SlideShare a Scribd company logo
1 of 21
Download to read offline
Kongestif Kalp Yetmezliğinin
İkinci-Derece Fark Harita Grafiği ile
Topografik Analizi ve Teşhisi
Apdullah YAYIK
Yakup KUTLU
Mustafa Kemal Üniversitesi
Sinyal İşleme ve İletişim Uygulamaları 2014
Kongestif Kalp Yetmezliği (KKY)
Kongestif Kalp Yetmezliği (KKY)
Kalbin vücudun ihtiyaçlarını karşılayabilecek kadar
kan pompalayamamasıdır.
KKY Teşhisi
 KKY şüphesi bulunan hastalarda
 Ekokardiyografi,
 Anjiyografi,
 Göğüs röntgen filmi,
 BNP (Beyin(B-tip) Natriuretik Peptid),
 NT-proBNP (BNP’nin öncü hormonunun (proBNP) N-Terminal
fragmanı),
 MR görüntüleme
 Elektrokardiyografi,
gibi ek testlerden bir veya birkaçı uygulanmakta ve sonrasında teşhis
konulabilmektedir.
KKY Teşhisi
 KKY hastalığının uygun bir şekilde tedavi edilmesi,
hastalığın erken teşhis edilmesiyle mümkün olduğundan
elektrokardiyogram (EKG) kayıtlarından KKY
hastalığının otomatik olarak belirlenmesi klinik açıdan
oldukça önemlidir.
Kullanılan Veri Tabanı
 www.physionet.org iki veritabanı kullanılmıştır.
KKY Hastası verileri : Yaşları 22 ile 71 arasında değişen 15
adet hastadan alınmış kayıtlardır.
 Sağlıklı Kişi Verileri : Yasları 20 ile 50 arasında değişen 18 hasta
olmayan gönüllüden alınmış kayıtlardır.
Ön İşlem
 Her hastadan 10 sn’ lik kayıtlar halinde bölümlenmiştir
 10’ar saniyelik pencereler (2500 örnekli pencerelere
oluşturmaktadır),
 her kayıttan150 farklı pencere alınarak incelenmiştir.
 veri kümesinde
 KKY hastalarından 2250
 Normal EKG kayıtlardan 2700
 Toplam 4950 adet 10’ar saniyelik pencereden oluşturulmuştur.
 Normalizasyon işlemi yapılır.
 Normalizasyon işlemi, bir örnek mutlak en büyük değere bölünerek
yapılmaktadır.
A Platform for Local Interactions between
Robots in Large Formations
Özniteliklerin Çıkarılması
 İkinci-Dereceden fark (IDF) grafiği
 X(t) EKG sinyali olduğunu kabul edersek,
 [X(t+1)-X(t)] ve [X(t+2)-X(t+1)] ikili noktalarının Kartezyen koordinat
grafiğinde oluşturduğu harita grafiğidir.
 Diğer bir değişle EKG sinyalindeki ardışık noktaların farklarının
birbirlerine göre saçılımlarından oluşmaktadır.
 Böylece ardışık farkların değerlerinin istatiksel durumu
gözlenebilmektedir.
 Çalışmalarda İDFG analizi yapılırken farklı yarıçaplı daireler
bölgelere bölünerek incelemeler yapılarak öznitelikler çıkarılmıştır
-1 -0.8 -0.6 -0.4 -0.2 0 0.2 0.4 0.6 0.8 1
-1
-0.8
-0.6
-0.4
-0.2
0
0.2
0.4
0.6
0.8
1
1 4
32
3-3-3-1 6-5-1-0 1-1-1-0 6-5-3-0
4
6
5
3
0
Basit öznitelik çıkartma örneği
KKY ve Normal kayıtlar için IDF
grafiği örnekleri
Öz Düzenleyici Haritalar
 Rekabete dayalı eğiticisiz öğrenme algoritmasını temel
alan bir yapay sinir ağı modelidir.
 ÖDH ağları ile diğer sinir ağları modelleri arasındaki en
önemli fark, eğitimden sonra ağın verdiği yanıtların 2
boyutlu harita üzerinde topoğrafik olarak
düzenlenmesidir.
Öz Düzenleyici Harita Yapısı
||)()(||min||)()(|| twtxtwtx ii
i
ci

