SlideShare a Scribd company logo
1 of 25
Download to read offline
UNIVERZA V LJUBLJANI 
BIOTEHNIŠKA FAKULTETA 
ODDELEK ZA BIOLOGIJO 
Nejc DRAGANJEC 
ELEKTRONSKA MIKROSKOPIJA 
MIKROGRAFIJE IN ULTRASTRUKTURE 
POROCILO O VAJAH PRI PREDMETU 
FUNKCIONALNA BIOLOGIJA CELICE 
Molekulska in funkcionalna biologija MSc 
Mentor: asist. dr. Nada ŽNIDARŠIC 
Mentor: dr. Magda TUŠEK ŽNIDARIC 
Ljubljana, 2014
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
II 
KAZALO 
1 Uvod 2 
2 Ultrastruktura virusov in bakterij (vaje 19. 12. 2013) 3 
2.1 Bakteriofagi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 
2.2 Rikecije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5 
3 Ultrastruktura živalskih celic (vaje 23. 12. 2013) 8 
3.1 Hepatopankreas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8 
3.2 Gonade . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 
5 Viri 22
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
1 
SLIKE 
2.1 Bakteriofag T4 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 
2.2 Rickettsia slovaca v celici . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5 
2.3 Rickettsia slovaca okoli jedra . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6 
2.4 Kolonija Rickettsia slovaca . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 
3.1 Hepatopankreas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 
3.2 Golgijev aparat . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10 
3.3 Jedro z jedrcem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 
3.4 Jedrne pore . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 
3.5 Zgornja meja locljivosti TEM . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13 
3.6 GER . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14 
3.7 Lizosom z bakrom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15 
3.8 Bazalna lamina . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 
3.9 Gonade . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18 
3.10 Spermatozoj . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 
3.11 Prerez flagela . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20 
3.12 Spermatozoj med razvojem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
2 
1 UVOD 
Ker je valovna dolžina elektronskega žarka 100.000-krat krajša od valovne dolžine 
vidne svetlobe, je teoreticna locljivost elektronske mikroskopije 0,001 nm. Toda zaradi 
napak magnetnih lec je dejanska maksimalna locljivost osnovnih tehnik elektronske 
miroskopije okoli 0,1 nm oz 1 Å. Prakticno locljivost pa doloca tudi vrsta vzorca in 
njegove znacilnosti. Prakticno dosegljiva locljivost bioloških vzorcev je zaradi njihovih 
lastnosti okoli 1 nm (Echin, 2009; Egerton, 2005; Goodhew et al., 2001; Khan, 212; 
Watt, 1997). 
Poznamo dve osnovni vrsti elektronskih mikroskopov (presevni elektronski mikroskop 
oz. TEM in vrsticni elektronski mikroskop oz. SEM), ki se po svojih znacilnostih 
in principu delovanja precej razlikujeta. Konstrukcija TEM je v osnovi podobna 
svetlobnemu mikroskopu. Vir “svetlobe” nadomesti elektronska puška oz. linearni 
pospeševalnik iz katode in anode. Katoda poskrbi za vir elektronov in anoda za 
pospeševanje v smeri preparata. Snop elektronov nato potuje po koloni, v kateri 
moramo vzdrževati visoki vakum. Za fokusiranje in radialno pospeševanje snopa poskrbi 
sistem elektromagnetnih lec, ki delujejo kot kondenzor, objektiv in projektiv. Med 
snopom elektronov in preparatom pride do interakcij (odboj, elasticno in neelasticno 
sipanje), katerih frekvenca je odvisna od elektronske gostote preparata. Klasicna 
priprava preparatov za TEM je postopek iz 6 korakov: fiksacija, dehidracija, vklapljanje, 
rezanje, prenos na nosilec in kontrastiranje s težkimi kovinami (Echin, 2009; Egerton, 
2005; Goodhew et al., 2001; Khan, 212; Watt, 1997).
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
3 
2 ULTRASTRUKTURA VIRUSOV IN BAKTERIJ (VAJE 19. 12. 2013) 
2.1 BAKTERIOFAGI 
Elektronsko mikroskopijo virusov se dandanes uporablja za hitro diagnostiko kužnih 
delcev (npr. pri porajajocih se boleznih in osebah ter živalih z imunsko pomanjkljivostjo), 
za skrajšanje postopka na celicnih kulturah (npr. virus Nipah, SARS, metapneumovirus, 
bocavirus), za iskanje novih povzrociteljev, kadar reagenti ali diagnosticne metode niso 
na razpolago, pri “odprtem pogledu”, kadar je možnih vec povzrociteljev, ter pri kontroli 
kvalitete in dobre laboratorijske prakse (npr. ugotavljanje specificnosti antigenov in 
metod). Metode elektronske mikroskopije so bile v virologiji preteklosti že veckrat 
kljucne. Eno izmed prvih odkritij ob pomoci elektronske mikroskopije je bila 1948 
odkrita razlika med virusom crnih koz (Orthopox, Poxviridae) in virusom varicele zostra 
(Varicellovirus). 1952 smo dobili prvo mikrografijo poliovirusa, 1976 je bil v Zairu odkrit 
virus Ebola, v novejših casih pa nam je elektronska mikroskopija leta 2003 podala kar 
dve diagnozi, in sicer diagnozo SARS na Kitajskem in virusa opicjih koz pri prerijskih 
psih in ljudeh v ZDA (Goodhew et al., 2001; Watt, 1997). 
Postopek priprave virusnega preparata za elektronsko mikroskopijo gre vedno skozi 
4 glavne stopnje: 1. odvzem in prenos kužnine, 2. delo s kužnim in zelo kužnim 
