Yatim Mandiri didirikan pada tahun 1994 dengan nama Yayasan Pembinaan dan Pengembangan Panti Asuhan Islam dan Anak Purna Asuh untuk memandirikan anak yatim melalui program pendidikan dan keterampilan. Yayasan ini kemudian berganti nama menjadi Yatim Mandiri pada tahun 2008 untuk memperluas manfaat pemberdayaan anak yatim. Saat ini Yatim Mandiri telah memiliki 42 cabang di 12 provinsi Indonesia dan terdaftar sebagai Lembaga Amil Zakat Nas