SlideShare a Scribd company logo
GUIÓ

                                                                              Que és el material genètic?
                                                                              Com es transmet la informació del nucli a la resta de la
                                                                              cèl·lula?
       Jornades Formatives en MALALTIES MINORITÀRIES                          Com es tradueix i com s’executa la informació?
                           Curs 2009-210                                      El codi genètic es pot alterar?
                                                                              Què son les mutacions?
                  Com “parlen” els gens?                                      Quina relació hi ha entre mutació , producte gènic alterat
                                                                              i malaltia?
                     Dra.Teresa Pàmpols i Ros                                 L’expressió clínica és molt variable. Per què?
Institut de Bioquímica Clínica. Servei de Bioquímica i Genètica molecular.    Com es transmeten les malalties genètiques a la descendència?
                      Hospital Clínic de Barcelona i                          Perquè les malalties hereditàries tenen prevalences tan
                         (tpampols@clinic.ub.es)                              baixes?




                                                                             Dins el nucli d’una
          De fet, els gens “parlen” bioquímica                               cèlula hi ha
                                                                             enmagatzemada la
                                                                             informació per a la
                          Com ho fan ?                                       constitució del ser viu
                                                                             del qual procedeix : el
              Que és el material genètic?                                    material genètic




                                                                                                                   Guanina
                                                                                                                   Adenina
                                                                                                                   Timina
                                                                                                                   Citosina

  El material genètic es l’àcid desoxiribonucleic
(ADN)=desoxiribosa + fosfat+ bases nucleotídiques




                                                                                                                                              1
3’
L’ADN es una enciclopedia que enmagatzema tota la                                                                   A               A                                                  A
                                                                                                                                                                                            3’
                                                                                                                C                        C                              T
                                                                                                                                                                  G
informació mitjançant un senzill alfabet de 4 lletres                                                               T               T                        C                         T
                                                                                                                                              T                        A
                                                                                                                G                        G                        C
    ATGTTGACCTGATCGAAATGGATCCTCTCTCGACTATAACCAATGATG                                                                                                         G           enlace de
                                                                                                                                              A
    GAAATGGATCATGTTGACCTGATCGATCCTCTCTCGACTTTGACCTGC                                                       5’                base                                        hidrógeno          5’
    ATGATGCCTAGCATGTTGACCTGATCGAAATGGATCCTCTCTCGACTA
    GGATCCTCTCTCGACTATAACCAATGATGCCTAGCACATGTTGACCTG
    CGACTATAACCAATGATGCCTAGCATGTTGACCTGATCGAAATGGATC
                                                                                     Una molècula d’ADN, està constituïda per dues cadenes amb
    CTAGCCAATGATGCCTAGCCAATGATGCCTAGCATGATGCCTAGCTTG                              seqüències de nucleòtids complementaries, generant una doble hèlix
    TGGATCCTCTCTCGACTATAACCAATGATGCCTAGATGTTGACCTGAT                               de aproximadament 10 parelles de nucleòtids per volta de la hèlix.
    GGATCCTCTCTCGACTATAACCAATGATGCCTAGCACATGTTGACCTG
    CCTGATCGAAATGGATCCTCTCTCGACTATAACCAATGATGCCTAGCA
    ATGTTGACCTGATCGAAATGGATCCTCTCTCGACTATAACCAATGATG
    CTAGCCAATGATGCCTAGCCAATGATGCCTAGCATGATGCCTAGCTTG
    GACTATAACCAATGATGCCTAGCACATGTTCTAGCCAATGATGCACA
    TGTTCTAGCCCTAGCCAATGATGCCTAGCATGATGCCTAGCTTGTGATG


                                                                                Biología Molecular de la Célula B. Alberts, D. Bray, J. Lewis, M. Raff, K. Roberts, JD. Watson. Ed. Omega (1994)




                                                                                                           MAGNITUD DEL ADN
                                      oòcit                  espermatozous


   El DNA del nucli d’una cèl·lula reproductora és un doble
   filament en espiral de 1 m de longitud que conte 3 x 109
                       parells de bases


