1. Çağrılı 1501/1507
1
TÜBİTAK
PROJE ÖNERİ BİLGİLERİ FORMU
AGY100/AGY101
v1.0
Proje Numarası :
Proje Adı : Akciğer, kolorektal ve böbrek kanseri tedavisinde kullanılmak amaçlı
yeni nesil mRNA-Nanopartikül immünoterapi ajanı geliştirilmesi.
Kuruluş Adı :
Ortak Adı (Varsa): :
2. Çağrılı 1501/1507
2
A. KURULUŞ VE PROJE BİLGİLERİ.......................................................................................................................................3
A.1 - PROJE ÖN BİLGİLERİ......................................................................................................................................................3
A.2 - KURULUŞ BİLGİLERİ.......................................................................................................................................................4
A.3. PROJE KISA TANITIMI.....................................................................................................................................................5
B. PROJENİN ENDÜSTRİYEL AR-GE İÇERİĞİ, TEKNOLOJİ DÜZEYİ VE YENİLİKÇİ YÖNÜ .........................................................8
B.1 - PROJENİN ÇAĞRI KONUSUYLA İLİŞKİSİ VE HEDEFLERİ...................................................................................................8
B.2 PROJENİN TEKNOLOJİ DÜZEYİ.......................................................................................................................................14
B.3 PROJENIN SOMUT / ÖLÇÜLEBILIR HEDEFLERLE TANITIMI VE ÇÖZÜM YAKLAŞIMLARI (AR-GE SISTEMATIĞI) ...............16
B.4. PROJENIN YENILIKÇI YÖNLERI......................................................................................................................................22
C. PROJE PLANI VE KURULUŞ ALTYAPISI..........................................................................................................................24
C.1. İŞ PLANI........................................................................................................................................................................24
C.2. PROJE YÖNETIMI VE ORGANIZASYONU .......................................................................................................................28
C.3. KURULUŞ ALTYAPISI (*)................................................................................................................................................29
D. PROJENİN EKONOMİK YARARA VE ULUSAL KAZANIMA DÖNÜŞEBİLİRLİĞİ .................................................................30
D.1 EKONOMIK ÖNGÖRÜLER..............................................................................................................................................30
D.2 ULUSAL KAZANIMLAR...................................................................................................................................................32
E. RİSK VE FİNANSMAN YAPISI........................................................................................................................................34
F. PROJE BÜTÇESİ............................................................................................................................................................36
F.1 - PERSONEL GİDERLERİ TAHMİNİ MALİYET FORMU (M011)..........................................................................................36
F.2 - SEYAHAT GİDERLERİ TAHMİNİ MALİYET FORMU (M012)............................................................................................37
F.3 - ALET/TEÇHİZAT/YAZILIM/YAYIN ALIMLARI TAHMİNİ MALİYET FORMU (M013) ........................................................38
F.4 - AR-GE VE TEST KURULUŞLARINA YAPTIRILAN İŞLER TAHMİNİ MALİYET FORMU (M014).............................................43
F.5 - HİZMET ALIMLARI TAHMİNİ MALİYET FORMU (M015) ...............................................................................................44
F.6 - MALZEME ALIMLARI TAHMİNİ MALİYET FORMU (M016) ...........................................................................................45
F.7 - DÖNEMSEL VE TOPLAM TAHMİNİ MALİYET FORMU (TL) (M030) ...............................................................................52
G.EKLER ..........................................................................................................................................................................53
3. Çağrılı 1501/1507
3
A. KURULUŞ VE PROJE BİLGİLERİ
A.0. İlgili Proje ile Karşılaştırma(*)
(*)
Sunulan yeni proje önerisi daha önce TÜBİTAK’a sunulmuş ve ret edilmiş / geri çekilmiş veya yürürlükten kaldırılmış
bir projenin tekrar sunulması ise ya da daha önce TÜBİTAK desteği ile yürütülmüş olan bir projenin devamı niteliğinde
ise, bu bölümde istenen bilgiler hazırlanarak sunulmalıdır.
Açıklama: Bu bölümde sunulan yeni proje önerinizi;
i) Daha önce TÜBİTAK’a sunulmuş olan ve ret edilen / geri çekilen veya yürürlükten kaldırılan bir projenin tekrar
sunulması ise; söz konusu proje ile karşılaştırarak, yeni projenin öncekine göre hedeflenen çıktıların özellikleri,
yenilikçi yönleri, uygulanacak yöntemler ile proje planı, bütçesi ve işbirlikleri gibi açılardan farklılıklarına,
ii) Daha önce TÜBİTAK desteği ile yürütülmüş olan bir projenin devamı niteliğinde ise; söz konusu proje ile
karşılaştırarak, yeni projenin öncekine göre hedeflenen çıktıların özellikleri, yenilikçi yönleri ve uygulanacak
yöntemler gibi açılardan farklılık ve üstünlüklerine,
ilişkin bilgileri içeren bir doküman hazırlayarak, pdf formatında yükleyiniz (Ekleyeceğiniz dosya boyutu en fazla 5 MB
olabilir).
İlgili Proje ile Karşılaştırma
A.1 - PROJE ÖN BİLGİLERİ
A.1.1.
Proje Numarası
Projenin Adı
Proje Başlama Tarihi Proje Bitiş Tarihi
Destek Başlama Tarihi Destek Bitiş
Tarihi
Proje Süresi Destek Süresi
Teknoloji Grubu
Yasal/özel izin: O Proje çalışmaları yasal/özel izin (Etik Kurul vb) gerektirmektedir.
O Proje çalışmaları yasal/özel izin (Etik Kurul vb) gerektirmemektedir.
Proje bilgileri paylaşımı O Proje adı ve Proje Amacı bölümünde verilen bilgilerin başarı öyküsü vb tanıtım
faaliyetlerinde, analiz ve raporlama çalışmalarında yayınlanmasına onay veriyorum.
O Proje destek süreci tamamlandıktan sonra projenin adının ve amacının TÜBİTAK web
sayfasında yayınlanmasına onay veriyorum. (PRODİS’e not: Bu bölümde birinci seçenek
işaretlendiği takdirde ikinci seçenek otomatik olarak işaretlenecektir.)
Ar-Ge Çalışmalarının
Yürütüleceği Sektör
Proje Çıktılarının
Kullanılacağı Sektör
iii)
Proje Önerisinin İçerdiği Bilimsel ve Teknolojik Alanlar
Proje Çıktısının Ekonomik Faaliyet Sınıfı (NACE Kodu)
Proje Çıktısının GTİP Kodu
Proje Başlangıç Teknoloji Hazırlık Seviyesi
Proje Sonunda Ulaşılması Hedeflenen Teknoloji Hazırlık Seviyesi
A.1.2.
Proje Yürütücüsü
Adı, Soyadı iv) TC Kimlik No
Unvanı/Görevi
Yazışma Adresi
Telefon v) Faks
E-Posta İkincil E-Posta
4. Çağrılı 1501/1507
4
A.2 - KURULUŞ BİLGİLERİ
A.2.1 – Başvuru Yapan Kuruluş Bilgileri
A.2.1.1.
A.2.1.2. Proje Kişi Bilgileri
A.2.1.3.
Kuruluş Personel Dağılımı
Birimi Doktora Yüksek Lisans Lisans Teknik/ Meslek
Lise
Diğe
r
Toplam
Üretim
Ar-Ge
Diğer
Toplam
A.2.1.4.
Kuruluşun Bir Önceki
Yıl veya Son Ara
Hesap Dönemine Ait
Mali Bilgiler (TL)
Yıl/Dönem
Yıllık Çalışan Sayısı (YİB)
Net Satış Hasılatı
Ar-Ge Giderleri
Yurtdışı Satışlar Toplamı
Ödenmiş Sermaye
Mali Bilanço Toplamı (Aktif veya Pasif
Toplamı)
Kamudan Son Üç Yılda Sağlanan Toplam
Hibe Destek Tutarı (TL)
Özkaynaklar
Son Üç Yıl Net Satış Ortalaması
TEYDEB programlarından nasıl haberdar olduğunuzu aşağıda belirtiniz.
O Daha önce başvurmuştum
O TTO (Teknoloji Transfer Ofisleri)
O Danışmanlık şirketleri aracılığı ile
O Broşür, dergi vs.
O TEYDEB’in sunumlarına katıldım
O Diğer
Kuruluş Yetkilisi
Kuruluş Türü/Ölçeği/Bilanço
verileri
Vergi Dairesi
Vergi Sicil No
Kuruluş Tescil Tarihi
Ticaret Sicil No
Projenin Yapıldığı Yer:
(Teknokent/Ar-Ge
Merkezi/OSB/Diğer)
Kuruluş Yetkilisi
Adı, Soyadı TC Kimlik No
Unvanı/Görevi
Telefon Faks
E-Posta
Ortak Kuruluş Bilgileri
5. Çağrılı 1501/1507
5
A.2.1.5 Firmanın Diğer Ar-Ge Projeleri:
Kuruluşun Son Beş Yılda Tamamlanmış ve Devam Eden Diğer Ar-Ge Projeleri (*)
Proje No ve
Adı
Desteğin Alındığı
Kurum
Destek
Tutarı
Başlangıç-Bitiş
Tarihleri
Ekonomik Değerler
Açıklama
İhracat Tutarı:
Patent Sayısı:
Lisans Gelirleri:
TEYDEB Desteği mi?:
Toplam Satış Miktarı:
(*) PRODİS’te kuruluşun önceki TÜBİTAK Proje bilgileri veri tabanından otomatik olarak gelmektedir. Söz konusu proje
bilgileri ile ilgili düzenleme yapılabilir, farklı kurumların desteği ile yürütülmüş proje bilgileri eklenebilir.(Otomatik olarak
listelenecektir.)
A.2.1.6. Firmanızın(varsa) daha önce TÜBİTAK tarafından desteklenmiş projeleri için sorular:
1.Desteklenmiş proje çıktılarının pazar payı ve elde edilen ciro ne kadardır? (Ürün geliştirme dışındaki projeler için dolaylı
şekilde kazanç
sağlamaya olanak sağlayan verimlilik artışı,maliyet azaltma,kalite artışı,gibi faydaların ayrıntılı açıklaması.
2.Desteklenmiş projelerin çıktıları için firmanız tarafından satış sonrası destek veriliyor mu? Satış yapılan ürün
geliştirilmeye devam ediliyor mu?
3.Desteklenmiş proje çıktıları ihraç edilen bir ana ürünün bileşeni mi? (Örneğin ihraç edilen bir otomobilin jantı gibi)
4.Uluslararası Ar-Ge destek programlarına (AB Çerçeve Programları vb.) başvuru yapılmış mı? Uluslararası bir projede yer
alınmış mı? Alınmış ise projedeki rolünüz nedir, kısaca belirtiniz.
A.3. PROJE KISA TANITIMI
Kanser, tedavi edilmez ise ölümle sonuçlanabilecek kontrolsüz büyüyen ve yayılan hücrelerle karakterize edilmiş hastalık
grubu olarak tanımlanmaktadır (Cancer.org, 2022). Kanser tedavisinde yeni yaklaşımlar geliştirilse de halen en yaygın
tedavi yöntemi olan kemoterapi yaygın olarak kullanılmaktadır. Kemoterapi gören hastalarda görülen şikayetler ve tedavi
etkinliği ise hastalığın seyri kişiden kişiye değişmektedir. Hal böyle iken tedavi süresinin azaltılarak hem maliyet hem de
sürdürülebilirlik açısından mRNA teknolojisinin terapötik ajan olarak kullanılmasının yeni ve etkili bir yöntem olması göz
önüne alındığında pek çok araştırma ve geliştirme imkanı doğmaktadır.
mRNA teknolojisi, Nanoteknoloji ile birleştirildiğinde ise ortaya oldukça tatmin edici ve ümit vadeden neticeler
çıkmaktadır. Bu proje kapsamında yeni teknolojiler kullanılarak biyo uyumlu ve hastalığa özgü yaklaşımlar aracılığı ile
hem tedaviye ulaşım olanağı hem de hastaların yaşam kalitesinin arttırılması hedeflenmektedir. Bu hedefler doğrultusunda
farklı mühendislik disiplinlerini ve tıp bilimini bir araya getirerek immünoterapötik genler içeren biyo çözünür ve biyo
uyumlu nanopartiküller geliştirilmesi amaçlanmaktadır. Çalışma kapsamında yeni nesil VLP-Nanopartiküllerin barındırdığı
hücresel nüfuz etme özelliğine sahip peptitler sayesinde hedef alınan kanser dokusuna intratümöral enjeksiyon yöntemi ile
Kuruluş Adı:
Vergi Dairesi ve Sicil No:
Adresi:
Tel/Faks/E-posta/Web Adresi:
Kuruluş Yetkilisi:
TC Kimlik No:
Ünvanı/Görevi:
Tel/Faks/E-posta:
Kuruluş Türü / Ölçeği:
6. Çağrılı 1501/1507
6
verildiğinde bileşenlerin, hücresel bağışıklığı uyararak kanserli hücrelerin hem tamir mekanizmasının çalıştırılması hem de
işaretlenerek programlanmış hücre ölümünün başlatılması sayesinde hastalığa karşı yeni bir terapötik silah edinilmiş
olacaktır.
1 - Kuruluş Kısa Tanıtımı ve Projenin Başlatılma Gerekçesi
Kuruluşunuzun ana faaliyet alanı, başlıca ürün ve hizmetleri, kuruluşunuza rekabette avantaj sağlayan ana / öz
yetkinlikleriniz (en iyi olduğunuz alanlar) ve kuruluşunuzun gelecek vizyonu ile ilgili özet bir bilgi vererek, önerilen
projenin tüm bunlarla ne şekilde ilişkilendiğini (projenin kuruluşunuz için stratejik önemini) açıklayınız (En fazla 1.500
karakter)
2 - Projenin Amacı (En fazla 1.000 karakter)
mRNA taşıyıcı nanopartikül temeline dayanan yenilikçi yöntemlerin çoğu, özellikle Sars-Cov-2 virüsünün sebep
olduğu Covid-19 pandemisinin bir getirisi olmuştur. Bu yöntemler ile oluşturulan aşılar ise Covid-19 pandemisinde
oldukça etkin biçimde kullanılmış ve salgına karşı önemli bir kalkan olmuştur. Bu teknolojinin güvenilirliği ve etkinliği
pek çok kanser çalışmasına da ilham kaynağı olmuş ve bu alanda pek çok çalışma yapılmıştır.
Kanser tedavisinde de yeni bakış açıları ile güncel teknolojilerin etkin bir biçimde melezlenerek oluşturulduğu bazı
ürünlerin kanserli hücrelerle etkileşime girerek terapötik ajanı teslim etmesi prensibine dayandığı bilinmektedir.
Bu proje kapsamında da mRNA teknolojisi, nanoteknoloji ile birlikte kullanılarak düşük toksisite ve yüksek etkinliğe
sahip immünoterapötik aşılar/ürünler geliştirilmesi amaçlanmaktadır. Geliştirilecek olan ürünler sayesinde pek çok
kanser hastasının sağlığına kavuşmasının yanı sıra ülkemize katma değer olarak geri döneceği öngörülmektedir.