materialom, 3. koncentriranje virusov v suspenziji do koncentracije najmanj 106/ml 
in 4. priprava vzorca za opazovanje. Priprava vzorca za opazovanje nudi dva možna 
pristopa. En pristop je negativno kontrastiranje in drugi pristop je vlaganje vzorcev in 
priprava ultratankih rezin. Vzorci, ki smo jih pri vajah opazovali mi, so bili pripravljeni 
z negativnim kontrastiranjem (Echin, 2009; Egerton, 2005; Khan, 212; Watt, 1997). 
S tehniko negativnega kontrastiranja izkorišcamo elektronsko prepustnost virusov. 
Kontrastnost povecamo z uporabo negativnih kontrastnih sredstev, kar pomeni, da 
s težkimi kovinami okolju zmanjšamo prepustnost za elektrone. Ker le elektroni, ki 
prehajajo skozi vzorec, dajo sliko virusa, so virusi svetlejši od okolice. Kontrastna 
sredstva, ki se uporabljajo najpogosteje, so fosforvolframova kislina (2 %), amonijev 
molibdat (1 %) in uranilni acetat (1 %). Vzorec se nanaša na bakrove mrežice s 
standardno 400 polji, prevlecene s plasticnim filmom (formvar ali pioloform) in ojacane 
z ogljikom (Egerton, 2005; Frank, 1992; Goodhew et al., 2001; Khan, 212; Watt, 1997). 
Preparat, ki smo ga gledali na vajah, je bil negativno kontrastiran premaz bakteriofagov, 
zaradi velikosti najverjetneje bakteriofagov T4, ki so med najvecjimi fagi in dosegajo 
200 nm v dolžino 100 nm v širino. Znacilna je tudi opažena bazalna plošca, vzorec na 
repu pa namiguje na prisotnost kontraktilne prevleke, ki je še ena izmed lastnosti fagov 
T4, a je zaradi slabega kontrasta in ostrine ne moremo nedvomno potrditi (Madigan
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
4 
et al., 2012). 
Slika 2.1: Oznacene ultrastrukture: (1) kapsida, (2) bazalna plošca, (3) vrat z vzorcem, ki bi lahko 
predstavljal kontraktilno prevleko, (4) kontrastno sredstvo, ki ga je bilo na preparatu nekoliko prevec, 
(5) ovratnik (Madigan et al., 2012).
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
5 
2.2 RIKECIJE 
Rikecije so obligatne intracelularne G bakterije, ki lahko rastejo znotraj citoplazme 
gostiteljskih evkariontskih celic. Za rikecije je težko predvideti virulentnost in zmožnost 
patogeneze na cloveku, saj obstaja velika variabilnost v virulenci že med osebki iste 
vrste (Boldis et al., 2009). 
Preparat, ki smo ga opazovali, so bile pripravljene ultratanke rezine z rikecijami 
(Rickettsia slovaca) okuženih celic. 
Slika 2.2: Oznacene ultrastrukture: (1) proste zunaj celicne Rickettsia slovaca, (2) proste Rickettsia 
slovaca v citoplazmi, (3) jedro, (4) citoplazemske vakuole, (5) napihnjen endoplazmatski retikulum, (6) 
napihnjen/otecen mitohondrij, (7) prosta Rickettsia slovaca znotraj jedra (Boldis et al., 2009).
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
6 
Slika 2.3: Oznacene ultrastrukture: (1) tvorjenje septuma med deleco se Rickettsia slovaca, (2) dolga 
oblika Rickettsia slovaca (vec kot 2 mikro metra), (3) mitohondrij, (4) jedro, (5) jedrce, (6) Rickettsia 
slovaca med prodiranjem proti/v jedro (Boldis et al., 2009).
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
7 
Slika 2.4: Oznacene ultrastrukture: (1) kolonija Rickettsia slovaca v obliki krofa (“doughnut colonies”), 
(2) citoplazemske vakuole, (3) aktinski repi, fenotip rikecij (Boldis et al., 2009).
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
8 
3 ULTRASTRUKTURA ŽIVALSKIH CELIC (VAJE 23. 12. 2013) 
3.1 HEPATOPANKREAS 
Preparat je bil pripravljen iz hepatopankreasa mokrice (Porcellio scaber ), ki je modelni 
organizem in vivo poskusov na mnogih podrocjih, uveljavljeni pa so predvsem v toksiko-loških 
raziskavah. Kopenski raki enakonožci so široko razširjena skupina, ki igra kljucno 
ekološko vlogo v dekompoziciji organske snovi podrastja. Hepatopankreas je centralni 
metabolni organ teh živali, pomembno vlogo pa ima tudi pri skladišcenju mineralov 
(Longo et al., 2013; Znidaršic et al., 2003).
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
9 
Slika 3.1: Oznacene ultrastrukture: (1) apikalni del celic S hepatopankreasa, (2) glikogen (minimalna 
kolicina v primerjavi s celicami B), (3) mitohondriji, (4) granulirani elektronsko gosti depoziti po 
citoplazemski površini plazemske membrane , (5) mašcobne kaplje, (6) avtofagna vakuola (Longo et al., 
2013; Znidaršic et al., 2003).
10 
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
Slika 3.2: Oznacene ultrastrukture: (1) Golgijev aparat, (2) mitohondriji, (3) jedro, (4) jedrna 
membrana (Longo et al., 2013; Znidaršic et al., 2003).
11 
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
Slika 3.3: Oznacene ultrastrukture: (1) jedrce, (2) jedro, (3) jedrna membrana, (4) mitohondriji (Longo 
et al., 2013; Znidaršic et al., 2003).
12 
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
Slika 3.4: Oznacene ultrastrukture: (1) kromatin, (2) jedrne pore, (3) jedrna membrana, (4) ribosomi, 
(5) mašcobna kaplja (Longo et al., 2013; Znidaršic et al., 2003).
13 
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
Slika 3.5: Zgornja meja povecave in resolucije elektronskega mikroskopa, ki smo ga na vajah uporabljali. 
Oznacene ultrastrukture: (1) jedrna membrana, (2) ribosomi (Longo et al., 2013; Znidaršic et al., 
2003).
14 
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