)()( iwxw cii
 
xi n boyutlu giriş örüntü vektörü,
wij ise xj girişi ile i. işlem elemanı arasındaki ağırlıktır.
Ωc(i) komşuluk fonksiyonuyla (gaussian)
η öğrenme oranı
c indisi kazanan nöronudur
Öz düzenleyici Ağ yapısının U-matris
gösterimi
a) b) c)
 İki boyutlu öz düzenleyici ağ yapısındaki bir birine yakın nöronlar
arasındaki uzaklıklar hesaplanır
 Bu uzaklık değeri gerçek nöronlar arasında ekstra bir nöron olarak
yerleştirilerek U-matris elde edilir
 U-matristeki küçük değerler benzerlikleri, yüksek genlikli değerleri ise
kümelerin birbirinden farklılığını göstermektedir.
Öz Düzenleyici Haritalar
U-matris gösterimi (a) İki boyutlu gri renk tonlu gösterimi, (b) Gerçek etiketli kümelerinin iki
boyutlu gri renk tonlu gösterimi, (c) Üç boyutlu gösterimi
Oluşturulan veri seti ÖDH ağının eğitiminde kullanılmıştır.
ÖDH yapısında toplam 2500 (50x50) nöronlu altıgen
topoloji kullanılmıştır. Daha sonra eğitilmiş ÖDH ağına
karşılık gelen U-matrisler hesaplanmıştır.
iki boyutlu U-matrisi gösterimi
SOM 25-Jan-2013
U-matrix
0.0706
6.25
12.4
Gerçek etiketli kümelerinin iki
boyutlu gri renk tonlu gösterimi
Sinyal İşleme ve İletişim Uygulamaları
SOM 25-Jan-2013
U-matrix
0.0706
6.25
12.4
U-matris’in üç boyutlu gösterimi
Sinyal İşleme ve İletişim Uygulamaları
0
20
40
60
80
100
0
20
40
60
80
100
0
5
10
15
Sınıflandırıcı
 Bu çalışmada
 incelenen özniteliklerin ÖDH grafiği ile sonuçların tutarlılığını
değerlendirmek için
 Radyal Tabanlı Fonksiyon (RTF) ağı sınıflandırıcı olarak tercih
edilmiştir.
Başarım Kriterleri
 Başarım kriteri olarak
 Duyarlılık (DUY),
 Belirlilik (BEL),
 Seçicilik (SEÇ)
 Genel Basarım
olarak belirlenmiştir.
Sonuçlar
 Sonuç olarak
 Ham EKG verisi üzerinden RTF ağı sınıflandırıcının %99
genel başarım ile sınıflandırma yapabildiği tespit
edilmiştir.
 Literatürde gerçekleştirilen çalışmaların başarımlarıyla
karşılaştırılmasını yapmak oldukça zordur.
 Literatürde bu konuyla ilgili çalışmalar mevcuttur.
 %80-100 arasında Genel Basarıma sahip çalışmalar mevcuttur.
Sonuç ve Tartışma
Sorular?
Ayrıntılı bilgi için,
apdullahyayik@gmail.com

More Related Content

Featured

PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024
PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024
PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024Neil Kimberley
 
Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)
Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)
Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)contently
 
How to Prepare For a Successful Job Search for 2024
How to Prepare For a Successful Job Search for 2024How to Prepare For a Successful Job Search for 2024
How to Prepare For a Successful Job Search for 2024Albert Qian
 
Social Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie Insights
Social Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie InsightsSocial Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie Insights
Social Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie InsightsKurio // The Social Media Age(ncy)
 
Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024
Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024
Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024Search Engine Journal
 
5 Public speaking tips from TED - Visualized summary
5 Public speaking tips from TED - Visualized summary5 Public speaking tips from TED - Visualized summary
5 Public speaking tips from TED - Visualized summarySpeakerHub
 
ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd
ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd
ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd Clark Boyd
 
Getting into the tech field. what next
Getting into the tech field. what next Getting into the tech field. what next
Getting into the tech field. what next Tessa Mero
 
Google's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search Intent
Google's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search IntentGoogle's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search Intent
Google's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search IntentLily Ray
 
Time Management & Productivity - Best Practices
Time Management & Productivity -  Best PracticesTime Management & Productivity -  Best Practices
Time Management & Productivity - Best PracticesVit Horky
 
The six step guide to practical project management
The six step guide to practical project managementThe six step guide to practical project management
The six step guide to practical project managementMindGenius
 
Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...
Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...
Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...RachelPearson36
 
Unlocking the Power of ChatGPT and AI in Testing - A Real-World Look, present...
Unlocking the Power of ChatGPT and AI in Testing - A Real-World Look, present...Unlocking the Power of ChatGPT and AI in Testing - A Real-World Look, present...
Unlocking the Power of ChatGPT and AI in Testing - A Real-World Look, present...Applitools
 
12 Ways to Increase Your Influence at Work
12 Ways to Increase Your Influence at Work12 Ways to Increase Your Influence at Work
12 Ways to Increase Your Influence at WorkGetSmarter
 
Ride the Storm: Navigating Through Unstable Periods / Katerina Rudko (Belka G...
Ride the Storm: Navigating Through Unstable Periods / Katerina Rudko (Belka G...Ride the Storm: Navigating Through Unstable Periods / Katerina Rudko (Belka G...
Ride the Storm: Navigating Through Unstable Periods / Katerina Rudko (Belka G...DevGAMM Conference
 
Barbie - Brand Strategy Presentation
Barbie - Brand Strategy PresentationBarbie - Brand Strategy Presentation
Barbie - Brand Strategy PresentationErica Santiago
 

Featured (20)

PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024
PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024
PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024
 
Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)
Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)
Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)
 
How to Prepare For a Successful Job Search for 2024
How to Prepare For a Successful Job Search for 2024How to Prepare For a Successful Job Search for 2024
How to Prepare For a Successful Job Search for 2024
 
Social Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie Insights
Social Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie InsightsSocial Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie Insights
Social Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie Insights
 
Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024
Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024
Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024
 
5 Public speaking tips from TED - Visualized summary
5 Public speaking tips from TED - Visualized summary5 Public speaking tips from TED - Visualized summary
5 Public speaking tips from TED - Visualized summary
 
ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd
ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd
ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd
 
Getting into the tech field. what next
Getting into the tech field. what next Getting into the tech field. what next
Getting into the tech field. what next
 
Google's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search Intent
Google's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search IntentGoogle's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search Intent
Google's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search Intent
 
How to have difficult conversations
How to have difficult conversations How to have difficult conversations
How to have difficult conversations
 
Introduction to Data Science
Introduction to Data ScienceIntroduction to Data Science
Introduction to Data Science
 
Time Management & Productivity - Best Practices
Time Management & Productivity -  Best PracticesTime Management & Productivity -  Best Practices
Time Management & Productivity - Best Practices
 
The six step guide to practical project management
The six step guide to practical project managementThe six step guide to practical project management
The six step guide to practical project management
 
Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...
Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...
Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...
 
Unlocking the Power of ChatGPT and AI in Testing - A Real-World Look, present...
Unlocking the Power of ChatGPT and AI in Testing - A Real-World Look, present...Unlocking the Power of ChatGPT and AI in Testing - A Real-World Look, present...
Unlocking the Power of ChatGPT and AI in Testing - A Real-World Look, present...
 