Anahtar Kelimeler:
3 - Yenilikçi Yönleri (En fazla 700 karakter)
Bu proje kapsamında kanser tedavisinde protein mühendisliği ve nanoteknoloji başta olmak üzere farklı disiplinler bir
araya getirilerek etkin ve sürdürülebilir iş modellerinin oluşturulması amaçlanmaktadır. Kanser tedavisinde kullanılmak
üzere yeni nesil hibrit biyomoleküllerin daha işlevsel hale getirilerek tedavi için yeni kilit taşı olabileceği
düşünülmektedir. Hücre nüfuz proteinleri (CPP), aptamerler ve viral proteinler hücresel immün yanıtın başlatılabilmesi
ve ilaç taşıyıcı sistemler için umut vadetmektedir. Taşınan materyalin stabilitesinin korunması ve işlevselliğinin
arttırılması için değerlendirmelidir. Genetik manipülasyonlar içermemesi ve hedeflenen bölgeye tutarlı bir şekilde
nüfuz edebilmesi açısından oldukça değerli özellikleri bulunmaktadır.
4 - Kullanılacak /Geliştirilecek Teknik ve Teknolojiler ile Özgün Katkılar(En fazla 700 karakter)
Kanser hücrelerinin morfoloji bakımından bulunduğu bölgelerdeki hücre tiplerine oldukça benzer özellikler
barındırması, kanser tedavisinde geliştirilecek yöntemlerin uygulanabilirliğini zorlaştırmaktadır. Ayrıca kanser
hücrelerinin metastaz ile yayılarak yeni tümör mikro çevreler oluşturması sonucunda hastalığın seyri bireylerde kötüye
gitmekte ve tedaviyi güçleştirmektedir. Bu gibi kanseri tedaviye karşı dirençli kılan özellikleri engellemek amacı ile
kanserli hücreleri, tamir mekanizması ile uyararak kanserleşmeyi durdurmak ya da işaretleyerek bağışıklık sistem
hücreleri tarafından algılanıp etkisiz hale getirilmesi proje kapsamında incelenecektir.
5 - Ekonomik ve Ulusal Kazanımlar (En fazla 1.000 karakter)
Kanser tedavisinde kullanılan ilaç ve cihazların pek çoğu yurt dışından ithal edildiğinden dolayı döviz kurundaki
yükseliş ve pandeminin sebep olduğu lojistik aksamaları, üretim maliyetleri gibi sebepler sonucunda ile ulaşılabilirliği
zorlaşmaktadır. Tüm bu olumsuzluklara rağmen gelişen biyoteknoloji ve enformatik sayesinde yeni araştırmalar ve yeni
teknolojiler ortaya çıkmaktadır. Proje kapsamında kanser aşılarında yenilikçi yaklaşımların etkili bir biçimde
değerlendirilerek mevcut stratejilere uyarlanması neticesinde yeni iş modelleri geliştirilerek odaklanılan hedeflerin
başarımı hedeflenmektedir.
Milli teknoloji hamlesi çağrısının bir getirisi olarak Türkiye’nin teknolojik yetkinliğinin arttırılması ve etki gücü yüksek
projelerin hayata geçirilmesinde oluşturulan destekler sayesinde pek çok atılım yapılmış ve yapılmaya devam
etmektedir. Aynı zamanda bu proje de ülkemizin dışa bağımlılığını azaltarak yeni istihdam olanaklarının açılması için
değerli bir girişimdir.
7. Çağrılı 1501/1507
7
Proje Görseli
Projenizi değerlendiricilere en iyi şekilde yansıtacağını düşündüğünüz en az bir görsel materyal (fotoğraf, teknik resim,
yerleşim resmi ya da taslak çizim, tablo, grafik, devre şeması, sistem mimarisi, kavramsal model diyagramı, akış
diyagramı, vb.) bu kısma yüklenmelidir. (Resim (JPG, JPEG, GIF, PNG), PDF ya da Microsoft Word Belgesi formatında
dokümanlar yükleyebilirsiniz. 1 ek en fazla 5 MB olabilir, eklerinizin toplam boyutu ise en fazla 10 MB olabilir)
Görsel-1
Görsel-2
Görsel-3
...........
Sunum Materyali (Opsiyonel)
Zorunlu olMAmakla birlikte isteyen proje sahibi firmalar/proje yürütücüleri, aşağıdaki sunum seçeneklerinden birini
hazırlayıp Proje Öneri Formuna ekleyebilirler (Bu bölümde sadece kuruluş tanıtımı şekline videolar yüklemeyiniz. Video
klibiniz en fazla 10 MB olabilir. Sisteme yüklenecek videolar “flv” formatında olmalıdır. Farklı formattaki videolarınızı
“flv” formatına Format Factory vb. programlarla dönüştürebilirsiniz. Yüklenecek sunum dosyası boyutu en fazla 5 MB
olabilir):
O Proje Sunumu (MSPowerPoint formatında olmalı, 10 slayt sayfasını geçmemelidir)
O Proje Tanıtım Videosu (flv formatında olmalı, süresi 5 dakikayı geçmemelidir)
O Hiçbiri
8. Çağrılı 1501/1507
8
B. PROJENİN ENDÜSTRİYEL AR-GE İÇERİĞİ, TEKNOLOJİ DÜZEYİ VE YENİLİKÇİ YÖNÜ
B.1 - PROJENİN ÇAĞRI KONUSUYLA İLİŞKİSİ VE HEDEFLERİ
1 - Projenin çağrı konusuyla ilişkisini açıklayınız.
Akciğer, kolorektal ve böbrek kanseri tedavisinde kullanılmak amaçlı yeni nesil mRNA bazlı nanopartikül immünoterapi
ajanı geliştirilmesi projesi kapsamında yapılacak yerli ürünler ve yeni alanların biyonanoteknoloji sektörüne yeni bakış
açıları kazandırması amaçlanmaktadır. Bu kapsamda nanopartiküllerin üzerine yüzey modifikasyonları yapılarak farklı
hastalıklara uygun taşıyıcı nanopartiküllerin geliştirilip biyoteknolojik ilaç sektörüne kazandırılması hedeflenmektedir.
Çalışma getirileri pek çok açıdan önem arz etmektedir. Özellikle kanser tedavisinde mevcut tedavi yöntemlerinin
etkinliğinin yetersiz kalması ve erişilebilirliğinde karşılaşılabilen sorunlar sebebi ile hedef kitleye ulaştırılamaması
neticesinde bireylerin mağduriyetinin önlenmesi ve tedavi olanaklarının daha güvenli, ulaşılabilir ve etkili hale getirilmesi
gerekmektedir.
Biyoteknolojik ilaç sektörü, yeni hastalıkların belirmesi ve bu hastalıklardan müzdarip bireylerin yaşam kalitesinin artması
ve şikayetlerinin azalarak tekrar sağlıklarına kavuşması için gereken yeniliklerin yapılabilmesi açısından oldukça kıymetli
olanaklara sahiptir. Bu proje dahilinde yapılacak çalışmalar ve çıktıları sayesinde büyük oranda dışa bağımlı olduğumuz
biyoteknolojik onkoterapi ürünleri konusunda rekabetçi yeni teknolojilerin ve ürünlerin geliştirilmesi sağlanacaktır.
2 - Projenin genel amacını açıklayınız. Proje ile çözülmesi amaçlanan problemi tanımlayınız.
Kanser tedavisinde hasta sayısının günden güne artması ve halen oldukça sitotoksik bir yöntem olan kemoterapinin en
yaygın yöntem olması tüm dünyadan araştırmacıları bu konuda yeni yöntemler ve ürünler geliştirmeye teşvik etmektedir.
Bu projede öncelikle akciğer, kolorektal ve böbrek kanserleri tedavisinde kullanılmak üzere Biyomühendislik prensipleri
kullanılarak Biyo-uyumlu ve hücre-spesifik yüksek etkinliğe sahip nanoteknoloji temelli immünoterapötik ajan
geliştirilmesi amaçlanmaktadır. Aynı zamanda proje ara ürünlerinin de değerlendirilip farklı çalışmalara ilham olunacağı
beklenmektedir.
3 - Proje amaçlarına ulaşmak için önerilen çözümü açıklayınız.
Hücre zarları, seçici geçirgen özellikleri sayesinde sitozol ve ekstraselüler çevre arasındaki değişimlerin kontrolünde
önemli bir fonksiyona sahiptir. Bu sebepten dolayı plazma membranları pek çok anti-kanser molekülünün iletilmesi
sırasında intraselüler zorluklar çıkarmaktadır. Aktif bileşenlerin taşınımı sırasında lipit tabakanın aşılması sırasında
çoğunlukla özel taşıyıcı sistemler gerekmektedir. Hücre nüfuz proteinleri (CPP) şeklindeki genellikle 5-30 aminoasit
uzunluğundaki özel proteinler, hedef hücrelere plazmit DNA, RNA, oligonükleotidler, lipozomlar ve anti-kanser ilaçların
iletilmesi sağlanabilmektedir (Borrelli, 2017).
Mesajcı RNA (mRNA) sistemler pek çok hastalığı tedavi etmek veya önlemek amacı ile kullanabilecek yeni bir alan
olarak karşımıza çıkmaktadır. In vivo fonksiyonlarının sağlanması amacı ile mRNA ‘nın güvenli, etkili ve stabil teslim
sistemlerinin kullanılması gerekmektedir. Nükleik asidin hücre içerisine alınabilmesi ve içeride degrede olmaması için bu
sistemler hayati önem taşımaktadır. Özellikle lipit nanopartikül-mRNA aşıları COVID-19 pandemisinde oldukça yaygın
olarak araştırılmış ve birbirinden farklı başarılı projeler ortaya çıkmıştır. Biyo-uyumlu olması ve önlenebilir riskleri
sayesinde güvenilirliği de ayrıca desteklenmedir (Hou, 2016).
GM-CSF veya GMCSF, 127 aminoasit içeren nötrofil, eozinofil, monosit ve makrofajların çoğalma ve diferansiasyonunu
sağlayan bir glikoproteindir. GM-CSF organizmada T lenfosit, monosit, fibroblast ve endotel hücrelerinde sentezlenir.
GM-CSF organizmada T lenfosit, monosit, fibroblast ve endotel hücrelerinde sentezlenir. Fizyolojik koşullarda olgun kan
hücrelerinin fonksiyonlarını düzenlemede santral rol oynadığı düşünülmektedir. GM-CSF nötrofillerde “oksidatif burst”
metabolizmasını uyarır, bakteri ve maya hücrelerinin fagositozunu arttırır. ADCC’yi arttırıcı rol oynar. İn vitro GM-
CSF’in nötrofil migrasyonunu inhibe etttiği gösterilmiştir. Nötrofilleri infeksiyon bölgesinde immobilize etmek GM-
CSF’in normal bir fonksiyonu gibi görünmektedir. GM-CSF’in eozinofil sitotoksisitesini de arttırdığı, bazofillerden
histamin açığa çıkmasını uyardığı in vitro olarak gösterilmiştir. Ayrıca mononükleer fagositlerde de “oksidatif burst”
metabolizması, fagositoz ve sitotoksisiteyi arttırmaktadır. Tümör hücrelerini öldürücü etkisi de gösterilmiştir. İn vitro
çalışmalarda monositlerin fungisidal ve ADCC aktivitesinin GM-CSF tarafından stimüle edildiği belirlenmiştir ve
makrofajların protozoaları öldürme etkisi güçlenmiştir (Aktaş, F. 1996).
Kanser immünite döngüsünde immün kontrol noktası (PD1) ve onun ligandı (PDL-1) apoptoz mekanizmasının
başlamasına ve tümör gelişiminin desteklenmesine katkı sağlamaktadır. Anti PDL-1 veya anti PD-1 ajanlar ise bu
etkileşimi engelleyerek T hücrelerin tümör hücrelerini tanıyarak etkisiz kale getirmekle görevlidir. Teorikte
9. Çağrılı 1501/1507
9
uygulanabilirliği desteklenmiş ve çalışmalara konu olmuştur. Ancak PD1/PDL-1 hedeflemesi, pro-tümör aktivitesinin
engellenmesinde tek başına beklenilen ölçüde etkiyi sağlayamamıştır (Lei, 2020). Anti PDL-1 ajanı, GMCSF ile birlikte
viroterapi ajanı içerisinde intratümöral enjeksiyon yöntemi ile kanserli dokuya enjekte edildiğinde ise tümör spesifik T
hücre cevabı için yeniden programlama için hücreye aktarıldıktan sonra koekspresyon şeklinde ifadesi sağlanmış ve yalnız
başına PDL-1 hedeflemesine göre çok daha etkili olduğu belirlenmiştir (Wang, 2020).
P53 proteini immünoterapi için oldukça önemli bir hedeftir, çünkü p53 ‘teki mutasyonlar insan tümörlerinde en çok
karşılaşılan genetik farklılaşmalardır. Bu mutasyonlar çok sayıda işlevsiz p53 ün sentezlenmesine yol açar. Malignant
olmayan tümör dokularında bu tip işlevsel olmayan p53 proteini nispeten daha azdır (Roth, 1996). P53 ‘ün fonksiyon
kaybı, immünosupresyonda rol oynayarak kanserleşmeye katkı sağlamaktadır. Bozulan fonsiyonun düzenlenmesi üzerine
farklı çalışmalar yapılmış ve dikkat çeken sonuçlar elde edilmiştir. Bu çalışmalardan bir tanesinde p53 ve anti PD-1
proteinlerinin birlikte ekspresyonunda, bu fonksiyon kaybının yeniden programlanması ile tümör mikroçevresinin
azaltılması sağlanmıştır (Xiao J. C., 2022).
P53, GM-CSF ve anti PD-1 ‘in birlikte ekspresyonu neticesinde bozulan işlevlerin düzenlenmesi, düzenlenemiyorsa
işaretlenmesi ve immün supresif özelliklerinin inhibisyonu sağlanarak kanser hücrelerinin metastazının durdurularak
programlanmış hücre ölümü başlatılamadığı takdirde, immün sistem hücreleri tarafından algılanabilir ve sindirilebilir hale
getirilebilir olmasını mümkün kılacaktır. Tek bir yöntem ile farklı amaçların aşamalı olarak ulaşabilmesi adına,
prosedürlerin geliştirilebilmesi için çalışma kapsamında geliştirmelerin olmasının muhtemel olduğu bilinmelidir. Çalışma
kapsamında tüm parametrelerin ivedilik ile incelenerek işlevlerini yerine getirmesi sağlanacaktır.
4 - Önerilen çözüm ile ulaşılması planlanan hedefleri açıklayınız.
Projenin hedefleri başlıca şu şekilde sıralanabilir;
Klinik onkolojide sürdürülebilir biyoteknolojik uygulamaların yaygınlaşması.
Onkolojide standart uygulamarın yarattığı yan etkiler ve tedavi oranının düşük olması sebebi ile hastalığa yönelik daha
geniş çaplı tedavilerin geliştirilerek hastaların faydalanabileceği konuma getirilmesi gerekmektedir.
Yan etki ve kemoterapinin sebep olduğu rahatsızlıkların en aza indirgenerek hastaların yaşam kalitesinin
arttırılması.
