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怎样查阅文献

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给课题组同学做关于怎样查阅文献的报告

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怎样查阅文献

  1. 1. 怎样查阅文献 2014年9月11日
  2. 2. 提纲 1. 引言 2. 怎样查找文献 3. 怎样管理文献 4. 怎样管理知识
  3. 3. 1. 引言 1.1 为什么要讲这个题目 ▫ 科技文献数量巨大,而且继续增长 ▫ 2006 年总共1,350,000 篇论文发表在23,750 个期刊中 Björk, Bo-Christer, Annikki Roos, and Mari Lauri. "Global annual volume of peer reviewed scholarly articles and the share available via different Open Access options." Proceedings ELPUB2008 Conference on Electronic Publishing–Toronto. Vol. 2. 2008. ▫ Web of Science索引年增幅2.5%(1995-2007) NSF, Science and Engineering Indicators: 2010 Learned Publishing, 2010, 23, 258
  4. 4. 1. 引言 1.1 为什么要讲这个题目 ▫ 图书馆举办的讲座 ▫ 文献检索课 问题:文献检索具有不确定性,不适合讲授。 • 太专注于软件和网站的功能介绍 • 部分内容属于众所周知 • 落后于当今互联网时代 • “计算机使用技巧”的传授(vs 思维方法的传授)
  5. 5. 1. 引言 1.1 为什么要讲这个题目 参照Vogel’s Textbook of Practical Organic 1.2 科技文献种类 Chemistry • Primary sources – Journals, patents, dissertations, reports, etc. • Secondary sources – Abstracts(文摘) ▫ e.g. Chemical Abstracts Service (CAS) > 两个数据库:CAplus: bibliographic information and abstracts; Registry: substances > CAS Source Index (CASSI):所有的publication > Subject Coverage and Arrangement of Abstracts by Sections in Chemical Abstracts: 一共有80个section > 6部索引:Chemical Substance Index, General Subject Index, Formula Index, Index of Ring systems, Patent Index, Author Index
  6. 6. 1. 引言 1.1 为什么要讲这个题目 1.2 科技文献种类 • Primary sources – Journals, patents, dissertations, reports, etc. • Secondary sources – Abstracts(文摘) ▫ e.g. Chemical Abstracts Service (CAS) > 两个数据库:CAplus: bibliographic information and abstracts; Registry: substances > CAS Source Index (CASSI):所有的publication > Subject Coverage and Arrangement of Abstracts by Sections in Chemical Abstracts: 一共有80个section > 6部索引:Chemical Substance Index, General Subject Index, Formula Index, Index of Ring systems, Patent Index, Author Index
  7. 7. 1. 引言 1.1 为什么要讲这个题目 1.2 科技文献种类 • Primary sources – Journals, patents, dissertations, reports, etc. • Secondary sources – Abstracts(文摘) • Tertiary sources – Reviews, Handbooks • 其他形式的文献 ▫ Textbooks, Edited books, book series An edited book features articles or other material on the same subject but by different authors collected together in one book by an editor.
  8. 8. 1. 引言 1.1 为什么要讲这个题目 1.2 科技文献种类 • Primary sources – Journals, patents, dissertations, reports, etc. • Secondary sources – Abstracts(文摘) • Tertiary sources – Reviews, Handbooks • 其他形式的文献 ▫ Textbooks, Edited books, book series ▫ Lecture notes, conference proceedings, PPT, wiki, videos, etc.