Slika 3.6: Oznacene ultrastrukture: (1) lizosom z izmerjenim premerom, (2) membrana lizosoma, (3) 
ribosomi, (4) granulirani endoplazmatski retikulum (Longo et al., 2013; Znidaršic et al., 2003).
15 
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
Slika 3.7: Oznacene ultrastrukture: (1) mitohondrij, (2) lizosom, (3) v lizosomu vskladišcen baker, (4) 
notranja membrana mitohondrija (Longo et al., 2013; Znidaršic et al., 2003).
16 
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
Slika 3.8: Oznacene ultrastrukture: (1) bazalna lamina B celice, (2) mitohondriji, (3) ribosomi, (4) 
bazalni labirint z znacilnimi invaginacijami (Longo et al., 2013; Znidaršic et al., 2003).
17 
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
3.2 GONADE 
Gonade so pripadale živali iz razreda Bivalvia, glede na ultrastrukturne lastnosti 
spermatozojev morda celo Mytella sp.. Pomembnost morfologije spermatozojev za 
taksonomijo je do sedaj poudarilo že veliko študij in v preteklosti je bila primerjava 
spermatozojev že veckrat uspešno uporabljena za dolocanje filogenetskih odnosov 
znotraj razreda Bivalvia. Že samo na podlagi prisotnosti ali odsotnosti akrosoma 
lahko osebek uvrstimo med dve poddružini. Osebki, katerih spermatozoji ne posedujejo 
akrosomalnega podaljška, spadajo v poddružino Modiolinae, osebki katerih spermatozoji 
akrosomalni podaljšek imajo, pa v poddružino Mytilinae (Introíni et al., 2010). Slednje 
drži tudi za naš preparat.
18 
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
Slika 3.9: Oznacene ultrastrukture: (1) mocno izraženi mitohondriji, (2) jedro z mocno kompaktirano 
DNA, (3) akrosom, (4) precni prerezi flagelov z znacilno strukturo citoskeleta, (5) sub-akrosomalna 
regija, (6) precni prerez akrosoma (Introíni et al., 2010).
19 
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
Slika 3.10: Oznacene ultrastrukture: (1) proksimalni centriol, (2) distalni centriol, (3) lep vzdolžni 
prerez flagela, (4) precni akrosoma (Introíni et al., 2010).
20 
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
Slika 3.11: Oznacene ultrastrukture: (1) 2 centralna samostojna mikrotubula, (2) plazmalema, (3) 9 
dvojnih mikrotubulov iz A in B tubula (Introíni et al., 2010).
21 
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
Slika 3.12: Oznacene ultrastrukture: (1) spermatozoj med razvojem, (2) mitohondrij, (3) jedro z že 
precej kompaktirano DNA (Introíni et al., 2010).
22 
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
LITERATURA 
Boldis V., Strus J., Kocianová E., Tusek-Znidaric M., Stefanidesová K., Spitalská E. 2009. 
Ultrastructural study of the life cycle of Rickettsia slovaca, wild and standard type, 
cultivated in L929 and Vero cell lines. Folia microbiologica 54, 2: 130–6 ISSN 1874- 
9356 doi:10.1007/s12223-009-0019-4 URL http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ 
19418250 
Echin P. 2009. Handbook of sample preparation for scaning electron microscopy and 
x-ray microanalysis. Springer Science Business Media ISBN 9780387857305 
Egerton R. F. 2005. Physical Principles of Electron Microscopy. Boston, MA: Springer 
US ISBN 978-0-387-25800-3 doi:10.1007/b136495 URL http://www.springerlink. 
com/index/10.1007/b136495 
Frank J. 1992. Electron tomography. New York: Springer Science Business Media ISBN 
9781475721652 
Goodhew P. J., Humphreys J., Beanland R. 2001. Electron microscopy and 
analysis. London, New York: Taylor & Francis 3rd edn. ISBN 0748409688 
URL http://books.google.com/books?hl=en&lr=&id=zuxPIVmGLGsC&oi= 
fnd&pg=PR9&dq=Electron+Microscopy+and+Analysis&ots=-V0PqeZKYI&sig= 
wcoH4wJoBYOxcIYyeoP9Oe_CvD8 
Introíni G. O., Maester F. M., Leite F. P. P., Recco-Pimentel S. M. 2010. Sperm 
ultrastructure of Mytella (Bivalvia) populations from distinct habitats along the 
northern coast of São Paulo State, Brazil. Biocell : official journal of the Sociedades 
Latinoamericanas de Microscopía Electronica ... et. al 34, 3: 103–11 ISSN 0327-9545 
URL http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21443140 
Khan M. 212. The transmission electron microscope. Rijeka: InTech ISBN 
9789535104506 
Longo G., Trovato M., Mazzei V., Ferrante M., Conti G. O. 2013. Ligia 
italica (Isopoda, Oniscidea) as bioindicator of mercury pollution of marine 
rocky coasts. PloS one 8, 3: e58548 ISSN 1932-6203 doi:10.1371/journal.pone. 
0058548 URL http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid= 
3589354&tool=pmcentrez&rendertype=abstract 
Madigan M. T., Martinko J. M., Stahl D. A., Clark D. P. 2012. Brock Biology of Micro-organisms. 
San Francisco, CA: Benjamin Cummings 13th edn. ISBN 9780321649638 
Watt I. M. 1997. The principles and practice of electron microscopy. Cam-
23 
Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture 
Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 
bridge: Cambridge University Press 2nd edn. ISBN 9781139170529 doi: 
10.1017/CBO9781139170529 URL http://ebooks.cambridge.org/ref/id/ 
CBO9781139170529 
Znidaršic N., Strus J., Drobne D. 2003. Ultrastructural alterations of the hepatopancreas 
in Porcellio scaber under stress. Environmental toxicology and pharmacology 13, 3: 
161–74 ISSN 1382-6689 doi:10.1016/S1382-6689(02)00158-8 URL http://www.ncbi. 
nlm.nih.gov/pubmed/21782651

