Manual d'us bàsic de la base de dades especialitzada en ciències de la salut PubMed-Medline: presentació, cerques simples, gestió i recuperació de resultats.

1. Bases de dades: PubMed – Medline (bàsic)
Darrera actualització: 20/09/2010
Biblioteca del Campus de Ciències de la Salut de Bellvitge

2. Abast
Presentació de nivell bàsic de PubMed‐Medline: cerques senzilles,
operacions principals, prestacions més comunes i recuperació del text
complet dels articles.
Índex
1. Presentació de PubMed – Medline
2. Com cercar a PubMed
3. L’historial de cerques: Search History
4. Aplicar filtres a les cerques: Limits
5. Canviar la visualització: Display Settings
6. Treballant amb les referències: Send to
7. Recuperar el text complet dels articles

3. 1. Presentació de PubMed-Medline
Base de dades bibliogràfica produïda per la National Library of
Medicine.
Conté les cites bibliogràfiques i abstracts (resums)
d’articles de revistes relacionats amb la literatura biomèdica, la
investigació i la pràctica clínica.
Processa més de 5.000 revistes biomèdiques: totes les
editades als EEUU i d’altres de fins a 80 països.

4. És la base de dades per excel·lència en ciències de la
salut i una de les més importants que existeixen en qualsevol
àmbit del coneixement.
Lliure accés: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed

5. Continguts disponibles des de 1950 (OldMedline).
Inclou 20 milions de cites bibliogràfiques (incloses les
d’OldMedline).
La majoria de les cites inclouen resum (abstract) i moltes
també enllaços al text complet de l’article.
Predominen les cites referides a articles en anglès.
Actualització molt ràpida.
Possibilitats de cerca molt elaborades (operadors
booleans, límits, combinació de cerques anteriors, articles
relacionats, etc).

6. • Tesaurus: llenguatge controlat i jeràrquic usat per a la
indexació de continguts.
• Medline fa servir el MeSH (Medical Subject Headings),
tesaurus fet per la NLM, molt emprat arreu del món.
Exemple del
tesaurus MeSH
• PubMed – Medline permet fer cerques de continguts per mitjà
del seu tesaurus MeSH

7. PubMed - Medline integra altres subbases:
• Pre-Medline: cites d’articles que es publicaran properament i
dels quals ja es pot recuperar la referència.
• Old-Medline: incorporació retrospectiva d’articles publicats
amb anterioritat a l’existència de Medline (només d’algunes
revistes). Els més antics són dels anys 50.
També integra el dipòsit digital:
• PubMed Central: els articles es poden consultar íntegrament
en versió electrònica de manera gratuïta.

8. 2. Com cercar a Pubmed
Accés:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=pubmed

9. • Un cop a la pantalla principal s’introdueixen els termes que
volem cercar (en anglès).
• Els termes es relacionen amb els operadors booleans (AND, OR,
NOT). AND és l’operador per defecte (si no en posem cap).
• Es poden fer truncaments de paraules amb el símbol (*).
Per exemple, si s’escriu asthma* es recuperaran els registres que
continguin: asthma, asthmaticus, asthmatic...
• També es poden fer servir cometes per a cercar termes com
una frase. Per exemple “Isaacs Syndrome” només retornarà els
registres on aquests termes apareguin junts.

10. • Si es busquen articles que tractin sobre el càncer de mama es
pot provar amb els termes breast AND cancer
Quan comencem a
escriure el sistema ens
farà suggeriments
En aquest cas podríem
triar breast cancer....
...i fer clic a Search
per llençar la cerca
AND és l’operador booleà per defecte, no és necessari posar‐lo però cal
tenir present que això pot influir en el resultats obtinguts

11. • La pantalla de resultats ens mostrarà les referències de tots els
articles que incloguin aquestes dues paraules en alguna
part del seu contingut.
A la part esquerra tenim
el total de resultats i diu
quins s’estan mostrant
A la part dreta podem
fer la navegació entre
pàgines de resultats
Cadascuna de les
entrades es correspon a
la referència d’un article

12. • Cada entrada es correspon amb la referència d’un article citat
segons la normativa Vancouver
Si fem clic al títol...
...veurem el registre
complet (amb el resum)
Al registre complet
Tot el que sembla un
també hi veurem un
enllaç, funciona com un
llistat d’articles
enllaç (p.e. Si fem clic aquí,
relacionats
ens mostrarà TOTS els
articles d’aquest autor)