  9. 9. 1. 引言 1.1 为什么要讲这个题目 1.2 科技文献种类 1.3 文献查找的常见目的 • 解答某个问题 ▫ “什么是XXX?”学习知识 > e.g. nonergodicity, attractive glass, etc. > 出现在不同类型的文献(journal articles, books, wiki) > 不同语境表达的意义不同,解释的深浅不同,难以一次性理解 > 处理好“暂时理解”和“深入理解”、“全面理解”的关系 ▫ “有没有人做过XXX?”找依据、论据 > e.g. 用过XX方法合成过、表征过XX;为什么说XXX > 延伸疑问:有什么结论、是否成功、能否验证想法、…… > 很可能没有出处,是在自己实验过程中冒出来的idea ▫ 进行正式的文献调查(literature survey) • 日常的文献跟踪、科研动态跟踪
  10. 10. 2. 怎么查 • 三种情况: ▫ 查特定的paper(略) ▫ 回答问题——主题搜索和cross referencing ▫ 日常文献跟踪 • 主题搜索 ▫ Google (Web): wiki, lecture notes, dissertations, … 范围包括部分下述Google子产品的结果 ▫ ~ Scholar: journal, patents, proceedings, preprints > 可以查文章的被引,以及在被引列表中进一步查找 > 可以找到全文的其他来源 ▫ ~ Books > “哪些书会讲授XX概念?” ▫ ~ Images, ~ Videos: 示意图、动画、ppt、讲座视频 ▫ ISI Web of Knowledge: 查综述比较有用
  11. 11. 2. 怎么查 • 三种情况: ▫ 查特定的paper(略) ▫ 主题搜索和cross referencing ▫ 日常文献跟踪 • 主题搜索 ▫ Google (Web): wiki, lecture notes, dissertations, … 范围包括部分下述Google子产品的结果 ▫ ~ Scholar: journal, patents, proceedings, preprints > 可以查文章的被引,以及在被引列表中进一步查找 > 可以找到全文的其他来源 ▫ ~ Books > “哪些书会讲授XX概念?” ▫ ~ Images, ~ Videos: 示意图、动画、ppt、讲座视频 ▫ ISI Web of Knowledge: 查综述比较有用
  12. 12. 2. 怎么查 • 三种情况: ▫ 查特定的paper(略) ▫ 主题搜索和cross referencing ▫ 日常文献跟踪 • 主题搜索:Google和ISI • Cross referencing ▫ 从文章引用中发现更核心、经典、重要的文献 ▫ 从重要文章的被引中找后续工作,抓住一个研究方向的主流
  13. 13. 2. 怎么查 • 三种情况: ▫ 查特定的paper(略) ▫ 主题搜索和cross referencing ▫ 日常文献跟踪 • 主题搜索 • Cross referencing • 两法交替使用,穷尽所有能找到的资料 • 先不要认真阅读具体的文献 • 通过PDF阅读器、网页浏览器等的“查找”功能定 位你所搜的关键词出现在文献中的位置,迅速 判断文献实际相关程度,作出筛选 • 发现更正确的术语,完善搜索的关键词,重搜 • 查找本身就是一个学习的过程
  14. 14. 2. 怎么查 • 三种情况 • 日常文献跟踪 ▫ 为什么? > 发现新方向、新方法、新结论 > 保持英语阅读量,提高英语水平 ▫ 面临的难题 > 文献量巨大,99%无参考和学习价值 > 分散在各期刊网站上 > 不定期看几篇,漏掉大量; > 看到的也多半属于那99%,失去“跟踪”的意义 > 坐在电脑前一般都有正事要干 ▫ 目标 > 设立关注的领域范围 > 集中订阅 > 闲散时间看 > 逐篇浏览,找出那1%
  15. 15. 2. 怎么查 • 三种情况 • 日常文献跟踪 ▫ 为什么? ▫ 面临的难题 ▫ 目标 ▫ 工具:RSS RSS – Rich Site Summary 网易体育新 闻 PRL新论文 个人博客新文 章 搜索结果的 新条目 RSS Reader
  16. 16. 2. 怎么查 • 用RSS订阅新论文 ▫ 订阅源(feed):各相关期刊
  17. 17. 2. 怎么查 • 用RSS订阅新论文 ▫ 订阅源(feed):各相关期刊 ▫ 阅读器(reader)
  18. 18. 2. 怎么查 2.1 科技文献种类 2.2 文献查找的常见目的 2.3 去哪里查?Google, ISI 2.4 日常文献跟踪 ▫ 什么是RSS? Save for later 添加RSS源地址
  19. 19. Save for later
  20. 20. 1. 打开原始页 2. 打开PDF 3. 速览文章内容 4. 下载/记录/忽 略
  21. 21. 3. 怎么管理 • 面临的问题 ▫ 文献量巨大 ▫ 文献种类不同,数量、特点也不同(journal articles, dissertations, books, webpages, PPT, DOC, etc.) ▫ 管理资料→ 管理知识 3.1 用EndNote 管理学术文献 ▫ 可管理类型:journal articles, dissertations, books 3.1.1 Journal articles ▫ 文件名命名
  22. 22. 3. 怎么管理 • 面临的问题 ▫ 文献量巨大 ▫ 文献种类不同,数量、特点也不同(journal articles, dissertations, books, webpages, PPT, DOC, etc.) ▫ 管理资料→ 管理知识 3.1 用EndNote 管理学术文献 ▫ 可管理类型:journal articles, dissertations, books 3.1.1 Journal articles ▫ 文件名命名 能够确定其唯一性的最少信息——期刊名缩写_卷_首页 ▫ 一一对应(1. 遇到某文献,快速确定自己是否已经有了;2. 迅速定位)