More Related Content

More from Nejc Draganjec

Sonogenetic Locale Specific Activation of Universal Vectors for Xenobiotics -...
Sonogenetic Locale Specific Activation of Universal Vectors for Xenobiotics -...Sonogenetic Locale Specific Activation of Universal Vectors for Xenobiotics -...
Sonogenetic Locale Specific Activation of Universal Vectors for Xenobiotics -...Nejc Draganjec
 
Mycroscopy of biological systems
Mycroscopy of biological systemsMycroscopy of biological systems
Mycroscopy of biological systemsNejc Draganjec
 
Embryology practicum report
Embryology practicum report Embryology practicum report
Embryology practicum report Nejc Draganjec
 
Gene expression control - practicum report
Gene expression control - practicum reportGene expression control - practicum report
Gene expression control - practicum reportNejc Draganjec
 
Longevity, anti-aging and quality of life (Seminar prezentation)
Longevity, anti-aging and quality of life (Seminar prezentation)Longevity, anti-aging and quality of life (Seminar prezentation)
Longevity, anti-aging and quality of life (Seminar prezentation)Nejc Draganjec
 
Certificate of attendance - Scientific meeting - 4th colloquium of genetics
Certificate of attendance - Scientific meeting - 4th colloquium of geneticsCertificate of attendance - Scientific meeting - 4th colloquium of genetics
Certificate of attendance - Scientific meeting - 4th colloquium of geneticsNejc Draganjec
 
LOKALIZACIJA CELIČNIH STRUKTUR V BIOLOŠKIH VZORCIH Z MIKROSKOPSKIMI TEHNIKAMI...
LOKALIZACIJA CELIČNIH STRUKTUR V BIOLOŠKIH VZORCIH Z MIKROSKOPSKIMI TEHNIKAMI...LOKALIZACIJA CELIČNIH STRUKTUR V BIOLOŠKIH VZORCIH Z MIKROSKOPSKIMI TEHNIKAMI...
LOKALIZACIJA CELIČNIH STRUKTUR V BIOLOŠKIH VZORCIH Z MIKROSKOPSKIMI TEHNIKAMI...Nejc Draganjec
 
EKOPOIEZA MARSA – PRILOŽNOSTI IN OVIRE, KI JIH PREDSTAVLJA INŽENIRING NOVEGA ...
EKOPOIEZA MARSA – PRILOŽNOSTI IN OVIRE, KI JIH PREDSTAVLJA INŽENIRING NOVEGA ...EKOPOIEZA MARSA – PRILOŽNOSTI IN OVIRE, KI JIH PREDSTAVLJA INŽENIRING NOVEGA ...
EKOPOIEZA MARSA – PRILOŽNOSTI IN OVIRE, KI JIH PREDSTAVLJA INŽENIRING NOVEGA ...Nejc Draganjec
 
PREDSTAVITEV: EKOPOIEZA MARSA – PRILOŽNOSTI IN OVIRE, KI JIH PREDSTAVLJA INŽE...
PREDSTAVITEV: EKOPOIEZA MARSA – PRILOŽNOSTI IN OVIRE, KI JIH PREDSTAVLJA INŽE...PREDSTAVITEV: EKOPOIEZA MARSA – PRILOŽNOSTI IN OVIRE, KI JIH PREDSTAVLJA INŽE...
PREDSTAVITEV: EKOPOIEZA MARSA – PRILOŽNOSTI IN OVIRE, KI JIH PREDSTAVLJA INŽE...Nejc Draganjec
 
Vretenčarji na sončni pogon - Endosimbioza fotosimbionta zelene alge (Oophila...
Vretenčarji na sončni pogon - Endosimbioza fotosimbionta zelene alge (Oophila...Vretenčarji na sončni pogon - Endosimbioza fotosimbionta zelene alge (Oophila...
Vretenčarji na sončni pogon - Endosimbioza fotosimbionta zelene alge (Oophila...Nejc Draganjec
 
Predstavite: Vretenčarji na sončni pogon - Endosimbioza fotosimbionta zelene ...
Predstavite: Vretenčarji na sončni pogon - Endosimbioza fotosimbionta zelene ...Predstavite: Vretenčarji na sončni pogon - Endosimbioza fotosimbionta zelene ...
Predstavite: Vretenčarji na sončni pogon - Endosimbioza fotosimbionta zelene ...Nejc Draganjec
 
Pregled uporabe genetskih orodij v etologiji
Pregled uporabe genetskih orodij v etologijiPregled uporabe genetskih orodij v etologiji
Pregled uporabe genetskih orodij v etologijiNejc Draganjec
 
Puščave - seminarska naloga pri predmetu ekologija
Puščave - seminarska naloga pri predmetu ekologijaPuščave - seminarska naloga pri predmetu ekologija
Puščave - seminarska naloga pri predmetu ekologijaNejc Draganjec
 
Puščave- predstavitev seminarske naloge pri predmetu ekologija
Puščave- predstavitev seminarske naloge pri predmetu ekologijaPuščave- predstavitev seminarske naloge pri predmetu ekologija
Puščave- predstavitev seminarske naloge pri predmetu ekologijaNejc Draganjec
 
One zoom - biološka podatkovna zbirka in predvsem orodje za vizualizacijo
One zoom - biološka podatkovna zbirka in predvsem orodje za vizualizacijoOne zoom - biološka podatkovna zbirka in predvsem orodje za vizualizacijo
One zoom - biološka podatkovna zbirka in predvsem orodje za vizualizacijoNejc Draganjec
 
Evolucija raka - vpliv naravne selekcije na evolucijo onkoloških obolenj
Evolucija raka - vpliv naravne selekcije na evolucijo onkoloških obolenjEvolucija raka - vpliv naravne selekcije na evolucijo onkoloških obolenj
Evolucija raka - vpliv naravne selekcije na evolucijo onkoloških obolenjNejc Draganjec
 
Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja(nejc draganjec in kaja m...
Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja(nejc draganjec in kaja m...Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja(nejc draganjec in kaja m...
Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja(nejc draganjec in kaja m...Nejc Draganjec
 
Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja (nejc draganjec in kaja ...
Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja (nejc draganjec in kaja ...Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja (nejc draganjec in kaja ...
Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja (nejc draganjec in kaja ...Nejc Draganjec
 
Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja poročilo diskusije(nej...
Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja   poročilo diskusije(nej...Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja   poročilo diskusije(nej...
Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja poročilo diskusije(nej...Nejc Draganjec
 

More from Nejc Draganjec (19)

Sonogenetic Locale Specific Activation of Universal Vectors for Xenobiotics -...
Sonogenetic Locale Specific Activation of Universal Vectors for Xenobiotics -...Sonogenetic Locale Specific Activation of Universal Vectors for Xenobiotics -...
Sonogenetic Locale Specific Activation of Universal Vectors for Xenobiotics -...
 
