SlideShare a Scribd company logo
Metallo-Beta-Laktamaz
      volume: 2

    Mehmet ÖZTÜRK
Metallo-Beta-Laktamaz geninin (blaIMP ), Serratia
marcescens’ in klinik izolatları arasında plazmid aracılığı ile
                          yayılması
Beta-Laktamazlar

• Carbapenemler (imipenem ve penipenem), geniş spektrumlu beta
  laktamaz üreten gram negatif çubuklara karşı nispeten kararlı ajanlardır.
• Bu beta-laktamazların çoğu, enzimin aktif merkezinde bir serin kalıntısına
  sahiptirler ve bunlar A sınıfı beta laktamlara ( SHV- ve TEM- ‘ nin de dahil
  olduğu) aittir.
• Japonya’ da , imipenemin gram negatif bakteri vakalarına karşı serbest bir
  şekilde kullanılması, birçok klinik izolatta, karbapenemlere ve geniş
  spektrumlu beta-laktamlara karşı direnç ortaya çıktığını göstermiştir.
• Enterobacteriaceae ve Pseudomonas spp. Familyalarından olan bu dirençli
  suşlar, fırsatçı olarak yada nosokomiyal (hastane enfeksiyonu)
  enfeksiyonlarında konakçıda tehlike oluşturmaktadır.
Beta-Laktamazlar



• Yapılan çalışmada imipenem dirençli Serratia marcescens suşları izole
  edilmiş ve bu suşların Metallo-Beta-Laktamaz , İMP ürettiği doğrulandı.
• Metallo-Beta-Laktamaz üreten suşlar genellikle yüksek seviyede diranç ve
  hemen hemen tüm beta-laktam antibiyotiklere direnç gösteriyor. Bu
  nedenle, Japonya’ da ki genel hastanelerde Metallo-Beta-Laktamaz üreten
  bakterilerin dağlımı araştırılmış.
Materyal ve Metod



• 1993 ylında Aichi’ de bulunan 7 genel hastaneden nisan ve mayıs
  aylarında bakteriyal suşlar toplandı ve test edildi.
• Aichi japonya’ nın ortasında bulunur ve yaklaşık olarak nüfusu 6,850,000
  dir. Hem Anjyo hemde Okazaki’ ye komşudur.
• Her hastadan tek suş izole edilmiş. Bazı suşlarıın 2 kere izolasyonunu
  engellenmesi için ve toplamda 105 Serratia marcescens suşu toplanmış.
Hassasiyet testi


• Mueller-Hinton II agar (BBL) agar kullanılarak, agar dilusyon metodu ile
  MİCs yapıldı.
• Plaklara logaritmik fazda bulunan kültürden 5 µl alınarak plaklara eklendi.
• Plaklar 18 saat boyunca, 37 ͦ C de inkübasyona bırakıldı.
• Ve daha sonra her bir beta-laktam antibiyotiliğin MİC değeri National
  Committee for Clinical Laboratory standartlarına göre belirlendi.
Metallo-Beta-Laktamaz’ ın saflaştırılması, inhibisyon
     çalışması ve amino asit dizisinin belirlenmesi


• İnhibisyon çalışması için; Metallo-Beta-Laktamaz aktivitesi , imipenemi
  hidrolizi ile belirlendi.
• Watanabe ve arkadaşlarının metodu ile Hg, Cu ve EDTA’ nın inhibitör etkisi
  test edildi ve imipenem substrat olarak kullanıldı.
• AK9373 suşunun Metallo-Beta-Laktamaz enzimi Osana ve arkadaşlarının
  metodu kullanılarak yüksek derecede saflaşrıldı ve aminoasit dizisi, N
  terminal peptid sekans cihazı kullanılarak belirlendi. (model 437A; Applied
  Biosystems Inc., Foster City, Calif.).
DNA manipulasyonu and Southern hibridizasyon
                      analizi
• Plazmid DNA, hızlı alkalin ekstraksiyon metodu ile hazırlandı.
• Low-Melting agaroz jel elektroforezi yapıldı ve sonra elektroelusyon
  yapıldı.
• Restriksiyon endonukleazlar Nippon Gene şirketine hazırlatıldı.
  Rekombinant plazmid aşağıdaki şekildeki gibi hazırlandı.
Sonuçlar

• Aichi’ deki genel hastanelerden izole edilen Serratia marcescens suşları
  tablo 1 de gösterilmiştir. A ve B hastanelerinde dirençli suş
  bulunamamıştır.