                                                   cèl.lula de la pell
                                                                                     Les 3 x 109 parells de bases (lletres) del genoma haploide
      El nucli d’una cèl·lula somàtica te dos filaments , el
                                                                                        (d’una cèl·lula germinal) escrites una darrera l’altra
     procedent del pare i el procedent de la mare, es a dir 2
                                                                                         ocuparien 200 volums de 1000 pàgines cadascun
                        metres de DNA




          L’ADN está “empaquetat”dins el nucli                                           Quan una cèl·lula es divideix , el material genètic s’ha de
                                                                                        replicar i repartir en les dues cèl·lules filles ( mitosis). Per a
                                                                                       evitar errors l’ADN es reparteix en paquets petits densament
                                                                                                         empaquetats (cromosomes)




          Fibras de cromatina

                                                      Empaquetamiento Grado 6
                                           60% proteína
                   Cromatina               35% DNA
                                           5% RNA
                                                                                  1879-1872 Arnold y Fleming : Primeres observacions de cromosomes en mitosis
Principios de Bioquímica. Lehninger 1986




                                                                                                                                                                                                   2
46 cromosomes
                              2 metres DNA
               µ
              5µm
                              600mg/mL (70% pes)



                µ
              25µm


                                                                                                                         Cromosoma Metafàsic


                                                                                Empaquetament
      Cèl·lula somàtica                                                          1.000-10.000
                                                                                   vegades

                                                Nucli en metafase
                                                                              Principios de Bioquímica. Lehninger 1986
                                    1956 Tjio & Levan : Tenim 46 cromosomas




      La informació de la enciclopèdia (l’ADN) està                           El GEN es la unitat física i funcional de la herència
    organitzada en frases (gens) i les frases en paraules                      i la majoria conté informació per a elaborar una
        (codons ) formats per 3 lletres (les 4 bases                                                proteïna
                     nucleotídiques)
                                                                                 Molts gens tenen un tamany de unes 100.000
ATGTTGACCTGATCGAAATGGATCCTCTCTCGACTATAACCAATGATG
GAAATGGATCATGTTGACCTGATCGATCCTCTCTCGACTTTGACCTGC                                               parells de bases.
ATGATGCCTAGCATGTTGACCTGATCGAAATGGATCCTCTCTCGACTA
GGA TCC TCT CTC GAC TAT AAC CAA TGA TGC CTA GCA CAT GTT GAC
CGA CTA TAA CCA ATG ATG CCT AGC ATG TTG ACC TGA TCG AAA TGG
                                                                               Hi ha gens molt grans : el gen de la Distrofina te
CTA GCC AAT GAT GCC TAG CCA ATG ATG CCT AGC ATGA TGC CTA ATC                                       2.4 Mb
CTC TCT CGA CTA TAA CCA ATG ATG CCT AGA TGT TGA CCT GAT
GGATCCTCTCTCGACTATAACCAATGATGCCTAGCACATGTTGACCTG
CCTGATCGAAATGGATCCTCTCTCGACTATAACCAATGATGCCTAGCA                                     ( 1 Megabase = 1.000.000 de parells de bases)
ATGTTGACCTGATCGAAATGGATCCTCTCTCGACTATAACCAATGATG
CTAGCCAATGATGCCTAGCCAATGATGCCTAGCATGATGCCTAGCTTG
GAC TAT AAC CAA TGA TGC CTA GCA CAT GTT CTA GCC AAT GAT GCA CA
                                                                                            El genoma humà te 3.200 Mb
TGT TCT AGC CCT AGC CAA TGA TGC CTA GCA TGA TGC CTA GCT TGT
                                                                                      Només 1,4 % del genoma es codificant




    Tenim també un petit genoma mitocondrial: ADN mt                                                 14 d’abril de 2003




                          Es circular i te 13.6 Kb                                           “Wellcome to the Genomic Age”
                     S’hereta exclusivament per línia
                                 materna
                                                                                                       www.genome.gov




