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2011학년도 2학기 의학 통계학 팀 프로젝트




         20106127 박무승 20106143 이성주
         20106129 송주연 20106153 이지현


December 10, 2011   의학통계학 팀 프로젝트     1
추간판 탈출증


         Backpain 통계 자료 개요
         환자 대조군 연구(Case-Control Study)
         Backpain 소스 코드 주석 및 그 의미
         그래프 해석 및 분석



December 10, 2011   의학통계학 팀 프로젝트         2
추간판
         척추의 추골 사이 위치
              구부리는 것을 가능하게 함
         척추원반 or 척추 디스크
    추간판 탈출증
         디스크 질긴 바깥쪽 껍질에 해
         당하는 섬유가 찢어지거나 약
         해져서 디스크 내용물이 밖으
         로 흘러나오는 경우
         대개 중년의 성인들에게서 발생

December 10, 2011      의학통계학 팀 프로젝트   3
증상
         흘러나온 디스크가 척추관내
         척추신경 압박
         다양한 신경 관련 증상 유발
              통증, 감각저하, 근육 약화 등
              심한 경우 방광이나 내장을 조
              절하는 신경을 압박하여     소변
              실금이나 내장조절기능에 장애
              가 생기기도 함




December 10, 2011       의학통계학 팀 프로젝트   4
디스크 노화
    유전적 인자
    개인적 위험인자
    운전자, 컴퓨터 프로그래머 등 오랫동안
    앉아서 일하는 직업군이 추간판 탈출증에
    노출될 확률이 높다.



December 10, 2011   의학통계학 팀 프로젝트   5
열악한 도로 환경
 울퉁불퉁한 도로 과속방지턱
열악한 업무 환경
 장시간 운전으로 인한 피로와 스트레스, 교통체증, 짧
 은 배차간격으로 인한 휴식 부족 등
앉아서 일함
 서있을 때보다 앉아있을 때 2~3배 하중이 척추에 가
 해짐. 육체적 움직임이 적은 좁은 운전석에 장시간 앉
 음으로 인한 균형 붕괴
Driving and Back Pain Data
    차를 운전하는 것과 급성 추간판 탈출증(Acute
    Herniated Lumbar Intervertebral Discs, AHLID)으
    로 인한 요통 발생 사이의 관계
    환자 대조군 연구(Case-Control Study)
         Case Group : AHLID 판정
         Control Group : 척추와 관련 이상 없음
         최종 여성 89쌍, 남성 128쌍 → 전체 217쌍 모집


December 10, 2011    의학통계학 팀 프로젝트                7
통계에 사용된 변수 : 434명 & 4가지 요인
         ID : 매칭된 짝의 번호
         Status : Case or Control을 구분
         Driver : 운전하는가의 여부를 구분
         Suburban : 교외에 거주하는가의 여부를 구분
              실험 대상 추출 과정 중에 교외 거주 여부 요인을 추
              가로 알아냄으로써, Suburban 여부까지
              Backpain과 관련있는지 조사하게 됨.



December 10, 2011     의학통계학 팀 프로젝트        8
ID : 총 217쌍 조사 → 217번까지 존재
  Status, Driver, Suburban : Yes or No 형태 → 2가지 답변 존재
  ID(Pair Number) = Case 1명 + Control 1명 (Status에 기준한 구성)

December 10, 2011       의학통계학 팀 프로젝트                        9
정의
연구하고자 하는 질병이 있는 집단(CASE)와
없는 집단(CONTROL)을 선정하여 질병의
발생과 관련되어 있으리라 생각하는 잠정적 위
험요인에 대한 두 집단의 과거 노출률을 비교
하는 방법
DESIGN

       CASE                 CONTROL




위험인자          위험인자   위험인자             위험인자
 노출           비 노출    노출              비 노출
CASE 와 CONTROL을 위험인자 노출 여부에 따
라 각각 두 그룹으로 나눈 후 비율을 구하고 분석



             왼쪽 그림에서 빨간색
             선으로 표시된 너비의
             차이가 위험인자에 대한
             노출률의 차이이다.
장점
시간과 비용 절약
비교적 드문 질병을 연구하기에 적합
한 질병에 관계되는 여러 위험요인을 동시에
조사하는 것이 가능
단점
요인에 대한 노출률이 낮은 경우
수행하기 곤란
요인과 질병과의 시간적 선후관계 불분명
전체적인 자료 탐색 – xtabs, ftable, addmargins