Mycroscopy of biological systems
Mycroscopy of biological systemsMycroscopy of biological systems
Mycroscopy of biological systems
 
Embryology practicum report
Embryology practicum report Embryology practicum report
Embryology practicum report
 
Gene expression control - practicum report
Gene expression control - practicum reportGene expression control - practicum report
Gene expression control - practicum report
 
Longevity, anti-aging and quality of life (Seminar prezentation)
Longevity, anti-aging and quality of life (Seminar prezentation)Longevity, anti-aging and quality of life (Seminar prezentation)
Longevity, anti-aging and quality of life (Seminar prezentation)
 
Certificate of attendance - Scientific meeting - 4th colloquium of genetics
Certificate of attendance - Scientific meeting - 4th colloquium of geneticsCertificate of attendance - Scientific meeting - 4th colloquium of genetics
Certificate of attendance - Scientific meeting - 4th colloquium of genetics
 
LOKALIZACIJA CELIČNIH STRUKTUR V BIOLOŠKIH VZORCIH Z MIKROSKOPSKIMI TEHNIKAMI...
LOKALIZACIJA CELIČNIH STRUKTUR V BIOLOŠKIH VZORCIH Z MIKROSKOPSKIMI TEHNIKAMI...LOKALIZACIJA CELIČNIH STRUKTUR V BIOLOŠKIH VZORCIH Z MIKROSKOPSKIMI TEHNIKAMI...
LOKALIZACIJA CELIČNIH STRUKTUR V BIOLOŠKIH VZORCIH Z MIKROSKOPSKIMI TEHNIKAMI...
 
EKOPOIEZA MARSA – PRILOŽNOSTI IN OVIRE, KI JIH PREDSTAVLJA INŽENIRING NOVEGA ...
EKOPOIEZA MARSA – PRILOŽNOSTI IN OVIRE, KI JIH PREDSTAVLJA INŽENIRING NOVEGA ...EKOPOIEZA MARSA – PRILOŽNOSTI IN OVIRE, KI JIH PREDSTAVLJA INŽENIRING NOVEGA ...
EKOPOIEZA MARSA – PRILOŽNOSTI IN OVIRE, KI JIH PREDSTAVLJA INŽENIRING NOVEGA ...
 
PREDSTAVITEV: EKOPOIEZA MARSA – PRILOŽNOSTI IN OVIRE, KI JIH PREDSTAVLJA INŽE...
PREDSTAVITEV: EKOPOIEZA MARSA – PRILOŽNOSTI IN OVIRE, KI JIH PREDSTAVLJA INŽE...PREDSTAVITEV: EKOPOIEZA MARSA – PRILOŽNOSTI IN OVIRE, KI JIH PREDSTAVLJA INŽE...
PREDSTAVITEV: EKOPOIEZA MARSA – PRILOŽNOSTI IN OVIRE, KI JIH PREDSTAVLJA INŽE...
 
Vretenčarji na sončni pogon - Endosimbioza fotosimbionta zelene alge (Oophila...
Vretenčarji na sončni pogon - Endosimbioza fotosimbionta zelene alge (Oophila...Vretenčarji na sončni pogon - Endosimbioza fotosimbionta zelene alge (Oophila...
Vretenčarji na sončni pogon - Endosimbioza fotosimbionta zelene alge (Oophila...
 
Predstavite: Vretenčarji na sončni pogon - Endosimbioza fotosimbionta zelene ...
Predstavite: Vretenčarji na sončni pogon - Endosimbioza fotosimbionta zelene ...Predstavite: Vretenčarji na sončni pogon - Endosimbioza fotosimbionta zelene ...
Predstavite: Vretenčarji na sončni pogon - Endosimbioza fotosimbionta zelene ...
 
Pregled uporabe genetskih orodij v etologiji
Pregled uporabe genetskih orodij v etologijiPregled uporabe genetskih orodij v etologiji
Pregled uporabe genetskih orodij v etologiji
 
Puščave - seminarska naloga pri predmetu ekologija
Puščave - seminarska naloga pri predmetu ekologijaPuščave - seminarska naloga pri predmetu ekologija
Puščave - seminarska naloga pri predmetu ekologija
 
Puščave- predstavitev seminarske naloge pri predmetu ekologija
Puščave- predstavitev seminarske naloge pri predmetu ekologijaPuščave- predstavitev seminarske naloge pri predmetu ekologija
Puščave- predstavitev seminarske naloge pri predmetu ekologija
 
One zoom - biološka podatkovna zbirka in predvsem orodje za vizualizacijo
One zoom - biološka podatkovna zbirka in predvsem orodje za vizualizacijoOne zoom - biološka podatkovna zbirka in predvsem orodje za vizualizacijo
One zoom - biološka podatkovna zbirka in predvsem orodje za vizualizacijo
 
Evolucija raka - vpliv naravne selekcije na evolucijo onkoloških obolenj
Evolucija raka - vpliv naravne selekcije na evolucijo onkoloških obolenjEvolucija raka - vpliv naravne selekcije na evolucijo onkoloških obolenj
Evolucija raka - vpliv naravne selekcije na evolucijo onkoloških obolenj
 
Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja(nejc draganjec in kaja m...
Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja(nejc draganjec in kaja m...Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja(nejc draganjec in kaja m...
Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja(nejc draganjec in kaja m...
 
Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja (nejc draganjec in kaja ...
Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja (nejc draganjec in kaja ...Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja (nejc draganjec in kaja ...
Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja (nejc draganjec in kaja ...
 
Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja poročilo diskusije(nej...
Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja   poročilo diskusije(nej...Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja   poročilo diskusije(nej...
Gensko spremenjeni organizmi in potencialna tveganja poročilo diskusije(nej...
 

ELEKTRONSKA MIKROSKOPIJA MIKROGRAFIJE IN ULTRASTRUKTURE

  • 1. UNIVERZA V LJUBLJANI BIOTEHNIŠKA FAKULTETA ODDELEK ZA BIOLOGIJO Nejc DRAGANJEC ELEKTRONSKA MIKROSKOPIJA MIKROGRAFIJE IN ULTRASTRUKTURE POROCILO O VAJAH PRI PREDMETU FUNKCIONALNA BIOLOGIJA CELICE Molekulska in funkcionalna biologija MSc Mentor: asist. dr. Nada ŽNIDARŠIC Mentor: dr. Magda TUŠEK ŽNIDARIC Ljubljana, 2014
  • 2. Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 II KAZALO 1 Uvod 2 2 Ultrastruktura virusov in bakterij (vaje 19. 12. 2013) 3 2.1 Bakteriofagi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 2.2 Rikecije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5 3 Ultrastruktura živalskih celic (vaje 23. 12. 2013) 8 3.1 Hepatopankreas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8 3.2 Gonade . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 5 Viri 22
  • 3. Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 1 SLIKE 2.1 Bakteriofag T4 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 2.2 Rickettsia slovaca v celici . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5 2.3 Rickettsia slovaca okoli jedra . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6 2.4 Kolonija Rickettsia slovaca . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7 3.1 Hepatopankreas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 3.2 Golgijev aparat . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10 3.3 Jedro z jedrcem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 3.4 Jedrne pore . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 3.5 Zgornja meja locljivosti TEM . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13 3.6 GER . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14 3.7 Lizosom z bakrom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15 3.8 Bazalna lamina . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 3.9 Gonade . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18 3.10 Spermatozoj . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 3.11 Prerez flagela . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20 3.12 Spermatozoj med razvojem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
  • 4. Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 2 1 UVOD Ker je valovna dolžina elektronskega žarka 100.000-krat krajša od valovne dolžine vidne svetlobe, je teoreticna locljivost elektronske mikroskopije 0,001 nm. Toda zaradi napak magnetnih lec je dejanska maksimalna locljivost osnovnih tehnik elektronske miroskopije okoli 0,1 nm oz 1 Å. Prakticno locljivost pa doloca tudi vrsta vzorca in njegove znacilnosti. Prakticno dosegljiva locljivost bioloških vzorcev je zaradi njihovih lastnosti okoli 1 nm (Echin, 2009; Egerton, 2005; Goodhew et al., 2001; Khan, 212; Watt, 1997). Poznamo dve osnovni vrsti elektronskih mikroskopov (presevni elektronski mikroskop oz. TEM in vrsticni elektronski mikroskop oz. SEM), ki se po svojih znacilnostih in principu delovanja precej razlikujeta. Konstrukcija TEM je v osnovi podobna svetlobnemu mikroskopu. Vir “svetlobe” nadomesti elektronska puška oz. linearni pospeševalnik iz katode in anode. Katoda poskrbi za vir elektronov in anoda za pospeševanje v smeri preparata. Snop elektronov nato potuje po koloni, v kateri moramo vzdrževati visoki vakum. Za fokusiranje in radialno pospeševanje snopa poskrbi sistem elektromagnetnih lec, ki delujejo kot kondenzor, objektiv in projektiv. Med snopom elektronov in preparatom pride do interakcij (odboj, elasticno in neelasticno sipanje), katerih frekvenca je odvisna od elektronske gostote preparata. Klasicna priprava preparatov za TEM je postopek iz 6 korakov: fiksacija, dehidracija, vklapljanje, rezanje, prenos na nosilec in kontrastiranje s težkimi kovinami (Echin, 2009; Egerton, 2005; Goodhew et al., 2001; Khan, 212; Watt, 1997).
  • 5. Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 3 2 ULTRASTRUKTURA VIRUSOV IN BAKTERIJ (VAJE 19. 12. 2013) 2.1 BAKTERIOFAGI Elektronsko mikroskopijo virusov se dandanes uporablja za hitro diagnostiko kužnih delcev (npr. pri porajajocih se boleznih in osebah ter živalih z imunsko pomanjkljivostjo), za skrajšanje postopka na celicnih kulturah (npr. virus Nipah, SARS, metapneumovirus, bocavirus), za iskanje novih povzrociteljev, kadar reagenti ali diagnosticne metode niso na razpolago, pri “odprtem pogledu”, kadar je možnih vec povzrociteljev, ter pri kontroli kvalitete in dobre laboratorijske prakse (npr. ugotavljanje specificnosti antigenov in metod). Metode elektronske mikroskopije so bile v virologiji preteklosti že veckrat kljucne. Eno izmed prvih odkritij ob pomoci elektronske mikroskopije je bila 1948 odkrita razlika med virusom crnih koz (Orthopox, Poxviridae) in virusom varicele zostra (Varicellovirus). 