Mikhail Eidelstein: AMRmap online platform for national AMR data analysis and presentation and associated web resources

1. AMRmap - онлайн платформа
анализа данных резистентности
к антимикробным препаратам
(АМП) в РФ
А.Ю. Кузьменков*, М.В. Эйдельштейн
НИИ Антимикробной химиотерапии ФГБОУ ВО «Смоленский
государственный медицинский университет» Минздрава России
* Alexey.Kuzmenkov@antibiotic.ru
AMRcloud - новая онлайн
платформа анализа и
представления
пользовательских данных
резистентности к АМП

2. AMRmap.ru

3. analytics.google.com
104 страны
20 000 активных пользователей

4.  Результаты многоцентровых проспективных
исследований НИИАХ / МАКМАХ (с 1998 г. до настоящего времени)
 >50 городов РФ (+ центры в соседних странах СНГ)
 >50000 неповторяющихся (по одному от пациента) клинических изолятов
(~5000 в год; колонизирующие изоляты и изоляты из окружающей среды не включаются)
 Сбор, хранение и тестирование изолятов в лаборатории НИИАХ.
Количественные данные МПК (20-35 АМП и комбинаций для различных видов МО)
 Определение категорий Ч-У-Р согласно актуальным критериям (EUCAST)
 Любые виды МО и АМП (при наличии данных и критериев или только распределения
МПК для отдельных комбинаций в случае отсутствия пограничных значений для категорий)
 Все значимые виды клинического материала (категоризация по локализации
инфекции)
 Генетические детерминанты резистентности (например, гены карбапенемаз у
>6000 изолятов)
 Регулярное пополнение и обновление (ежегодно)
AMRmap.ru: источники данных

5.  Выбор и фильтрация данных
(источник, тип и локализация инфекции, профиль отделения, география, период времени,
демографические параметры)
 In vitro активность различных АМП в отношении выбранных МО
(отдельные виды или группы МО)
 Тренды, распределения Ч-У-Р по выбранным параметрам
 Распределения МПК
 Интерактивные карты
 Ассоциированная и множественная резистентность, поиск факторов
риска наличия резистентности
 Распространенность значимых генетических детерминант устойчивости,
сравнения генотипов и фенотипов (МПК)
 Сравнения групп, выбранных по любым параметрам
 Обратная связь и отчеты для участвующих центров (требуется логин)
AMRmap.ru: основные функции

7. AMRmap.ru SNPT.antibiotic.ru

8. Пользователь Данные
(таблица)
Инструмент
анализа

10. Открытая веб платформа для анализа и представления данных
резистентности к АМП, которая позволяет…
 создавать защищенные учетные записи пользователей
 создавать проекты и загружать наборы данных
(локальные или многоцентровые проекты: МПК, зоны подавления роста, категории
чувствительности, маркеры резистентности и любые метаданные)
 анализировать данные с помощью системы “умной фильтрации” и
разнообразных инструментов визуализации
(интерактивных таблиц, диаграмм, географических карт)
 оценивать динамику и тенденций распространения резистентности
 обмениваться данными с помощью постоянных веб ссылок
(выборочные результаты / инфографика или целый веб проект)
AMRcloud.net

11. Не является и не заменяет собой…
 электронный лабораторный журнал
 ЛИС / МИС
 программы обработки и переноса данных в ЛИС /
МИС или центральные БД
AMRcloud.net

12. Оценка чувствительности клинических изолятов Enterobacterales и
Pseudomonas aeruginosa к цефтазидиму/авибактаму с помощью
диско-диффузионного метода
 Октябрь 2018 – Апрель 2019
 75 лабораторий в 35 городах РФ
 Рутинное определение чувствительности к ЦАЗ/АВИ (ДДМ) и
карбапенемам (любые методы)
 Результаты определения карбапенемаз (если проводилось)
 Внесение результатов в веб БД
 Бактериальные изоляты: 7 168
- Enterobacterales: 5 509
- Pseudomonas aeruginosa: 1 659
AMRcloud.net:
пример использования

14. Импорт данных из таблицы

16. Анализ данных

19. Обмен данными и их
представление онлайн

21. AMRcloud.net