Bilindiği üzere kemoterapi, kanserli hücrelerle birlikte sağlıklı hücreler için de toksik etkilere sebep olabileceğinden,
etkinliğiyle beraber güvenilirliği de hâlen tartışma konusudur. Bu durumda daha spesifik yöntemlerin araştırılması
gerekmektedir.
Yerli teknolojinin geliştirilmesi ile kanser tedavisinde dışa bağımlılığın azaltılarak arz-talep dengesinin
sağlanması.
Döviz kurunda oluşabilecek dengesizlikler ve lojistik-üretim gibi etmenlerin herhangi bir zincirinde oluşabilecek en ufak
bir aksaklık, tedavisinde zamanla yarışılan bu gibi hastalıklar için oldukça kritik öneme sahip olmaktadır. Dış olanakların
azaltılarak hem sürdürülebilir ve güvenilir yöntemlerin geliştirilerek ulusal bir değer kazanımı hem de projenin sahip
olduşu inovatif yaklaşım ve uyarlanabilirliği sayesinde literatüre önemli sonuçların eklenmesi beklenmektedir.
Üretim faaliyetlerinin artması ve proje çıktılarının ürüne dönüşmesi sonrasında oluşabilecek istihdam
olanakları sayesinde yetenekli bireylere deneyim kazandırılması.
Covid-19 pandemisinin kötü bir sonucu olarak üretimde ve enerjide yaşanılan negative yöndeki gelişmeler, bazı sektörleri
sekteye uğratmış ve küresel ekonomik krizler ortaya çıkmıştır. Ancak biyoteknoloji ve tıp sektöründe pek çok çalışma için
ilham kaynağı olmuş ve olası yeni bir küresel krizin doğru değerlendirilebilmesi açısından farklı perspektifler
kazanılmıştır.
Ayrıca farklı araştırma alanlarının kefşedilerek ihtiyaçlar neticesinde ülkemizin nitelikli bilim insanı ekosistemine katkı
sunulması, aslında kötü durumlardan da iyi dersler çıkarılması olanağını sunmaktadır. Proje çıktılarının ürüne
dönüştürülmesi basamakları için ihtiyaç duyulacak personel istihdamı da sağlanarak nitelikli iş gücü elde edilecektir.
10. Çağrılı 1501/1507
10
Ürünün dönüştürülebilirliği sayesinde yeni uyarlamalar ile farklı sorunlara inovatif yaklaşımlar oluşturulması.
Nanopartikül yüzeyinde bulunan hücre-spesifik biyomoleküllerin, farklı hedef hücrelere göre uygun peptit-ligand
etkileşimlerinin analizi ve partiküllerin taşıdığı ajanların da hedef etkileşime uygun olarak uyarlanması neticesinde farklı
yaklaşımları inceleyebilmek mümkün olacaktır.
5 - Önerilen projenin nihai faydalanıcılarını tanımlayıp bu hedef grubun seçilme nedenlerini gerekçelendiriniz.
Kanser Dünya çapında yaygın görülen bir hastalık olmasının yanı sıra ülkemizde de sağlıksız beslenme, hareketsizlik,
genetik yatkınlık, stres ve sigara kullanımı gibi başlıca etmenler sebebi ile yaygınlaşmaktadır. Dünya sağlık örgütü
(WHO) tarafından yapılan istatistik çalışmalarında 2020 yılında Türkiye ‘de 233.834 kanser vakası bildirilmiş ve bunların
41.264 ‘ünü akciğer kanseri, 21.191 ‘ini kolorektal kanser, 5.125 ‘ini ise böbrek kanseri hastaları oluşturmaktadır. Yani
yaklaşık olarak 233.834 toplam kanser hastasının 67.580 ‘ünü sadece bu 3 kanser türü olduğu düşünüldüğünde aslında
oldukça yüksek bir oranda hastanın tedavi şansının artması söz konusudur.
Yapılan değerlendirmeler sonucunda hem ulusal hem de uluslararası çerçevede düşünüldüğünde akciğer ve kolon
kanserleri aslında tedavi edilmesi zor ve hastalık seyrinin kötü gittiği kanser türleri olarak karşımıza çıkmaktadır. Diğer
sebepler ile birlikte düşünüldüğünde bu kanser türlerinin erken tedavi imkanının kısıtlılığı ve terapi basamaklarının
tarışılması gerektiğinden dolayı pek çok zorluğa yol açmaktadır. Vaka sayısı ve hastalığın seviyesi bir yana, ulaşılabilirliği
konularında inovatif yaklaşımların gerekmesi durumu bizleri bu noktada iş başına çağırmıştır. Çalışmamız kapsamında
akciğer, kolon ve böbrek kanser türleri hedef alınarak, önceliği güvenilir ve etkili bir yaklaşım oluşturma konusunda
yetersiz kalınan tedavi yöntemi geliştirmek olacaktır.
6 - Uygulanacak yöntemleri ve bu yöntemlerin seçilme gerekçelerini detaylı olarak açıklayınız.
İmmün kontrol noktası blokajı (ICB) ile immünoterapi, hepatoselüler karsinomda (HCC) ve kısmen immünosupresif
tümör mikro çevresinin (TME) aracılık ettiği diğer kanserlerde sınırlı faydalar göstermiştir. p53 fonksiyon kaybı
immünosupresyonda bir rol oynayabileceğinden, p53 ekspresyonunu restore etmenin immün TME ve ICB etkinliği
üzerindeki etkileri incelenmiştir. HCC modellerinde p53 ifadesini etkin bir şekilde indüklemek için bir CXCR4 hedefli
mRNA nanopartikül platformu geliştirilmiş ve optimize edilmiştir. P53-null ortotopik ve ektopik fare HCC modellerini
kullanarak, CXCR4-hedefli p53 mRNA nanopartiküllerini anti-PD-1 ajan ile birleştirmenin, immün TME'nin hücresel ve
moleküler bileşenlerinin küresel olarak yeniden programlanmasını etkili bir şekilde indüklediği soucuna ulaşılmıştır. Bu
etki, anti-PD-1 tedavisine veya tek başına terapötik p53 ekspresyonuna kıyasla gelişmiş anti-tümör etkileriyle
sonuçlanmaktadır (Xiao, 2020).
Rekombinant viral proteinlerin sentezi, saflaştırılması ve karakterizasyonu.
Virüs benzeri parçacıklar (VLP) viral yapısal proteinlerin kendi kendine konformasyonel özelliklerinin kazandığı kendi
biçimini oluşturduğu nanoyapılardır. VLP’ ler genetik materyal içermemesinden dolayı replike olamaması ve enfeksiyöz
olmaması avantajlarının yanı sıra virüs partiküllerinin moleküler ve morfolojik olarak neredeyse aynısıdır.
SARS-COV-2-VLP, Coronavirüsün sebep olduğu (COVID-19) pandemisinde aşı materyali olarak oldukça ihtiyaç duyulan
bir bileşen haline gelmiştir. Son çalışmalar gösterdi ki memeli hayvan hücresi ekspresyon sistemlerindeki doğru post-
translasyonel modifikasyonlar sayesinde partikülün self-assembling modelinin oluşturulması ve partikülün işlevsel hale
gelmesi sağlanmaktadır. SARS-CoV-2 yapısal proteinleri (M: membran proteini, E: Küçük zarf proteini) SARS-CoV-2
VLP oluşumu için gereklidir. Self-assembling modeli ile bu proteinlerin Vero E6 ve HEK-293T hücrelerinde ekspresyonu
analiz edildiğinde Vero E6 hücre hattının HEK-293T hücre hattına göre biraz daha stabil olduğu belirlenmiştir. Elde
edilen partiküller, virion a hem morfolojik hem karakteristik olarak benzemektedir. Uygulanabilirliğinin kolaylığı ve
sürdürülebilirliği açısından diğer yöntemlere göre farklı avantajlara sahiptir (Xu, 2020).
Bu çalışma kapsamında da her bir viral protein için ayrı ayrı Vero E6 hücre hattı ile ekspresyon yapılacaktır. Literatürde
desteklendiği üzere post-translasyonel modifikasyonlar ve sahip olduğu insan biyolojisine göre uyumluluk özelliği
açısından oldukça elverişli bir üretim imkânı sunacağı öngörülmektedir.
11. Çağrılı 1501/1507
11
mRNA içeren nanopartikül geliştirilmesi
mRNA, viral aşılar, protein ikmal terapisi, kanser immünoterapisi, hücresel yeniden programlama ve genom düzenleme
gibi geniş uygulama alanı sayesinde büyük bir terapötik potansiyele sahiptir. Terapötik etkileri başarmak adına mRNA
molekülleri ilgili ve yeterli proteinleri ifade etmek adına belirli bir hücreyi hedeflemelidir. Ancak endozomal kaçış ve
hedefli teslim konusu mRNA taşıyıcı sistemleri için halen bir zorluk olarak karşımıza çıkmaktadır. mRNA taşıyıcı
sistemler üzerinde bu konular hakkında daha noktanın çözümlenmesi gerekmektedir.
Partiküllerin yapı analizi
Mikroskopik teknikler;
Mikroskopik teknikler optik, elektron ve taramalı prob mikroskobu yöntemlerini içerir. Taramalı yakın alan optik
mikroskopi (SNOM); NP’lerin boyutları optik mikroskopi algılama limitinin altında olduğundan, NP agregatlarını
görüntülemek için 50 ila 100 nm arasında çözünürlüğe sahip SNOM modifiye görüntüleme tekniği kullanılabilir (AD,
2000). Atomik kuvvet mikroskopisi (AFM) Taramalı elektron mikroskobu (SEM) ve geçirimli elektron mikroskopisi
(TEM) kullanılarak NP’ler sadece görselleştirilemez, aynı zamanda agregasyon, dağılma, emilim, boyut, yapı ve şekil
durumu gibi özelliklerde gözlemlenebilir (Palchoudhury, 2015). Konfokal mikroskopi/Konfokal lazer tarama mikroskobu
(CLSM); floresan numuneleri algılayabilmesi ve kalın örnekleri görüntüleyebilmesinden dolayı kolloid numunelerin
karakterize edilmesinde kullanılabilir. NP’ler için alt nanometre mekansal çözünürlükte görüntüler ile kimyasal veriler de
sağlayabilir. Atomik kuvvet mikroskobu (AFM) kullanılarak NP’leri tamamen sıvı halde görüntülemek mümkündür.
AFM, taramalı prob mikroskopları (SPM) ailesine aittir (Balnois, 2007).
Kromatografik yöntemler;
Boyut dışlama kromatografisi (SEC); bu en yaygın uygulanan kromatografik yöntem olup voltametrik gibi saptama
teknikleriyle birlikte kullanılır. Alan akış fraksiyonasyonu (FFF); Kompleks doğal numunelerde NP’lerin boyut ayrımı
için son derece umut verici bir tekniktir NP’leri yalnızca hidrodinamik kuvvetlere dayanan sabit faz olmadan ayırır (]
Hassellov, 2008). Hidrodinamik kromatografi (HDC); farklı ortamlarda geniş partikül boyutu ayırım aralığı ile çeşitli
NP’lerin boyutlandırılmasını sağlar. Bununla birlikte HDC, agrega oluşumunun daha iyi anlaşılmasına yardımcı olmakta
özellikle yararlıdır. Kapiler elektroforez (CE) dir. Bu yöntemler oldukça hassas olup numunelerin daha sonraki analizlerde
kullanılmasını sağlar (Detection and Characterization of Engineered Nanoparticles in Food and the Environment, 2008).
Spektroskopik yöntemler;
Dinamik ışık saçılımı metodu (DLS); NP boyutlandırılması ve süspansiyonlarda agregasyonunun belirlenmesi için
kullanılan en yaygın yöntemdir.
Foton korelasyon spektroskopisi (PCS); DLS de olduğu gibi özellikle NP’lerin boyutlandırılması ve süspansiyonlardaki
agregasyon durumlarının saptanması için yararlıdır.
Kütle spektrometresi; bir iyon kaynağı, bir kütle analizörü ve bir dedektör sisteminden oluşur ve ESI ve MALDI
tekniklerini içerir (DAĞLIOĞLU, 2018).
Santrifüjleme ve filtrasyon teknikleri;
Bu yöntemler, düşük maliyetli, yüksek hızlı ve yüksek hacimli teknikler olup numunelerin hazırlanması ve boyut
fraksiyonlamasında uygun yöntemdir.
Ultra santrifüjleme (UC); 1,000,000 g’a kadar hızlanma için çok yüksek eğirme hızlarına sahip bir santrifüj sistemidir.
Analitik ve hazırlayıcı UC olmak üzere İki farklı ultra-santrifüj tipi vardır.
Analitik ultra santrifüj (ANUC); numune ultraviyole ışık emilimi ve/veya optik refraktif indeks hassas sistemleri
kullanılarak bir optik algılama sistemi vasıtasıyla gerçek zamanlı olarak izlenebilir. Hazırlayıcı ultra santrifüj; ince
tanecikli fraksiyonların peletlenmesi, gradyan ayırma işlemleri ve TEM ve AFM substratlarında sudaki kolloidleri ve
NP’lerin agregasyonu için kullanılmıştır (Lead, 2006).
Çapraz akışlı filtrasyon (CFF) veya tanjant filtrasyon; numuneleri tekrar sirküle eder ve bu sayede, tıkanıklığı,
konsantrasyon polarizasyonunu ve geleneksel sonda filtrelemenin neden olduğu diğer artefaktları azaltır.
12. Çağrılı 1501/1507
12
Yüzey Yük Ölçümleri;
Kolloidal NP’ler sulu solüsyonlarda yüzey yüklerini artırır. Net yüzey yükü veya yüzey potansiyeli en önemli NP
özelliklerinden biridir. NP dispersiyonunun partiküller arası itme ile ne derece elektrostatik olarak stabilize edildiğini
açıklar. Sonuç olarak, NP yüzey potansiyelinin akıbeti ve davranışları üzerinde yüzey yükünün büyük etkisi olur.
Bununla birlikte, yüzey potansiyelini doğrudan ölçmek kolay değildir, ancak elektroforez ile ölçülen partiküllerin
elektrostatik çift katmandaki bir hidrodinamik kayma düzlemindeki potansiyeli olan zeta potansiyeli ölçen basit bir
yöntem bulunmaktadır. Ölçülen elektroforetik hareketlilik Smoluchowski teorileri ile Z potansiyeline dönüştürülebilir.
Sıfır yük noktası (SYN) negatif ve pozitif yüklerin dengelendiği pH’dır, bu nedenle NP’lerin üzerinde net bir yük yoktur.
SYN’de, genellikle çekici van der waals kuvvetlerinin (bağlarının) harekete geçebilmesi için partiküllerin yakın temas
etmesi sağlanıldığından dolayı maksimum agregasyon gerçekleşir (Dağlıoğlu, 2018).
