古代ゲノム解析で近年分かってきた日本列島に住む人類の謎

1. Enjoy Science
ゲノム解析で
うかび
あがる日本の
謎
2024/3/17

2. 留意事項
◼ この分野はまだ不確定要素と流動性が高いので、あくまで発信
日時での情報であることに留意ください。
◼ 所属組織ではなく、あくまで個人としての発信です。本情報に
伴う結果に関して責任は負いかねます。
2

3. 本シリーズ共通の趣旨：３つの謎をカジュアルに楽しむ
生命とは？
宇宙とは？
知能とは？
宇宙物理学
宇宙生物学
分子生物学
合成生物学
神経科学
コンピュータ科学
物理学
生物学
化学
生理学
数学
解きたい謎 関連する学問テーマ 学問テーマの大分類
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4. 全体の流れ
1. 古代ゲノム解析の基礎
2. ゲノム解析で浮かびあがる日本人
1. 日本列島への移住ルート
2. 縄文人とは？
3. 日本人のルーツ
3. まとめ
4

5. 従来の考古学は骨の形態からの類推（統計も駆使）
5
縄文人 宮野貝塚 弥生人 金隈遺跡

6. 最新科学で人類考古学（日本列島）をUpdate
6
https://i-bioarchaeology.org/research/
統合生物考古学(integrative bioarchaeology)の概念図
領域代表 山田 康弘
東京都立大学
人文科学研究科
教授

7. 縄文人の歯からＤＮＡを解析
7
https://www.brh.co.jp/publication/journal/087/research/1

8. 古代ゲノム貢献で初のノーベル賞受賞者
8
2022年のノーベル医学生理学賞受賞の連絡を受けた直後のスバンテ・ペーボ氏
（撮影リンダ・ブィジラント氏/ノーベル財団提供）
https://scienceportal.jst.go.jp/explore/review/20221013_e01/

9. 古代人のDNA解析
9
https://scienceportal.jst.go.jp/explore/review/20221013_e01/

10. 古代ゲノム解析の基礎
Copyright@ Koji fukuoka 10
〇出所：日本国際賞
https://www.japanprize.jp/data/prize/2020/j_2_achievements.pdf
ミトコンドリアDNA
が断片的に存在(核
DNAより採取容易)
対象DNA断片を増幅し、
つなぎ合わせることで配
列を推測
1997年に、ネアンデルタール人のミトコンド
リアDNAとホモ・サピエンスを比較すると共
通点は見つからなかった
→直系祖先ではない
2010年に
次世代
シーケン
サーで、
古代人の
全核DNA
の解析に
成功
ネアンデルタール人とデニソワ人とホ
モ・サピエンスは「交雑（交配）」
していた
2008年に
ネアンデ
ルタール
人に近い
「デニソ
ワ人」が
DNA解析
で発見

11. ホモ・サピエンスと旧人との交雑
Copyright@ Koji fukuoka 11
〇私たちとネアンデルタール人が交配した事実、なぜわかったのか
https://gendai.ismedia.jp/articles/-/71473
〇DNAで語る日本人起源論

12. ホモ・サピエンスのアフリカ起源とした拡散
Copyright@ Koji fukuoka 12
https://www.brh.co.jp/publication/journal/087/research/1
ミトコンドリア
DNA解析で、アフ
リカ起源説が有力

13. 日本でも縄文人の核ゲノム抽出に成功
13
https://www.tokyo-np.co.jp/article/136006
船橋市の古作（こさく）貝塚から出土した人骨
歯よりも耳奥に良質
なDNAがあることが
判明

14. 各大陸別に見たDNAの関係性（核ゲノムベース）
14
https://www.brh.co.jp/publication/journal/087/research/1

15. 東アジアに絞った各地域別の比較
15
本土日本人：アイヌと琉球
を除いている

16. 日本列島の歴史
16
〇出所：図解 人類の進化
1.6万年前
3000年前
1700年前
貝塚時代後期 縄文時代
弥生時代
縄文時代
旧石器時代
旧石器時代
旧石器時代
古墳時代
アイヌ文化
日本列島 南部 日本列島 中央部 日本列島 北部

17. 日本列島への移住ルート
17
この時期に初上陸
http://m-ac.jp/science/homo/japanese/reach/index_j.phtml
縄文時代
ホモ・サピエンスがアフリカを出始めた時期
3.8万年前の地形

