3. Aminokyseliny
• Všetky majú aminoskupinu na α uhlíku a sú
ľavotočivé
• Ich fyzikálno-chemické vlastnosti sú určené
charakterom bočného reťazca
4. Rozdelenie aminokyselín
Nepolárne Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Phe,
Trp, Met, Pro
Polárne Tyr, Asn, Gln, Ser,Thr, Cys
Kyslé Asp, Glu
Zásadité His, Arg, Lys
5. Stavba proteinov
• Sú polypeptidy, ich monomérnymi jednotkami sú
aminokyseliny
• Aminokyseliny sú navzájom spojené peptidovými
väzbami – vznikajú spojením karboxylových a
aminoskupín
6. Štruktúra proteinov
• Okrem peptidických (kovalentných) sa na jej
tvorbe podialajú iónové, vodíkové a Van der
Waalsove väzby
• Rozlišuje sa primárna, sekundárna, terciárna a
kvartérna štruktúra proteinov
7. Molekuly tvoriace nukleové
kyseliny
• Pentóza
• Zvyšok kyseliny fosforečnej
• Dusíkaté bázy:
- deriváty purínu: adenín, guanín
- deriváty pyrimidínu: cytozín, tymín, uracyl (RNA)
8. Párovanie báz
• Spojenie dvoch báz vodíkovými väzbami
• Na základe Watson-Crickových pravidiel sa
navzájom párujú adenín s tymínom a guanín s
cytozínom
9. Primárna štruktúra DNA
• Je určená poradím báz v
jednoreťazovom vlákne DNA
• Na jej tvorbe sa podielajú
kovalentné väzby
• Nukleotidy sú spojené 3´,5´
fosfodiesterovou väzbou
10. Sekundárna štruktúra DNA
• Najčastejšie štruktúra
dvojšrobovnice
• Na tvorbe sekundárnej štruktúry
sa podielajú predovšetkým
vodíkové väzby
• Oba reťazce sú navzájom
komplementárne a antiparalelné
• Na dvojšrobovnici sa rozlišuje
väčší a menší žliabok
11. Terciárna štruktúra DNA
• DNA ktorá nemá terciárnu štruktúru sa označuje
ako relaxovaná
• Vyššie vynutie DNA – superhelix (nadšrobovnica)
• Kladné alebo záporné nadšrobovicové vinutie
• Topoizomerázy – enzýmy ktoré katalyzujú zmeny
vynutia DNA
12. Replikácia DNA
• Semikonzervatívna – každé vlákno je templátom
materskej molekuly
• Semidiskontinuálna – jeden reťazec sa syntetizuje
diskontinuálne
• Katalyzovaná komplexnou enzymatickou
mašinériou
13. Priebeh replikácie
• Syntéza prebieha v tzv.
replikačnej vidlici
• Polymeráza potrebuje pre
začatie syntézy RNA
primer
• Vlákno je vždy
syntetizované v smere 5
´→ 3´
14. Priebeh replikácie
• Jedno vlákno je syntetizované kontinuálne – vedúci
(leading) reťazec a druhé diskontinuálne –
oneskorujúci sa (lagging) reťazec
• Oneskorujúce sa vlákno je syntetizované cez
Okazakiho fragmenty – 100 až 1000 nukleotidové
úseky, jeho syntéza začína na konci RNA primeru
• Diskontinuálne nasyntetizované reťazce sú spojené
DNA ligázou
• Rýchlosť replikácie je približne 100 bp/s. a prebieha
súčastne v mnohých častiach genómu
15. Enzýmy zúčastnujúce sa na
replikácii DNA
Topoizomerázy Zmenou vynutia rušia terciárnu
štruktúru DNA superhelixu
Helikázy Ruší vodíkové väzby v dvojšrobovnici a
mení ju na dve jednoreťazové vlákna
DNA Syntetizujú nové vlákno DNA
polymerázy
Primázy Katalyzuje syntézu RNA primeru –
miesta odkial sa začína syntéza DNA
Ligázy Katalyzujú vznik fosfodiesterovej väzby
16. Eukaryotické DNA polymerázy
α β χ δ ε
Lokalizácia Jadro Jadro Mit. Jadro Jadro
3´→5´ exonukleázová - - + + +
aktivita
Asociovná DNA + - - - -
primáza
3´→5´ exonukleázová aktivita – excízia nesprávne
inkorporovaných nukleotidov (oprava mutácii)
17. Reverzná transkripcia
• Prepis genetickej informácie z RNA do DNA
• Katalyzovaná reverznou transkriptázou – enzýmom
retrovírusov – inkorporácia vírusovej cDNA do
eukaryotického genómu