Kütle Yoğunluğunun Ölçümü;
Kütle, NP ’lerin geleneksel ve en sık ölçülen konsantrasyon metriğidir. NP numunelerinin toplam kütle
konsantrasyonlarını ölçmek için günümüzde çeşitli analitik teknikler ve metodolojiler mevcuttur. En yaygın olanları ICP-
MS, AAS, UV-vis spektroskopisi ve kuvartz kristal mikro dengesidir. Atomik absorpsiyon spektroskopisi (AAS);
potansiyel olarak doğal organik madde (DOM) veya ağır yüzey aktif madde kapsama alanındaki kütle konsantrasyonlarını
belirlemek için kullanışlı analitik yöntemdir (Hartmann, 2013).
Nanopartikül yüzeylerinin self-assembling yöntemi ile viral proteinler ile kaplanması sonucu virüs benzeri
nanopartikül taşıyıcı parçacık oluşturulması ve karakterizasyonu
In-Vitro ortamda self-assembling yöntemi ile viral kapsit proteinlerinin nanopartikül yüzeyinde bir araya getirilerek viral
proteinler ile enkapsüle edilmiş nanopartikülün oluşturulması çalışması bu projenin inovatif yaklaşımlarından sadece
biridir. Bu yöntem ile hücresel immün yanıtın başlatılması için gerekli indükleme işleminin başarımının sağlanması
düşünülmektedir.
Kanser hücre hatlarının hazırlanması
Hücre kültürü, çok hücreli organizmalara ait hücrelerin, laboratuvar ortamında özel olarak tasarlanmış kaplarda, ısı, nem,
besin gibi ortam şartlarının kontrol edilerek kontaminasyondan ayrı bir şekilde yaşatılmasıdır. İnsan da dâhil olmak üzere
herhangi bir canlıdan alınan hücrelerin suni ortamda yaşatılabilmesi, herhangi bir doku ya da organdan alınan hücrelerin
kullanılabilmesi ve birçok etik kaygıyı gidermesi, hücre kültürü çalışmalarının tercih sebepleri arasında yer almaktadır
(Zucco F, 1998).
Çalışma kapsamında Kolon kanser hücre hattı, Akciğer kanser hücre hattı ve Böbrek kanser hücre hattı temin edilerek
kullanılacaktır.
Aktif bileşenin anti proliferatif ve anti migratif özelliklerinin belirlenmesi
Akciğer, Kolon ve Böbrek kanser hücre hatları ile hazırlanan kültürlerde pipet ucu veya bisturi yardımı ile kesikler atılıp
aktif bileşen ile muamelesi sonucu yara iyileşme analizi ile kanser hücrelerinin proliferasyonu ve migrasyonu analiz
edilmesi prosesine dayanmaktadır.
RNA ekstraksiyon, cDNA sentezi ve Q-PCR analizleri gibi yöntemler ile Bax, Bcl-2 ve p53 gibi tümörle ilişkili
belirteçlerin tayini yapılarak istatistiksel olarak negatif kontrole göre değerlendirmesi yapılarak aktif bileşenin etkinliğinin
ölçümü gerçekleştirilmektedir.
Sitotoksisite analizleri
Sitotoksik terimi, hücre ölümüne neden olan anlamına gelmektedir. Sitotoksisite araştırmaları, bir maddenin sitotoksik
potansiyelinin olup olmadığının belirlenmesi amacıyla yapılır. Hücre temelli sitotoksisite çalışmaları gerek uygulama
kolaylığı, gerekse in vivo çalışmalardan elde edilen verilerle uyum göstermesi nedeniyle, hayvan deneylerine alternatif
olarak doğmuş ve toksikoloji laboratuvarlarında sıkça tercih edilir hale gelmiştir (Riss TL, 2006). Sitotoksisite, incelenen
maddenin dozuna ve maruziyet süresine bağlı olarak hücrelere değişik derecelerde zarar veren bir olaydır. Hücreler,
sitotoksik maddeye maruz kalırsa apoptoz, otofaji ve nekroz gibi olaylar sonucu ölebilir ya da sitostazis nedeniyle
proliferasyon özelliklerini kaybedebilirler (Galluzzi L, 2009). Hücre bazlı sitotoksisite çalışmaları ile test edilen maddenin
sitostatik ve sitotoksik etkileri hakkında temel bilgi edinilir (Riss TL M. R., 2004). Deneysel olarak kimyasal, biyolojik ya
da fiziksel etkenlere maruz bırakılan hücrelerin, maruziyet sonrasındaki canlılıklarının belirlenmesi, bu çalışmaların
13. Çağrılı 1501/1507
13
önemli bir basamağıdır (Niles AL, 2007).
Hücre canlılığının belirlenmesi için uygulanan çok sayıda test vardır. Yapılan sitotoksisite çalışmasının tipi ne olursa
olsun, önemli olan çalışma sonundaki canlı/ölü hücre miktarının belirlenmesidir (Riss TL M. R., 2004). Sitotoksisite
belirleme metodları genel olarak kolorimetrik, lüminesans ve enzimatik yöntemlerdir (Crouch SPM, 1993).
Kolorimetrik metodlarda, 3-(4,5-dimetiltiyazol2-yl)-2,5-difeniltetrazolyum-bromür (MTT), 3-(4,5- dimetiltiyazol-2-yl)-5-
(3-karboksimetoksifenil)-2-(4- sülfofenil)-2H-tetrazolyum (MTS), 2,3-bis-(2- metoksi-4-nitro-5-sülfofenil)-2H-
tetrazolyum-5- karboksianilid (XTT), 2-(4-iodofenil)-3-(4-nitrofenil)- 5-(2,4-disülfofenil)-2H-tetrazolyum (WST) gibi
tetrazolyum tuzları kullanılarak renk değişikliği ya da kristal viyolet, nötral kırmızısı gibi boya maddeleri kullanılarak
hücrelerin spesifik boyanması esasına dayalı ölçüm yapılır (Borenfreund E, 1985). Luminometrik metodlar, floresans ve
biyolüminesans olarak ikiye ayrılmaktadır. Floresans metodlarda, floresans özellikteki maddeler kullanılırken,
biyolüminesans metodlarda lusiferaz denilen özel enzimler ve bunların substratlarının kullanımı ile canlı/ölü hücre tespiti
yapılması söz konusudur (TOKUR, 2017). Daha gelişmiş biyolüminesans metodlarda (gerçek zamanlı biyolüminesans),
hücrelerin sitotoksik madde ile maruziyeti, sadece testin yapıldığı anda değil, maruziyet süresince incelenebilir hale
gelmiştir (Duellman SJ, 2015). Hücre hasarını ya da ölümünü takiben vasata sızan enzimler de ölü hücre sayısının belirteci
olarak ele alınmıştır. Bu enzimler içerisinde stabilitesi ile öne çıkan laktat dehidrojenaz (LDH), hücre ölümü belirteci
olarak canlılık testleri arasındaki yerini almıştır (Korzeniewski C, 1983).
7 - Çağrı metninde yer alan öncelikli alanlar bağlantısı inceleyerek projenizin bu alanlarda bulunan "Öncelikli Ar-Ge ve
Yenilik Konuları"na yönelik geliştirip geliştirilmediğini belirtiniz. (Öncelikli Ürün ve Teknolojiler başlıklarında yer alan
açıklamaları ve Teknoloji Hazırlık Seviyesi (THS) dikkate alınması önerilmektedir.)
√ Evet
O Hayır
Öncelikli Alan Gerekçesi: Yurtdışına bağımlı olunan teknolojilerde rekabetçi yerli teknolojilerin kazanılması.
14. Çağrılı 1501/1507
14
B.2 PROJENİN TEKNOLOJİ DÜZEYİ
Tekniğin/Teknolojinin Bilinen Güncel Durumu (“State-of-the-Art”)
Proje konusu ile ilgili ulusal/uluslararası mevcut düzeyi açıklayınız. (En fazla 3.000 karakter)
Kanser araştırmalarında her gün yeni gelişmeler olsa da henüz tüm kanser tiplerine uygun etkili ve güvenilir bir tedavi
yöntemi bulunmamaktadır. Bu bağlamda hastalığın sebep olduğu hasarın giderilmesi ve ilerlemesinin önlenmesi konuları
halen mutlak bir çözüme kavuşamamıştır. Ancak modern teknolojinin güzel getirilerinden biri olan elektronik cihazlar ve
yüksek hızlı bilgisayarlar sayesinde pek çok işlem oldukça hızlı bir şekilde gerçekleştirilebilmektedir. Aynı zamanda
oluşan bilgi birikimi ve yetişmiş nitelikli bilim insanları gibi etmenler ile umut veren gelişmeler olmaktadır. Dünyanın her
yerinden farklı bilim insanları hâlen yeni yöntemler ve yeni araçlar kullanarak ölümcül bir hastalık olan kanserin tedavisi
üzerinde çalışmalar yapmaktadır. Yaşam bilimleri ve Tıp biliminin ortak paydada buluşturulması neticesinde farklı
prensipler de ortaya çıkmaktadır. Bu prensipler bugün kanser de dahil olmak üzere pek çok problem için çözümler üretmek
üzere çalışmaktadır.
Nanotıp, köken olarak malzeme biliminin tıp bilimi ile birleşerek henüz tedavisi olmayan hastalıklara çözümler üretilmesi
gereğinden yola çıkarak ortak bilgi birikiminin değerlendirilerek ürüne dönüştürülmesini kapsayan bir bilim dalıdır.
Modern teknoloji olanakları kullanılarak oluşturulan terapötik yaklaşımlara her gün yenisi eklenirken, çözülmesi gereken
başka durumlar da ortaya çıkmaktadır.
Bu sorunların üstesinden gelebilmek adına, gerçekleştirilmiş başarılı projelerden ilham alınarak personelin mesleki beceri
ve bilgi birikimi de eklenerek hastalıklara farklı hastalıklarla olan ilişkisi ve çok disiplinli çalışmaların yapılması
hedeflenen bu proje kapsamında pek çok yenilikçi yaklaşım ve yöntem kurgulanacaktır. mRNA teknolojisi, özellikle
pandemideki başarısı ve klinik araştırmalardaki üzerine çektiği dikkat ile yeni çalışma ve ürünler için kilit taşı haline
gelmiştir. mRNA teknolojisinin nanoteknoloji ile birlikte kullanıldığı farklı ürünler ve farklı araştırmalar gün yüzüne
çıkmaya devam etmektedir. Ülkemiz için de kaçırılmaması elzem bir fırsat olarak değerlendirilmesi gereken yeni nesil
biyoteknolojik ilaç sektöründe yapılacak olan atılımların küresel ölçekte de ihtiyaç olduğu göz önünde bulundurulduğunda,
ortaya çıkan talep göz ardı edilemez seviyeye gelmektedir. Milli teknoloji hamlesi ve 11. Kalkınma planı kapsamına alınan
bu ihtiyaç, bugün dikkat çeken bir seviyededir.
Mevcut teknolojik yeterlilik ve geniş literatür taraması sonrasında elde edilen bulgular detaylıca analiz edilmiş ve farklı
çıkarımlarda bulunulmuştur. Kullanılacak materyal ve yöntem kullanılarak benzer çalışmalardan elde edilmiş başarılar,
teknolojinin güncel başarı oranını destekler niteliktedir. Farklı çalışmalardan esinlenilerek biyomühendislik prensipleri
kullanılarak oluşturulan ve bilimsel literatürle desteklenerek oluşturulan bu proje kapsamında farklı informatik araştırma
sonuçları elde edilmiştir. Bu sonuçları takiben sektörün ihtiyaç duyduğu yüksek etkinlikliğe sahip ileri teknoloji ürünlerin,
yurtiçi ve yurtdışı pazara sunularak immünoterapötik sektöründe dışa bağımlılığın azaltılması hedeflenmektedir.
Geliştirilen teknoloji düzeyinin ve ürünlerin, muadilleri ile rekabet edebilecek kalitede olması ve literatüre büyük katkı
sunması olası bir başarım olarak dikkat çekmelidir.
Proje Faaliyetlerinin Kapsadığı Teknik ve Teknolojiler ile Özgün Katkılar
Projede özellikle tasarım/geliştirme süreçlerinde geliştirilecek ya da kullanılacak teknik ve teknolojileri aşağıdaki tabloda
listeleyiniz. Projenin teknik/teknolojik içeriğine kuruluşunuzun özgün katkılarını ve kuruluşunuz dışından destek alınacak
uzmanlık konularını da belirtiniz:
Teknik /
teknolojinin
adı/tanımı
Kullanılacak /
Geliştirilecek
Projede niçin
ihtiyaç
duyulduğu
Projenin hangi
aşamasını
ilgilendirdiği (iş
paketi)
Çalışmayı
yürütecek proje
personelleri
Kuruluş dışından
danışmanlık /
hizmet alınacak
kişi ya da
kuruluşlar
“... analizi”
“Yeni ...üretim
tekniği”
“... testleri”
Teknik/Teknolojik Belirsizlik ve Zorluklar
Kuruluşunuzun mevcut bilgi birikimini ve geçmiş projelerden elde ettiği yeteneklerini dikkate alarak, önerilen projenin
geliştirilmesi sırasında deneyim sahibi olmadığınız, ilk kez karşılaşacağınız, üstesinden gelmeniz gereken teknik/teknolojik
15. Çağrılı 1501/1507
15
belirsizlikleri ve zorlukları açıklayınız. (En fazla 3000 karakter)
Teknik çalışmalar detaylıca araştırılarak metodolojik altyapı analizi sonucunda yöntemin uygulanabilirliği noktasında
olumlu sonuçlara ulaşılmıştır. Referans alınan noktaların güvenilirliği ve destekleyici bilgileri, bu bağlamda biz
çalışmacılar için tatmin edici olmuştur. Gelişmiş teknoloji kullanılarak mevcut problemlere karşı olan yenilikçi çözüm
yaklaşımları deneysel olarak değerlendirilecektir. Olası bir tedarik aksaklığını önlemek adına ön market ve stok araştırması
yapılacaktır. Yükselen kur farkı gibi ekonomik zorlukları aşabilmek adına önceliğimiz mümkün olduğu kadar yerli üretim
ürünleri tercih etmek olacaktır.
Çalışma neticesinde referans ürünlere göre istatistiksel olarak anlamlı bir üstünlük göstermediği taktirde iyileştirme
çalışmaları ve oransal revizyonlar değerlendirilecektir. Dozaj, sentez koşulları, yapı kararlılığını etkileyen etmenler gibi pek
çok parametrenin aktif bir şekilde etkileyeceği bu gibi çalışmalarda, beklenilen etkinin görülmesi için farklı oranlarda
örneklerin paralel olarak üretilmesi ve çalışılması gerekebilmektedir. Bu gibi prosedürler için yeteri kadar materyal tedariği
bulundurulacak ve kaynaklar verimli bir şekilde kullanılacaktır. Çalışmanın kontrolü açısından örnekler uzun süre
muhafaza edilebilecek şekilde optimize edilecek, her basamağa ait numuneler, karakteristik özelliklerini kaybetmeyeceği
şekilde saklanacaktır. Olası bir işlev kaybı görülebilecek durumlara karşın, saklanan numuneler tekrar analiz edilecek ve
prosesler GLP şartları altında devam ettirilecektir.