Yüksek dirençli suşların hepsi G hastanesinden izole edildi. İmipenem dirençli
suşların yüzdesi her hastanede farklı çıktı. En yüksek yüzde C hastanesinde
bulundu.
Sonuçlar
• 7 hastaneden toplam 17 klinik izolat imipenem direnç gösterdi.
• 105 izolatın , 13 beta-laktam antibiyotiğe karşı toplam direnç yüzdesi figür
  2 de gösterilmiştir.
• Serratia marcescens suşları imipenem hassasiyetine göre 3 grupta
  sınıflandırılmıştır.
• National Committee for Clinical Laboratory göre 85 suş (%81) MİC değeri
  2 µg/ml den daha az bulunduğu için hassas olarak kabul edilmiştir.
• 20 suş (%19) imipeneme dirençli olarak kabul edilmiştir.
• Bu 20 suşun 3 tanesi imipeneme karşı 32 µg/ml den daha yüksek MİC
  değeri olduğu için yüksek dirençli olarak kabul edilmiştir.
• Diğer 17 suş orta dirençli grupta sınıflandırılmıtır.
• İmipenem dirençli şuşların 9 tanesi, tüm beta-laktam antibiyotiklere
  (kloramfenikol ve norflaksosin) karşı 2 µg/ml den daha yüksek değerde
  saptlanmış.
Plazmidler ve İmipenem Direncinin Transferi

• Her imipenem dirençli suşun plazmid taşıdığı gözlemlenmiştir.
• Suşların plazmid profili , imipeneme karşı MİC değerinin 2 µg/ml daha
  fazla olmasıdır.
• İmipenem dirençli AK9373 suşunun plazmidi transfer edildi ,konjugasyon
  yolu ile E.coli CSH2 konjugasyon yolu ile ve CSH2 suşunun direnci
  imipeneme karşı 4 µg/ml olduğu gözlemlenmiştir.
• Diğer yüksek dirençli suşlar AK9374, AK9385 ve AK9391 ile konjugasyon
  yapılamamıştır.
• Elektroporasyon ile plazmid yarıdımı ile aktarılmaya çalışılmıştır. Her
  transformat 16 µg/ml ceftazidime ve 4µg/ml imipenem direnci
  gözlemlenmiştir.
• Konugasyon sonucu büyük bir plazmidin E.coli CSH2 ye transfer
  edildiği, hibridizasyon sonucu belirlenmitir.
Southern hibridizasyon analizi

• Metallo-Beta-Laktamaz spesifik DNA probu , plazmid ile hibridize olmştur
  ve AK9373, AK9374, AK9385, ve AK9391 ve suşlarda kromozomal
  pozisyonda hibridizasyon saplanamamıştır.
• Hibridizasyonda AK9374, AK9385 ve AK9391 benzer büyüklükte
  plazmidler bulunduğu gözlemlenmiştir.
• AK9373 suşunda iki farklı bölgede hibrdizasyon sinyaline rastlanmıştır ve
  bu iki sinyalin benzer plazmidlerin farklı formu olabilileceği
  düşünülmektedir.
Southern hibridizasyon analizi
Metallo-Beta-Laktamaz geninin inaktivasyonu

• Hg ve Cu varlığında imipenem karşı enzim aktivitesi kaybolmaktadır.
• EDTA eklendiğinde enzim aktivitesinde önemli bir düşüş
  gözlemlenmektedir.
• S. marcescens TN9106. Metallo-Beta-Laktamaz enziminin aminoasit
  sekansı İMP-1 metallo beta laktamaz enzimine eş olduğu belirlenmiştir.
Dinlediğiniz için teşekkür ederim