     하나의 제 3요인을 바탕으로 제 1요인과 제 2요인을 서로 구분하여 2차원 table로 구성.
     이 경우 Suburban의 factor 개수에 따라 표를 나눔
     Flat Table. 3차원으로 나타날 수 있는 표를 평면적인 형태로 나타내는 것
     2차원 table에 맨 끝하나씩 행렬을 추가하여 각 행과 열에 대한 부분합과 전체 합을 구한 것


December 10, 2011       의학통계학 팀 프로젝트                     15
Driver 여부에 따른 발병률 차이




                    Xtabs : 자료를 2*2 table로 나타내는 것
                        가로축 Status 제 1요인, 세로축 Driver 제 2요인
                    Prop.table : 제 2요인에 근거, (              ) Driver
                    Yes와 No 따로 각각 Case와 Control의 비율 나타내
                    는 것.
                        E.g. Driver No & Case Group 0.372 + Driver
                        No & Control Group 0.628 = Driver No 1
                                             : 소수점 아래 셋째 자리
December 10, 2011      의학통계학 팀 프로젝트                              16
Driver 여부에 따른 발병률 차이




    앞의 xtabs table에 대한 chisq.test
                                     : 모든 표의 요인
         이           이분법이므로 어느 하나의 수가 정해지면 나머
         지          모든 표의 빈칸 요소가 저절로 결정된다.
                           : 자료가 유의하다는 결론

December 10, 2011          의학통계학 팀 프로젝트           17
Suburban 여부에 따른 발병률 차이




December 10, 2011   의학통계학 팀 프로젝트   18
Conditional Logit 모델 적합




    Driver & Suburban 설명변수를 이용하여 분석

      모든 환자를 똑같이 취급할 수 없음
    하나의 대표 값으로 나타내면 전체적인 Case 환자 분석 용이

December 10, 2011    의학통계학 팀 프로젝트        19
Conditional Logit 모델 적합




    backpain_glm<-clogit(I(status == "case") ~ driver + suburban +
    strata(ID), data = backpain)
                                 , Driver과 Suburban 변수로 근거하여
        분석
        전체적인 윤곽 분석 (Summary 이용)
December 10, 2011           의학통계학 팀 프로젝트                             20
Conditional Logit 모델 적합




    backpain_glm<-clogit(I(status == "case") ~ driver + suburban +
    strata(ID), data = backpain)
                                 , Driver과 Suburban 변수로 근거하여
        분석
        전체적인 윤곽 분석 (Summary 이용)
December 10, 2011           의학통계학 팀 프로젝트                             21
Conditional Logit 모델 적합




             : 해당 조건에 속하는 도수의 크기를 직사각형 전체
    넓이 중 일부에 나타냄으로써 크기를 비교할 수 있도록 한 Plot




December 10, 2011   의학통계학 팀 프로젝트            22
a & b 높이 : driver가 아니면서 backpain일 비율 &
 driver가 아니면서 backpain이 아닐 비율
→
 c & d 높이 : driver이면서 backpain일 비율 &
driver이면서 backpain이 아닐 비율
 →
오른쪽 위치한 mosaicplot (c,d) 너비
      > 왼쪽 위치한 mosaicplot (a,b) 너비
→
  ( 운전을 하는 사람의 수 : 64+63=127,
    운전을 하지 않는 사람의 수 : 26+47=73 )
Driver No & Backpain Yes          : 0.372
      < Driver No & Backpain No          : 0.628
운전을 하지 않을 경우 backpain이 발생하지 않을 확률이 발생할
 확률보다 높음
 Driver Yes & Backpain Yes          : 0.532
      > Driver Yes & Backpain No          : 0.468
운전을 할 경우 backpain이 발생할 확률이 그렇지 않을 확률보다 높음
Driver가 아니면서 backpain일 경우에 해당하는
mosaicplot(a)의 높이와 Driver이면서 backpain일 경우에
해당하는 mosaicplot(c)의 높이의 차이
: 0.532 - 0.372 =
오른쪽 위치한 mosaicplot (c,d) 너비
      > 왼쪽 위치한 mosaicplot (a,b) 너비
→
  ( 운전을 하는 사람의 수 : 64+63=127,
    운전을 하지 않는 사람의 수 : 26+47=73 )
a & b 높이 : suburban이 아니면서 backpain일 비율 &
suburban이 아니면서 backpain이 아닐 비율
→
c & d 높이 : suburban이면서 backpain일 비율 &
suburban이면서 backpain이 아닐 비율
→
오른쪽에 위치한 mosaicplot들(c,d)의 너비와 왼쪽에 위치
한
mosaicplot들(a,b)의 너비의 길이가 크게 차이가 나지 않음
→