Sürdürülebilirlik ilkesi gereğince en az prototip oluşturulması tamamlanana kadar yeterli miktarda ürün aynı kalitede
üretilebilecek kadar sarf bulundurulması gerekmektedir. Bu durumu sağlayabilmek adına sarf tüketimine uygun sipariş
miktarı oluşturulmuştur.
mRNA bazlı biyonanopartikül konusunda hâlen bazı noktaların geliştirilmesi/iyileştirilmesi gerekebilmektedir. Diğer
çalışma alanlarına nazaran daha yeni bir konu olan bu nanotıp dalı, dikate değer farklılıklar ve avantajları da beraberinde
getirmektedir.
16. Çağrılı 1501/1507
16
B.3 PROJENIN SOMUT / ÖLÇÜLEBILIR HEDEFLERLE TANITIMI VE ÇÖZÜM YAKLAŞIMLARI (AR-GE
SISTEMATIĞI)
Proje Hedefleri
Projenin hedeflenen çıktılarını tanımlayan, en önemli (en fazla 5 adet) somut ve ölçülebilir başarı ölçütlerini (kapasite,
fiziksel boyut, çalışma koşulları, hız, çeşitli performans değerleri, vb.) aşağıdaki tabloda belirtiniz.
Başarı ölçütü Hedeflenen değer
Viral kapsit proteinlerinin rekombinant olarak çözülebilir ve saflaştırılabilir formda
eldesi.
En az %95 saflık oranında,
endotoksin içermeyen, steril
proteinler.
mRNA dizisinin, kimerik nanopartikül içerisinde stabilitesinin sağlanarak
enkapsülasyonu.
Yap karakterizasyonu analizleri
ile bütünlüğün korunması
incelenecektir.
Nanopartikül yüzeyinin viral kapsit proteinleri ile kaplanarak VLP-Nanopartikül
yapısının işlevsel bir şekilde oluşturulması.
Tüm bileşenlerin aktivite
göstermesi ve herhangi bir
bileşenin diğerinin inhibisyonuna
sebep olamaması.
Hedeflendiği kanser hücrelerinde in-vitro ve in-vivo olarak anti-metastatik, anti-
proliferatif özelliklerin incelenmesi, etkinliğin verimlilik çalışmaları.
Kemoterapi ajanları ile
karşılaştırılarak terapi çıktılarının
tayin edilmesi sonucu kayda
değer bir verimlilik elde edilmesi.
Proje Hazırlık Çalışmaları
Proje konusuna ilişkin literatür ve patent araştırmaları, teknik fizibilite çalışmaları ve takip edilecek standart / şartnamelerle
ilgili proje başvurusu öncesinde edinilen bilgileri, aşağıdaki tablo ve alanlarda belirtiniz.
Projeye katkı sağlayacak –varsa- literatür araştırması sonuçları:
Yayın adı Tarihi Yazar(lar) Projeye girdi oluşturacak özet bilgi:
Hematopoetik Büyüme Faktörleri ve
İnfeksiyon Hastalıklarında Kullanımı. 1996 Aktaş, F.
GM-CSF ve kanser ilgisi.
The Global Use of Medicines 2022: Outlook
to 2026. 2022 Anonim.
2026 yılında olabilecek ilaç pazarı ve
kanser ilaçlarının pazarı.
Cell Penetrating Peptides as Molecular
Carriers for Anti-Cancer Agents. 2017
Borrelli, A.,
Tornesello, A.
L., Tornesello,
M. L. ve
Buonaguro, F.
M.
Hücre nüfuzu için kullanılan CPP (Cell
penetration peptides) kullanılarak anti-
kanser ajanların taşınması.
Force Microscopy and Force Measurements
of Environmental Colloids. 2007
Balnois, E.,
Papastavrou, G.
ve Wilkinson,
K.J.
Kuvvet mikroskopları kullanılarak
nanopartiküllerin konformasyonel
yapılarının analizi.
Toxicity determined in vitro by
morphological alterations and neutral red
absorption. 1985
Borenfreund E.
ve Puerner JA.
Hücre canlılığının kolorimetrik yöntemler
ile analizi, sitotoksisite testleri.
Cancer Facts and Statistics,
https://www.cancer.org/research/cancer-
facts-statistics.html
Erişim
tarihi:
11.04.2022 Anonim.
Global kanser istatistikleri.
The use of ATP bioluminescence as a
measure of cell proliferation and
cytotoxicity. 1993
Crouch, S. P.,
Kozlowski, R.,
Slater, K. J. ve
Fletcher, J.
Yaygın sitotoksisite testleri.
Detection and characterization of
engineered nanoparticles in food and the
environment. 2008
Tiede, K.,
Boxall, A. B. A.,
Tear, S. P.,
Nanopartiküllerin boyutsal olarak analizi
ve saflaştırılması.
17. Çağrılı 1501/1507
17
Lewis, J., David,
H. ve Hassellov,
M.
Bioluminescent, nonlytic, real-time cell
viability assay and use in inhibitor screening. 2015
Duellman, S. J.,
Zhou, W.,
Meisenheimer,
P., Vidugiris, G.,
Cali, J. J.,
Gautam, P.,
Wennerberg, K.
ve Vidugiriene,
J.
Biyolimünesans yöntemler ile sitotoksisite
testleri.
Guidelines for the use and interpretation of
assays for monitoring cell death in higher
eukaryotes. 2009
Galluzzi, L,
Aaronson, S. A.,
Abrams, J.,
Alnemri, E. S.,
Andrews, D. W.,
Baehrecke, E.
H., Bazan, N.
G.,
Blagosklonny,
M. V.,
Blomgren, K.,
Borner, C.,
Bredesen, D. E.,
Brenner, C.,
Castedo M.,
Cidlowski, J. A.,
Ciechanover,
A., Cohen, G.
M., Laurenzi, V.
D., Maria, R. D.
E., Deshmukh,
M., Dynlacht, B.
D., El-Deiry, W.
S., Flavell, R. A.,
Fulda, S.,
Garrido, C.,
Golstein, P.,
Gougeon, M. L.,
Green, D. R.,
Gronemeyer,
H., Hajnóczky,
G., Hardwick, J.
M., Hengartner,
M. O., Ichijo, H.,
Jäättelä, M.,
Kepp, O.,
Kimchi, A.,
Klionsky, D. J.,
Knight, R. A.,
Programlanmış hücre ölümlerinin ve
sitotoksisite analizlerinin görüntülenmesi.
18. Çağrılı 1501/1507
18
Kornbluth, S.,
Kumar, S.,
Levine, B.,
Lipton, S. A.,
Lugli, E.,
Madeo, F.,
Malomi, M.,
Marine, J. C.,
Martin, S. J.,
Medema, J. P.,
Mehlen, P.,
Melino, G.,
Moll, U. M.,
Morselli, E.,
Nagata, S.,
Nicholson, D.
W.,Nicotera, P.,
G Nuñez, Oren,
M., Penninger,
J., Pervaiz, S.,
Peter, M. E.,
Piacentini, M.,
Prehn, J. H. M.,
Puthalakath, H.,
Rabinovich,
G.A., Rizzuto,
R., Rodrigues,
C. M. P.,
Rubinsztein, D.
C., Rudel, T.,
Scorrano,
L.,Simon, H. U.,
Steller, H.,
Tschopp, J.,
Tsujimoto, Y.,
Vandenabeele,
P., Vitale, I.,
Vousden, K H.,
Youle, R. J.,
Yuan, J.,
Zhivotovsky, B.
ve Kroemer, G.
An engineered oncolytic virus expressing PD-
L1 inhibitors activates tumor neoantigen-
specific T cell responses. 2020
Wang, G., Kang
X., Chen K. S.,
Jehng, T., Jones
L., Chen, J.,
Huang X. F. ve
Chen, S. Y.
Ant PD-L1 ‘in yalnız kullanımına göre
GMCSF ile birlikte kullanımı daha etkili
olmuştur.
Species Selective Preconcentration And
Quantification Of Gold Nanoparticles Using
Cloud Point Extraction And Electrothermal 2013
Hartmann G. ve
Schuster M.
Nanopartiküllerin kütlesel yoğunluğunun
hesaplanması.
19. Çağrılı 1501/1507
19
Atomic Absorption Spectrometry.
Nanoparticle Analysis and Characterization
Methodologies in Environmental Risk
Assessment of Engineered Nanoparticles. 2008
Hassellöv, M.,
Readman, W. J.,
James F.
Ranville, J. F. ve
Tiede, K.
Nanopartiküllerin yük analizleri ve
karakterizasyonları.
Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN 2021
Sung, H., Ferlay,
J., Siegel, R. L.,
Laversanne, M.,
Soerjomataram,
I., Jemal, A. ve
Bray, F.
Dünya sağlık örgütü (WHO) tarafından
gerçekleştirilmiş küresel kanser
istatistikleri.
p53 as a target for cancer vaccines:
Recombinant canarypox virus vectors
expressing p53 protect mice against lethal
tumor cell challenge. 1996
Roth, J.,
Dittmer, D.,
Rea, D.,
Tartaglia, J.,
Paoletti, E.,
Arnold ve
Levine, J.
P53 proteini hedeflemesinin önemi, ve
kanser ile ilişkisinin incelenmesi.
An enzyme-release assay for natural
cyotoxicity. 1983
Korzeniewski,
C. ve
Callewaert, D.
M.
Belirli enzimlerin analizi ile hücresel
canlılığın belirlenmesi.
Aquatic Colloids And Nanoparticles: Current
Knowledge And Future Trends. 2006
Lead, J.R ve
Wilkinson, K. J.
Nanopartiküllerin santrifügasyon
yöntemleri ile agregasyonları.
A homogeneous assay to measure live and
dead cells in the same sample by detecting
different protease markers. 2007
Niles, A. L.
Moravec, R. A.,
Hesselberth, P.
E., Scurria, M.
A., Daily, W. J.
ve Riss, T. L.
Farklı etmenlere maruz bırakılan
hücrelerin canlılık analizleri.
Overview of methods for analysing single
ultrafine particles. 2000 Maynard, A. D.
Nanopartiküllerin mikroskobik teknikler
ile karakterizasyonu.
In Vitro Sitotoksisite Testleri. 2017
Tokur, O. ve
Aksoy, A.
Farklı in-vitro sitotoksisite test yöntemleri
ile etken madde etkinliklerinin ölçülmesi
kıyaslaması.
Methods for Measuring Concentration
(Mass, Surface Area And Number) of
Nanoparticles). 2015
Palchoudhury,
S.,
Baalousha,M.
ve Lead., J. R.
Farklı nanopartiküllerin mikroskobik
olarak incelenmesi.
Resistance Mechanisms of Anti-PD1/PDL1
Therapy in Solid Tumors. 2020
Lei, Q., Wang,
D., Sun, K.,
Wang, L. ve
Zhang, Y.
Bazı kanser türlerinin Anti-PD1/PD-L1
direnciyle ilgili incelemeler.
Use of multiple assay endpoints to
investigate the effects of incubation time,
dose of toxin, and plating density in cell-
based cytotoxicity assays. 2004
Riss, T. L. ve
Moravec, R. A.
Sitotoksisite konusunda ek bilgiler.
Homogeneous multiwell assays for
measuring cell viability, cytotoxicity, and
apoptosis. 2006
Riss, T. L. ve
Moravec, R. A.,
O’Brien, M. A.,
Sitotoksisite testlerinde hücre
kültürlerinin kullanılmasının önemi.
20. Çağrılı 1501/1507
20
Hawkins, E. M.
ve Niles, A.
Construction of SARS-CoV-2 Virus-Like
Particles by Mammalian Expression System. 2020
Xu, R., Shi, M.,
Li, J., Song, P.
ve Li, N.
VERO-E6 ve HEK-293T hücre hatlarında
Sars-Cov-2 virüsünün zarf proteinleri
kullanılarak VLP üretimi.
mRNA vaccine delivery using lipid
nanoparticles. 2016
Reichmuth, A.
M., Oberli, M.
A., Jaklenec, A.,
Langer, R. ve
Blankschtein, D.
Nanopartikül Karakterizasyon Yöntemleri ve
Ekotoksisite Deneylerindeki Önemi. 2018
Dağlıoğlu, Y. Ve
Yılmaz, H. Ö.
Nanopartiküllerin karakteristik ve yapısal
özelliklerinin belirlenmesinde kullanılan
yöntemler.
Combining p53 mRNA nanotherapy with
immune checkpoint blockade reprograms
the immune microenvironment for effective
cancer therapy. 2022
Xiao, Y., Chen,
J., Zhou, H.,
Zeng, X., Ruan,
Z., Pu, Z., Jiang,
X., Matsui, A.,
Zhu, L.,
Amoozgar, Z.,
Chen, D. S.,
Han, X., Duda,
D. G. ve Shi, J.
mRNA teknolojisi kullanılarak kanser
kalkanı olarak bilinen p53 ‘ün immün
kontrol noktası görevinin kanserli
hücrelerde yeniden aktive edilerek tümör
mikroçevresinin düzenlenmesi.
Cellular Models for In Vitro Toxicity Testing. 1998
Zucco, D.,
Angelis, I. D. ve
Stammati, A.
Hücre hatlarının toksisite testlerinde
kullanılması.
Proje konusu ile ilişkili –varsa- patent / faydalı model araştırması sonuçları:
Patent
numarası
Kayıtlı olduğu patent
ofisi (TPE, EPO,
USPTO, JPO...vb)
Yılı (başvuru
aşamasında ise
başvuru yılı)
Patent /
başvuru
sahipleri
Projeye girdi oluşturacak özet bilgi
Teknik ön fizibilite çalışmalarının –yapıldı ise- özet bulguları: (En fazla 1500 karakter)
1.
2.
3.
Proje çıktısına ilişkin takip edilecek standartlar / şartnameler: (En fazla 1500 karakter)
1.
2.
3.
Ar-Ge Sürecinde Kullanılacak Yöntemler
Yukarıda tanımlanan proje hedeflerine ulaşmak için uygulanacak analitik / deneysel çözüm yöntemlerini belirtiniz. (NOT:
Bu bölümde sunulan proje özelinde hangi teknik / bilimsel yaklaşımların ve bunlara ait aşamaların takip edileceği
açıklanmalı, iş paketleri isimleri ya da her projede olabilecek standart / rutin çalışma yöntemleri tekrarlanmamalıdır.) (En
fazla 3000 karakter)
Biyoinformatik
21. Çağrılı 1501/1507
21
NCBI veritabanı ve biyoinformatik araçlar kullanılarak hedef ürüne yönelik pek çok özelliğin belirlenebilmesi ve farklı
karakteristik özelliklerin incelenebilmesi işlemleri yapılabilmektedir. Bu gibi faydalı analiz araçları kullanılarak çalışmanın
seyrini tamamen etkileyebilecek işlevlerin yönetimi mümkün olmaktadır.
