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Introduction of inspectDF package
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- 2. @kato_kohaku • 臨床検査事業 のなかのひと ？専門 • 遊牧＠モンゴル → 臨床検査事業の研究所 • 生態学／環境科学 → 医療情報学／疫学 1cm 誰？
- 3. マーケットバスケット分析 • 「おむつとビール」で有名なアレ • アソシエーション分析、関連ルールマイニングとかいろいろ呼ばれる •トランザクションデータベースに頻出する、アイテム間の何らかの組み合わせ規則 をとりだす 用語 • ルールの条件部(lhs) • 結論部(rhs) • 支持度：support(X ⇒ Y) • アイテムX,Yを同時に含むトランザクションが、データ中に占める比率 • 確信度：confidence(X ⇒ Y) • アイテム X が含まれるトランザクション中に、アイテム Y も同時に含まれる比率 • リフト：lift (X ⇒ Y) • 確信度をトランザクションにYが含まれる頻度で補正したもの、有効性の指標 LHS => RHS {"パン","オムツ", "ハム"} => {"ビール“}
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- 5. 標準ツールでのルール探索がつらい • 標準の、print(), summary()がそっけない •標準の、subset()をはじめとする関数のつかいかたを覚えたくない → data frame ＋ dplyr&etc. で探索したい モチベーション
- 6. 「モダン」な探索に向けて • ルールリスト をデータフレーム で 扱いたい • (一応) inspect() 内のprint()の副作用でデータフレームの取得は可能 → コンソールに全部出力される • 体裁(=>)のためだけに、無名のカラムを含むdata frameが出力される モチベーション
- 7. 作った：inspectDFパッケージ • arules::inspect()をinvisibleにdata.frameで出力する • arules::inspect()の代わりに inspectDF() するだけ。 inspectDF package
- 8. 作った：inspectDFパッケージ • それぞれのカラムを取り出すための関数は、arules標準で用意されている • 自分が作ったのは、LHSに含まれるアイテム数(n.lhs) だけ inspectDF package
- 9. インストール • Github から •https://github.com/katokohaku/inspectDF inspectDF package
- 10. 「モダン」な探索例 1. 条件部に、yogurt またはsausage を含むルールのうち、 2. 確信度→リフト値の高い順に、 3. アイテムが2つ以上のルールを、 4. 上位5件 inspectDF package
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- 13. 余談：アイテム名とセパレータ • アイテム名に“,”が含まれることがある • たとえばDHA inspectDF package
- 14. 余談：アイテム名とセパレータ • アイテム名に“,”が含まれることがある • sepオプションで好きな文字列をセパレータに指定可能 •もともとのarulesの機能を継承しただけ inspectDF package
- 15. 参考 • フリーソフトによるデータ解析・マイニング • アソシエーション分析(1) •https://www.cis.doshisha.ac.jp/mjin/R/40/40.html • アソシエーション分析(2) • https://www1.doshisha.ac.jp/~mjin/R/Chap_41/41.html • グラフプロット • マーケットバスケット分析の結果をRパッケージigraphを使って可視化する • https://qiita.com/hideaki/items/8066a635e61ee0d1b389