  23. 23. 3. 怎么管理 • 面临的问题 ▫ 文献量巨大 ▫ 文献种类不同,数量、特点也不同(journal articles, dissertations, books, webpages, PPT, DOC, etc.) ▫ 管理资料→ 管理知识 3.1 用EndNote 管理学术文献 ▫ 可管理类型:journal articles, dissertations, books 3.1.1 Journal articles ▫ 文件名命名 能够确定其唯一性的最少信息——期刊名缩写_卷_首页 ▫ 一一对应(1. 遇到某文献,快速确定自己是否已经有了;2. 迅速定位) ▫ 分组(经常性地独立topics)
  24. 24. 3. 怎么管理 • 面临的问题 ▫ 文献量巨大 ▫ 文献种类不同,数量、特点也不同(journal articles, dissertations, books, webpages, PPT, DOC, etc.) ▫ 管理资料→ 管理知识 3.1 用EndNote 管理学术文献 ▫ 可管理类型:journal articles, dissertations, books 3.1.1 Journal articles ▫ 文件名命名 能够确定其唯一性的最少信息——期刊名缩写_卷_首页 ▫ 一一对应(1. 遇到某文献,快速确定自己是否已经有了;2. 迅速定位) ▫ 分组(经常性地独立topics) ▫ 灵活查找(排序、主题词搜索)
  25. 25. 确认是否已经有这个文献 了
  26. 26. 按研究历史阅读
  27. 27. 用LAOS研究微凝胶的文章 有哪些? Joshi有一篇发表在Chem. Eng. Sci. 的论文忘了具体编号了想找出来
  28. 28. 3. 怎么管理 • 面临的问题 ▫ 文献量巨大 ▫ 文献种类不同,数量、特点也不同(journal articles, dissertations, books, webpages, PPT, DOC, etc.) ▫ 管理资料→ 管理知识 3.1 用EndNote 管理学术文献 ▫ 可管理类型:journal articles, dissertations, books 3.1.1 Journal articles ▫ 文件名命名 能够确定其唯一性的最少信息——期刊名缩写_卷_首页 ▫ 一一对应(1. 遇到某文献,快速确定自己是否已经有了;2. 迅速定位) ▫ 分组(经常性地独立topics) ▫ 灵活查找(排序、主题词搜索)、 ▫ 怎样拥有这样的数据库?——导入。
  29. 29. 全套操作: 1. 下载PDF全文(重命名) 2. 下载supporting information(加入pdf全文后面) 3. 下载citation文件(导入EndNote)
  30. 30. 3. 怎么管理 • 面临的问题 ▫ 文献量巨大 ▫ 文献种类不同,数量、特点也不同(journal articles, dissertations, books, webpages, PPT, DOC, etc.) ▫ 管理资料→ 管理知识 3.1 用EndNote 管理学术文献 ▫ 可管理类型:journal articles, dissertations, books 3.1.1 Journal articles 3.3.2 Dissertations ▫ 学位论文的特点:
  31. 31. 3. 怎么管理 • 面临的问题 ▫ 文献量巨大 ▫ 文献种类不同,数量、特点也不同(journal articles, dissertations, books, webpages, PPT, DOC, etc.) ▫ 管理资料→ 管理知识 3.1 用EndNote 管理学术文献 ▫ 可管理类型:journal articles, dissertations, books 3.1.1 Journal articles 3.3.2 Dissertations ▫ 学位论文的特点 > 数量少,印象深,查用频率低 > 信息量比journal article大(综述+方法的建立+多项研究结果) > 一般在大学的网站找到,没有导入endnote功能 ▫ 所有dissertation作为一个库 ▫ 手动输入信息(花专门时间做)
  32. 32. 3. 怎么管理 • 面临的问题 ▫ 文献量巨大 ▫ 文献种类不同,数量、特点也不同(journal articles, dissertations, books, webpages, PPT, DOC, etc.) ▫ 管理资料→ 管理知识 3.1 用EndNote 管理学术文献 ▫ 可管理类型:journal articles, dissertations, books 3.1.1 Journal articles 3.3.2 Dissertations 3.3.3 Books ▫ 数量更少,印象更深,查用频率更低,可以凭记忆,大致命名,分学科放置 即可
  33. 33. 3. 怎么管理 • 面临的问题 ▫ 文献量巨大 ▫ 文献种类不同,数量、特点也不同(journal articles, dissertations, books, webpages, PPT, DOC, etc.) ▫ 管理资料→ 管理知识 3.1 用EndNote 管理学术文献 ▫ 可管理类型:journal articles, dissertations, books 3.1.1 Journal articles 3.3.2 Dissertations 3.3.3 Books 3.3.4 其他类型的资料 网页、PPT、DOC、PDF、图片、只言片语,…… ——使用OneNote与知识管理相结合