                                                                                                                                               3
Nature, 21 Oct. 2004

                                                                                          ¡¡ Sorpresa, Sorpresa !!
                                                                               Només tenim 19.599 gens codificadors de
                                                                                               proteïnes
                                                                                       ( de fet son uns 25.000)
                                                                                         www.ncbi.nih.gov/Genbank
                                                                                           www.genome.ucsc.edu
                                                                                             www.ensembl.org
                                                                                            www.ddbj.nih.ac.jp
                                                                                        www.ebi.ac.uk/embl/index.html



                                                          Wadsworth Center




Els gens es distribueixen en cada un dels cromosomes                            Diem locus a la posició fixa d’un gen en un
       sempre de la mateixa manera (MAPA)                                                      cromosoma
                                                                                          ex. el locus del gen OCA 1 es 11q 1.4-q 2.1
                   Gen A
                   Gen   B                                   metafase           La distancia entre gens es medeix en
                   Gen   C                                                                 centimorgans
                   Gen   D
                   Gen   E                                                           1 centimorgan = 1.000.000 de parells de bases
                   Gen   F
                   Gen   G
                                                                               La llista ordenada de loci es denomina mapa
     ¡Recordeu! Cèl·lules somàtiques: 46 cromosomes, formats per                                  genètic
      Desierto génico
     gens i proteïnes que es localitzen en el núcli, 23 procedents del
     pare amb els 25.000 gens paterns i 23 procedents de la mare
     amb els 25.000 gens materns. Al tenyir el nucli en metafase
                                                                             Diem al.lel a la variant de la secuencia d’ADN en
     veiem els cromosomes individualitzats i “bandejats”                                     un determinat locus




                                                                             La informació continguda en l’ADNdel nucli es
                                                                             transmet al citoplasma de la cel.lula mitjançant
                                                                                                 l’ARN
   Com es transmet la informació del
     nucli a la resta de la cèl·lula?
                               i                                                                     Procés
                                                                                  Transcripció de l’ADN a ARNp(precursor)
   Com es tradueix i com s’executa la
             informació?                                                              “Splicing” a ARNm (missatger)
                                                                                      Traducció a un producte gènic




                                                                                                                                        4
L’ARN es un esquelet de ribosa                      Quan un gen s’ha d’expressar o “encendre” s’obre la doble
                                                                                                                    hèlix de l’ADN a l’ inici del gen i la RNA polimerasa va
                                                                  fosfat i 4 bases nucleotídicas                     ensamblant les bases nucleotídiques complementaries
                                                                    G C A i U ( en lloc de T)                                     formant un RNA precursor
                                                                                                                                    Es diu procés de transcripció




                                 Intensificador
                                                        TRANSCRIPCIÓ
                                                        Silen
                                                             ciad
                                                                  or
                                                                                                                   L’expressió dels gens a nivell transcripcional es complexa i
                                                                                                  Represor         regulada per factors controladors
                                                                          In
              or




                                                                            t en
                                     Activador
         icad




                                                                                sif                                Inclòs un cop transcrit el RNAp hi ha regulació ( per el
                                                                                      ica
                                                                                         do
    nsif




                                                                                              r                    splicing, per a l’exportació del ARNm al citoplasma i per a la
Inte




                   Activador                                                                                       seva estabilitat)
                                                              Activador
                                                                                                                   L'expressió gènica es la base de la diferenciació cel·lular,
                                250 40
                                                                                                                   morphogenèsis i adaptabilitat de l’organisme
                                                 30
                               110       60      BETA                                     H                        Depèn de mecanismes anomenats epigenètics
                                                 30
                                                 ALFA
                                                        150                    E
                                 80       Proteína                    F            Polimerasa
                                                                                                                                Metilació del ADN
                                      de unión a TATA                               de ARN              Regió
                                A                             B
                                                                                                        Xifrada
                                                                                                                                Silenciació de gens
                                                                                                                                Modificacions d’histones
                                       Bloque TATA
                                                        Centre promotor                                                         Proteïnes modificadores de la cromatina