Rekombinant viral kapsit proteinleri
Parçacık özelliklerinin ve yapısal dinamiklerin oldukça önemli olduğu bu çalışma bünyesindeki her bir bileşenin
konformasyonu ve karakteristik özellikleri bakımından tam olarak işlevsel olması gerekmektedir. Bu bağlamda, protein
yapıları, kararlılığı, işlevselliği gibi parametrelerin beklenen etkiyi en üst seviyede karşılaması gerekmektedir.
mRNA içeren nanopartikül
mRNA dizisinin ekspresyonu sonucu elde edilecek olan terapötik ajanların çalışmadaki etkilerine ait bilgilere diğer
bölümlerde kapsamlı bir şekilde yer verilmiştir. 3 ana terapötiğin (GMCSF, anti-PD1 ve p53) aktif olarak rol alacağı etki
mekanizmasında pek çok parametre analiz edilmiş ve litreatür anlamında sistematiği bozan bir fenomene rastlanmamıştır.
Molekül ağırlığı da belirlenen ve moleküler anlamda bir zorluk belirlenememiştir. Buna istinaden belirlenen
biyomoleküllerin ağırlıkları; GCSF: 18 kDa, p53: 44 kDa, pembrolizumab: 146 kDa. olarak saptanmıştır. İş modelinin
teknik olarak sahip olunması gereken özellikleri barındırması sayesinde çalışma için oldukça elverişli bir aday olduğu,
yadsınamaz bir gerçektir.
Corona formasyonu
Viral kapsit proteinlerini yüzeyinde ihtiva eden biyonanopartikül, içerisinde bulundurduğu farklı görevleri olan terapötik
ajanları da ifade edecek mRNA dizisi ile başlı başına inovatif bir yaklaşım olarak karşımıza çıkmaktadır. Benzer yöntemler
ile geliştirilmiş ürünlerin sayısı çok fazla olmasada, nitelik bakımından farkındalık yaratabilecek bir potansiyele sahiptir.
Gerek oluşturulmuş ve sonuçlanmış ürünlerin başarısı, gerekse bu başarılı ürünlerden ilham alarak araştırılan farklı
konuların sahip olduğu bilimsel değerler dikkate değer bir birikim sunmaktadır.
In-Vitro testler
Kanser hücre hatları için belirli özellikleri bünyesinde barındırarak gerçeğe en yakın simülasyonu sağlayacak olan hücre
hatları ile çalışma sağlanacağı için ürünün etkinliğinin bu aşamada anlamlı bir fark oluşturması istenmektedir.
In-Vivo testler
Canlı hayvan modelinde yine kanser çalışmalarında yaygın olarak kullanılan ve amaca uygun yapısı ile kullanılması
düşünülen nude farelerin kullanılması planlanmaktadır. Yine sürdürülebilirlik ilkesi gereğince minimum sayıda denek,
optimum şartlarda kullanılacaktır.
22. Çağrılı 1501/1507
22
B.4. PROJENIN YENILIKÇI YÖNLERI
Yenilikler
Projede hedeflenen çıktının yenilikçi yönlerini, pazar ve sektördeki (firma içinde, yurt içinde veya dışında) benzerlerine
göre öngörülen farklılıklarını, avantajlarını, üstünlüklerini kısaca özetledikten sonra, aşağıdaki iki tabloda mümkün
olduğunca somut/sayısal, ölçülebilir değerlerle kıyaslayarak belirtiniz.
Biyonanoteknoloji ve nanotıp alanları diğer alanlara nispeten yeni olsalar da sahip oldukları farklı sorunlara karşı
geliştirilen yeni kullanım olanakları bakımından umut vadetmektedir. Bu alanlardaki ilgili prensipler kullanılarak viral
peptitlerin hücresel sızma becerisi sayesinde gen tesliminde dayanılarak oluşturulan modellememizde, doğru hedeflemenin
sağlanarak immünoterapötik etkinin gerçekleştirilebilmesi kilit önem arz etmektedir. Corona formasyonu adı verilen
prensip ile nanopartiküllerin yüzeyine lipit, peptit veya farklı biyomoleküller eklenerek biyo-dağılımı, biyo-uyumluluğu ve
biyo-çözünürlüğü gibi farklı parametreleri optimize edilebilmektedir. Söz konusu sistemler pek çok çalışma tarafından
desteklenmiş, güvenilir yöntemlerdir. Ancak onkolitik virüs çalışmaları biraz daha perde arkasında kalmış ve yeni
teknolojiler ile desteklenmesi konusundaki noktalar yeteri kadar incelenememiştir. Bu projede, bahsedilen prensiplerin
güncel metotlar ile revize edilerek optimal koşulların sağlanabilmesi adına farklı bir yaklaşım sergilenecektir. Daha stabil,
biyo-uyumlu ve daha etkin bir ürün geliştirmeyi düşündüğümüz çalışma dinamiklerinin etkinlikleri, diğer referans
yöntemler ve ürünler ile kıyaslanarak etkinliği tartışılacaktır.
a) Önerilen proje çıktısının kuruluşunuzun mevcut ürünleri/süreçleri ve daha önce tamamladığı Ar-Ge projelerinin
çıktılarıyla kıyaslanması (Tablo Y.1):
o Kuruluşumuzda önerilen proje çıktısı ile kıyaslama yapılabilecek benzer bir ürün/süreç yoktur.
o Kuruluşumuzun benzer ürün/süreçlerle kıyaslama aşağıdaki tabloda yapılmıştır.
Teknik Özellikler Proje Çıktısı Kuruluşta Mevcut
Diğer Ürün/Süreç
(1)
(Varsa) Kuruluşta
Mevcut Diğer
Ürün/Süreç (2)
.......
Özellik-1
Özellik-2
Özellik-3
b) Önerilen proje çıktısının yurtiçi/yurtdışı pazardaki mevcut veya potansiyel benzerleri ile kıyaslanması (Tablo
Y.2):
o Projede piyasada kıyaslanabilecek bir benzeri olmayan yeni bir ürün/süreç geliştirilecektir.
o Proje çıktısının yurtiçi/yurtdışı pazardaki mevcut veya potansiyel benzerleri ile kıyaslaması aşağıdaki tabloda
yapılmıştır.
Teknik Özellikler Proje Çıktısı Benzer Ürün/Süreç
(1)
(Varsa) Benzer
Ürün/Süreç (2)
.......
Özellik-1
Özellik-2
Özellik-3
23. Çağrılı 1501/1507
23
ORTAKLI PROJEYE İLİŞKİN BİLGİLER (*)
(*)(Bu bölüm ulusal ortaklı yürütülen projeler kapsamındaki başvurularda aktif hale getirilecektir.)
Projede ortaklar arasındaki iş bölümünü açıklayınız. Projedeki görev ve sorumluluklarınızı iş paketleri ile ilişkilendirerek
belirtiniz. Proje ortaklarının projede kullanılacak yeteneklerinin birbirlerini tamamlayıcılığı hakkında bilgi veriniz.
Projenin ortaklarından teknoloji transferi yapılması öngörülüyorsa, projedeki teknoloji transferinin kalıcılığının
sağlanmasına yönelik çalışmalar hakkında bilgi veriniz.
Proje sonucunda oluşacak fikri ve sınai mülkiyet haklarının ortaklar arasındaki paylaşımının nasıl yapılacağını açıklayınız.
24. Çağrılı 1501/1507
24
C. PROJE PLANI VE KURULUŞ ALTYAPISI
C.1. İŞ PLANI
Detaylı İş-Zaman Çubuk Grafiği
Detaylı İş Zaman Çubuk Grafiği
İş Paketleri Listesi
Sıra
No
Kod İş Paketi Adı
Başlama-Bitiş
Tarihleri
1 Bi1 Biyoinformatik Çalışmalar. ..-..-.... - ..-..-....
2 ReD1 Rekombinant DNA Teknolojisi Çalışmaları. ..-..-.... - ..-..-....
3 MaCov-19
Memeli Hücre Kültüründe Viral Kapsit Proteinlerinin Üretilmesi ve
Karakterizasyonu.
..-..-.... - ..-..-....
4 BiNano-1 Biyonanoteknoloji Çalışmaları. ..-..-.... - ..-..-....
5 ResI İn-Vitro ve İn-Vivo Çalışmalar. ..-..-.... - ..-..-....
6 Try22 Sonuçlandırma ve Ticarileştirme. ..-..-.... - ..-..-....
7 ...... ..-..-.... - ..-..-....
8 ...... ..-..-.... - ..-..-....
9 ...... ..-..-.... - ..-..-....
10 ...... ..-..-.... - ..-..-....
İş Paketi Tanımlama Formu (Her iş paketi için ayrı bir form hazırlanacaktır)
İş Paketi No:
İş Paketi Adı:
Başlama Tarihi:
Bitiş Tarihi:
İlgili Kuruluşlar (Ortaklı projelerde proje ortaklarından bu iş paketinde yer alanları
işaretleyiniz)
İş paketi faaliyetlerini listeleyiniz (En fazla 3.000 karakter):
Biyoinformatik Çalışmalar.
Viral kapsit proteinleri için primer tasarımı, yapı kurgusu ve biyokimyasal özelliklerin belirlenmesi.
mRNA dizisinin tasarlanması, biyoinformatik çalışmaları.
Bilgisayar destekli simülasyon yaklaşımı ile yapının 3 boyutlu konformasyonunun analizi.
Yapı kararlılığının sağlanabilmesi adına gerekli iyileştirmelerin yapılması.
Rekombinant DNA Teknolojisi Çalışmaları.
Viral kapsit proteinlerine ait gen dizilerinin QPCR ile amplifikasyonu.
Viral kapsit proteinleri için E.Coli ‘ye transformasyon işlemi ve rekombinant bakteri kolonisinin oluşturulması.
Viral kapsit proteinlerini ifade edecek ekspresyon vektörünün elde edilebilmesi için inokülasyon ve ölçek
büyültülmesi.
Rekombinant bakterilerin hasat edilerek plazmit vektör saflaştırılması (kit kullanılarak yapılacaktır).
25. Çağrılı 1501/1507
25
Memeli Hücre Kültüründe Viral Kapsit Proteinlerinin Üretilmesi ve Karakterizasyonu.
Plazmit vektörlerin host hücreye transfeksiyonu (Transfeksiyon ajanı kullanılacaktır).
Viral kapsit proteinlerinin (M, E, S, N) ayrı ayrı üretilmesi ve saflaştırılması.
Biyonanoteknoloji Çalışmaları.
Corona formasyonu oluşturmak için çekirdek partikül içerisine mRNA dizisinin enkapsülasyonu.
Nanopartikül yüzeyinin viral kapsit proteinleri ile self-assembling modeli kurgulaması sayesinde kaplanması.
Nanopartikülün yapı analizi ve morfolojik incelemesi.
İn-Vitro ve İn-Vivo Çalışmalar.
Kanser hücre hatlarının kültürü.
Sitotoksisite testleri.
Migrasyon ve apoptoz incelemeleri.
Sayısal verilerin elde edilmesi, değerlendirilmesi ve referanslara göre kıyaslama yapılması.
Sonuçların gözden geçirilmesi ve verimlilik arttırma çalışmaları.
Canlı hayvan modeli çalışmaları.
Sonuçların gözden geçirilmesi ve verimlilik arttırma çalışmaları.
Sonuçlandırma ve Ticarileştirme.
Potansiyel yan ürünlerin ve informatik çıktıların değerlendirilmesi.
Projenin sonuçlanması ve nihai çıktıların raporlanması.
Pilot ölçekte üretim ve faz çalışmaları.
Ar-Ge sürecinin yanı sıra ticarileşme ve global pazara çıkışın başlaması.
26. Çağrılı 1501/1507
26
İş paketinde kullanılacak yöntemleri ve bunlara kendi özgün katkılarınızı açıklayıp, incelenecek parametreleri listeleyiniz
(En fazla 3.000 karakter):
Biyoinformatik çalışmalar
Viral proteinlerin üretimi için, uygun ekspresyon sistemlerinin oluşturulması basamağı kapsamında öncelikle hedef
biyomoleküllerin uygun konakçıda işlevsel olarak sentezlenebilmesi ve saflaştırma sırasında verimliliğin sağlanabilmesi
adına ek iyileştirme ve gen manipülasyonlarının yapılması gerekebilmektedir. Bu kapsamda farklı kütüphanelerden ve
biyoinformatik araçlardan yararlanılarak bilgisayar destekli modelleme ve kurgulamanın yapılması, sonraki proseslerin
başarısı ve verimliğini etkileyecek ilk adımdır.
Moleküler biyoloji çalışmaları
Gen ürünü tasarlanıp temin edildikten sonra, PCR ile çalışmanın sürdürülebilirliğini sağlamak içim çoğaltılmalıdır, bu
işlem sırasında gerekli prosesler sağlanıp, restriksiyon enzimleri yardımı ile gen dizisinin, baktriyel ekspresyon vektörüne
ligasyonu sağlanır. Gerekli seçilimler yapılarak plazmit DNA ‘nın konakçı hücrenin genomuna aktarılmış olduğu
doğrulanır. Böylece belirli hüre grubunun kolonileri kullanılarak ölçek büyültme işlemi yapılabilir.
Bakteriye transformasyon yöntemi ile aktarılan plazmit DNA, belirli bir yoğunluğa erişildiğinde hücrelerin hasat edilerek
plazmit DNA saflaştırılması sağlanır. Saflaştırılan plazmitlerin termal stabilitesi sağlanarak işlem boyunca steril ortamda
korunması gerekmektedir. Oldukça hassas ve dikkatli yapılması gereken işlemler sırasında termal ve
Rekombinant viral proteinlerin ekspresyonu, saflaştırılması ve karakterizasyonu
Saflaştırılmış olan gen ürünü, ekspresyon için host hücreye transfekte edilecek ve hücre miktarı belirli bir yoğunluğa
geldiğinde hasat edilerek parçalanacaktır. Endojen peptitlerin açığa çıkarılması ile saflaştırma işlemleri gerçekleştirilerek
her protein için ayrı bir üretim yapılacaktır.
mRNA tasarımı
Hedef hücrede transfeksiyonundan sonra hem ekstraselüler matriksten hem de hücre içi savunma mekanizmasından
kaçarak istenilen genlerin ifade edilip işlevsel olarak görev alabilmesi sağlanacaktır.
mRNA içeren nanopartikül sentezi
mRNA dizisi Corona formasyonu adı verilen yöntem ile ko-polimer sentetik malzemeler ile enkapsüle edilecektir. Bu
kapsamda Sars-CoV-2 kapsit proteinlerinin self-assembling özelliği kullanılacaktır.
Nanopartikül karakterizasyonu
Projenin amacına ulaşması için, partikülün fiziksel ve kimyasal özellikleri son derece önemli olduğundan dolayı bu nokta
çalışmanın en titiz analiz edildiği adım olacaktır.
Nanopartikül yüzeyinin modifikasyonu ve stabilizasyonu
Yüzey morfolojisinin belirlenmesi ve aktivite verimliliğinin sağlanması adına gerekli modifikasyonlar ve stabilizasyonlar
sağlanacaktır.
In-vitro çalışmalar
Akciğer, kolon ve böbrek kanseri hücre hatlarında kansere özgü fenomenlerin engellenerek kanserleşmenin durdurulması
ve yayılması durdurulmasının sağlanması üzerine çalışmalar yapılacaktır.
Aktivite tayini
Akciğer, kolon ve böbrek kanser hücre hatları üzerinde etken maddenin anti migratif, anti proliferatif ve apopototik
özellikleri incelenecek, bulgular tartışılarak yöntemin başarısı belirlenecektir.
