AAUPB berfungsi untuk mengatur dan mengawasi lembaga pendidikan tinggi di Indonesia. AAUPB memiliki peran penting dalam menjamin mutu pendidikan tinggi dengan menetapkan standar akademik dan kriteria lembaga perguruan tinggi. AAUPB juga membagi lembaga pendidikan tinggi menjadi beberapa jenis berdasarkan kriteria yang ditetapkan.