12 Ways to Increase Your Influence at Work
12 Ways to Increase Your Influence at Work12 Ways to Increase Your Influence at Work
12 Ways to Increase Your Influence at Work
 
ChatGPT webinar slides
ChatGPT webinar slidesChatGPT webinar slides
ChatGPT webinar slides
 
More than Just Lines on a Map: Best Practices for U.S Bike Routes
More than Just Lines on a Map: Best Practices for U.S Bike RoutesMore than Just Lines on a Map: Best Practices for U.S Bike Routes
More than Just Lines on a Map: Best Practices for U.S Bike Routes
 
Ride the Storm: Navigating Through Unstable Periods / Katerina Rudko (Belka G...
Ride the Storm: Navigating Through Unstable Periods / Katerina Rudko (Belka G...Ride the Storm: Navigating Through Unstable Periods / Katerina Rudko (Belka G...
Ride the Storm: Navigating Through Unstable Periods / Katerina Rudko (Belka G...
 
Barbie - Brand Strategy Presentation
Barbie - Brand Strategy PresentationBarbie - Brand Strategy Presentation
Barbie - Brand Strategy Presentation
 

Neural CHF Detection and Topographic Analyses SIU 2014

  • 1. Kongestif Kalp Yetmezliğinin İkinci-Derece Fark Harita Grafiği ile Topografik Analizi ve Teşhisi Apdullah YAYIK Yakup KUTLU Mustafa Kemal Üniversitesi Sinyal İşleme ve İletişim Uygulamaları 2014
  • 2. Kongestif Kalp Yetmezliği (KKY) Kongestif Kalp Yetmezliği (KKY) Kalbin vücudun ihtiyaçlarını karşılayabilecek kadar kan pompalayamamasıdır.
  • 3. KKY Teşhisi  KKY şüphesi bulunan hastalarda  Ekokardiyografi,  Anjiyografi,  Göğüs röntgen filmi,  BNP (Beyin(B-tip) Natriuretik Peptid),  NT-proBNP (BNP’nin öncü hormonunun (proBNP) N-Terminal fragmanı),  MR görüntüleme  Elektrokardiyografi, gibi ek testlerden bir veya birkaçı uygulanmakta ve sonrasında teşhis konulabilmektedir.
  • 4. KKY Teşhisi  KKY hastalığının uygun bir şekilde tedavi edilmesi, hastalığın erken teşhis edilmesiyle mümkün olduğundan elektrokardiyogram (EKG) kayıtlarından KKY hastalığının otomatik olarak belirlenmesi klinik açıdan oldukça önemlidir.
  • 5. Kullanılan Veri Tabanı  www.physionet.org iki veritabanı kullanılmıştır. KKY Hastası verileri : Yaşları 22 ile 71 arasında değişen 15 adet hastadan alınmış kayıtlardır.  Sağlıklı Kişi Verileri : Yasları 20 ile 50 arasında değişen 18 hasta olmayan gönüllüden alınmış kayıtlardır.
  • 6. Ön İşlem  Her hastadan 10 sn’ lik kayıtlar halinde bölümlenmiştir  10’ar saniyelik pencereler (2500 örnekli pencerelere oluşturmaktadır),  her kayıttan150 farklı pencere alınarak incelenmiştir.  veri kümesinde  KKY hastalarından 2250  Normal EKG kayıtlardan 2700  Toplam 4950 adet 10’ar saniyelik pencereden oluşturulmuştur.  Normalizasyon işlemi yapılır.  Normalizasyon işlemi, bir örnek mutlak en büyük değere bölünerek yapılmaktadır.