     R.Tjian “Mecanismo molecular del control génico”. Investigación y Ciencia. Abril 1995




                                                                                                                                    Un gen te introns i exons
                                                                                                                  l’ADN del gen es transcriu sencer pero nomes es tradueixen els introns
               Els mecanismes epigenètics son responsables de la
               inactivació al atzar d’un dels cromosomes X en les                                                              Intró 1                   Intró 2           Intró 3
               cèl.lules dels fetus de sexe femení en les primeres etapes                                         P exó 1                  exó 2                   exó 3
               del desenvolupament                                                                                                                                                   RNAp



                                                                                                                  “splicing”
               Son malaltíes epigenètiques : Les sídromes de Rett,
               Angelman , Prader –Willi i Beckwith-Wiedemann                                                                                                        RNAm

                                                                                                                               traducció

                                                                                                                                                                    Producte gènic




                                                                                                                                                                                            5
CÓDI GENÈTIC
         Ampliem el concepte traducció:
                                                                     AMINOÁCIDS                                         CODONS
                                                                A     Ala      Alanina                                GCA GCC GCG                GCU
   Un cop fora del nucli la seqüència de l’ARN m                C     Cys      Cisteína                               UGC UGU
      es llegida per uns agregats moleculars :                  D     Asp      Acid aspártic                          GAC GAU
                      ribosomes
                                                                K     Lys           Lisina                            AAA AAG
      Cada triplet o codó te el significat d’un
   aminoàcid Els aminoàcids es fixen a molècules                Y    Tyr Tirosina              UAC UAU
       d’ARN petites de RNAt (transferència)
    i es van ensamblant i formant un polipèptid                Hi han 20 aminoàcids i 64 combinacions de triplets possibles ,
                                                                la majoria d'aminoàcids està especificat per mes d’un codò




                      Traducció



                                                                        ¡¡¡¡Un polipèptid de 400 aminoacids
                                                                               es sintetitza en 20 segons!!!!!




                                                                          Els 4 passos de la formació de proteïnes
Repàs

                        núcli
                ADN        intró   exó

                           TRANSCRIPCIÓ
                                                                1. Transcripció y traducció                     2. Plegament
                ARN p




                           “SPLICING”


               RNAm
                                          Producte gènic =
                            TRADUCCIÓ                           3. Modificacions post traducció                4. Interacció proteïna-proteïna
                                         Polipèptid/Proteïna

                                                                               The Promise of Proteomics.
                                                                               New York Academy of Sciences. January 31, 2001. www.nyas.org




                                                                                                                                                       6
¡Hi ha moltes mes proteïnes que gens !
         (25.000 gens / 200.000 proteïnes)
         Un gen pot donar lloc a diversos                               El codi genètic es pot alterar?
      “transcrits” o PRODUCTES GÈNICS
             (polipéptids/proteínes)
                                                                              Què son les mutacions?



                “Splicing” alternatiu




Quan una cèl·lula entra en divisió s’ha de replicar tot
                       l’ADN
       50 enzims reparadors             Errors de
              Polimerització :1 en 10 -4
       40 enzims correctors             Errors de
                replicació : 1 en 10   -10

                                                          La forquilla de replicació avança a la velocitat de 50 nucleotids / segon
   Al duplicar el genoma s’ensamblen 1,2 x 10 10          El doble filament de l’ DNA se ha de desenrotllar y l’helix paterna gira
                     nucleotids                           a 50 revolucions/segon (3000 rpm)
                                                            “ La celula Viva” .C.de Duve.Biblioteca Scientific American . Labor 1998




