なぜ系統を考慮するのか―演技する鳥類の進化―

なぜ系統を考慮するのか
－演技する鳥類の進化－
西條未来
総合研究大学院大学先導科学研究科博士前期課程2年
✉ saijo.0830@gmail.com
日本鳥学会2018@新潟
W09「系統種間比較のいろは」

はじめに 2
?
X
系統種間比較はなぜ必要なのか？？
※方法についてはブラックボックスとして話します
分析したいものごにょごにょ結果

もくじ
1. 系統種間比較はなぜ必要か？
2. 系統種間比較はどうやってやるのか？
3. 実例 (チドリ目における対捕食者行動の種間比較)
3

系統樹＝生物の進化の歴史
• 生物の進化の歴史
• 種の近縁関係
などの情報が含まれる
4
→ 系統を抜きにして生物の進化を
知ることはできない
Darwinが1837年に書いた系統樹

なぜ系統を考慮しなければならないのか 5
A.系統的制約がありデータが独立でないから
飾り羽を持つ種飾り羽を持たない種
(例)

“系統的制約”とは？ 6
近い種は似たような形質を持ちやすいということ
A C DB E
AとBの
共通祖先
AとEの
共通祖先

データが独立じゃないデータが独立

羽の長いグループ羽の短いグループ

データが独立じゃない
N = 2
データが独立

飾り羽の獲得は1回飾り羽の獲得は2回
形質の変化 → レアイベント！
2羽
3羽

系統樹を使うとどんなことが分かる？
1. 祖先形質の推定
その形質がどのように
進化したのかを明らかに
する
2. 二形質間の相関
その形質の進化に関する
要因を明らかにする
13

14
?
or

15
?
or
案1: 墓を掘る

16
?
or
案1: 墓を掘る

17
?
or
案1: 墓を掘る
→ 案2: 祖先形質の推定

18
or
10% 90%
形質をさかのぼって
推定する

その形質がどのように
進化したのかを明らかに
する
その形質の進化に関する
要因を明らかにする
19

20
飾
り
羽
の
長
さ
飛行距離
長い
短い
長い短い
仮説: よく飛ぶ種は飾り羽が長い
→ 仮説は支持された！

21
→ 仮説は支持された？
飾
り
羽
の
長
さ
飛行距離
長い
短い
長い短い

22
→ 仮説は支持さなかった……😢
飾
り
羽
の
長
さ
飛行距離
長い
短い
長い短い

23
→ 仮説は支持さなかった…… ？
飾
り
羽
の
長
さ
飛行距離
長い
短い
長い短い

24
系統を考慮しないと…？
→ 間違った結果を導き出してしまうことがある！
本当は系統の影響なのに
関係があると結論付けてしまう
(type I error)
本当は関係があるのに
無関係だと結論付けてしまう
(type II error)

もくじ
25

系統種間比較はどうやってやる？
種間比較に必要なもの
1. 系統樹
2. 系統樹を扱える分析ソフト (R, BayesTraits, Mesquite など)
3. 検証したい仮説とデータ
26

1. 系統樹 27
Jetz et al. (2012) Nature 鳥類9993種の系統樹
系統樹データはBirdtree.orgで入手可能

2. 系統樹を扱える分析ソフト
R, BayesTraits, Mesquiteなど
• 無料のフリーソフト
• 使い方の教科書なども豊富
• ググればいろいろと出てきます
Revellさんのブログとか
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• 自分で取ったデータでもよし！
• 過去の論文やデータベースから得たデータでもよし！
あとはアイディア勝負なので頑張ってください
29

鳥で系統種間比較をやろう！
種間比較に必要なもの
1. 系統樹
2. 系統樹を扱える分析ソフト (R, BayesTraits, Mesquite など)
30
← ある
← ある
← ある
→ いろいろできるぞ！

もくじ
31

もくじ
↑大人の都合により省略……
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Take home message
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間口は広く、奥は深く
系統種間比較は怖くない
✉ saijo.0830@gmail.com

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