More Related Content

Viewers also liked

Pp industrial - 11.05.2012
Pp   industrial - 11.05.2012Pp   industrial - 11.05.2012
Pp industrial - 11.05.2012Satinath Das
 
Trakya universitesi-ders
Trakya universitesi-dersTrakya universitesi-ders
Trakya universitesi-derszeynep_zyn85
 
Do What You Love - www.talkingassets.com
Do What You Love - www.talkingassets.com Do What You Love - www.talkingassets.com
Do What You Love - www.talkingassets.com PN001
 
Mobile learning
Mobile learning Mobile learning
Mobile learning reyesmo
 
Genetica de poblaciones parte1
Genetica de poblaciones parte1Genetica de poblaciones parte1
Genetica de poblaciones parte1Diana Fresoli
 
How to succeed in a business
How to succeed in a businessHow to succeed in a business
How to succeed in a businessMaerisha
 
Canterbury tales
Canterbury talesCanterbury tales
Canterbury talesMaerisha
 
Ecologia și ideologiile verzilor
Ecologia și ideologiile verzilorEcologia și ideologiile verzilor
Ecologia și ideologiile verzilorMarian Chiriac
 
Multimedia Learning
Multimedia Learning Multimedia Learning
Multimedia Learning reyesmo
 
How Gundersen Lutheran Health System Will Be Energy Independent by 2014
How Gundersen Lutheran Health System Will Be Energy Independent by 2014How Gundersen Lutheran Health System Will Be Energy Independent by 2014
How Gundersen Lutheran Health System Will Be Energy Independent by 2014erwinmayeen
 

Viewers also liked (15)

Pp industrial - 11.05.2012
Pp   industrial - 11.05.2012Pp   industrial - 11.05.2012
Pp industrial - 11.05.2012
 
Virgin Green Media
Virgin Green MediaVirgin Green Media
Virgin Green Media
 
Trakya universitesi-ders
Trakya universitesi-dersTrakya universitesi-ders
Trakya universitesi-ders
 
Do What You Love - www.talkingassets.com
Do What You Love - www.talkingassets.com Do What You Love - www.talkingassets.com
Do What You Love - www.talkingassets.com
 
Operaciones de Manufacturas
Operaciones de ManufacturasOperaciones de Manufacturas
Operaciones de Manufacturas
 
Mobile learning
Mobile learning Mobile learning
Mobile learning
 
Genetica de poblaciones parte1
Genetica de poblaciones parte1Genetica de poblaciones parte1
Genetica de poblaciones parte1
 
How to succeed in a business
How to succeed in a businessHow to succeed in a business
How to succeed in a business
 
Canterbury tales
Canterbury talesCanterbury tales
Canterbury tales
 
Rocky point real estate and easy to fly in
Rocky point real estate and easy to fly inRocky point real estate and easy to fly in
Rocky point real estate and easy to fly in
 
Ecologia și ideologiile verzilor
Ecologia și ideologiile verzilorEcologia și ideologiile verzilor
Ecologia și ideologiile verzilor
 
Multimedia Learning
Multimedia Learning Multimedia Learning
Multimedia Learning
 
Humanities research
Humanities researchHumanities research
Humanities research
 
How Gundersen Lutheran Health System Will Be Energy Independent by 2014
How Gundersen Lutheran Health System Will Be Energy Independent by 2014How Gundersen Lutheran Health System Will Be Energy Independent by 2014
How Gundersen Lutheran Health System Will Be Energy Independent by 2014
 
Holy Cross Men’s Lacrosse Team Hosted Golf Outing and Dinner
Holy Cross Men’s Lacrosse Team Hosted Golf Outing and DinnerHoly Cross Men’s Lacrosse Team Hosted Golf Outing and Dinner
Holy Cross Men’s Lacrosse Team Hosted Golf Outing and Dinner
 

