1. 1. Sejarah
Pondok Pesantren merupakan suatu wadah yang sangat efektif sekali didalam
mengembangkan ilmu religious atau keagamaan, maka dari itu Pondok Pesantren Islam
salafiyah yang dirintis ( Pendiri dari tahun 1986 s/d 2006 ) oleh KH. Abu Zairi merupakan
salah satu pondok pesantren yang masih berpegang teguh pada kesalafan, dengan demikian
setelah mereka menyelesaikan pendidikan dilingkungan ppondok esantren diharapkan
menguasai ilmu – ilmu agama yang berciri islami secara mutlak sehinggga mereka
menganggap ilmu pengetahuan umum tidak begitu penting karena begitu mereka terjun di
tengah – tengah masyarakat hanya dituntut dapat mengajar mengaji Al- Qur’an mangaji kitab
serta memimpin do’a sesuai dengan keperluan yang dibutuhkan. Tetapi kenyataannya dalam
menghadapi tantangan kehidupan kedepan ilmu – ilmu yang bersifat umum juga sangat
memberikan arti yang sangat penting bagi setiap santri atau murid untuk mencapai
kebahagiaan dunia maupun akhirat.
Akhirnya setelah dibentuk Yayasan Pondok Pesantren Islam Salafiyah yang mana
pengurusnya sebagian dari orang – orang tokoh pendidikan seperti Bapak H. Nur ra’is dulu
pernah menjadi Kepala sekolah di SDN Panji Kab. Situbondo ( Pensiun ) dan pada waktu itu
pula beliau dtunjuk oleh Yayasan Pondok Pesantren Islam Salafiyah sebagai ketuanya sampai
tahun 2011. Kiprahnya dalam dunia pendidikan cukup banyak memberikan kontribusi dalam
upaya pengembangan pendidikan di Pondok pesantren terutama menjadikan Pondok
pesantren yang lebih modern seperti sistem pendidikan, manejemen-manejemen serta sumber
daya manusia secara menyeluruh. Kemudaian pengurus yang lain adalah bapak H. Abd
Rasyid yang pada saat itu menjabat sebagai Kabag PU di Situbondo ditunjuk menjadi
sekretaris di YPPI “ Salafiyah “ dan Bapak Sunar bagian pendidikan dan Bpk KH. Abu zairi
sebagai penanggung jawab / Pengasuh Pondok Pesantren Islam Salafiyah desa Pakisan Kec.
Tlogosari Kab. Bondowoso. semenjak Pengasuh Pertama (K.H.Abu Zairi) wafat pada
Tanggal 31 Agustus 2006, semua kepengurusan di YPPI salafiyah maupun di lembaga MTs
Hidayatullah dirubah struktur kepengurusan dan baru terbentuk pengurus yang baru pada
tahun 2012 sampai sekarang. Dari mereka yang duduk sebagai pengurus di YPPI “ Salafiyah
“ tersebut memberikan pandangan atau masukan tentang pentingnya pelaksanaan pendidikan
yang berbasis agama dan ilmu pengetahuan umum kepada KH. Abuzairi dan diterima oleh
beliau.
Pada saat pertama kali berdiri tahun 1994, siswa yang tertampung adalah 90 siswa.
Dengan status“TERDAFTAR” kemudian pada tahun pelajaran 2004/2005 dilaksanakan
akreditasi pertama dengan memperoleh status “TERAKREDITASI B” Sampai Sekarang.

2. 2. Pengurus Yayasan pada saat pertama kali terbentuk sebagai berikut:
PELINDUNG : Kepala Desa Pakisan
PENASEHAT / DEWAN PEMBINA : Habib Ahmad Al Muhdor
KETUA UMUM : H. Muchtar Saleh
KETUA 1 : KH. Abuzairi
KETUA 2 : H. Nur Ra’is
SEKRETARIS 1 : H. Abd Rasyid
SEKRETARIS 2 : Muhammad Rapi
BENDAHARA UMUM : Sujoto
SEKSI – SEKSI :
SEKSI USAHA : Muhammad Jasin
Edi Susanto
Subroto
SEKSI DAKWAH : Habib Ahmad Almuhdor
KH. Abuzairi
H. Muchtar Saleh
Djamsuri
SEKSI PENDIDIKAN : Mchammad Djufri
Saiful Bachri, S. Pd
Ali Muqaddas, BA
3. Kepala sekolah yang pernah menjabat di MTs Hidayatullah antara lain :
 H. Jailani mulai tahun 1994 – 1996
 Ali Muqaddas, BA sejak tahun 1996 - 2013
 Ali Wafa, S.Pd.I sejak tahun 2013 - sekarang