Utilidad de la genómica en la salud humana

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Utilidad de la genómica en la salud humana -
Manuel Hermida -
Massive sequencing data analysis workshop -
Granada 2011

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Utilidad de la genómica en la salud humana

  1. 1. Utilidad de la Genómica en la Salud Humana Manuel Hermida Prieto INIBIC La Coruña manuel@hermidaprieto.com
  2. 2. Gregor Johann Mendel (1822 – 1884)
  3. 3. El sarcómero
  4. 4. MCH: proteinas de generación
  5. 5. CARDIOPATÍAS FAMILIARES:base genetica compleja y de reciente conocimiento: -Muchos genes: >50 -Muchas mutaciones > 5000el estudio del genoma aportará más conocimiento
  6. 6. Miocardiopatías:HipertoficaDilatadarestrcitivaNo compactadaDisplasia/miocardiopatía del ventriculo derechoCanalopatíasSindrome QT largoSindrome QT cortoSindrome BrugadaTaquicardia ventricular catecolaminergica polimórfica
  7. 7. CardiomyophatiesHCM MCDDAVD LVNC Hemocromatosis Amiloidosis MCR
  8. 8. ECHO-GUIDED GENETIC TESTING IN HCMREVERSE APICAL 79% + 30% + 35% de 10% de poblac poblac 45% en 8% en <50a <50a 13% en 13% en >50a >50aNEUTRAL SIGMOID 41% + 8% + 8% de 47% de poblac poblac 9% en 38% en <50a <50a 8% en 67% en >50a >50a (Binder J et al. Mayo Clinic Proc 2006;81:459-467)
  9. 9. MCD: proteínas de tracción!
  10. 10. Displasia/miocardiopatia del ventrículo derecho
  11. 11. CANALOPATÍAS
  12. 12. Fase 2 Fase 1 Na+ Ca2+ Cav1.2 (CACNA1C)+ ICa: 2 (CACNB2)+ 2/ (CACNA2D1-2) Ito: IKur: Kv1.5 (KCNA5)+ Kv4.3 (KCND3)+ K+ Kvβ2.1 (KCNAB2) KChIP2 (KCNIP2)0 mV Fase 3 K+ IKr: Kv7.1 (KCNH2)+ MiRP1 (KCNE2) Fase 0 IKs: Kv11.1(KCNQ1)+ K+ MinK (KCNE1) Na+ INa: Nav1.5 (SCN5A)+ K+-85 mV  (SCN1-3B) Fase 4 Kir2.1 K+ IK1: (KCNJ2)
  13. 13. KCNQ1 Los canales de K+ son tetrámeros de subunidades alfa que forman un poro conductor hidrófilo al disponerse de forma simétrica dos a dos
  14. 14. Síndrome de QT largo (SQTL): prevalencia 1:5000Síndrome de QT corto (SQTC)Síndrome de Brugada (SB): prevalencia 1-5:10000
  15. 15. -Motor y tracción-Unión celular-CanalesEstán en las bases moleculares de CF
  16. 16. Aplicabilidad clínica estudios genéticosEnfermedad Gen % Score genotipTS CACNA1c 100 5.5RWLQTS KCNQ1,KCNH2,SCN5A,KCNE1,KCNE2 >50 4.5JLN LQTS KCNQ1,KCNE1 >50 4.5AS KCNJ2 50 4.5DCM-CD LMNA/C 30-50 3.5HCM MYH7,MYL3,MYL2,ACTC,TNNT2,TPM1, >50 3 TNNI3,MYBPC3,TTNCCVPT RyR2,CASQ2 >50 3ARVC PKP2,DSP,JUP 30-50 2BrS SCN5A <30 1.5DCM MYH7,TNNT2,TNNI3,PM1 <10 0.5SQTS KCNQ1,KCNH2,KCNJ2 0 0.5PCCD SCN5A 0 0.5FAF KCNQ1,KCNE2 0 0.5SSS HCN4,SCN5A 0 0.5LVNC Cypher/ZASP 0 0.5 Priori, Napolitano. Circulation 2006
  17. 17. 2000 individuals HCM = 1/500BEFORE = 4 ?? Symptoms / Clinical tests CLINICAL DIAGNOSIS HCMNOW Genetic diagnosis M1 M2 M3 …700 different Silent carrier mutations Relative of a carrier HCM1 HCM2 HCM3 Individualized medicine Medical Prognosis 1 Prognosis 2 Prognosis 3 knowledge Treatment 1 Treatment 2 Treatment 3 managment Risk 1 Risk 2 Risk 3 CLINICAL APPLICATION
  18. 18. La genética es un problema para los clínicos1.-No tienen formación en genética2.-habitualmente la prescripción del análisis se realiza por prestigio omediante proyectos de investigación3.-algunos pacientes la demandan pq han oído hablar de ella. Se han creadomuy altas expectativas
  19. 19. 4.-Sin embargo la interpretación del resultado es máscompleja de los previsto: ya no son trisomias o cromosomasfrágiles o enfermedades monogenéticas con un únicamutación responsable.
  20. 20. • Hay un exceso de información• Hay un defecto de conocimiento
  21. 21. • Las preguntas en medicina• ¿que tengo?• ¿qué me va a pasar?
  22. 22. La genética es un problema para los clínicos7.- Por tanto la formación del clínico es una cuestión pendiente de resolver.Cómo y quien transmite la información al paciente.8.-En España aún no existe especialidad de genética reconocida9.-Otros países otros modelos: el consejero genético: se preocupa deaspectos psicológicos relacionados con la herencia.
  23. 23. El problema es:¿cómo se empaqueta la información de losanálisis bioinformáticos en un formatocomprensible para un no especialista en genéticao un consejero genético?
  24. 24. El problema no acaba cuando seindentifica una mutacion, sino que empieza
  25. 25. La genética es un problema económico1.-La genética es cara2.-La tendencia es externalizar este tipo de servicios en la sanidad pública.3.-Los hospitales desarrollan estrategias defensivas: solicitar a los médicos datos sobreel valor del diagnóstico, sobre como modificara el tto, si hay o no alternativas y cualesson las bases científicas que lo sostienen.4.-Quién paga y cuanto.
  26. 26. ¿El futuro?La genética bajará de precioQué esperan los clínicos de la NGS?Se mantendrá el problema de la transmisión de información muy complejaMensaje:la importancia del empaquetado final y la necesidad de la confianza mutua.

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