2. Ser 195 is een onderdeel van Catalytic triade: Asp102; His57 en Ser195. Serine 195 wordt omgezet in een nucleofiel. Hoe zorgt de rangschikking van de drie residuen in de triade tot een hoge reactiviteit van ser 195.

3. Peptide hydrolyse door chymotrypsine

5. catalytic strategies

6. catalytic strategies Uiteenvallen van tetraëder Het proton van het positief geladen His wordt overgedragen aan de aminogroep die gevormd is door verbreking van de peptide binding.

8. catalytic strategies Deacylering:

9. catalytic strategies

10. catalytic strategies

11. catalytic strategies

12. catalytic strategies

13. Active site results in substrate specificity and stereospecificity 1 3 2

14. 7 5 6 4

15. Specificiteit van proteases Chymotrypsine knipt peptidebinding na residuen met een aromatische of lange hydrofobe keten Tripsine knipt peptidebinding na residuen met een lange positief geladen zijketen (arg;lys) Elastase knipt peptidebinding na residuen met een kleine zijketen (alanine; serine)

16. catalytic strategies Chymotrypsin binding pocket Een diepe relatieve hydrofobe pocket, S1 pocked.

17. Meer complexe specificiteit van protease enzymen

18. S1 pocket van chymotrypsine, trypsine en elastase.

19. De katalytische triade en oxyanion hole van subtilisin Subtilisin een protease in bacterien. Bevat de katalytische traide en oxyanion hole.

20. Site directe mutagenese van triade aminozuren in subtilisin

21. Andere proteases. Strategie: Genereer een nucleofiel die carbonyl groep van peptide binding aanvalt.

22. HIS Cys

25. HIV protease.

28. Bespreking 4 klasse van enzymen Serine proteases (chymotrypsine) Carbonic anhydrase Restriction endonucleases Nucleoside monophosphate kinases

29. Carbonic Anhydrase. CO 2 is eindproduct van metabolisme. Het wordt afgegeven aan het bloed en getransporteerd maar longen. In rode bloedcellen reageert CO 2 met water.

30. Carbonic anhydrases maakt een snelle reactie veel sneller.

31. Het enzym carbonic anhydrase bevat een gebonden zink-ion.

32. Enzym Carbonic Anhydrase. Zink is aanwezig in biologische systemen uitsluitend in de +2 toestand Zink is gebonden aan 4 of meer liganden. In carbonic anhydrase zijn drie coördinaten bezet door de imidazole-ringen van drie histidine-residuen en de andere coördinaat is bezet door water.

33. Effect pH op activiteit van carbonic anhydrase

34. Welke invloed heeft het zinkcomplex op CO 2 -hydratatie De binding van een watermolecuul aan het positief geladen zinkcentrum verlaagt de pK A van water van 15,7 tot 7.

35. Mechanisme van carbonic anhydrase