13. • A la columna dreta de la pantalla de resultats es troben
varis blocs laterals que possibiliten accions addicionals:
Filter your results per
filtrar els resultats de
manera que només es
...o bé, a articles gratuïts
mostrin aquells que es
(entrant al registre
corresponen a revisions...
complet, trobem l’enllaç
al text complet)
Veure les referències dels
articles que es troben a
PubMed Central

14. Also try suggereix
Recent activity registra possibles cerques
tots els passos que hem addicionals
anat fent durant la cerca
i ens hi permet retornar
en tot moment
Altres blocs que podem trobar:
•Find related data per a buscar informació relacionada amb la
cerca a altres bases de dades de l’NCBI.
• Search details per veure els detalls de la cerca actual.
• Titles with your search terms que mostra referències
d’articles que contenent els termes de la cerca al seu títol.

15. 3. L’historial de cerques: Search History
Search History ens permet recuperar en tot moment
cerques anteriors i permet, a més, combinar-les.
Si fem clic a Advanced
Search accedirem a
l’historial de cerques
L’historial de cerques es manté fins que passen 8 hores sense
activitat a PubMed o fins que fem clic a Clear History.

16. Seach History assigna a cada cerca un número que ens permet
combinar cerques anteriors:
Aquesta expressió de cerca farà una intersecció dels resultats
obtinguts a les cerques #2 i #1 que, en aquest cas, es
corresponen a:
(targeted radiotherapy ) AND (breast cancer)
a més, a la part dreta, veurem els resultats
corresponents a cada cerca. Fent‐hi clic, podem
recuperar en tot moment la cerca que ens interessi

17. 4. Aplicar filtres a les cerques: Limits
Limits ens permet aplicar filtres o condicions addicionals a
les cerques. Per accedir-hi fem clic a la pestanya
corresponent:
Les possibilitats són moltes, veurem les més habituals:
• Suprimir les referències sense resum
• Filtrar-les segons la data de publicació de l’article
• Limitar-les segons la llengua de publicació de l’article

18. Algunes referències no tenen resum (abstract) i ens hem de
conformar amb el títol per a saber de què tracten. Aquesta
informació sovint és insuficient.
Per això, si tenim un nombre considerable de resultats, pot ser
útil suprimir les referències que no en tenen:
Del bloc de filtres
Text Options
marquem la casella
Abstracts... ...i fem clic a Search
per tornar a llençar la
cerca

19. • Si volem limitar els resultats en funció de la data de
publicació dels articles, hem d’obrir el desplegable que hi ha a
Dates:
Podem filtrar els
articles publicats en
els últims X dies o X
anys...
...o triar Specify
date range...
...que ens permet
establir un període
concret
(en format ANY‐MES‐DIA, on
mes i dia són opcionals)
En qualsevol cas, hem
de fer clic a Search per
aplicar el filtre

20. • El bloc de filtres Languages, permet destriar les referències en
funció de l’idioma en que han estat publicats originalment els
articles:
Podem triar tants
idiomes com vulguem
(per exemple, anglès i
castellà)
Atenció! PubMed-Medline tradueix a l’anglès tota la informació
que conté independentment de l’idioma en que estigui escrit
l’article:
Per exemple, aquest
article està publicat
originalment en xinès!

21. • Hi ha molts més filtres que es poden aplicar per a refinar les
cerques. En cas de dubtes sobre el funcionament d’algun d’ells, es
pot consultar l’ajuda disponible:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=helppubmed&part=pubmedhelp#pubmedhelp.Limits
• Els filtres es mantenen actius en les cerques successives fins que
els desactivem fent clic a Reset:
• Quan hi ha algun filtre aplicat a una cerca, la pantalla principal
ens mostra la informació corresponent:
Des d’aquí també
podem desactivar‐los:
Remove, o bé
modificar‐los: Change

22. 5. Canviar la visualització: Display settings
Display Settings ens permet canviar:
• El format en que es visualitzen les referències
• El nombre de resultats per pàgina
• L’ordenació en que es mostren
Fem clic a Display Settings per
obrir el menú amb les opcions
disponibles

23. Canviar el format de visualització
• El format de visualització per defecte és el Summary.
• El menú Format ens permet canviar-lo, entre d’altres
possibilitats, per:
• Abstract que inclou el resum i els enllaços al text complet.
• Medline que farem servir per exporta-les a un gestor
bibliogràfic com RefWorks.
Un cop fem clic a Apply
tots els registres es
mostraran en el format
seleccionat