(교외에 거주하는 사람의 수 : 127+107=234,      교
외에 거주하지 않는 사람의 수 : 90+110=200 )
전에 살펴본 driver-backpain mosaicplot과 달리 a,b의
 높이 차와 c,d의 높이 차가 크게 두드러지지 않는다.
 Suburban이 아니면서 backpain일 경우에 해당하는
mosaicplot(a)의 높이와 suburban이면서 backpain일 경우에
 해당하는 mosaicplot(c)의 높이의 차이
: 0.543 - 0.450 =
빨간색 선(0.16) > 파란색 선(0.093)
이 case control study는 위험인자로
생각되는 운전이 정말로 backpain에 영향
을 끼치는지에 대한 연구이다.
Driver 여부에 따른 발병률 차이에 대한
자료가 유의성이 있었다.
또한 운전과 병 사이의 관련 또한 유의한 것
으로 나타났다.
실험 대상 추출 과정 중 교외 거주 여부라는
요인이 추가되었고, 그에 따라 추가로
suburban과 backpain 사이의 유의성도 검
증하였다.
유의성 검증 결과 suburban은 backpain과
상관관계가 없었다.
서론에서 밝혔듯이 운전은 추간판      탈
출증을 일으킬 수 있는 요인이 될 수 있다.
운전은 개인적 위험요인이 됨을 자료    분
석을 통해 확인하였다.
운전은 추간판 탈출증과 관련이 있다.
http://www.vitaminmd.co.kr/dic/disease/harvard/view.md
?diseaseid=000oK
http://blog.naver.com/PostView.nhn?blogId=kjsspine&log
No=60095892695
http://www.google.co.kr/url?sa=t&rct=j&q=case%20contr
ol%20study&source=web&cd=6&ved=0CGAQFjAF&url=
http%3A%2F%2Fwww.kosinmed.or.kr%2Fdept_home%
2Fedu%2Ffiles%2Fedu_c_tm04.ppt&ei=ljDbTrqSOampi
Ae9w_3ZDQ&usg=AFQjCNGJZuZMBf62rFTX2qw7Knb
OibQ86w&cad=rjt

