Процент общих генов у родственников Двоюродные сибсы Р = ? ½ ½ Пусть аллель  а 1  получен от матери (Р = 1). Вероятность, что ее  сестра  имеет тот  же ген  =  ½ .  Что она передаст его своему ребенку – тоже   ½ .  Значит для аллеля  а 1  вероятность совпасть с аллелем двоюродного сибса –  ¼ . Для аллеля  а 2  она равна 0. Значит, половина генов имеет Р =  ¼  , половина – 0.  Р =   1 8
Задача об инбридинге ,[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
Задача об инбридинге. Решение. Аа  ×  АА Р Для двух сибсов (братья-сестры) вероятность иметь ген  а   =  ¼ Р (Аа) =  ½ Для каждого ребенка Если  известно , что один из них имеет этот ген, то вероятность, что второй имеет тот же ген –  ½ Степень родства братьев-сестер (процент общих генов)
Двоюродные брат и сестра вступают в брак. Вероятность, что  оба они  гетерозиготны по гену  а   –  ? Риск выщепления вредных генов при инбридинге Дедушка – носитель рецессивного гена болезни  а . Р = ? ½ ½ ½ ½ Аа АА 1 16 Р  =  ¼ ∙ ¼  =
Двоюродные брат и сестра вступают в брак. Если  известно , что один из них –  носитель  гена  а , то вероятность, что партнер тоже носитель – ? Риск выщепления вредных генов при инбридинге Дедушка – носитель рецессивного гена болезни  а . Р = ? ½ Аа АА ½ ½ ½ 1 4
В следующий раз –  о проверке теорий в генетике Как определить, подтверждает или опровергает эксперимент вашу теорию, если событие – случайное
Адрес этой презентации http ://www.slideshare.net/outdoors   Другие мои лекции по биологии и концепциям современного естествознания http ://vatson.hoter.ru/   ©   Марина Волошина

More Related Content

What's hot

確率ロボティクス第二回
確率ロボティクス第二回確率ロボティクス第二回
確率ロボティクス第二回Ryuichi Ueda
 
はじめてのパターン認識 第1章
はじめてのパターン認識 第1章はじめてのパターン認識 第1章
はじめてのパターン認識 第1章Prunus 1350
 
統計的学習の基礎6章前半 #カステラ本
統計的学習の基礎6章前半 #カステラ本統計的学習の基礎6章前半 #カステラ本
統計的学習の基礎6章前半 #カステラ本Akifumi Eguchi
 
オンライン凸最適化と線形識別モデル学習の最前線_IBIS2011
オンライン凸最適化と線形識別モデル学習の最前線_IBIS2011オンライン凸最適化と線形識別モデル学習の最前線_IBIS2011
オンライン凸最適化と線形識別モデル学習の最前線_IBIS2011Preferred Networks
 
パーセプトロン型学習規則
パーセプトロン型学習規則パーセプトロン型学習規則
パーセプトロン型学習規則Shuhei Sowa
 
劣モジュラ最適化と機械学習 3章
劣モジュラ最適化と機械学習 3章劣モジュラ最適化と機械学習 3章
劣モジュラ最適化と機械学習 3章Hakky St
 
PRML上巻勉強会 at 東京大学 資料 第4章4.3.1 〜 4.5.2
PRML上巻勉強会 at 東京大学 資料 第4章4.3.1 〜 4.5.2PRML上巻勉強会 at 東京大学 資料 第4章4.3.1 〜 4.5.2
PRML上巻勉強会 at 東京大学 資料 第4章4.3.1 〜 4.5.2Hiroyuki Kato
 
Teoria da relatividade
Teoria da relatividadeTeoria da relatividade
Teoria da relatividade123djenani
 
制限ボルツマンマシン入門
制限ボルツマンマシン入門制限ボルツマンマシン入門
制限ボルツマンマシン入門佑馬 斎藤
 
Cap. I - Fotogrametria II
Cap. I - Fotogrametria IICap. I - Fotogrametria II
Cap. I - Fotogrametria IIUFPR
 

What's hot (19)

確率ロボティクス第二回
確率ロボティクス第二回確率ロボティクス第二回
確率ロボティクス第二回
 
はじめてのパターン認識 第1章
はじめてのパターン認識 第1章はじめてのパターン認識 第1章
はじめてのパターン認識 第1章
 
統計的学習の基礎6章前半 #カステラ本
統計的学習の基礎6章前半 #カステラ本統計的学習の基礎6章前半 #カステラ本
統計的学習の基礎6章前半 #カステラ本
 
Prml 4.1.1
Prml 4.1.1Prml 4.1.1
Prml 4.1.1
 
PRML4.3.3
PRML4.3.3PRML4.3.3
PRML4.3.3
 
オンライン凸最適化と線形識別モデル学習の最前線_IBIS2011
オンライン凸最適化と線形識別モデル学習の最前線_IBIS2011オンライン凸最適化と線形識別モデル学習の最前線_IBIS2011
オンライン凸最適化と線形識別モデル学習の最前線_IBIS2011
 