  • 7. A Platform for Local Interactions between Robots in Large Formations Özniteliklerin Çıkarılması  İkinci-Dereceden fark (IDF) grafiği  X(t) EKG sinyali olduğunu kabul edersek,  [X(t+1)-X(t)] ve [X(t+2)-X(t+1)] ikili noktalarının Kartezyen koordinat grafiğinde oluşturduğu harita grafiğidir.  Diğer bir değişle EKG sinyalindeki ardışık noktaların farklarının birbirlerine göre saçılımlarından oluşmaktadır.  Böylece ardışık farkların değerlerinin istatiksel durumu gözlenebilmektedir.  Çalışmalarda İDFG analizi yapılırken farklı yarıçaplı daireler bölgelere bölünerek incelemeler yapılarak öznitelikler çıkarılmıştır
  • 8. -1 -0.8 -0.6 -0.4 -0.2 0 0.2 0.4 0.6 0.8 1 -1 -0.8 -0.6 -0.4 -0.2 0 0.2 0.4 0.6 0.8 1 1 4 32 3-3-3-1 6-5-1-0 1-1-1-0 6-5-3-0 4 6 5 3 0 Basit öznitelik çıkartma örneği
  • 9. KKY ve Normal kayıtlar için IDF grafiği örnekleri
  • 10. Öz Düzenleyici Haritalar  Rekabete dayalı eğiticisiz öğrenme algoritmasını temel alan bir yapay sinir ağı modelidir.  ÖDH ağları ile diğer sinir ağları modelleri arasındaki en önemli fark, eğitimden sonra ağın verdiği yanıtların 2 boyutlu harita üzerinde topoğrafik olarak düzenlenmesidir.
  • 11. Öz Düzenleyici Harita Yapısı ||)()(||min||)()(|| twtxtwtx ii i ci  )()( iwxw cii   xi n boyutlu giriş örüntü vektörü, wij ise xj girişi ile i. işlem elemanı arasındaki ağırlıktır. Ωc(i) komşuluk fonksiyonuyla (gaussian) η öğrenme oranı c indisi kazanan nöronudur
  • 12. Öz düzenleyici Ağ yapısının U-matris gösterimi a) b) c)  İki boyutlu öz düzenleyici ağ yapısındaki bir birine yakın nöronlar arasındaki uzaklıklar hesaplanır  Bu uzaklık değeri gerçek nöronlar arasında ekstra bir nöron olarak yerleştirilerek U-matris elde edilir  U-matristeki küçük değerler benzerlikleri, yüksek genlikli değerleri ise kümelerin birbirinden farklılığını göstermektedir.
  • 13. Öz Düzenleyici Haritalar U-matris gösterimi (a) İki boyutlu gri renk tonlu gösterimi, (b) Gerçek etiketli kümelerinin iki boyutlu gri renk tonlu gösterimi, (c) Üç boyutlu gösterimi Oluşturulan veri seti ÖDH ağının eğitiminde kullanılmıştır. ÖDH yapısında toplam 2500 (50x50) nöronlu altıgen topoloji kullanılmıştır. Daha sonra eğitilmiş ÖDH ağına karşılık gelen U-matrisler hesaplanmıştır.
  • 14. iki boyutlu U-matrisi gösterimi SOM 25-Jan-2013 U-matrix 0.0706 6.25 12.4
  • 15. Gerçek etiketli kümelerinin iki boyutlu gri renk tonlu gösterimi Sinyal İşleme ve İletişim Uygulamaları SOM 25-Jan-2013 U-matrix 0.0706 6.25 12.4
  • 16. U-matris’in üç boyutlu gösterimi Sinyal İşleme ve İletişim Uygulamaları 0 20 40 60 80 100 0 20 40 60 80 100 0 5 10 15
  • 17. Sınıflandırıcı  Bu çalışmada  incelenen özniteliklerin ÖDH grafiği ile sonuçların tutarlılığını değerlendirmek için  Radyal Tabanlı Fonksiyon (RTF) ağı sınıflandırıcı olarak tercih edilmiştir.
  • 18. Başarım Kriterleri  Başarım kriteri olarak  Duyarlılık (DUY),  Belirlilik (BEL),  Seçicilik (SEÇ)  Genel Basarım olarak belirlenmiştir.
  • 20.  Sonuç olarak  Ham EKG verisi üzerinden RTF ağı sınıflandırıcının %99 genel başarım ile sınıflandırma yapabildiği tespit edilmiştir.  Literatürde gerçekleştirilen çalışmaların başarımlarıyla karşılaştırılmasını yapmak oldukça zordur.  Literatürde bu konuyla ilgili çalışmalar mevcuttur.  %80-100 arasında Genel Basarıma sahip çalışmalar mevcuttur. Sonuç ve Tartışma