SRM является на сегодняшний день лучшим методом для поиска белковых маркеров, проведения скрининговых исследований в биоматериале, обеспечивает высокую специфичность анализа, непревзойденную чувствительность и мультиплексность.

1. ООО «ПОСТГЕНТЕХ»
ЦЕЛЬ: РАЗРАБОТАТЬ ТЕХНОЛОГИЮ СОЗДАНИЯ АНАЛИТИЧЕСКИХ
ТЕСТ-СИСТЕМ ДЛЯ КЛИНИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ
БИОЛОГИЧЕСКИХ ПРОБ НА ГЕНОМНОМ, ТРАНСКРИПТО-
ПРОТЕОМНОМ И МЕТАБОЛОМНОМ УРОВНЕ

2. СХЕМА РАЗРАБОТКИ ТЕХНОЛОГИИ
МЕТА-АНАЛИЗ ДАННЫХ
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЙ СКРИНИНГ
ОТБОР ПАТТЕРНОВ (ПЛЕЯДЫ) БИОМАРКЕРОВ
ВАЛИДАЦИОННЫЕ ИСПЫТАНИЯ
ИНФОРМАЦИОННО-
АНАЛИТИЧЕСКАЯ
ЭКСПЕРТНАЯ
СИСТЕМА

3. ПРОБЛЕМА С ПАНЕЛЯМИ БИОМАРКЕРОВ:
все, что можно было открыть легким способом -
уже открыто !!!
Простатический специфический антиген
Раковый эмбриональный антиген
Альфа-фетопротеин …

4. ПАТТЕРНЫ ПРОТИВ БИОМАРКЕРОВ
• Здравый смысл
Биомаркеры должны лучше отделять опухоли
от нормы, потому что они СПЕЦИФИЧНЫ для
опухоли. Паттерны содержат много шума
• Однако высокий уровень шума и определяет
злокачественный потенциал опухоли, ее
плеоморфизм

5. ДВА ПРОГНОСТИЧЕСКИХ НАБОРА БИОМАРКЕРОВ
ДЛЯ РАКА МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ
Wang et al.
Lancet 2005,
List = 76
лучших генов
Van’t Veer. et al.
Nature 2002,
List = 70
лучших генов
76 2 70

6. ОПРЕДЕЛЕНИЕ НОРМЫ
ЧТО ТАКОЕ
НОРМАЛЬНАЯ
ПЕЧЕНЬ ?
НОРМАЛЬНЫХ ПЕЧЕНЕЙ НЕ БЫВАЕТ,
КАК И СТАНДАРТНЫХ ПЕЧЕНЕЙ

7. НАСКОЛЬКО ПЛОХА МОЯ ОПУХОЛЬ?
ОТВЕТ:
дистанция от идеальной нормы
Ваша опухоль

8. ИЗМЕРЕНИЕ РАССТОЯНИЙ В ПРОСТРАНСТВЕ
МНОГОПАРАМЕТРИЧЕСКОЙ ДИАГНОСТИКИ
Пространство ,
занимаемое
ОПУХОЛЕВЫМИ
образцами
DCancer
Центр пространства
НОРМАЛЬНЫХ тканей
DNormal
Центр
пространства
ОПУХОЛЕВОЙ
клетки
Пространство,
занимаемое
НОРМАЛЬНЫМИ
образцами

9. ПРИМЕР №1:
Панели биомаркеров
АДЕНОКАРЦИНОМА ЛЕГКИХ
СОСЕДНЯЯ НОРМАЛЬНАЯ ТКАНЬ
Каждая точка это
отдельный образец
нормы и опухоли на
микрочипе
Dcspec – расстояние от центра пространства, занимаемого ОПУХОЛЕВЫМИ образцами
Dnspec – расстояние от центра пространства, занимаемого НОРМАЛЬНЫМИ образцами

10. ПРИМЕР №2:
мишени для лекарств
Гены-мишени,
повреждение
которых убивает
опухоль
Онкогены – драйверы
опухолевых процессов

11. ВЗГЛЯД В БУДУЩЕЕ
ЦЕНТРАЛИЗОВАННАЯ
ЛАБОРАТОРИЯ Профили 100 нормальных образцов простаты
Определение НОРМАЛЬНОГО ПРОСТРАНСТВА
для каждого вида оборудования
Для каждого опухолевого образца,
будет измерено расстояние до нормальной ткани

12. ДРУГИЕ ПРИМЕНЕНИЯ
(кроме онкологии)
• СТАРЕНИЕ: как далеки мои ткани от
идеала?
• Хронические заболевания –
сердечнососудистые, резистентность к
инсулину
• Пре-злокачественные воспалительные
состояния – могут регистрировать скрытую
анеуплоидизацию … канцерогенез…