27. Çağrılı 1501/1507
27
İn-vivo çalışmalar
Yöntemin canlı modelde incelenerek başarı profili ve risklerinin belirlenmesi ile yöntemin geliştirilerek ileri dönemde
insana uygulanabilmesi açısından uygun standartlar geliştirilecektir. Çalışma kapsamında kobay olarak kanserli nude
fareler kullanılacaktır. Gerekli etik izinler ve sertifikalar temin edilecektir.
İş paketindeki deney, test ve analizleri nedenleri ile aşağıdaki tabloda listeleyiniz (deney ve testlerin nerede yapılacağını
belirtiniz, yurt dışında yapılacaklar için detaylı gerekçe gösteriniz. Bu iş paketinde herhangi bir deney / test / analiz
yapılmayacaksa belirtiniz):
Deney / Test / Analiz Adı Yapılma
Nedeni
Yapılacağı Yer (firmada, yurtiçi ya da
yurtdışı kuruluşlarda)
(Yurtdışında yapılacak
ise) Gereçkesi
Bu iş paketi faaliyetlerinin izlenmesini sağlayan ve tamamlandığını gösteren ölçülebilir/somut teknik ara çıktıları
(kilometre taşlarını) belirtiniz:
Ara Çıktının Tanımı Beklenen Gerçekleşme Tarihi: Çıktının Kullanılacağı İş Paketi
Ara çıktı-1 .../.../......
Ara çıktı-2 .../.../......
Ara Çıktılar (Kilometre Taşları) Listesi (*)
Ara Çıktı Elde edileceği iş paketi Beklenen gerçekleşme tarihi Çıktının kullanılacağı iş paketi
Ara Çıktı-1
Ara Çıktı-2
(*)
Bu bölüm iş paketlerinde verilecek Ara Çıktı bilgileri kullanılarak PRODİS tarafından otomatik olarak oluşturulur.
28. Çağrılı 1501/1507
28
C.2. PROJE YÖNETIMI VE ORGANIZASYONU
Proje Yönetimi İle İlgili Açıklamalar
Proje Personel Listesi
Bu formda projede görevli personeller ile ilgili bilgiler eklenecektir.
Proje personelinin her biri için Personel Özgeçmis Formu'nu doldurarak "Personel Ekle" ekranından PDF formatına
dönüştürüp ekleyiniz.
Personel Adı Unvan
TC
Kimlik/Pasaport
No
Eğitim
Durumu
Lisans
Mezuniyet
Tarihi
İşe Başlama
Tarihi
Fikir
Sahibi
Özgeçmiş
.................. ........ .......... ............... ........
29. Çağrılı 1501/1507
29
C.3. KURULUŞ ALTYAPISI (*)
(*)
Bu bölüm birden fazla kuruluş tarafından sunulan ortaklı projelerde her kuruluş için ayrı ayrı doldurulacaktır)
Kuruluşun Ar-Ge Olanakları
Kuruluşunuzun Ar-Ge olanaklarını ve deneyimini, aşağıdaki başlıklar altında açıklayınız:
a) Kuruluşunuzun mevcut Ar-Ge yapılanması (Ar-Ge birimi, laboratuvar ve test ortamları, alet-teçhizat ve yazılım araçları,
kütüphane olanakları, Ar-Ge amaçlı ayrılmış platform.vb),
b) Kuruluşunuz dışından alınan danışmanlık hizmetleri ve diğer kuruluşlarla yapılan ortak çalışmalar.
c) Proje sonucu ortaya çıkacak bilgi birikimini kuruluşunuzda kalıcı hale getirmek için aldığınız tedbirleri açıklayınız.
d) Yeni ürün geliştirme ve tasarım yeteneğiniz hakkında bilgi veriniz.
30. Çağrılı 1501/1507
30
D. PROJENİN EKONOMİK YARARA VE ULUSAL KAZANIMA DÖNÜŞEBİLİRLİĞİ
D.1 EKONOMIK ÖNGÖRÜLER
Ticari Başarı Potansiyeli
Proje çıktısının ticarileşme / ekonomik yarara dönüşme potansiyelini değerlendirerek;
a) Hedeflenen kullanım alanları, yurtiçi ve yurtdışı pazarların büyüklüğü, sözkonusu pazarlara erişim stratejisi, olası
müşteriler ve rakiplerin mevcut pazar payları hakkında bilgi veriniz. (En fazla 3.000 karakter)
Onkoloji, her geçen gün artan talep ve yetersiz etkinlikli ürün yelpazesi sebebi ile,zaman zaman dikkate değer bir talebe
karşın bu talebi karşılayamayan bir tıp alanı durumunda kalmıştır. Kişiden kişiye göre değişebilen hastalık seyri ve
tedaviye cevap oranının bir sonucu olarak daha çok kişiselleştirilmiş tıp adı verilen yöntemlerin ve genel geçer
prosedürlerin izlenmesi, hastalığa dair bulguların ve belirteçlerin etkin bir biçimde hedeflenemediği gerçeği ile karşımıza
çıkmaktadır. Bu sorunların üstesinden gelebilmek adına modernize edilmiş yöntemlerin literatürdeki hastalık
fenomenlerinin doğru şekilde yorumlanarak önleyici yaklaşımların etkin bir biçimde kullanılması gerekmektedir.
Oluşabilecek know-how ve lisans satışları da aynı zamanda ek gelir olarak değerlendirilecektir. Çalışmayla ilgili eğitimler
ve bu konuda verilecek ilham ile yeni fikirlerin, belki de iş birliklerinin ortaya çıkması beklenmektedir.
Ürünün seri üretim basamağına geçmesi durumunda oluşan devasa yatırım ve ülkemizin kanser biyoteknolojisi alanında bir
cazibe merkezi haline gelmesi gibi güzel gelişmeleri de tetikleyebilecek bir potansiyeli barındıran bu gibi kilit araştırmalar
oldukça önemlidir.
IQVIA insan veri bilimi enstitüsü ‘nün Ocak 2022 yılında paylaşmış olduğu 2026 yılına kadar oluşması beklenen ilaç pazar
payı istatistiki araştırmasına göre 2021 yılı sonunda yaklaşık 187 milyar dolar olan global onkolojik ürünlerin pazar payı
2026 yılına kadar kademeli olarak artarak 306 milyar doları bulması beklenmektedir. 2026 yılı tüm ilaç harcamaları
beklentileri geneline bakıldığında en yüksek pazar payının yaklaşık %9 ila %12 ‘sinin onkoloji, yine kısmen kanser
tedavisinde kullanılan immünoloji ürünlerinin %6 ila %9 arası bir Pazar payının oluşması beklenmektedir (Anonim A,
2021).
Kanser ilaçlarını en fazla ihraç eden ülke Almanya, en fazla ithal eden ülkenin ise Amerika Birleşik Devletleri olması
dikkat çekmektedir. Sektörün liderliği Avrupa ülkelerinin tekelinden çıkarak global bir eşitlik sağlamak adına gelişmekte
olan ülkeler için de erişilebilir ve yüksek etkinliğe sahip bir ürün alternatifi oluşturulmalıdır. Bu proje kapsamında elde
edilecek ürünlerin başarı potansiyelinin doğru değerlendirilmesi ve etkili pazarlama stratejileri ile yüksek kâr marjı ve
katma değer sağlanması beklenmektedir.
b) Çıktının ticarileşmesi / ekonomik getiri sağlar hale gelmesi için ilave yatırım ihtiyacı varsa, önemli maliyet
kalemlerini ve bu maliyetlerin nasıl karşılanacağını / finanse edileceğini açıklayınız. Ticarileştirme sürecinin kimlerce
ve nasıl yöneteceğini ve bu kişilerin konuya ilişkin deneyimlerini özetleyiniz. (En fazla 3.000 karakter)
Proje çıktısının ticarileşmesi /ekonomik getiri sağlar hale gelmesi için;
O İlave Yatırım İhtiyacı YOKtur.
O İlave Yatırım İhtiyacı VARdır.
Ekonomik Getiri Tahmini
(NOT: Proje çıktısı belirli bir sektör ya da müşteri kitlesini hedefleyerek pazara sunulacak bir “ürün” ise (a) bölümünü, tek
bir müşteri talebi doğrultusunda (müşteriye özel) geliştirilecek bir ürün ya da süreç ise (b) bölümünü, pazara sunulmayacak,
sadece kuruluşunuz tarafından kullanılacak yeni ya da iyileştirilmiş bir süreç veya ürün ise (c) bölümünü doldurunuz.)
O a) Pazara sunulacak.
O b) Tek bir müşteri için geliştirilecek.
O b-1) Müşteri talebinin tekrarlanması beklenMEmektedir.
O b-2) Müşteri talebinin sürekliliği beklenmektedir.
O c) Kuruluş içinde kullanılacak.
a) Proje çıktısının kuruluşunuza sağlayacağı ekonomik getiriye ilişkin rakamsal öngörülerinizi aşağıdaki tabloda
belirtiniz. Öngörülerinize esas teşkil eden hesaplamalarınızı / yaklaşımlarınızı aşağıda açıklayınız. (En fazla 3.000
karakter)
O i) Proje çıktısı sadece yurtiçi pazara sunulacaktır.
O ii) Proje çıktısının yurtdışı pazarlara (da) sunulması hedeflenmektedir.
31. Çağrılı 1501/1507
31
Proje başlangıcından itibaren yurtiçi pazara çıkış süresi (Ay):
Proje başlangıcından itibaren yurtdışı pazara çıkış süresi (Ay)(*)
:
Proje tamamlandıktan sonra kuruluşunuzun; 1.Yıl sonu 3.Yıl sonu 5. Yıl ve sonrası
Beklenen yurtiçi toplam satış hasılatı (TL)
Beklenen yurtdışı toplam satış (ihracat) hasılatı (TL) (*)
Yurtiçi satış hasılatında beklenen artış (%)
Yurtdışı satış hasılatında beklenen artış (%)(*)
Yurtiçi pazar payında beklenen artış (%)
Yurtdışı pazar payında beklenen artış (%)(*)
(*)
Proje çıktısının yurtdışı pazarlara da sunulması hedefleniyorsa doldurulacaktır.
b) Proje çıktısının müşterisi (yurtiçi, yurtdışı), kullanılacağı sektör, ülkemize ithal ikamesi sağlama potansiyeli, proje
çıktısının satışından beklenen kâr ve proje sonrasında proje çıktısına benzer/ilişkili konularda yeni siparişler alma
potansiyeli hakkında bilgi veriniz. (En fazla 3.000 karakter)
b-1) Proje çıktısı ile elde edilmesi beklenen toplam satış hasılatı (TL):
b-2)
O i) Proje çıktısı sadece yurtiçi pazara sunulacaktır.
O ii) Proje çıktısının yurtdışı pazarlara (da) sunulması hedeflenmektedir.
Proje başlangıcından itibaren yurtiçi pazara çıkış süresi (Ay):
Proje başlangıcından itibaren yurtdışı pazara çıkış süresi (Ay)(*)
:
Proje tamamlandıktan sonra kuruluşunuzun; 1.Yıl sonu 3.Yıl sonu 5. Yıl ve sonrası
Beklenen yurtiçi toplam satış hasılatı (TL)
Beklenen yurtdışı toplam satış (ihracat) hasılatı (TL) (*)
Yurtiçi satış hasılatında beklenen artış (%)
Yurtdışı satış hasılatında beklenen artış (%)(*)
Yurtiçi pazar payında beklenen artış (%)
Yurtdışı pazar payında beklenen artış (%)(*)
(*)
Proje çıktısının yurtdışı pazarlara da sunulması hedefleniyorsa doldurulacaktır.
c) Proje çıktısının kuruluş verimliliğine, maliyet düşüşüne, kalite artışına ve rekabet gücüne beklenen katkılarını sayısal
veriler kullanarak belirtiniz. (En fazla 3.000 karakter)
Kâra Geçiş Noktası
Proje için harcanan kaynağın ne kadar sürede ve nasıl geri kazanılacağını açıklayınız. Proje başlangıcından itibaren kâra
geçiş süresini –hesaplamalarınızla birlikte- belirtiniz. (En fazla 3.000 karakter)
32. Çağrılı 1501/1507
32
D.2 ULUSAL KAZANIMLAR
Projenin sağlayabileceği ulusal kazanımları, aşağıdaki başlıklardan ilgili gördüklerinizi dikkate alarak belirtiniz:
a) Ulusal bilgi birikimi ve teknolojik gelişime katkısı,
b) Kuruluş içinde veya dışında, aynı veya farklı teknoloji alanlarında yeni uygulamalar veya Ar-Ge projeleri
başlatma potansiyeli,
c) Patent alma ve lisans/know-how satış beklentisi (projede patent, faydalı model ve endüstriyel tasarım tesciline
konu olabilecek çıktılar),
d) Yeni iş alanları oluşturma ve istihdam etkisi,
e) Sektörel katkısı (projenin yan sanayi oluşturma ve geliştirmeye, ilgili sektör ve diğer sektörlere katkısı),
f) Projenin ve çıktılarının sosyo-kültürel hayata etkisi, eğitim, sağlık, bölgeler arası gelişmişlik farkını azaltma gibi
konularda iyileştirme sağlama potansiyeli,
g) Proje faaliyetleri ve çıktısının çevreye ve canlılara olumlu etkileri
h) Proje çalışmalarında bilimsel yayına konu olabilecek çıktıları.
(En fazla 5.000 karakter)
2022 yılı itibari ile hâlen kansere yönelik etkili ve güvenilir bir yöntem geliştirilmemiş olsa da farklı kanser tiplerine göre
nispeten biraz daha özelleşmiş yeni tedavi yöntemleri umut verici şekilde ortaya çıkmaktadır. Pandeminin ve küresel
ekonomik krizin de etkileri ile çalışmalar yavaşlamış ta olsa devam etmektedir. Kamu-sanayi iş birlikleri ve hibe destekleri
ile bu etkileşim daha da güçlenerek insanlık yararına adımlar atılmaktadır. Ulusal ve uluslararası mecralar topyekûn bir
efor ile insanlığın bu sorununu artık çözülebilir bir konuma getirmek için çalışmaktadır. Ayrıca bu iş birlikleri sayesinde
hem çalışmalar için fon sağlanıp hem de belirli süreçlerin hızlı bir şekilde neticelendirilebilmesi sağlanmaktadır.
Nitelikli ve eğitimli bireylerin yurt dışında ulaşılabilir bulduğu çalışma ortamı ve imkânlardan yararlanmak için yaptıkları
beyin göçünü azaltabilmek adına ülkemizin de sadece araştırmak ile kalmayıp, ürüne dönüştürülebilmesi açısından da
önemli olmaktadır. Ar-Ge firmalarının devlet destekli sistemden yararlanarak döviz kurlarındaki dalgalanmalardan ve
üretim, lojistik gibi erişilebilirlik sorunlarından en az ölçüde etkilenmesi oldukça önemlidir. Bu bağlamda sanayi önce pilot
ölçek üretimlerin, sonrasında ise endüstriyel üretimlerin yolunu açarak istihdam olanakları yaratılacak katma değerli
ürünlerin ve hizmetlerin kazandırılmasının önemi açık bir şekilde fark edilebilmektedir.