Elevadores 1
Elevadores 1Elevadores 1
Elevadores 1
 
3-2-動能與功能原理
3-2-動能與功能原理3-2-動能與功能原理
3-2-動能與功能原理
 
パーセプトロン型学習規則
パーセプトロン型学習規則パーセプトロン型学習規則
パーセプトロン型学習規則
 
劣モジュラ最適化と機械学習 3章
劣モジュラ最適化と機械学習 3章劣モジュラ最適化と機械学習 3章
劣モジュラ最適化と機械学習 3章
 
PRML上巻勉強会 at 東京大学 資料 第4章4.3.1 〜 4.5.2
PRML上巻勉強会 at 東京大学 資料 第4章4.3.1 〜 4.5.2PRML上巻勉強会 at 東京大学 資料 第4章4.3.1 〜 4.5.2
PRML上巻勉強会 at 東京大学 資料 第4章4.3.1 〜 4.5.2
 
Random Forestsとその応用
Random Forestsとその応用Random Forestsとその応用
Random Forestsとその応用
 
情緒紅綠燈
情緒紅綠燈 情緒紅綠燈
情緒紅綠燈
 
CH3-幾何光學
CH3-幾何光學CH3-幾何光學
CH3-幾何光學
 
決定木学習
決定木学習決定木学習
決定木学習
 
Teoria da relatividade
Teoria da relatividadeTeoria da relatividade
Teoria da relatividade
 
制限ボルツマンマシン入門
制限ボルツマンマシン入門制限ボルツマンマシン入門
制限ボルツマンマシン入門
 
PRML 第14章
PRML 第14章PRML 第14章
PRML 第14章
 
Cap. I - Fotogrametria II
Cap. I - Fotogrametria IICap. I - Fotogrametria II
Cap. I - Fotogrametria II
 