  34. 34. 3. 怎么管理 • 面临的问题 3.1 用EndNote 管理学术文献 3.2 用OneNote 管理知识
  35. 35. • 所有内容任意放置 • 文字 网址、节选段落 • 笔迹 • 图片 示意图、截图,保持原始分辨率 • 文件 直接嵌在笔记本中,双击编辑,保存改动,支持任何格式 • 其他对象 公式、OriginPro,双击编辑 跨平台 云同步
  36. 36. 3. 怎么管理 • 面临的问题 3.1 用EndNote 管理学术文献 3.2 用OneNote 管理知识 ▫ 回顾——查找文献的目的: 什么是XXX?学习知识 谁做过XXX?找依据、证据 ▫ 方法:EndNote → Acrobat → OneNote 确定需阅读的文献范 围 (排序、查找、挑选) 逐篇阅读记录整理
  37. 37. MCT能够预测短程吸引作用粒子的kinetic arrest 不同的和Singularity例1:什么是attractive glass? 所谓attractive glass是在MCT的框架内的概念。按照MCT预测,phi>0.40,从排斥到吸引的相互作用相图 都能预测出来,发现有两种glass。 MCT怎么预测的? Phys. Rev. E 59:R1347, 63:011401 Tau: dimensionless temperature. MD模拟结果:Phys. Rev. E 65:050802, 66:041402(详尽结果) 实验体系Science 296:104, PRL 89:125701 MCT计算预测结果: MCT计算预测结果: 随着吸引势增加,平台出现,消失,再出现。新出现的平台尺度比旧平台小,时间比旧平台短,说明 引力造成的localization效应强(活动空间距离小),但束缚力弱,逃脱时间短。 实验结果: f(q,t)的平台先出现(A)再消失(B,C)再出现(D,E),与MCT预测结果相符。 更仔细的实验结果(考虑了aging)见Phys. Rev. E 69:011503 PRL 89:125701 Singularity的问题: 在此点附近有logarithmic characteristic of the correlation function。MCT预测此点是唯一的:(phi*, T*, ξ*),实验和模拟只能模到此点的附件,找到logarithmic行为PRL 84:5431, 88:098301, Science 296:104, Phys. Rev. E 66:041402 的问题: 在此点附近有logarithmic characteristic of the correlation function。MCT预测此点是唯一的:(phi*, T*, ξ*),实验和模拟只能模到此点的附件,找到logarithmic行为PRL 84:5431, 88:098301, Science 296:104, Phys. Rev. E 66:041402 MCT能够预测短程吸引作用粒子的kinetic arrest 不同的volume fraction, attraction和attraction range Suggests that the underlying 'ideal glass transition', found within MCT, could provide a universal mechanism for homogeneous gelation??in which the arrested state is viewed as an attraction-driven glass. (J. Phys. Condens. Matter 16:S4861的语言。 Phys. Rev. E 59:5706, 63:011401, 59:R1347, 69:011401 J. Phys. Condens. Matter 15:S869 MCT对于Heterogeneous gel(特别是低浓度)的适用性? 说phase separation的dense phase是attractive glass: J. Phys. Condens. Matter 16:S4861 J. Chem. Phys. 122:224903 (数值模拟) 又有人说低密度直接成为percolation,没有phase separation(也没去supress) EPL 72:1032 A. Puertas, M. Fuchs, M. Cates等人的模拟工作 Liquid-gas phase separation at long wavelengths可以通过叠加长程排斥来suppress If no barrier were used, because the simulation is small compared to a real system, substantial phase separation on the length scale of the simulation box would occur quite rapidly. Ref. Phys. Rev. E 67:031406, J. Phys., Condens. Matter 16:S4861 但是加了Long range repulsion也会带来问题。