2. 自己紹介
• Keiichiro ONO (大野圭一朗)
• ライフサイエンス分野に特化したソフトウェア開発者
• カリフォルニア大学サンディエゴ校医学部 Trey Ideker研究室
• 以下の非営利団体で技術者をやっています
• National Resource for Network Biology
• The Cytoscape Consortium
• Cancer Cell Map Initiative
• San Diego Center for Systems Biology
• 主なプロジェクト
• Cytoscape / DCell / NDEx
4. Using deep learning to model the hierarchical structure and function of a cell.
Ma J, Yu MK, Fong S, Ono K, Sage E, Demchak B, Sharan R, Ideker T. Nat Methods. 2018 Mar 5. doi:
10.1038/nmeth.4627. PMID: 29505029
5. A gene ontology inferred from molecular networks. Dutkowski J,
Kramer M, Surma MA, Balakrishnan R, Cherry JM, Krogan NJ,
Ideker T., Nature Biotechnology 2013 Jan;31(1):38-45.
NeXO Web: the NeXO ontology database and visualization
platform. Dutkowski J, Ono K, Kramer M, Yu M, Pratt D,
Demchak B, Ideker T., Nucleic Acids Res. 2014 Jan;42(Database
issue).