Struktur organisasi Rumah Sakit Umum Daerah Salak terdiri dari Direktur sebagai kepala, beberapa bidang fungsional dan sekretaris. Bidang fungsional terdiri dari Bidang Sarana Prasarana dan Rekam Medik serta Bidang Pelayanan dan Keperawatan, masing-masing dipimpin oleh seorang kepala bidang dan beberapa seksi.