An introduction to R: graphics

1. I2R Grafica in R

8. Funzioni di alto livello Comandi per la grafica 3D image, contour, persp Grafici a “torta” pie B ox-and-whisker plot boxplot Grafici a “colonne” barplot Generazione di istogrammi hist Grafici per confrontare diverse distribuzioni qqnorm, qqplot La funzione più utilizzata: permette di generare diverse tipologie di grafici (per punti, linee, grafici a barre, etc) plot start.help() PACKAGES/graphics library(help="graphics") more info:

10. plot(x) > x <- rnorm(1000) > plot(x)

12. plot(X) > x <- 1:100 > y <- x^2 > m <- cbind(x,y) > plot(m)

13. plot(f) > fact <- factor(rep(c(&quot;GGGACT&quot;,&quot;CCCGGT&quot;,&quot;GGTGGT&quot;),c(5,8,10))) Versione compatta Versione estesa > summary(fact) CCCGGT GGGACT GGTGGT 8 5 10 > class(fact) [1] &quot;factor&quot; > plot(fact) > seq <- c(&quot;GGGACT&quot;,&quot;CCCGGT&quot;,&quot;GGTGGT&quot;) > times <- c(5,8,10) > v1 <- rep(seq,times) > fact <- factor(v1)

14. plot(f,y) > length(fact) [1] 23 > y <- rnorm(23) > cbind(fact,y) fact y [1,] 2 -0.384699247 [2,] 2 0.787114321 [3,] 2 -0.673250349 [4,] 2 -0.812762048 [5,] 2 0.103863277 [6,] 1 0.773316309 [7,] 1 1.702127982 [8,] 1 -0.725201109 [9,] 1 -1.127990472 [10,] 1 -0.792510586 [11,] 1 0.180637613 [12,] 1 -0.661579088 [13,] 1 -0.186712857 [14,] 3 1.956332425 [15,] 3 0.002924978 [16,] 3 0.139636871 [17,] 3 -1.293007897 [18,] 3 -0.631633961 [19,] 3 1.391216216 [20,] 3 -0.570057441 [21,] 3 0.370955534 [22,] 3 0.870275335 [23,] 3 1.193812723 plot(fact,y) 3° quartile 1° quartile mediana min max

15. plot(data.frame) > data(iris) > summary(iris) Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species Min. :4.300 Min. :2.000 Min. :1.000 Min. :0.100 setosa :50 1st Qu.:5.100 1st Qu.:2.800 1st Qu.:1.600 1st Qu.:0.300 versicolor:50 Median :5.800 Median :3.000 Median :4.350 Median :1.300 virginica :50 Mean :5.843 Mean :3.057 Mean :3.758 Mean :1.199 3rd Qu.:6.400 3rd Qu.:3.300 3rd Qu.:5.100 3rd Qu.:1.800 Max. :7.900 Max. :4.400 Max. :6.900 Max. :2.500 > plot(iris, col=&quot;darkgreen&quot;)

17. plot(function) > MyFunc <- function(x) (sin(x)) > class(MyFunc) [1] &quot;function&quot; > plot(MyFunc,0,2*pi, + col=“darkred”) plot(funzione, x min , x max ) plot(MyFunc,0,2*pi, col=&quot;darkred&quot;, xlim=c(2*pi,0))

18. Alcuni argomenti del comando plot() logical (TRUE/FALSE) string string string string vector: c(y1,y2) vector: c(x1,x2) 1-character string Etichetta asse delle y ylab Etichetta asse delle x xlab Se FALSE non disegna gli assi e il contorno del grafico axes Sottotitolo del grafico sub Titolo del grafico main Limiti di y (y1, y2) nel grafico. y1 > y2 inverte l’asse delle y ylim Limiti di x (x1, x2) nel grafico. x1 > x2 inverte l’asse delle x xlim tipo di grafico: punti, linee, ... type

19. plot(..., type=“”) Type &quot;p&quot; for p oints &quot;l&quot; for l ines &quot;b&quot; for b oth &quot;c&quot; for the lines part alone of &quot;b” &quot;o&quot; for both o verplotted &quot;h&quot; for h istogram vertical lines &quot;s&quot; for stair s teps &quot;S&quot; for other s teps &quot;n&quot; for no plotting. more info: help(plot) type p type l type b type c

20. plot(..., type=“”) Type &quot;p&quot; for p oints &quot;l&quot; for l ines &quot;b&quot; for b oth &quot;c&quot; for the lines part alone of &quot;b” &quot;o&quot; for both o verplotted &quot;h&quot; for h istogram vertical lines &quot;s&quot; for stair s teps &quot;S&quot; for other s teps &quot;n&quot; for no plotting. more info: help(plot) type o type h type s type S

22. qqnorm > x <- rnorm(100) > qqnorm(x) > qqline(x)

23. qqplot > x <- rnorm(100) > y <- rchisq(100,df=1) > qqplot(x,y) Normal VS chi square distribution

24. Funzioni di alto livello Comandi per la grafica 3D image, contour, persp Grafici a “torta” pie B ox-and-whisker plot boxplot Grafici a “colonne” barplot Generazione di istogrammi hist Grafici per confrontare diverse distribuzioni qqnorm, qqplot La funzione più utilizzata: permette di generare diverse tipologie di grafici (per punti, linee, grafici a barre, etc) plot

26. Istogramma con frequenze assolute o relative > w <- rnorm(1000,mean=100,sd=10) > hist(w, col=&quot;grey&quot;) > w <- rnorm(1000,mean=100,sd=10) > hist(w, col=&quot;grey”,freq=F) FREQ: Defaults to TRUE if and only if breaks are equidistant (and probability is not specified).

27. Istogramma: breaks > w <- rnorm(1000,mean=100,sd=10) > hist(w, col=&quot;grey&quot;, breaks=30, label=TRUE) label=TRUE

37. help(rainbow)

39. Funzioni di alto livello Comandi per la grafica 3D image, contour, persp Grafici a “torta” pie B ox-and-whisker plot boxplot Grafici a “colonne” barplot Generazione di istogrammi hist Grafici per confrontare diverse distribuzioni qqnorm, qqplot La funzione più utilizzata: permette di generare diverse tipologie di grafici (per punti, linee, grafici a barre, etc) plot

41. image (x,y,z) > data(volcano) > x <- 10*(1:nrow(volcano)) > y <- 10*(1:ncol(volcano)) > image(x, y, volcano, col = terrain.colors(100), axes = FALSE, main=&quot;Mappa topografica&quot;)

42. persp > persp(x,y,volcano, theta=135, phi=30, col=&quot;green3&quot;, scale=F, ltheta=-120, shade=0.75, border=NA, box=F, main=&quot;Mappa 3D&quot;)

43. contour > contour(x,y,volcano) > contour(x,y,volcano,add=TRUE)

45. par(mfrow=c(3,2))