Under certain cercumstances, long-range repulsive barriers are known to cause microphase separation. Ref. Phys. Rev. E 59:R6255, J. Chem. Phys. 110:4582, PCCP 4:949. In that case, the regions of high and low particle density arrange in a periodically ordered pattern, causing one or more Bragg peaks at low q in equilibrium. J. Phys. Chem. B 109:6666 PRL 88:098301 Phys. Rev. E 67:031406 J. Chem. Phys. 121:2813 较浓体系的gelation,跟MCT的结果比较 模拟的结果显示明显的动态不均匀性,于是跟MCT的预测不符(MCT预测不出动态不均匀性?) 在低浓体系也能看到明显的动态不均匀性:J. Stat. Mech. 2008, L04002 对于凝胶体系的动态不均匀性,可以定义一个几何量:time-dependent mean cluster size, S(t), defined by bonds that are present at both time 0 and time t. PRL 93:215701,发现低浓度下它跟dynamic susceptibility 基本重合,说明凝胶的dynamic susceptibility主要来自结构分布不均(cf glass)。当浓度增大,dynamic susceptibility出现一个峰,是S(t)没有的。但若另定义一个新量:the mean cluster size of mobil particles, Sm(t), where the clusters are made as before by particles connected by persistent bonds, but restricted to particles that in the time interval [0, t] have moved at least a distance r0 那么Sm(t)和dynamic susceptibility的峰就重合了。Nat. Mater. 1:145, PRL 92:148302 MCT也可以预测出动态不均匀性呀:Europhys. Lett. 67:21 MCT也可以预测出Kinetic arrest? Phys. Rev. E 59:5706, 63:011401, 59:R1347, 69:011401 J. Phys. Condens. Matter 15:S869 主要证据直接截图, 附论文出处,简短评 述 发现不同观点,copy 原话,附出处 未完全理解,有待进一 步阅读,打问号,附出 处
  38. 38. 例2:谁做过SRFS? Phys. Rev. E 58:3515 MD模拟 理论计算: 主要证据直接截图, 附论文出处,简短评 述 J. Chem. Phys. 116 6228 time -- shear rate superposition Lennard-Jones模型——松弛时间与剪切速率有关 Giesekus模型 尝试屈服应力流体模型: J. Non-Newt. Fluid Mech. 86:133, 102:157, 145:1, J. Rheol. 29:147, 53:245 Rheol. Acta 26:428 http://arxiv.org/pdf/1302.4271.pdf J. Non-Newt. Fluid Mech. 164:66 Soft Matter 7:2471 Eur. Phys. J. E 23:337 做了一个模型并亲测了SRFS。 疑问产生的缘由?自 己的实验结果。
  39. 39. 例3:撰写论文的过程
  40. 40. 例3:撰写论文的过程 学习的知识: 1. 明胶科学
  41. 41. 例3:撰写论文的过程 学习的知识: 1. 明胶科学 2. 超弹性网络模型 橡胶弹性本构方程的review: Rubber Chem. Technol. 79:835, 73:504 Gelat in的st rain hardening的连续介质模型: BST: Blatz, Sharda and Tschoegl Trans. Soc. Rheol . 18:145 用在gelat in: Polymer 26:1483 Polym. Gels. Netw. 4:189 介观模型(珠簧网络) J. Chem. Phys. 100:1649, 100:1657 Macromolecules 28:6284 用在明胶: J. Chem. Phys. 104:9209 (要用到df参数,解析解太复杂,用MC模拟) The transition zone for gelatin gels as measured by high-frequency rheology From <http://www.euronet.nl/users/bota/isj-tex.htm> http://uas.gd.calis.edu.cn:8090/amconsole/AuthServices? verb=login&goto=http://ill.gd.calis.edu.cn/gateway/Default.aspx Str ain-energy based models: Drozdov模型用在gelat in:Polymer 46:4928, 46:4938 Gent : Rubber Chem. Technol . 69:59, 72:263 Creton: Soft Mat ter 5:1440, 8:774 C. Horgan发了很多相关文章。 