1952 smo dobili prvo mikrografijo poliovirusa, 1976 je bil v Zairu odkrit virus Ebola, v novejših casih pa nam je elektronska mikroskopija leta 2003 podala kar dve diagnozi, in sicer diagnozo SARS na Kitajskem in virusa opicjih koz pri prerijskih psih in ljudeh v ZDA (Goodhew et al., 2001; Watt, 1997). Postopek priprave virusnega preparata za elektronsko mikroskopijo gre vedno skozi 4 glavne stopnje: 1. odvzem in prenos kužnine, 2. delo s kužnim in zelo kužnim materialom, 3. koncentriranje virusov v suspenziji do koncentracije najmanj 106/ml in 4. priprava vzorca za opazovanje. Priprava vzorca za opazovanje nudi dva možna pristopa. En pristop je negativno kontrastiranje in drugi pristop je vlaganje vzorcev in priprava ultratankih rezin. Vzorci, ki smo jih pri vajah opazovali mi, so bili pripravljeni z negativnim kontrastiranjem (Echin, 2009; Egerton, 2005; Khan, 212; Watt, 1997). S tehniko negativnega kontrastiranja izkorišcamo elektronsko prepustnost virusov. Kontrastnost povecamo z uporabo negativnih kontrastnih sredstev, kar pomeni, da s težkimi kovinami okolju zmanjšamo prepustnost za elektrone. Ker le elektroni, ki prehajajo skozi vzorec, dajo sliko virusa, so virusi svetlejši od okolice. Kontrastna sredstva, ki se uporabljajo najpogosteje, so fosforvolframova kislina (2 %), amonijev molibdat (1 %) in uranilni acetat (1 %). Vzorec se nanaša na bakrove mrežice s standardno 400 polji, prevlecene s plasticnim filmom (formvar ali pioloform) in ojacane z ogljikom (Egerton, 2005; Frank, 1992; Goodhew et al., 2001; Khan, 212; Watt, 1997). Preparat, ki smo ga gledali na vajah, je bil negativno kontrastiran premaz bakteriofagov, zaradi velikosti najverjetneje bakteriofagov T4, ki so med najvecjimi fagi in dosegajo 200 nm v dolžino 100 nm v širino. Znacilna je tudi opažena bazalna plošca, vzorec na repu pa namiguje na prisotnost kontraktilne prevleke, ki je še ena izmed lastnosti fagov T4, a je zaradi slabega kontrasta in ostrine ne moremo nedvomno potrditi (Madigan
  • 6. Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 4 et al., 2012). Slika 2.1: Oznacene ultrastrukture: (1) kapsida, (2) bazalna plošca, (3) vrat z vzorcem, ki bi lahko predstavljal kontraktilno prevleko, (4) kontrastno sredstvo, ki ga je bilo na preparatu nekoliko prevec, (5) ovratnik (Madigan et al., 2012).
  • 7. Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 5 2.2 RIKECIJE Rikecije so obligatne intracelularne G bakterije, ki lahko rastejo znotraj citoplazme gostiteljskih evkariontskih celic. Za rikecije je težko predvideti virulentnost in zmožnost patogeneze na cloveku, saj obstaja velika variabilnost v virulenci že med osebki iste vrste (Boldis et al., 2009). Preparat, ki smo ga opazovali, so bile pripravljene ultratanke rezine z rikecijami (Rickettsia slovaca) okuženih celic. Slika 2.2: Oznacene ultrastrukture: (1) proste zunaj celicne Rickettsia slovaca, (2) proste Rickettsia slovaca v citoplazmi, (3) jedro, (4) citoplazemske vakuole, (5) napihnjen endoplazmatski retikulum, (6) napihnjen/otecen mitohondrij, (7) prosta Rickettsia slovaca znotraj jedra (Boldis et al., 2009).
  • 8. Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 6 Slika 2.3: Oznacene ultrastrukture: (1) tvorjenje septuma med deleco se Rickettsia slovaca, (2) dolga oblika Rickettsia slovaca (vec kot 2 mikro metra), (3) mitohondrij, (4) jedro, (5) jedrce, (6) Rickettsia slovaca med prodiranjem proti/v jedro (Boldis et al., 2009).
  • 9. Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 7 Slika 2.4: Oznacene ultrastrukture: (1) kolonija Rickettsia slovaca v obliki krofa (“doughnut colonies”), (2) citoplazemske vakuole, (3) aktinski repi, fenotip rikecij (Boldis et al., 2009).
  • 10. Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 8 3 ULTRASTRUKTURA ŽIVALSKIH CELIC (VAJE 23. 12. 2013) 3.1 HEPATOPANKREAS Preparat je bil pripravljen iz hepatopankreasa mokrice (Porcellio scaber ), ki je modelni organizem in vivo poskusov na mnogih podrocjih, uveljavljeni pa so predvsem v toksiko-loških raziskavah. Kopenski raki enakonožci so široko razširjena skupina, ki igra kljucno ekološko vlogo v dekompoziciji organske snovi podrastja. Hepatopankreas je centralni metabolni organ teh živali, pomembno vlogo pa ima tudi pri skladišcenju mineralov (Longo et al., 2013; Znidaršic et al., 2003).
  • 11. Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 9 Slika 3.1: Oznacene ultrastrukture: (1) apikalni del celic S hepatopankreasa, (2) glikogen (minimalna kolicina v primerjavi s celicami B), (3) mitohondriji, (4) granulirani elektronsko gosti depoziti po citoplazemski površini plazemske membrane , (5) mašcobne kaplje, (6) avtofagna vakuola (Longo et al., 2013; Znidaršic et al., 2003).
  • 12. 10 Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 Slika 3.2: Oznacene ultrastrukture: (1) Golgijev aparat, (2) mitohondriji, (3) jedro, (4) jedrna membrana (Longo et al., 2013; Znidaršic et al., 2003).
  • 13. 11 Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 Slika 3.3: Oznacene ultrastrukture: (1) jedrce, (2) jedro, (3) jedrna membrana, (4) mitohondriji (Longo et al., 2013; Znidaršic et al., 2003).
  • 14. 12 Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 Slika 3.4: Oznacene ultrastrukture: (1) kromatin, (2) jedrne pore, (3) jedrna membrana, (4) ribosomi, (5) mašcobna kaplja (Longo et al., 2013; Znidaršic et al., 2003).
  • 15. 13 Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 Slika 3.5: Zgornja meja povecave in resolucije elektronskega mikroskopa, ki smo ga na vajah uporabljali. Oznacene ultrastrukture: (1) jedrna membrana, (2) ribosomi (Longo et al., 2013; Znidaršic et al., 2003).