MBL-2

  • 1. Metallo-Beta-Laktamaz volume: 2 Mehmet ÖZTÜRK
  • 2. Metallo-Beta-Laktamaz geninin (blaIMP ), Serratia marcescens’ in klinik izolatları arasında plazmid aracılığı ile yayılması
  • 3. Beta-Laktamazlar • Carbapenemler (imipenem ve penipenem), geniş spektrumlu beta laktamaz üreten gram negatif çubuklara karşı nispeten kararlı ajanlardır. • Bu beta-laktamazların çoğu, enzimin aktif merkezinde bir serin kalıntısına sahiptirler ve bunlar A sınıfı beta laktamlara ( SHV- ve TEM- ‘ nin de dahil olduğu) aittir. • Japonya’ da , imipenemin gram negatif bakteri vakalarına karşı serbest bir şekilde kullanılması, birçok klinik izolatta, karbapenemlere ve geniş spektrumlu beta-laktamlara karşı direnç ortaya çıktığını göstermiştir. • Enterobacteriaceae ve Pseudomonas spp. Familyalarından olan bu dirençli suşlar, fırsatçı olarak yada nosokomiyal (hastane enfeksiyonu) enfeksiyonlarında konakçıda tehlike oluşturmaktadır.
  • 4. Beta-Laktamazlar • Yapılan çalışmada imipenem dirençli Serratia marcescens suşları izole edilmiş ve bu suşların Metallo-Beta-Laktamaz , İMP ürettiği doğrulandı. • Metallo-Beta-Laktamaz üreten suşlar genellikle yüksek seviyede diranç ve hemen hemen tüm beta-laktam antibiyotiklere direnç gösteriyor. Bu nedenle, Japonya’ da ki genel hastanelerde Metallo-Beta-Laktamaz üreten bakterilerin dağlımı araştırılmış.
  • 5. Materyal ve Metod • 1993 ylında Aichi’ de bulunan 7 genel hastaneden nisan ve mayıs aylarında bakteriyal suşlar toplandı ve test edildi. • Aichi japonya’ nın ortasında bulunur ve yaklaşık olarak nüfusu 6,850,000 dir. Hem Anjyo hemde Okazaki’ ye komşudur. • Her hastadan tek suş izole edilmiş. Bazı suşlarıın 2 kere izolasyonunu engellenmesi için ve toplamda 105 Serratia marcescens suşu toplanmış.
  • 6. Hassasiyet testi • Mueller-Hinton II agar (BBL) agar kullanılarak, agar dilusyon metodu ile MİCs yapıldı. • Plaklara logaritmik fazda bulunan kültürden 5 µl alınarak plaklara eklendi. • Plaklar 18 saat boyunca, 37 ͦ C de inkübasyona bırakıldı. • Ve daha sonra her bir beta-laktam antibiyotiliğin MİC değeri National Committee for Clinical Laboratory standartlarına göre belirlendi.
  • 7. Metallo-Beta-Laktamaz’ ın saflaştırılması, inhibisyon çalışması ve amino asit dizisinin belirlenmesi • İnhibisyon çalışması için; Metallo-Beta-Laktamaz aktivitesi , imipenemi hidrolizi ile belirlendi. • Watanabe ve arkadaşlarının metodu ile Hg, Cu ve EDTA’ nın inhibitör etkisi test edildi ve imipenem substrat olarak kullanıldı. • AK9373 suşunun Metallo-Beta-Laktamaz enzimi Osana ve arkadaşlarının metodu kullanılarak yüksek derecede saflaşrıldı ve aminoasit dizisi, N terminal peptid sekans cihazı kullanılarak belirlendi. (model 437A; Applied Biosystems Inc., Foster City, Calif.).