18. 参考：縄文期に大噴火も
18
https://www.gurutto-oosumi.com/school/oosumishidankai/news/news-2178.html

19. 従来の説：二重構造説
19
Wiki：「二重構造モデル」

20. 隣接(東アジア)のゲノム解析で分かってきたこと
20
本土日本人：アイヌと琉球
を除いている
https://www.brh.co.jp/publication/journal/087/research/1

21. 縄文人の起源は？
21
https://www3.nhk.or.jp/news/special/international_news_navi/articles/feature/2023/12/04/36270.html
（北東でなく）東南アジアの古代人とDNAが似ていることが判明
タイやラオス周辺に2万数
千年前から4000年前にか
けて存在していた狩猟採
集民

22. 日本列島内でも縄文度合いは多様
22
https://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/info/8252/
現代の本土日本における、縄文人由来変異保有率の地理的分布および、縄文人由来変異保有率
と縄文時代晩期から弥生時代にかけての人口増加率との関係

23. 日本列島内でも縄文度合いは多様：体質の影響も？
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CRP：炎症に反応し
血清中で増加するタ
ンパク質。要は免疫
力が強い。

24. 参考：都道府県肥満ランキング
24
WHOによるBMI定義
https://serai.jp/health/346320
2018年に行われた、全国47都道府県の男女
（20代～60代、各都道府県100人、男女比5:5）
のBMI平均値により順位づけ

25. 独自の発展を遂げた縄文時代：土偶
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土偶
狩猟社会では類例はあまりない（農耕社会で
は女性像は多い）
出土地域・時期によって多様。
大半の土偶が、当時意図的に壊した可能性が
高い。
比較的知られている説
・女性をかたどったもので、出産・豊穣など
を願う役割。
その他の説
・人形（厄を移す役割）
・宇宙人（神としてあがめていた）
・植物のフィギュア（精霊的な役割）
https://jbpress.ismedia.jp/articles/-/65038
https://intojapanwaraku.com/rock/culture-rock/32979/#toc-6
Wiki：「土偶」

26. 独自の発展を遂げた縄文時代：縄文土器
26
深鉢形土器（火焔型土器） 縄文中期
新潟県十日町市笹山遺跡出土 十日町
市博物館蔵 国宝
Wiki：「縄文土器」
縄文土器
世界でも最古級（1.6万年前）の土器が青森県
大台山本遺跡で発見
※世界最古は中国で2022年に発表された2万
年前の土器片
中期になると左図のように独特な修飾を施し
たものも。
https://www.nikkei.com/article/DGXNASDG2803Y_Y2A620C1CR8000
https://jomon-japan.jp/kids/learn/map/odai-yamamoto/
大台山本（おおだ
い やまもと）遺跡
の 無文土器片
(むもんどきへん)

27. 縄文・弥生時代人の復元
27
船泊遺跡（北海道礼文島）で出土した
縄文人女性の復元（約3800年前）
https://www.nikkei.com/article/DGXMZO65930200W0A101C2MY1000/
https://www.yomiuri.co.jp/pluralphoto/20211031-OYT1I50015/
青谷 上寺地 （ かみじち ） 遺跡（鳥取
県鳥取市）で出土した弥生人の復元

28. 青谷弥生人そっくりさんグランプリ
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https://www.asahi.com/articles/photo/AS20220528001615.html

29. 現代日本人（本州）は縄文寄りか弥生寄りか？
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2021年に金沢大学などが共同で発表
https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.abh2419

30. 古墳時代に東アジアの広範囲から渡来？
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https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.abh2419
戦乱を逃れて広範囲に日本列島へ
渡来した可能性
→三重構造モデル

31. 改めて整理
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昔のDNA分析（ミトコンドリア系）では、北東アジア系寄りと思われていた
祖先は東南系で独自に進化。
弥生期に北東、古墳期に東全般
から渡来し、現代人は後者の
DNAに近い

32. まとめ
• ゲノム解析含む最新科学が考古学を大幅にUpdate
• 日本列島に４万年前に渡ってきた縄文人は近隣の大陸人と異な
る独自DNAを持っていた（ただし列島内で多様）
• 現代日本人のDNAは、縄文・弥生よりも、古墳時代に東アジア
から渡来したDNAが濃いことが分かり、注目が集まっている。
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