  • 16. 14 Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 Slika 3.6: Oznacene ultrastrukture: (1) lizosom z izmerjenim premerom, (2) membrana lizosoma, (3) ribosomi, (4) granulirani endoplazmatski retikulum (Longo et al., 2013; Znidaršic et al., 2003).
  • 17. 15 Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 Slika 3.7: Oznacene ultrastrukture: (1) mitohondrij, (2) lizosom, (3) v lizosomu vskladišcen baker, (4) notranja membrana mitohondrija (Longo et al., 2013; Znidaršic et al., 2003).
  • 18. 16 Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 Slika 3.8: Oznacene ultrastrukture: (1) bazalna lamina B celice, (2) mitohondriji, (3) ribosomi, (4) bazalni labirint z znacilnimi invaginacijami (Longo et al., 2013; Znidaršic et al., 2003).
  • 19. 17 Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 3.2 GONADE Gonade so pripadale živali iz razreda Bivalvia, glede na ultrastrukturne lastnosti spermatozojev morda celo Mytella sp.. Pomembnost morfologije spermatozojev za taksonomijo je do sedaj poudarilo že veliko študij in v preteklosti je bila primerjava spermatozojev že veckrat uspešno uporabljena za dolocanje filogenetskih odnosov znotraj razreda Bivalvia. Že samo na podlagi prisotnosti ali odsotnosti akrosoma lahko osebek uvrstimo med dve poddružini. Osebki, katerih spermatozoji ne posedujejo akrosomalnega podaljška, spadajo v poddružino Modiolinae, osebki katerih spermatozoji akrosomalni podaljšek imajo, pa v poddružino Mytilinae (Introíni et al., 2010). Slednje drži tudi za naš preparat.
  • 20. 18 Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 Slika 3.9: Oznacene ultrastrukture: (1) mocno izraženi mitohondriji, (2) jedro z mocno kompaktirano DNA, (3) akrosom, (4) precni prerezi flagelov z znacilno strukturo citoskeleta, (5) sub-akrosomalna regija, (6) precni prerez akrosoma (Introíni et al., 2010).
  • 21. 19 Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 Slika 3.10: Oznacene ultrastrukture: (1) proksimalni centriol, (2) distalni centriol, (3) lep vzdolžni prerez flagela, (4) precni akrosoma (Introíni et al., 2010).
  • 22. 20 Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 Slika 3.11: Oznacene ultrastrukture: (1) 2 centralna samostojna mikrotubula, (2) plazmalema, (3) 9 dvojnih mikrotubulov iz A in B tubula (Introíni et al., 2010).
  • 23. 21 Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 Slika 3.12: Oznacene ultrastrukture: (1) spermatozoj med razvojem, (2) mitohondrij, (3) jedro z že precej kompaktirano DNA (Introíni et al., 2010).
  • 24. 22 Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 LITERATURA Boldis V., Strus J., Kocianová E., Tusek-Znidaric M., Stefanidesová K., Spitalská E. 2009. Ultrastructural study of the life cycle of Rickettsia slovaca, wild and standard type, cultivated in L929 and Vero cell lines. Folia microbiologica 54, 2: 130–6 ISSN 1874- 9356 doi:10.1007/s12223-009-0019-4 URL http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ 19418250 Echin P. 2009. Handbook of sample preparation for scaning electron microscopy and x-ray microanalysis. Springer Science Business Media ISBN 9780387857305 Egerton R. F. 2005. Physical Principles of Electron Microscopy. Boston, MA: Springer US ISBN 978-0-387-25800-3 doi:10.1007/b136495 URL http://www.springerlink. com/index/10.1007/b136495 Frank J. 1992. Electron tomography. New York: Springer Science Business Media ISBN 9781475721652 Goodhew P. J., Humphreys J., Beanland R. 2001. Electron microscopy and analysis. London, New York: Taylor & Francis 3rd edn. ISBN 0748409688 URL http://books.google.com/books?hl=en&lr=&id=zuxPIVmGLGsC&oi= fnd&pg=PR9&dq=Electron+Microscopy+and+Analysis&ots=-V0PqeZKYI&sig= wcoH4wJoBYOxcIYyeoP9Oe_CvD8 Introíni G. O., Maester F. M., Leite F. P. P., Recco-Pimentel S. M. 2010. Sperm ultrastructure of Mytella (Bivalvia) populations from distinct habitats along the northern coast of São Paulo State, Brazil. Biocell : official journal of the Sociedades Latinoamericanas de Microscopía Electronica ... et. al 34, 3: 103–11 ISSN 0327-9545 URL http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21443140 Khan M. 212. The transmission electron microscope. Rijeka: InTech ISBN 9789535104506 Longo G., Trovato M., Mazzei V., Ferrante M., Conti G. O. 2013. Ligia italica (Isopoda, Oniscidea) as bioindicator of mercury pollution of marine rocky coasts. PloS one 8, 3: e58548 ISSN 1932-6203 doi:10.1371/journal.pone. 0058548 URL http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid= 3589354&tool=pmcentrez&rendertype=abstract Madigan M. T., Martinko J. M., Stahl D. A., Clark D. P. 2012. Brock Biology of Micro-organisms. San Francisco, CA: Benjamin Cummings 13th edn. ISBN 9780321649638 Watt I. M. 1997. The principles and practice of electron microscopy. Cam-
  • 25. 23 Draganjec N., Elektronska mikroskopija – mikrografije in ultrastrukture Porocilo o vajah, Ljubljana, Univ. v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za biologijo, 2014 bridge: Cambridge University Press 2nd edn. ISBN 9781139170529 doi: 10.1017/CBO9781139170529 URL http://ebooks.cambridge.org/ref/id/ CBO9781139170529 Znidaršic N., Strus J., Drobne D. 2003. Ultrastructural alterations of the hepatopancreas in Porcellio scaber under stress. Environmental toxicology and pharmacology 13, 3: 161–74 ISSN 1382-6689 doi:10.1016/S1382-6689(02)00158-8 URL http://www.ncbi. nlm.nih.gov/pubmed/21782651