  • 8. DNA manipulasyonu and Southern hibridizasyon analizi • Plazmid DNA, hızlı alkalin ekstraksiyon metodu ile hazırlandı. • Low-Melting agaroz jel elektroforezi yapıldı ve sonra elektroelusyon yapıldı. • Restriksiyon endonukleazlar Nippon Gene şirketine hazırlatıldı. Rekombinant plazmid aşağıdaki şekildeki gibi hazırlandı.
  • 9. Sonuçlar • Aichi’ deki genel hastanelerden izole edilen Serratia marcescens suşları tablo 1 de gösterilmiştir. A ve B hastanelerinde dirençli suş bulunamamıştır. Yüksek dirençli suşların hepsi G hastanesinden izole edildi. İmipenem dirençli suşların yüzdesi her hastanede farklı çıktı. En yüksek yüzde C hastanesinde bulundu.
  • 10. Sonuçlar • 7 hastaneden toplam 17 klinik izolat imipenem direnç gösterdi. • 105 izolatın , 13 beta-laktam antibiyotiğe karşı toplam direnç yüzdesi figür 2 de gösterilmiştir.
  • 11. • Serratia marcescens suşları imipenem hassasiyetine göre 3 grupta sınıflandırılmıştır. • National Committee for Clinical Laboratory göre 85 suş (%81) MİC değeri 2 µg/ml den daha az bulunduğu için hassas olarak kabul edilmiştir. • 20 suş (%19) imipeneme dirençli olarak kabul edilmiştir. • Bu 20 suşun 3 tanesi imipeneme karşı 32 µg/ml den daha yüksek MİC değeri olduğu için yüksek dirençli olarak kabul edilmiştir. • Diğer 17 suş orta dirençli grupta sınıflandırılmıtır.
  • 12. • İmipenem dirençli şuşların 9 tanesi, tüm beta-laktam antibiyotiklere (kloramfenikol ve norflaksosin) karşı 2 µg/ml den daha yüksek değerde saptlanmış.
  • 13. Plazmidler ve İmipenem Direncinin Transferi • Her imipenem dirençli suşun plazmid taşıdığı gözlemlenmiştir. • Suşların plazmid profili , imipeneme karşı MİC değerinin 2 µg/ml daha fazla olmasıdır. • İmipenem dirençli AK9373 suşunun plazmidi transfer edildi ,konjugasyon yolu ile E.coli CSH2 konjugasyon yolu ile ve CSH2 suşunun direnci imipeneme karşı 4 µg/ml olduğu gözlemlenmiştir. • Diğer yüksek dirençli suşlar AK9374, AK9385 ve AK9391 ile konjugasyon yapılamamıştır. • Elektroporasyon ile plazmid yarıdımı ile aktarılmaya çalışılmıştır. Her transformat 16 µg/ml ceftazidime ve 4µg/ml imipenem direnci gözlemlenmiştir.
  • 14. • Konugasyon sonucu büyük bir plazmidin E.coli CSH2 ye transfer edildiği, hibridizasyon sonucu belirlenmitir.
  • 15. Southern hibridizasyon analizi • Metallo-Beta-Laktamaz spesifik DNA probu , plazmid ile hibridize olmştur ve AK9373, AK9374, AK9385, ve AK9391 ve suşlarda kromozomal pozisyonda hibridizasyon saplanamamıştır. • Hibridizasyonda AK9374, AK9385 ve AK9391 benzer büyüklükte plazmidler bulunduğu gözlemlenmiştir. • AK9373 suşunda iki farklı bölgede hibrdizasyon sinyaline rastlanmıştır ve bu iki sinyalin benzer plazmidlerin farklı formu olabilileceği düşünülmektedir.
  • 17. Metallo-Beta-Laktamaz geninin inaktivasyonu • Hg ve Cu varlığında imipenem karşı enzim aktivitesi kaybolmaktadır. • EDTA eklendiğinde enzim aktivitesinde önemli bir düşüş gözlemlenmektedir. • S. marcescens TN9106. Metallo-Beta-Laktamaz enziminin aminoasit sekansı İMP-1 metallo beta laktamaz enzimine eş olduğu belirlenmiştir.