24. 6. Treballant amb les referències: Send to
• Un cop feta la cerca i aplicades les limitacions pertinents és
el moment de revisar les referències recuperades i triar
les que ens interessin.
• Amb aquestes (o amb totes les referències) ens pot
interessar guardar-les en un fitxer, imprimir-les o
enviar-les per correu electrònic.
• Per a seleccionar les referències que es volen guardar,
imprimir o enviar per correu, es fa servir el quadre de
selecció que hi ha associat a cada entrada:

25. Guardar referències: Send to File
A la part superior dreta de la pantalla de resultats trobarem
Send to, al fer-hi clic se’ns mostrarà la pantalla d’opcions:
Per guardar‐les triem
File...
...aleshores podrem triar el
format. Cal canviar a
Abstract si volem el resum o
Medline per exportar‐les a
En fer Create File, Refworks
s’obrirà un quadre de
diàleg que permet triar el
nom del fitxer i el lloc on
es guardarà

26. Enviar referències per correu electrònic: Send to E‐mail
En aquest cas triarem l’opció E-mail:
També podem triar el
format...
...i el nombre de
registres que s’enviaran
Finalment posem l’adreça
de correu i fem clic a
E‐mail per enviar‐lo

27. Imprimir referències: Format text
Abans d’imprimir les referències és important convertir-les a un format
adient (format text). En lloc de Send to farem servir el menú de
Display Settings que ja coneixem:
Summary (text) si no
volem imprimir el resum...
...o bé, Abstract (text)
per a imprimir‐les amb
el resum
Recordem fer clic a Apply!
Un cop tenim les referències en format text, només cal
donar l’ordre d’impressió al nostre navegador (Fitxer –
Imprimeix) o bé prémer la combinació de tecles CTRL + P.

28. 7. Recuperar el text complet dels articles
Hem vist que quan fem cerques a PubMed Medline el que
recuperem són referències d’articles.
Normalment ens interessarà recuperar l’article complet (full
text) d’algunes d’elles.
Si visualitzem el registre sencer veurem que moltes
referències presenten un enllaç al full text.
L’aspecte de l’enllaç varia segons l’editor de la revista on
s’ha publicat l’article però es troben sempre als
mateixos llocs:

29. A la part superior dreta
si estem visualitzant un
registre complet solt...
...o bé al final de cada
registre, si estem
visualitzant‐ne una
relació
(en format abstract)

30. • Els exemples anteriors es corresponen a articles publicats en
revistes del grup Springer els dos primers i d’Elsevier
el tercer.
• Sempre que veiem una icona d’aquest tipus en la referència d’un
article que ens interessi, hi fem clic com a primera opció per a
recuperar el text complet.
• Si la UB té subscrita la revista (o bé, si es tracta d’una revista
gratuïta) accedirem a l’article complet.
Atenció! Si la revista no és gratuïta, per a que
funcioni cal accedir-hi des d’un ordinador de la UB o
tenir configurat el servei de proxy
• Les icones que donen accés al text complet són molt variades:

31. Altres possibilitats:
• En alguns casos ens podem trobar en què quan fem clic a la
icona no accedim a l’article complet: el sistema no ens
reconeix o ens demana un codi, etc.
• En d’altres simplement la referència no presenta cap icona...
Això NO vol dir necessàriament que no tinguem accés a la revista:
la UB la pot tenir subscrita per algun altre proveïdor o bé es pot
tractar d’una revista publicada en paper.
Per tant, si ens hi trobem, SEMPRE cal consultar el catàleg del
CRAI per a esbrinar si tenim subscrita la revista.
http://www.bib.ub.edu/

32. Atenció!
Recordeu que al catàleg hem de buscar les revistes amb el seu
nom complet i sense l’article inicial (si en té).
Per exemple si volem buscar aquesta revista:
Haurem de buscar al catàleg:
PubMed dóna els noms abreujats de les revistes (d’acord amb la
Normativa Vancouver) però ens facilita també el nom complet,
només cal posar el ratolí a sobre d’una abreviatura...
... I veureu que durant uns
segons s’obre una etiqueta
amb el nom complet de la
revista

33. Dubtes? Preguntes?
Podeu consultar l’ajuda de PubMed:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=helppubmed
O bé, adreçar‐vos al personal de la biblioteca:
http://www.bib.ub.edu/biblioteques/campus‐bellvitge/
us ajudarem!

34. Moltes gràcies!