Detalle de contenidos del Módulo de Bioinformática que incluye nuestra oferta de Ciclos Formativos http://daw.gf.eug.es/es

1. Mòdul 10: Bioinformàtica
Durada: 264 hores
Hores de lliure disposició: No se n’assignen
Equivalència en crèdits ECTS: No se n’assignen
Unitats formatives que el componen:
UF1. Eines computacionals en informàtica mèdica. 55 hores
UF2. Eines computacionals en les ciències Òmiques. 99 hores
UF3. Disseny de nous fàrmacs. 110 hores
UF 1: Eines computacionals en informàtica mèdica
Durada: 55 hores
Continguts
1. Informàtica mèdica:
1.1 Les dades massives (Big-data) en la investigació biomèdica i en l’atenció
sanitària. Dades mèdiques de caràcter personal. L’anonimització de les
dades. Legislació en protecció de dades.
1.2 Tipus de dades biomèdiques. Bases de dades d’articles de científics.
1.3 Anàlisi de dades: mètodes estadístics. L’entorn de programari R. Anàlisi
de dades amb R.
2. Eines informàtiques en investigació biomèdica i atenció sanitària:
2.1 Cloud computing. Amazon Elastic Compute Cloud (Amazon EC2) i altres.
2.2 Bases de dades d’ús habitual en informàtica mèdica. PharmGKB,
ClinVar-NCBI, OMIM, BioMart, PDB i altres.
2.3 Enregistrament de resultats i elaboració d’informes.
UF 2: Eines computacionals en les ciències òmiques
Durada: 99 hores.
Continguts
1. Biomolècules i ciències òmiques:
1.1 Biomolècules: des de l’ADN a la síntesi de proteïnes. Estructura de
l’ADN. Els nucleòtids. Les proteïnes. Els aminoàcids. Estructura de les
proteïnes. Transcripció de l’ADN. L’ARN. Síntesi de proteïnes.
1.2 Tècniques de seqüenciació de l’ADN. Comparació de seqüencies.
Importància en l’estudi del genoma.
1.3 Ciències òmiques. Genòmica. Proteòmica i metabolòmica. Epigenòmica.
Interactòmica i biologia de sistemes. Altres ciències òmiques.
Aplicacions.
1.4 Sectors d’aplicació en l’àmbit biomèdic i agroalimentari.

2. 2. Eines informàtiques en les ciències òmiques:
2.1 Eines d’ús habitual en genòmica. Manipulació de seqüències. Alineació.
Acoblament de genomes. Anotació de gens. SAMtools, Galaxy i d’altres.
2.2 Repositori d’eines i aplicacions d’ús habitual en ciències òmiques.
Introducció a Bioconductor.
2.3 Aplicació de Bioconductor en les ciències òmiques: en trancriptòmica i en
epigenòmica.
2.4 Enregistrament de resultats i elaboració d’informes.
UF 3: Disseny de nous fàrmacs
Durada: 110 hores.
Continguts
1. Els fàrmacs i els receptors:
1.1 Els fàrmacs. Finalitats. Formes farmacèutiques i medicaments.
1.2 Biodisponibilitat i farmacocinètica. ADME.
1.4 Estructura de les proteïnes.
1.5 Receptors. Interacció fàrmac-receptor: agonistes, antagonistes, etc.
1.6 Estructura espacial de les molècules. Models 3D moleculars. Enllaços
intermoleculars. Grups funcionals.
2. Eines informàtiques en el disseny de nous fàrmacs:
2.1 Bases de dades d’estructures químiques.
2.2 Obtenció de dades. Filtrat. Mètodes de cerca.
2.3 Cribatge virtual 2D (virtual screening).
2.4 Eines per la cerca i el disseny de farmacòfors.
2.5 Eines per l’acoblament molecular (docking): AutoDock i AutoGrid.
2.6 Eines per simulació de dinàmica molecular: Gromacs, Amber i Charmm.
2.7 Eines pel modelat per homologia: Swiss-Model.
2.8 Enregistrament de resultats i elaboració d’informes.