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Backpain 자료 분석 보고

  • 1. 2011학년도 2학기 의학 통계학 팀 프로젝트 20106127 박무승 20106143 이성주 20106129 송주연 20106153 이지현 December 10, 2011 의학통계학 팀 프로젝트 1
  • 2. 추간판 탈출증 Backpain 통계 자료 개요 환자 대조군 연구(Case-Control Study) Backpain 소스 코드 주석 및 그 의미 그래프 해석 및 분석 December 10, 2011 의학통계학 팀 프로젝트 2
  • 3. 추간판 척추의 추골 사이 위치 구부리는 것을 가능하게 함 척추원반 or 척추 디스크 추간판 탈출증 디스크 질긴 바깥쪽 껍질에 해 당하는 섬유가 찢어지거나 약 해져서 디스크 내용물이 밖으 로 흘러나오는 경우 대개 중년의 성인들에게서 발생 December 10, 2011 의학통계학 팀 프로젝트 3
  • 4. 증상 흘러나온 디스크가 척추관내 척추신경 압박 다양한 신경 관련 증상 유발 통증, 감각저하, 근육 약화 등 심한 경우 방광이나 내장을 조 절하는 신경을 압박하여 소변 실금이나 내장조절기능에 장애 가 생기기도 함 December 10, 2011 의학통계학 팀 프로젝트 4
  • 5. 디스크 노화 유전적 인자 개인적 위험인자 운전자, 컴퓨터 프로그래머 등 오랫동안 앉아서 일하는 직업군이 추간판 탈출증에 노출될 확률이 높다. December 10, 2011 의학통계학 팀 프로젝트 5
  • 6. 열악한 도로 환경 울퉁불퉁한 도로 과속방지턱 열악한 업무 환경 장시간 운전으로 인한 피로와 스트레스, 교통체증, 짧 은 배차간격으로 인한 휴식 부족 등 앉아서 일함 서있을 때보다 앉아있을 때 2~3배 하중이 척추에 가 해짐. 육체적 움직임이 적은 좁은 운전석에 장시간 앉 음으로 인한 균형 붕괴
  • 7. Driving and Back Pain Data 차를 운전하는 것과 급성 추간판 탈출증(Acute Herniated Lumbar Intervertebral Discs, AHLID)으 로 인한 요통 발생 사이의 관계 환자 대조군 연구(Case-Control Study) Case Group : AHLID 판정 Control Group : 척추와 관련 이상 없음 최종 여성 89쌍, 남성 128쌍 → 전체 217쌍 모집 December 10, 2011 의학통계학 팀 프로젝트 7
  • 8. 통계에 사용된 변수 : 434명 & 4가지 요인 ID : 매칭된 짝의 번호 Status : Case or Control을 구분 Driver : 운전하는가의 여부를 구분 Suburban : 교외에 거주하는가의 여부를 구분 실험 대상 추출 과정 중에 교외 거주 여부 요인을 추 가로 알아냄으로써, Suburban 여부까지 Backpain과 관련있는지 조사하게 됨. December 10, 2011 의학통계학 팀 프로젝트 8
  • 9. ID : 총 217쌍 조사 → 217번까지 존재 Status, Driver, Suburban : Yes or No 형태 → 2가지 답변 존재 ID(Pair Number) = Case 1명 + Control 1명 (Status에 기준한 구성) December 10, 2011 의학통계학 팀 프로젝트 9
  • 10. 정의 연구하고자 하는 질병이 있는 집단(CASE)와 없는 집단(CONTROL)을 선정하여 질병의 발생과 관련되어 있으리라 생각하는 잠정적 위 험요인에 대한 두 집단의 과거 노출률을 비교 하는 방법
  • 11. DESIGN CASE CONTROL 위험인자 위험인자 위험인자 위험인자 노출 비 노출 노출 비 노출
  • 12. CASE 와 CONTROL을 위험인자 노출 여부에 따 라 각각 두 그룹으로 나눈 후 비율을 구하고 분석 왼쪽 그림에서 빨간색 선으로 표시된 너비의 차이가 위험인자에 대한 노출률의 차이이다.
  • 13. 장점 시간과 비용 절약 비교적 드문 질병을 연구하기에 적합 한 질병에 관계되는 여러 위험요인을 동시에 조사하는 것이 가능
  • 14. 단점 요인에 대한 노출률이 낮은 경우 수행하기 곤란 요인과 질병과의 시간적 선후관계 불분명
  • 15. 전체적인 자료 탐색 – xtabs, ftable, addmargins 하나의 제 3요인을 바탕으로 제 1요인과 제 2요인을 서로 구분하여 2차원 table로 구성. 이 경우 Suburban의 factor 개수에 따라 표를 나눔 Flat Table. 3차원으로 나타날 수 있는 표를 평면적인 형태로 나타내는 것 2차원 table에 맨 끝하나씩 행렬을 추가하여 각 행과 열에 대한 부분합과 전체 합을 구한 것 December 10, 2011 의학통계학 팀 프로젝트 15
  • 16. Driver 여부에 따른 발병률 차이 Xtabs : 자료를 2*2 table로 나타내는 것 가로축 Status 제 1요인, 세로축 Driver 제 2요인 Prop.table : 제 2요인에 근거, ( ) Driver Yes와 No 따로 각각 Case와 Control의 비율 나타내 는 것. E.g. Driver No & Case Group 0.372 + Driver No & Control Group 0.628 = Driver No 1 : 소수점 아래 셋째 자리 December 10, 2011 의학통계학 팀 프로젝트 16