Probability_in_Genetics_RU

  • 1. М.А. Волошина СУНЦ НГУ 200 8 Спецкурс Генетика 9.10.2008 Теория вероятности в генетике
  • 2.
  • 3.
  • 4.
  • 5.
  • 6. Вероятность получить двойку на экзамене? Множество возможных событий 2 3 4 5
  • 7.
  • 8. Множество возможных событий Элементарное событие 2 3 4 5
  • 9.
  • 10.
  • 11.
  • 12.
  • 13. В генетике большую роль играют равновероятные события
  • 14.
  • 15.
  • 16. Каждая ячейка – ¼ потомков АА аа А а А а Решетка Пеннета Р (гетерозигота) = ? Р (какая-нибудь гомозигота) = ? А F 2 1 : 1 А а а 1 : 1 Гаметы ♀ Гаметы ♂ А а аа А а АА
  • 17.
  • 18.
  • 19.
  • 20.
  • 21.
  • 22. Вероятность того, что произойдет хотя бы одно из событий X или Y X Y X Y X ∩ Y (объединение множеств X и Y ) Несовместные события Не могут произойти одновременно. Пересечение множеств X ∩ Y = Ø Совместные события Могут произойти одновременно. Пересечение множеств X ∩ Y ≠ Ø
  • 23. Вероятность того, что произойдет хотя бы одно из событий X или Y X Y X Y X ∩ Y (объединение множеств X и Y ) Несовместные события Генотип по одному гену: особь не может быть одновременно гетерозиготой Аа и гомозиготой АА по тому же гену . Совместные события Генотип по генам А и В. Возможны любые сочетания : АА Bb, aa BB…
  • 24. Правило сложения Вероятность того, что произойдет хотя бы одно из событий X или Y P (X или Y) = P (X) + P (Y) – P (X и Y) X Y X ∩ Y Чтобы не считать дважды
  • 25. Вероятность того, что произойдет хотя бы одно из событий X или Y P (X или Y) = P (X) + P (Y) – P (X и Y) X Y X Y = + –
  • 26. Для несовместных событий правило сложения упрощается P (X или Y) = P (X) + P (Y) X Y
  • 27.
  • 28.
  • 29. Задача из 13-ой международной олимпиады. Решение. 27 / 4 4 рец дом дом дом 27 / 4 4 дом рец дом дом ¾ ∙ ¼ ∙ ¾ ∙ ¾ дом дом рец дом ¼ ∙ ¾ ∙ ¾ ∙ ¾ дом дом дом рец Р 4 ребенок 3 ребенок 2 ребенок 1 ребенок
  • 30. Задача из 13-ой международной олимпиады. Решение. P = 27 ⁄ 4 4 ∙ 4 = 27 ⁄ 4 3 = = 27 ⁄ 64 = 42 %
  • 31.
  • 32.
  • 33.
  • 34.
  • 35.
  • 36. Определение коэффициента родства (процента одинаковых генов) у родственников
  • 37.
  • 38.
  • 39. Процент общих генов у родственников Рассмотрим произвольный ген а родителя . В нем два аллеля – а 1 и а 2 . Определим для каждого из них вероятность того, что ребенок имеет тот же аллель. Для а 1 она равна ½ . Для а 2 –тоже. Значит, для любого аллеля любого гена вероятность совпасть с геном ребенка равна ½ Родитель - ребенок Коэффициент родства (доля общих генов) а 1 а 2 а 3 а 4 Р = ?
  • 40. Для аллеля а 1 нашего ребенка вероятность, что его брат ⁄ сестра получат тот же ген = ½ . То же для аллеля а 2 -> для любого гена. Процент общих генов у родственников Брат – сестра (сибсы) Коэффициент родства = ½ Ребенок, для которого мы определяем процент общих генов с любым сибсом а 1 а 2 а 3 а 4 а 1 а 3 Р = ?
  • 41. Процент общих генов у родственников Половину генов каждый ребенок получил от общего родителя. Для этих генов вероятность оказаться одинаковыми Р = ½ . ( аллель а 1 ) Вторая половина генов ( а 3 ) у них от разных родителей, а значит ничего общего не имеет, Р=0. Полусибсы (только один родитель общий) Коэффициент родства полусибсов = ½ ∙ ½ = ¼ а 1 а 2 а 3 а 4 а 1 а 3 Р = ? а 5 а 6
  • 42. Другой способ вычисления Полусибсы (только один родитель общий) Коэффициент родства полусибсов = ½ ∙ ½ = ¼ а 1 а 2 а 3 а 4 а 1 а 3 Р = ? а 5 а 6 ½ ½ Рисуем все пути, связывающие этих родственников. Умножаем вероятности иметь общий ген на каждой веточке Почему здесь действует правило умножения вероятностей?
  • 43. Процент общих генов у родственников Какова вероятность, что внук имеет ген бабушки а 1 ? Бабушка ⁄ дедушка – внуки Для второго аллеля бабушки а 2 – то же самое. ½ – что его родитель получил этот ген, и ½ – что он получил этот ген от родителя. Так как должны произойти оба события – правило умножения: Р = ½ ∙ ½ = ¼ Коэффициент родства = ¼ а 1 а 2 Р = ? ½ ½
  • 44. а 1 а 2 Процент общих генов у родственников Двоюродные сибсы Р = ? ½ ½ Пусть аллель а 1 получен от матери (Р = 1). Вероятность, что ее сестра имеет тот же ген = ½ . Что она передаст его своему ребенку – тоже ½ . Значит для аллеля а 1 вероятность совпасть с аллелем двоюродного сибса – ¼ . Для аллеля а 2 она равна 0. Значит, половина генов имеет Р = ¼ , половина – 0. Р = 1 8
  • 45.
  • 46. Задача об инбридинге. Решение. Аа × АА Р Для двух сибсов (братья-сестры) вероятность иметь ген а = ¼ Р (Аа) = ½ Для каждого ребенка Если известно , что один из них имеет этот ген, то вероятность, что второй имеет тот же ген – ½ Степень родства братьев-сестер (процент общих генов)
  • 47. Двоюродные брат и сестра вступают в брак. Вероятность, что оба они гетерозиготны по гену а – ? Риск выщепления вредных генов при инбридинге Дедушка – носитель рецессивного гена болезни а . Р = ? ½ ½ ½ ½ Аа АА 1 16 Р = ¼ ∙ ¼ =
  • 48. Двоюродные брат и сестра вступают в брак. Если известно , что один из них – носитель гена а , то вероятность, что партнер тоже носитель – ? Риск выщепления вредных генов при инбридинге Дедушка – носитель рецессивного гена болезни а . Р = ? ½ Аа АА ½ ½ ½ 1 4
  • 49. В следующий раз – о проверке теорий в генетике Как определить, подтверждает или опровергает эксперимент вашу теорию, если событие – случайное
  • 50. Адрес этой презентации http ://www.slideshare.net/outdoors Другие мои лекции по биологии и концепциям современного естествознания http ://vatson.hoter.ru/ © Марина Волошина