Download to read offline
Docking 1
- 1. 1 Unitat de Farmacologiai Farmacognòsia - Facultat de Farmàcia 1. Introducció al docking molecular MOLECULAR DOCKING: 1. Introducció Curs 2020-2021 Prof. Dr. Francisco Pérez García Departament de Tecnologia Institut Pompeu Fabra Martorell Datura stramonium
- 2. 2 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Objectius • Saber si alguns productes naturals de plantes medicinals xineses emprades com injecció per tractar el COVID-19 s’uneixen a una proteïna del virus SARS-CoV-2, concretament la proteasa principal (main protease) • Comparar l’energía d’unió en kcal/mol de diferents compostos amb arxiu csv de swissdock.ch i la t de Student amb llenguatge R • Comparar els aminoàcids de les diferents proteases del protein Data bank 7BRO, 6Y2E, 7CWC, 6LU7(treure lligand) i altres, que s’uneixen amb els teus productes naturals i d’altres autors • Comparar resultats amb la bibliografia PÒSTER CIENTÍFIC
- 3. 3 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Xuebijing
- 4. 4 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular HPLC Xuebijing
- 5. 5 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Compostos a analitzar
- 6. 6 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Xuebijing
- 7. 7 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Proteïnes Estudiats al tema 4 de proteïnes del llibre de Biologia de Santillana, al igual que estructures secundaries i dominis.
- 8. 8 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Aminoàcids
- 9. 9 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Aminoàcids
- 10. 10 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Aminoàcids
- 11. 11 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Aminoàcids
- 12. 12 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Aminoàcids
- 13. 13 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Aminoàcids
- 14. 14 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular
- 15. 15 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Proteïnes
- 16. 16 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Aminoàcids
- 17. 17 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Entrada virus
- 18. 18 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Cicle virus
- 19. 19 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Dominis Proteasa principal del virus SARS-CoV-2
- 20. 20 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Docking
- 21. 21 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Docking
- 22. 22 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Proteasa
- 23. 23 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Proteasa
- 24. 24 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Proteasa
- 25. 25 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Proteasa
- 26. 26 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Protein Data Bank
- 27. 27 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Ligand
- 28. 28 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Ligand
- 29. 29 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Ligand
- 30. 30 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Ligand
- 31. 31 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Ligand
- 32. 32 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Ligand
- 33. 33 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Ligand
- 34. 34 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Ligand
- 35. 35 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Chimera
- 36. 36 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Avogadro
- 37. 37 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Chimera Programa Chimera vs Nou programa Chimera X
- 38. 38 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Tutorial Chimera
- 39. 39 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Chimera
- 40. 40 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Chimera
- 41. 41 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Chimera
- 42. 42 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular ChimeraX
- 43. 43 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular ChimeraX
- 44. 44 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular ChimeraX
- 45. 45 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Chimera
- 46. 46 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Chimera
- 47. 47 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Chimera
- 48. 48 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Chimera
- 49. 49 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Chimera
- 50. 50 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Chimera
- 51. 51 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Chimera
- 52. 52 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Chimera
- 53. 53 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Chimera
- 54. 54 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Chimera
- 55. 55 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Chimera
- 56. 56 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Chimera Afegir H als lligands i guardar com en format mol2 Afegir càrregues a les proteines i guardar en format pdb
- 57. 57 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Swissdock
- 58. 58 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Swissdock
- 59. 59 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Swissdock
- 60. 60 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Swissdock
- 61. 61 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Swissdock CSV
- 62. 62 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Swissdock CSV
- 63. 63 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Swissdock CSV
- 64. 64 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Swissdock CSV
- 65. 65 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Swissdock CSV
- 66. 66 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Swissdock CSV
- 67. 67 Prof. Dr. FranciscoPérez García – Departament de Tecnologia – Institut Pompeu Fabra Projecte de docking molecular Swissdock CSV