Gent的分子结构基础: The Gent model is a simple and accurate approximat ion of the Ar ruda-Boyce model , which is based on the stat ist ical mechanics of a mater ial wi th a cubic representat ive volume element containing eight chains along the diagonal di rections. J. Elast ici ty 68:167, 70:65 更详细: Proc. R. Soc. A 457:1999 Math. Mechanical . Sol ids7:353 MacKintosh半柔网络模型: Nonl inear elast ici ty of biopolymer gels (theor y) MacKintosh:Nature 435:191,PRL 75:4425 推导参考:J. Cel l Biol . 120:923 MacKintosh的chapter 8 相关:PRL 91:108102, 91:108103 单丝模型用于别的实验体系: Science 276:1112 Nature 393:181 Biophys. J. 75:3008 J. Mol . Biol . 286:553 Nat . Mater . 1:232 Nonl inear elast ici ty of biopolymer gels (theor y) MacKintosh:Nature 435:191,PRL 75:4425 推导参考:J. Cel l Biol . 120:923 MacKintosh的chapter 8 相关:PRL 91:108102, 91:108103 单丝模型用于别的实验体系: Science 276:1112 Nature 393:181 Biophys. J. 75:3008 J. Mol . Biol . 286:553 Nat . Mater . 1:232 有一个简化公式:M 28:8759 Model of l imi t ing chain extensibi li ty Review: Rubber Chem. Technol. 73:504 Const i tut ive model based on MacKintosh: ActaBiomater ial ia4:597 Nonl inear viscoelast ic model : Nonaffine deformation and reorganizat ion of the networ k explains the non-l inear elast ici ty -- PRL 95:178102 evidence: New J. Phys. 9:428 Macromolecules 44:140 Giesekus model原始文献 H. Giesekus, Rheol. Acta 21:366 J. Non-Newt . Fluid Mech. 11:69, 12:367 Bi rd的书eq. (7.3-3), p.353. Improvement: J. Non-Newt . Fluid Mech. 57:119 按Giesekus model计算振荡剪切行为: J. Rheol . 52:1427 Rheol . Acta 49:213 J. Non-Newt . Fluid Mech. 165:1564 Semi flexible biopolymer s such as Cel lulose ? F-act in: J. Biol . Chem. 269:32503, 275:35886 Soft Mater 4:1675
  42. 42. 例3:撰写论文的过程 学习的知识: 1. 明胶科学 2. 超弹性网络模型 3. Smoluchowski聚 集模型 Ini t ial growth obeys the scal ing of the dimensionless aggregat ion t ime tp <Rh> ~ tp in RLCA: Chem. Eng. Sci . 59:1783 M. Morbidel li 's works: The Smoluchowski can be rewr it ten so that the aggregat ion kinet ics dependence on stabi l i ty rat io Wand ini t ial par t icle volume fract ion ϕ0, as long as df and λ are fixed, leading to a master agregat ion cur ve for fixed values of df and λ. <R> ~ tp, and G' ~ tp: J. Phys. Chem. B 108:20105 More parameters: J. Phys. Chem. B 116:7066 Chem. Eng. Res. Des. 83:926 Chem. Eng. Processing 45:936 Langmui r 21:2062 …t oo many si mi l ar ar t i cl es. The basic pr inciple is summar ized in Dimensionl ess Agg... Ref: Adv. Col loid Inter f. Sci . 108-109:133, 103:33 J. Col loid Interf. Sci . 268:106 AIChE J. 49:1542 Exper iment: scal ing of st ructure factor PRL 68:3327, successful ly modeled by Smoluchowski equat ion (Phys. Rev. E 20:4068, PRL 74:282). 