Katma değer olarak kazandırılacak olan ürünler ve hizmetler sayesinde dışa bağımlılığın azaltılarak arz-talep dengesinin
kurulması özellikle ekonomik getirileri olabilecek potansiyel sahibi bu gibi girişimlerin önemini bir kez daha
belirtmektedir. Yapılan atılımlar ve destekler yardımı ile ülkemizin her alanda kendi kendine yetebilen bir ülke olabilmesi
adına önemli gelişmeler olmaktadır. Savunma sanayi ve madencilik anlamında çağı yakalayan ülkemiz, doğa bilimleri ve
tıp ta da önemli gelişmeler ile çağı ve hatta çağın ötesini kat edebilecek potansiyele sahiptir. Bu potansiyelin doğru ve etkin
bir biçimde kullanılarak sonuç elde edebilecek seviyeye getirmek te yine belirtilen paydaşların vazifelerini yerine getirmesi
ile mümkün olabilmektedir.
Elde edilecek yeni yöntem ve ürünlerin patentlenmesi ile fikir hırsızlığının önlenerek ürün çıktılarının uluslararası ticari
pazar payının oluşturması ve kazanımların ülkemizin bilim ekosistemine getirileri yadsınamaz seviyededir. Mülkiyet
hakları konusunda diğer çalışmalardan bağımsız ve üstün yönleri ile fark oluşturacak olan bu proje kapsamında, pek çok
olası çıktılar bulunmaktadır. Bunlara kısaca değinecek olursak; yeni mRNA enkapsülasyon yöntemleri, yeni nanopartikül
temelli taşıyıcı sistemler, belirli kanser biyomarkörleri ve hedefleme sistemleri, kanser tedavisinde kullanılabilecek yeni
yöntemler gibi farklı metot potansiyelleri ile beraber hem ürün hem yöntem olarak fikirlerin yasal olarak güvence altına
alınması düşünülmektedir. Ayrıca bu yöntemlerin know-how olarak satılması da ileriki dönemde düşünülmektedir. Böylece
farklı fikirlerle beraber harmanlandığında inovatif ürünlerin çıkabileceği göz önünde bulundurulmalıdır.
Kemoterapi, tedavi süresinin uzunluğu ve hastanın tedaviye cevap vermesinin her zaman mümkün olmaması sebebi ile
tercih edilebilirliği tartışılan bir tedavi yöntemidir. Hastalığın seyri konusunda umut vadetmemekle beraber
uygulanabilirliği de koşullara ve imkânlara göre değişiklik gösterebilmektedir. Hal böyle iken modern teknolojinin ve bilgi
birikiminin verimli ve akıllıca kullanılması gerekmektedir. Bu doğrultuda öncelikle hedefin iyi tanınması ve tedavinin
uygun kurgulanması, tedaviyi başarıya götürecek kilit unsurdur.
33. Çağrılı 1501/1507
33
Bilimsel literatüre kazandırılacak potansiyel bilgi kaynakları (yayın ve kitap) sayesinde ilgili mecralardaki bireylerin
yararlanabilmesi mümkün olacaktır. Bilimsel araştırmaların olmazsa olmazı olan yazılı kaynakların diğer araştırmacıların
da erişimine açılması, bu çalışmanın diğer araştırmacılar tarafından ilham kaynağı olabileceği düşünülmektedir. Farklı
yöntemlerin bir araya getirilerek güncel problemlere karşı çözüm üretilmesi, bu bağlamda oldukça önemlidir.
Yeni teknolojilerin geliştirilmesi ve mevcut sistemlere adapte edilmesi ile sürdürülebilirliği desteklenecek olan bu çalışma
kapsamında farklı hastalıklar ve diğer kanser türleri için de güncellenerek hedefe özgü geliştirmeler ile etkinliğin ve
uygulanabilirliğin arttırılabilir olması öngörülmektedir.
34. Çağrılı 1501/1507
34
E. RİSK VE FİNANSMAN YAPISI
Projenin Yürütülmesi Sırasında Karşılaşılabilecek Riskler ve Alınacak Önlemler
Projenin yürütülmesi sırasında karşılaşılması olası teknik, mali, idari ve hukuki riskler ile, bunların en aza indirilmesi için
ne tür önlemler almayı planladığınızı (“B plan(lar)ınızı”) belirtiniz.
Risk
Riskin
Gerçekleşmemes
i İçin Alınan
Önlemler
Alınan önlemlere rağmen riskin gerçekleşme
olasılığı nedir ve gerçekleşme durumunda etkisi
ne düzeyde olabilir?
Alınan önleme rağmen
riskin gerçekleşmesi
durumunda
yapılacaklar
(“B Planı”)
Olasılık
(Yüksek / Orta /
Düşük)
Etki
(Yüksek / Orta /
Düşük)
Lojistik ve
Tedarik
Problemleri
Bilinen ve
güvenilir
tedarikçilerin
kullanılması.
Orta Yüksek Başka tedarikçiler ile
irtibat haline geçilmesi
ve asıl tedarikçiye
durumun hassasiyetinin
bildirilmesi.
Kur farkındaki
dengesizlik
kaynaklı
maliyet
uyumsuzluğu
Olabildiğince
yerli üretim
ürünlerin satın
alınması.
Orta Orta Muadili bulunmaması
durumda yurt dışı
kaynaklardan temin
etmek ve çalışma için
önemi göz önünde
bulundurularak uygun
fiyatlı ancak biraz daha
iş gücüne
İhtiyaç duyulabilecek
ürünlerin kullanılması.
Sarf
malzemelerde
karşılaşılabile
cek kusur ve
hatalar.
Bilinen ve
güvenilirliği
yüksek ürün ve
cihazların
kullanılması.
Düşük Orta Kusurlu/arızalı ürünün
iadesi ve yeni ürün ve
cihazların temin
edilmesi.
Hizmet
alımlarından
dolayı
oluşabilecek
aksaklıklar.
Dış merkezlerden
alınacak
hizmetlerin
olabildiğine yakın
ve uzman
kurululuşlardan
temin edilmesi.
Düşük Orta Hizmet alımlarının yurt
dışından
gerçekleştirilmesi.
Proje Çıktısının Ticarileşmesi Aşamasında Karşılaşılabilecek Riskler ve Alınacak Önlemler
Ticarileştirme aşamasında kuruluşunuzun karşılaşılabileceği olası engelleri (teknik, mali, hukuki, fikri mülkiyet hakları vb.)
ve bu engellerin aşılmasına ilişkin planlarınızı belirtiniz. Ayrıca proje faaliyetlerinin ve proje çıktısının çevreye ve canlılara
olumsuz etkileri varsa, bunlara karşı almayı planladığınız önlemleri belirtiniz.
Risk
Riskin
Gerçekleşmemesi
İçin Alınan
Önlemler
Alınan önlemlere rağmen riskin gerçekleşme
olasılığı nedir ve gerçekleşme durumunda etkisi
ne düzeyde olabilir?
Alınan önleme rağmen
riskin gerçekleşmesi
durumunda
yapılacaklar
(“B Planı”)
Olasılık
(Yüksek / Orta /
Düşük)
Etki
(Yüksek / Orta /
Düşük)
35. Çağrılı 1501/1507
35
Finansman Yönetimi
Başvuru yapmakta olduğunuz destek programında desteklenen projelerde, proje harcamaları kuruluş tarafından yapıldıktan
sonra TÜBİTAK’a sunulur ve yapılan değerlendirme sonunda projeye ilişkin harcamaların belirli bir yüzdesi TÜBİTAK
tarafından kuruluşa ödenir. Projeyi yürütmek için özkaynaklarınızın ve diğer finansman kaynaklarının yeterliliği ve almayı
planladığınız tedbirlerle ilgili bilgi veriniz. (En fazla 3.000 karakter)
36. Çağrılı 1501/1507
36
F. PROJE BÜTÇESİ
F.1 - PERSONEL GİDERLERİ TAHMİNİ MALİYET FORMU (M011)
Proje Adı
İş Paketi No/Adı
Adı Soyadı İş Paketindeki Görevi Firmadaki Unvanı
Adam/Ay
Oranı
Ay
Toplam
Adam-Ay
Aylık Maliyet Toplam
İŞ PAKETİ ADAM-AY TOPLAMI = TOPLAM TL
37. Çağrılı 1501/1507
37
F.2 - SEYAHAT GİDERLERİ TAHMİNİ MALİYET FORMU (M012)
Proje Adı
Seyahati Yapacak
Kişinin Adı Soyadı
Firmadaki
Unvanı
Seyahat Açıklaması
Seyahatin Proje Faaliyetleriyle
İlişkisi
Şehir/Ülke Tutarı (TL)
TOPLAM TL
38. Çağrılı 1501/1507
38
F.3 - ALET/TEÇHİZAT/YAZILIM/YAYIN ALIMLARI TAHMİNİ MALİYET FORMU (M013)
Proje Adı
Sıra
no
Alet/Teçhizat/
Yazılım/Yayın Adı
Adet Kapasite
Teknik
Özellik
Proje
Faaliyetlerindeki
Kullanım Amacı
Proje Sonrası Kullanım
Yeri/Amacı Birim Fiyatı
(USD)
Birim Fiyatı
(TL)
Toplam Tutarı
(TL)
Ar-Ge Üretim
1
Agaroz Jel
Elektroforez Sistemi
1 En az 30
örnek
kapasiteli
UV geçirgen
ve dayanıklı
gövde
Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılaca
ktır
Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılacaktı
r
2
Buz Makinesi (MS2-
MaxiFlake60)
1 Günlük
60kg
üretim ve
15kg
saklama
kapasiteli
Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılaca
ktır
Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılacaktı
r
3 Chemidoc MP Imaging
System (Bio-Rad,
United Kingdom) veya
ThermoFisher IBright
1 Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılaca
ktır
Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılacaktı
r
4
Çalkalamalı İnkübatör
1 Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılaca
ktır
Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılacaktı
r
39. Çağrılı 1501/1507
39
5
Etüv
1 Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılaca
ktır
6
Hassas Terazi
1 Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılaca
ktır
7
Isıtıcılı Manyetik
Karıştırıcı
1 Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılaca
ktır
8
(-80º) Buzdolabı
1 Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılaca
ktır
9
Mikrodalga Fırın
1 Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılaca
ktır
10
Mikroplaka Okuyucu
1 Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılaca
ktır
40. Çağrılı 1501/1507
40
11
Nanodrop
1 Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılaca
ktır
Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılacaktı
r
12
Peristaltik Sistem
1 Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılaca
ktır
Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılacaktı
r
13
PH Metre
1 Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılaca
ktır
Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılacaktı
r
14
RT-PCR
1 Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılaca
ktır
Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılacaktı
r
15
Santrifüj (+4º)
1 Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılaca
ktır
Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılacaktı
r
16
SDS-PAGE
Elektroforez Sistemi
1 Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılaca
ktır
41. Çağrılı 1501/1507
41
17
Nanopartikül Sentez
Cihazı
1 Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılaca
ktır
Sonraki
çalışmalar
için de
kullanılacaktı
r
18 Sıcak Su Banyosu 1
19 Termometre 1
20 Ultrasantrifüj 1
21 UV Görüntüleme 1
22 Florasan Jel
Görüntüleme
Sistemleri
1
23 Vorteks 1
24 CO2 Destekli
İnkübatör
1
25 Zetasizer 1
26 Mikroakışkan İşlemci 10
27 Spektrofotometre 1
28 Buzdolabı (+4º) 1
29 Ultrasonik
Homojenizatör
1
30 Hücre sayıcı 1
43. Çağrılı 1501/1507
43
F.4 - AR-GE ve TEST KURULUŞLARINA YAPTIRILAN İŞLER TAHMİNİ MALİYET FORMU (M014)
Proje Adı
Ar-Ge’nin Yaptırıldığı Kuruluş Yaptırılan İşin Açıklaması Proje Faaliyetleriyle İlişkisi
Firma Dışı Yaptırılma
Gerekçesi
Tutarı (TL)
TOPLAM
TL
44. Çağrılı 1501/1507
44
F.5 - HİZMET ALIMLARI TAHMİNİ MALİYET FORMU (M015)
Proje Adı
Hizmetin Alındığı Kuruluş Hizmetin Açıklaması
Hizmet Alımının Proje Faaliyetleriyle
İlişkisi
Hizmet Alım Gerekçesi Tutarı (TL)
TOPLAM
TL
45. Çağrılı 1501/1507
45
F.6 - MALZEME ALIMLARI TAHMİNİ MALİYET FORMU (M016)
Proje Adı
Sıra
No
Malzeme Adı
Proje Faaliyetlerindeki
Kullanım Amacı
Miktarı ve
Birimi
Miktarın Gerekçelendirilmesi Birim Fiyatı (USD)
Birim Fiyatı (TL)
Toplam Tutarı (TL)
1 0.45 mm filter
membrane
(Millipore,
Billerica, MA,
United States)
2 6- Well plate
poly-d-lysine
kaplı
Hücre kültüründe
kullanılacaktır
3 Affinite
Kromatografisi
Biyomolekül Saflaştırma
Affinite
Kromatografisi
Rezini
Biyomolekül Saflaştırma
4
Agaroz
Jel ve bazı reaksiyonlarda
kullanılacaktır
5
Akrilamid
Jel elektroforezi için
kullanılacaktır
6
Azot Tankı
Kryo-saklama için
kullanılacaktır
46. Çağrılı 1501/1507
46
7
BSA
Hücre kültürü için
kullanılacaktır
8 CaCl2.2H2O
9
Cam Malzemeler
Reaksiyonlar için
kullanılacaktır
10 cDNA Sentezi
İçin
11 Coomasie
Brillant Blue
Jel boyama için
kullanılacaktır
12 Corporation,
Madison, Wi,
Usa)
13
Cryo-Tüp
Kryo-saklama için
kullanılacaktır
14
Dh5a
Rekombinant plazmitlerin
çoğaltılması
15 Diyaliz
Membranı
Boyuta bağlı partikül
filtrasyonu için kullanılacaktır
16 DMEM Besi
Ortamı
Hücre hatları için
kullanılacaktır
17
DMSO
Hücre pasajlama için
kullanılacaktır
18 EDTA
47. Çağrılı 1501/1507
47
19
Eppendorf
Numunelerin saklanması ve
bazı reaksiyonlar için
kullanılacaktır
20
Etanol
Sterilizasyon ve tepkimeler
için kullanılacaktır
21
Falcon Tüpler
Çeşitli numuneler ve çözeltiler
için kullanılacaktır
22
FBS
Hücre kültürü için
kullanılacaktır
23
Flasklar
Hücre hatlarının kültürü için
kullanılacaktır
24 Fragment
Assembly
Reagents (NEB)
25 Gen Sentezi
26
Gliserol
Bakteri hücrelerinin
dondurularak saklanması için
kullanılacaktır
27 HCl
28
Hızlı Antijen Kiti
Viral proteinlerin
saptanmasında kullanılacaktır
29
İmidazol
Saflaştırma işlemlerinde
kullanılacaktır
30
LB Besiyeri
Bakteri hücre kültürü için
kullanılacaktır