[GENEHACK 2015] protein complex clusteringdrack3800
Презентация для защиты проекта на хакатоне Genehack 2015 на физтехе. Мы собрали весь protein data bank, отобрали из файлов те, которые представляют белковые комплексы. Затем для каждого такого белкового комплекса построили матрицу средних расстояний между аминокислотами (20 штук) в разных цепях. После этого по матрицам построили тепловые карты, и прокластеризовали матрицы с помощью трех методов. Self-Organising Map считался с помощью CUDA 7.0. После разбиения на кластеры, мы проаннотировали все кластеры ключевыми словами из PDB-файлов.
На выходе разработана функциональная система аннотации кластеров.
[GENEHACK 2015] protein complex clusteringdrack3800
Презентация для защиты проекта на хакатоне Genehack 2015 на физтехе. Мы собрали весь protein data bank, отобрали из файлов те, которые представляют белковые комплексы. Затем для каждого такого белкового комплекса построили матрицу средних расстояний между аминокислотами (20 штук) в разных цепях. После этого по матрицам построили тепловые карты, и прокластеризовали матрицы с помощью трех методов. Self-Organising Map считался с помощью CUDA 7.0. После разбиения на кластеры, мы проаннотировали все кластеры ключевыми словами из PDB-файлов.
На выходе разработана функциональная система аннотации кластеров.
3. Вот подснежник на поляне,
Я его нашел.
Отнесу подснежник маме,
Хоть и не расцвел.
И меня с цветком так нежно
Мама обняла,
Что раскрылся мой подснежник
От ее тепла.
Григоре Виеру
4. Зимние морозы
Солнышко прогнало.
Хрупкая фиалка
На полянке встала.
К солнцу синий венчик
Тянется упрямо.
Первую фиалку
Я сорву для мамы.
В. Пасналеева
5. Б. Блинникова
Лишь пригрело солнце ярко,
Но ещё совсем не жарко.
Разноцветный сарафан
Одевает наш тюльпан.
А. Парошин
Стройный стебелёк,
Алый лепесток.
В жёлтой серединке
Чёрные тычинки.
6. Джулия Рум
Огонечки желтые
Из сухой травы.
Это мать-и-мачехи
Первые цветы.
Солнышко пригрело
И растаял снег.
Желтые цветочки
Солнышка привет.
7. Нарцисс золотистый,
душистый и чистый,
Сверкает своим колпачком над
травой.
А дети, срывая его, повторяют:
- Для мамы тебя принесём мы
домой!
Сесиль Мэри Баркер
8. Н. Нехаева
Как горошинки резные
На высокой ножке,
Ландыши цветут
лесные
Прямо у дорожки.
10. Пролеска голубая,
Свой глазик показала.
И ласковому солнышку
Так нежно закивала.
Голубые звезды
Усыпали поляну.
Первую пролеску
Соберу для мамы!
Наливайкина Людмила