详细的总结打在 一个word文件,嵌 在笔记中,可双击 详细查看。 Problem of Morbidel li 's work: 1. Only tested in the pre-gel regime? 2. How about the relaxat ion t ime? Master aggregat ion cur ve: Before gelat ion (<Rh>): Langmui r 23:10323, 25:12073 Macromolecules 42:9103 J. Phys. Chem. B 114:8838, 116:7066, 113:14962 PCCP 14:4906 Soft Mat ter 6:5425 Scal ing of di fferent condi tions: Par t icle volume fract ion: Chem. Eng. Sci . 59:1783, J. Phys. Chem. B 113:14962 coagulant concent rat ion: J. Phys. Chem. B 108:20105, 114:8838, Langmui r 25:12073, 21:2062, PCCP 14:4906, Soft Mat ter 6:5425 pH: J. Phys. Chem. B 116:7066 Temperature: J. Phys. Chem. B 116:7066, Langmui r 23:10323 Type of sal t : J. Phys. Chem. B 116:7066 After gelat ion (G'): Chem. Eng. Res. Des. 83:926 Langmui r 21:2062 J. Phys. Chem. B 108:20105 Soft Mat ter 6:5425 Scal ing of di fferent condi tions: Coagulant concent rat ions: J. Phys. Chem. B 108:20105, Scal ing of di fferent condi tions: Coagulant concent rat ions: J. Phys. Chem. B 108:20105, Langmui r 21:2062, Soft Mat ter 6:5425 Since inter connect ion kinetics leading to format ion of par t iculate gels is far from under stood, i t is not obvious a pr ior i that there should be kinetic master cur ves from gelat ion in dimensionless t ime tau simi lar to those deduced and obser ved experimental ly for aggregat ion kinet ics. However, i t turns out that cer tain gelat ion kinet ic master cur ves can be obser ved in slowly aggregat ing concentrated col loidal disper sions. Two-step model: aggregate -- inter connect ion Phys. Rev. B 51:11348 Adv. Col loid Interf. Sci . 108-109:133 DLS resear ch of hydrogels: J. Phys. Chem. B 104:11019 DLS of nonergodic systems Pusey and Megen: Physica A 157:705, Phys. Rev. A 43:5429 Model for DLS interpretat ion: Kral l et al .: PRL 80:778 Solomon and Varadan: Phys. Rev. E 63:051402 Numer ical calculat ion of the populat ion balance equat ion (PBE): The Kumar -Ramkr ishna (KR) method: Chem. Eng. Sci . 51:1311, 59:1783, J. Phys. Chem. B 116:120 凝胶也有两步decay: PVA+交联剂体系: Macromolecules 23:3284 Slow mode是cluster 的mobi li ty,fast mode是col lective mot ion of t ransient network 。 从slow mode得到cluster的R_h. c<c* , tau_s ~ q^2 (di ffusive) c>c* , tau_s ~ q^0 (relaxat ion) tau_s ~ tau_M (G'=G") Macromolecules 28:2339, 29:1445 colloid体系: PRL 80:778, 84:2275 Faraday Discuss. 123:237 Viscoelastic propert ies of physical ly crossl inked networks J. Non-Newt . Fluid Mech. 43:247, 43:273, 43:289 Whereas at high temperatures the relaxat ion in the system is dominated by par t icle col lision and di ffusion, at the temperatures where the aggregat ion star ts to produce 更
