Н. Платонов. Москва, 19 апреля 2013, Атлас-отель, презентация на конференции Совзонда

1. RR
как инструмент обработки и анализакак инструмент обработки и анализа
пространственных данныхпространственных данных
Никита ПлатоновНикита Платонов
platonov@sevin.ruplatonov@sevin.ru
Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н.Северцова РАНИнститут проблем экологии и эволюции им. А.Н.Северцова РАН
(ИПЭЭ РАН)(ИПЭЭ РАН)

2. ЛицензированиеЛицензирование

3. КроссплатформенностьКроссплатформенность

4. RR как проекткак проект
► R –R – этоэто GNU-GNU-проект (проект (“GNU S”“GNU S”))
 R Core TeamR Core Team
 R FoundationR Foundation
 R-ForgeR-Forge
 CRAN TeamCRAN Team
► R –R – это язык программированияэто язык программирования
 Динамическая типизацияДинамическая типизация
 Числа, строки; вектора, массивы, спискиЧисла, строки; вектора, массивы, списки
 Циклы, условия, функцииЦиклы, условия, функции
 Интерфейс к функциям наИнтерфейс к функциям на C, C++, FortranC, C++, Fortran
 Классы (Классы (S3S3,, S4S4))

5. RR как проекткак проект
► R –R – это программная оболочкаэто программная оболочка
 Интерфейс командной строкиИнтерфейс командной строки
 ИнтерпретаторИнтерпретатор
 Система помощиСистема помощи
 Графика и визуализацияГрафика и визуализация
 Системные (ОС) функцииСистемные (ОС) функции
 GUIs (R commander, RStudio)GUIs (R commander, RStudio)
 Интеграция со средствами разработки ПОИнтеграция со средствами разработки ПО
► R –R – это документацияэто документация
 ManualsManuals
 FAQFAQ
 RefcardsRefcards
 R JournalR Journal
 BooksBooks

6. RR как проекткак проект
► RR – это сообщество– это сообщество
 NabbleNabble
 Stack overflowStack overflow
 Пользовательские группы (Пользовательские группы (RUGsRUGs))
 useR!useR!
► RR – это– это широкие возможностиширокие возможности
 Расширяемость с помощью пакетовРасширяемость с помощью пакетов
 Взаимодействие с другимиВзаимодействие с другими Open SourceOpen Source
 Грамотное программирование (Literate Programming)Грамотное программирование (Literate Programming)
 Воспроизводимое исследование (Reproducible Research)Воспроизводимое исследование (Reproducible Research)
 ГИСГИС

7. RR как ГИСкак ГИС
► Импорт/экспортИмпорт/экспорт
 Растровые данныеРастровые данные (rgdal, raster)(rgdal, raster)
 Векторные данныеВекторные данные (rgdal, shapefile)(rgdal, shapefile)
► ПерепроецированиеПерепроецирование
 Растровые (Растровые (raster,raster, GDALGDAL))
 ВекторныеВекторные (rgdal, project,(rgdal, project, GDALGDAL))
► Статическая визуализацияСтатическая визуализация
 РастровыеРастровые (graphics, lattice, ggplot2, raster)(graphics, lattice, ggplot2, raster)
 Векторные (Векторные (graphicsgraphics))

8. RR как ГИСкак ГИС
► Динамическая/интерактивная визуализацияДинамическая/интерактивная визуализация
(+браузер(+браузер, tcl/tk, tcl/tk))
 Базовая карта (Базовая карта (Google Maps, OpenStreetMapGoogle Maps, OpenStreetMap))
 Растровые (Растровые (EBimage,EBimage, Open sourceOpen source ГИСГИС))
 Векторные (Векторные (?,?, Open sourceOpen source ГИСГИС))
► ОцифровкаОцифровка
► Анализ пространственного размещения точекАнализ пространственного размещения точек
► ГеостатистикаГеостатистика
► Пространственная регрессияПространственная регрессия
► Цифровая обработка и анализ растровыхЦифровая обработка и анализ растровых
изображенийизображений
► Map composerMap composer (статический,(статический, интерактивныйинтерактивный ))

9. Достоинства и недостаткиДостоинства и недостатки RR
► Большое число подключаемых модулей дляБольшое число подключаемых модулей для
обработки растровых данных и пространственногообработки растровых данных и пространственного
анализаанализа
► ВизуализацияВизуализация
► Пакетный режим без скриптовых языков и функцийПакетный режим без скриптовых языков и функций
ОСОС
► Подготовка картографического материала дляПодготовка картографического материала для
печати в научных журналахпечати в научных журналах
► Многопанельная компоновка карт может бытьМногопанельная компоновка карт может быть
достигнута базовым функционаломдостигнута базовым функционалом
► Слабая поддержка интерактивностиСлабая поддержка интерактивности
► Необходимость использования сторонних (Необходимость использования сторонних ( OpenOpen
SourceSource)) приложенийприложений

10. ОткрытостьОткрытость RR
► Для пользователяДля пользователя
 Техническая поддержка – сообществоТехническая поддержка – сообщество
 Стандартизированная документация – высокоуровневоеСтандартизированная документация – высокоуровневое
описаниеописание
 Исходный код – низкоуровневая документацияИсходный код – низкоуровневая документация
 Пользователь может стать разработчикомПользователь может стать разработчиком
► Для разработчикаДля разработчика
 Open Source: cOpen Source: cтандартизация участия в проектахтандартизация участия в проектах
 Open Source:Open Source: инструментарийинструментарий
 R:R: инструментарийинструментарий
► Для проектаДля проекта
 Экономия на закупках программных лицензийЭкономия на закупках программных лицензий
 Разработка заинтересованными участникамиРазработка заинтересованными участниками

11. Примеры использованияПримеры использования

12. Примеры использованияПримеры использования

13. Примеры использованияПримеры использования

14. Примеры использованияПримеры использования

15. Примеры использованияПримеры использования

16. Примеры использованияПримеры использования
Кириллица:Кириллица: ImageMagickImageMagick ((Open SourceOpen Source))

17. Примеры использованияПримеры использования

18. Примеры использованияПримеры использования

19. Примеры использованияПримеры использования

20. СпасибоСпасибо
Никита Платонов (ИПЭЭ РАН)Никита Платонов (ИПЭЭ РАН)
platonov@sevin.ruplatonov@sevin.ru