OS X 蘋果公司 證實 iPhone 會執行(除去不需要元件的)最佳化 OS X 作業系統,並佔用 8GB, 16GB 或 32GB (iPhone 3GS only) flash 記憶體中的 700MB 空間 [7] [8] [9] ,可以執行內建及未來由蘋果提供的應用程式。蘋果並未說明麥金塔和 iPhone 兩者的作業系統( OS X )間的實質差異,惟 iPhone 使用的處理器是 ARM ,與桌上型麥金塔使用的 x86 或 PowerPC 處理器不同,所以兩者使用的 OS X 版本也不相容。第三方應用程式曾經僅能透過 Safari 在控制環境中執行,目前蘋果公司已推出 AppStore 販賣第三方原生軟體。 [10] [8] [11] 蘋果公司對於更新 iPhone 作業系統傾向提供一種更為流暢、類似於 Windows Update, Mac OS X 和 iPod 的更新方式,和其他行動電話比較起來有更吸引顧客的優勢。 [7] iPhone 中的 OS X 版本 包含有 Core Animation 體元件,負責在使用者介面上提供平滑順暢的 動畫 效果。