  43. 43. 例3:撰写论文的过程 学习的知识: 1. 明胶科学 2. 超弹性网络模型 3. Smoluchowski聚 集模型 4. 反离子凝聚理论 关于势能计算: 写在草稿纸上的笔 记可以直接拍照贴 在OneNote
  44. 44. 例4:酝酿中的研究课题 网址、嵌入文件、 截图的灵活使用
  45. 45. 例4:酝酿中的研究课题 浓悬浮液的tubulent 培养浓的细菌液:PRL 107:028102 E. coli MG1655。这个procedure还挺详细! 最后重分散后的悬浮液细胞密义是3e10 cel l/mL,粘度为9.8e-4 Pa s。 PRL110:228102 Bacillus subtilis wild-type strain 168 在Terrific Broth (Sigma T5574)中培养 Concentrated 400x at 400g (final volume fraction ~30%-40%) 加入荧光的tracer particle: F-8816 invitrogen) Commercial particle image velocimetry (PIV) software (Dantec Flow Manager) At very high volume fractions (phi > 40%), steric repulsion and other short-range interactions can be expected to govern physical reorientation and alignment, whereas intrinsic Brownian motion effects become less important in this collision-dominated high-density regime. 通过氧的溶解量来控制细菌的游动速度PRL 109:248109 Strain 1085 of Bacillus subtilis oxigentaxis 装置:PRL 98:158102, 103:148101, PNAS 107:969 受限空间内的流场:http://arxiv.org/pdf/1304.2875v1.pdf Confinement Stabilizes a Bacterial Suspension into a Spiral Vortex 源文档<http://arxiv.org/abs/1304.2875> 实验结果与模拟相比较:PNAS 109:14308 B. subtilis 细菌推微球 化学控: 细菌吸附在PS球上:Biomed. Microdevices 14:1009 要用力气比较大的细菌 S. Marces cens (ATCC 274) Chemotaxi要用一个Microfluidic的chemical gradient generator APL 90:023902 细菌吸附在球上,球吸在表面上,控释 Small 7:588 APL 102:1743701 通过相差环实现单摄像机拍摄三维轨迹。 光控:PNAS 102:11963 APL 90:263901 磁控:Biomicrofluidics 6:24107 Science 190:377 细菌本身的运动(稀) Phys . Rev. E 83:035301重要的paper Chlamydomonas reinhardtii一种藻 高速摄像机是Phantom的Miro(400Hz) Glass chamber用牛血清蛋白coat防细胞粘附 用红光fi l ter随phototaxis 用IDL的那个软件来track可以同时track很多 用short chain dextran调水的粘度,链不能太长引起non-newtonian也不 能太短使得细胞渗透压太大,浓度范围使得粘度在1.5-3.7 mPa s 同种藻的Locomotion发 Scinece 325:487 PRL 104:098102, PRL 103:198103 Bacteriophage-functionalized surfaces http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/la500059u 2014/8/23 17:44 - 屏幕剪辑 http://arxiv.org/pdf/1403.2100v1.pdf Flagellar Synchronization 2014/8/23 17:41 - 屏幕剪辑 Active matter can induce forces on objects Phys. Rev. E 90:013019 http://arxiv.org/pdf/1403.1533v1.pdf Casimir effect in swimmer suspensions http://arxiv.org/pdf/1404.4857v2.pdf 平时跟踪新文献时及时记录,发现有归 类的内容及时归类。分主题、有图、有 文字要点、有出处。
  46. 46. 3. 怎么管理 • 面临的问题 3.1 用EndNote 管理学术文献 3.2 用OneNote 管理知识 ▫ 回顾——查找文献的目的: 什么是XXX?学习知识 谁做过XXX?找依据、证据 ▫ 方法:EndNote → Acrobat → OneNote ▫ 知识管理得越好,可回顾的时间间隔就越长,思考问题就越深入。

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