  • 17. Driver 여부에 따른 발병률 차이 앞의 xtabs table에 대한 chisq.test : 모든 표의 요인 이 이분법이므로 어느 하나의 수가 정해지면 나머 지 모든 표의 빈칸 요소가 저절로 결정된다. : 자료가 유의하다는 결론 December 10, 2011 의학통계학 팀 프로젝트 17
  • 18. Suburban 여부에 따른 발병률 차이 December 10, 2011 의학통계학 팀 프로젝트 18
  • 19. Conditional Logit 모델 적합 Driver & Suburban 설명변수를 이용하여 분석 모든 환자를 똑같이 취급할 수 없음 하나의 대표 값으로 나타내면 전체적인 Case 환자 분석 용이 December 10, 2011 의학통계학 팀 프로젝트 19
  • 20. Conditional Logit 모델 적합 backpain_glm<-clogit(I(status == "case") ~ driver + suburban + strata(ID), data = backpain) , Driver과 Suburban 변수로 근거하여 분석 전체적인 윤곽 분석 (Summary 이용) December 10, 2011 의학통계학 팀 프로젝트 20
  • 21. Conditional Logit 모델 적합 backpain_glm<-clogit(I(status == "case") ~ driver + suburban + strata(ID), data = backpain) , Driver과 Suburban 변수로 근거하여 분석 전체적인 윤곽 분석 (Summary 이용) December 10, 2011 의학통계학 팀 프로젝트 21
  • 22. Conditional Logit 모델 적합 : 해당 조건에 속하는 도수의 크기를 직사각형 전체 넓이 중 일부에 나타냄으로써 크기를 비교할 수 있도록 한 Plot December 10, 2011 의학통계학 팀 프로젝트 22
  • 23. a & b 높이 : driver가 아니면서 backpain일 비율 & driver가 아니면서 backpain이 아닐 비율 → c & d 높이 : driver이면서 backpain일 비율 & driver이면서 backpain이 아닐 비율 →
  • 24. 오른쪽 위치한 mosaicplot (c,d) 너비 > 왼쪽 위치한 mosaicplot (a,b) 너비 → ( 운전을 하는 사람의 수 : 64+63=127, 운전을 하지 않는 사람의 수 : 26+47=73 )
  • 25. Driver No & Backpain Yes : 0.372 < Driver No & Backpain No : 0.628 운전을 하지 않을 경우 backpain이 발생하지 않을 확률이 발생할 확률보다 높음 Driver Yes & Backpain Yes : 0.532 > Driver Yes & Backpain No : 0.468 운전을 할 경우 backpain이 발생할 확률이 그렇지 않을 확률보다 높음
  • 26. Driver가 아니면서 backpain일 경우에 해당하는 mosaicplot(a)의 높이와 Driver이면서 backpain일 경우에 해당하는 mosaicplot(c)의 높이의 차이 : 0.532 - 0.372 =
  • 27. 오른쪽 위치한 mosaicplot (c,d) 너비 > 왼쪽 위치한 mosaicplot (a,b) 너비 → ( 운전을 하는 사람의 수 : 64+63=127, 운전을 하지 않는 사람의 수 : 26+47=73 )
  • 28. a & b 높이 : suburban이 아니면서 backpain일 비율 & suburban이 아니면서 backpain이 아닐 비율 → c & d 높이 : suburban이면서 backpain일 비율 & suburban이면서 backpain이 아닐 비율 →
  • 29. 오른쪽에 위치한 mosaicplot들(c,d)의 너비와 왼쪽에 위치 한 mosaicplot들(a,b)의 너비의 길이가 크게 차이가 나지 않음 → (교외에 거주하는 사람의 수 : 127+107=234, 교 외에 거주하지 않는 사람의 수 : 90+110=200 )
  • 30. 전에 살펴본 driver-backpain mosaicplot과 달리 a,b의 높이 차와 c,d의 높이 차가 크게 두드러지지 않는다. Suburban이 아니면서 backpain일 경우에 해당하는 mosaicplot(a)의 높이와 suburban이면서 backpain일 경우에 해당하는 mosaicplot(c)의 높이의 차이 : 0.543 - 0.450 =
  • 31. 빨간색 선(0.16) > 파란색 선(0.093)
  • 32. 이 case control study는 위험인자로 생각되는 운전이 정말로 backpain에 영향 을 끼치는지에 대한 연구이다. Driver 여부에 따른 발병률 차이에 대한 자료가 유의성이 있었다. 또한 운전과 병 사이의 관련 또한 유의한 것 으로 나타났다.
  • 33. 실험 대상 추출 과정 중 교외 거주 여부라는 요인이 추가되었고, 그에 따라 추가로 suburban과 backpain 사이의 유의성도 검 증하였다. 유의성 검증 결과 suburban은 backpain과 상관관계가 없었다.
  • 34. 서론에서 밝혔듯이 운전은 추간판 탈 출증을 일으킬 수 있는 요인이 될 수 있다. 운전은 개인적 위험요인이 됨을 자료 분 석을 통해 확인하였다. 운전은 추간판 탈출증과 관련이 있다.