Amb una freqüència al voltant de 10-6 es produeixen           Les mutacions en una cèl·lula somàtica poden
        errors en la replicació de l’ADN                       ser rellevants per al càncer o envelliment i
                                                              només concerneixen a l’individu , però no a la
Mutació = canvi estable i hereditari en la seqüència                       seva descendència*
primària de nucleòtids de l’ADN que afecta la salut
                                                                  Les mutacions han d’estar en les cèl·lules
                                                                     germinals per a tenir impacte en la
     Excepcionalment poden ser inestables i el
                                                                        descendència d’un individu
   descobriment de la expansió de triplets ens ha
  permès explicar malalties com el Huntington, la             Les mutacions poden ser també produïdes per
    distròfia miotònica y la síndrome X-fràgil ,               factors mediambientals ( productes tòxics,
                                                                         radiacions ionitzants)
                                                                * son excepció els càncers familiars




                                                                                                                                       7
El terme mutacions s’empra només per als
        canvis en l’ADN que afecten la salut
      Altres canvis es diuen polimorfismes                                      Els essers humans tenim un genoma 99,9%
 contribueixen a la diversitat humana, permeten                                                  idèntic
   canvis adaptatius i son la base de la evolució                               El 0,1% del genoma que ens fa diferents pot
  Si mateix , polimorfismes en el gen o en altres                                  contenir les causes de que les persones
        locus poden modificar el genotip                                            enmalalteixin per agents infecciosos,
                                                                                 exposicions ambientals i comportaments o
   Hi ha polimorfismes (SNPs) que combinats                                                      estils de vida
    amb factors mediambientals confereixen
       susceptibilitat a malalties comunes




            Magnitud de les mutacions                                      Tipus de mutacions puntuals . Hem dit que els gens son
Mutacions molt grans (millions de parells de bases)                       frases amb significat formats per paraules de tres lletres
  S’altera la morfología i/o número dels cromosomes
Son visibles al microscopio observant el nucli en metafase
                                                                                  ATGCCTACTT ATG CCA TTG ATTCCCAA
                      ( Citogenètica)
Mutaciones de < 2.000-3.000Kb
                                                                                               aa1 aa2 aa3       POLIPEPTID
   Visibles emprant sondas moleculars (FISH etc.)
Mutaciones puntuals (delecions, insercions o canvis d’una
                       única base)
   “Visibles” amb els ull de la bioquímica emprant els
recursos recursos de la Genètica bioquímica i la Genètica
                                                                                  XBNMLANFK SAL DEL MAR ALKSFJLKJ
                        molecular




            Tipus de mutacions puntuals                                      Que passa quan trobem un canvi en l’ADN d’un
                                                                             pacient . Es una mutació o és un polimorfisme?
Vull més SAL DEL MAR          seqüència normal
                                                                           • Sabem que les mutaciones que truncan la proteïna , petitess
                                                                           insercione/delecions, mutacions que creen un codón “stop” o
Vull més SOL DEL MAR        substitució; error de sentit                                     mutacions de “splicing”
                                                     “missense”

Vull més SI L DEL MAR        substitució; pèrdua de sentit
                                              “nonsense”o absurda*                     Son causa de la malaltia
Vull més SALD ELM AR        deleció; pèrdua de sentit
                           “frame shift” o amb desplaçamento de motlle*
Vull més SAX LDE LM         inserció; pérdua de sentit                       • Les mutaciones que només cambien un AA

                                                                          son causa de la malaltia o un polimorfisme?
                Canvi en la proteïna




                                                                                                                                           8
1er es mira si la mutación està descrita a la bibliografía,
                       si no ho està:
         • Comparem la nostra proteïna amb la d’altres
           espècies (si es conserva el residu o no)
         • Mirem la importància del canvi de AA per a la
           funció de la proteïna                                                      Quina relació hi ha entre mutació , producte gènic

         • Ens assegurem que no hem trobat un altre canvi                                                                                        alterat i malaltia?
           en el gen
         • Estudis de expressió
         • Verifiquem si el canvi es troba en 50 individus
           de població general ( 100 al.els)




                                                                                        Un exemple, la Fenilcetonuria
                 Transcripció a ARN                      Traducción                                                                                                                                                                     La de tirosina producció
                                                     a producte gènic
                                                   (polipéptid/proteína)                                                                                                                                                                pigments i síntesi de
                                                                                                                                                                                                                                        neurotransmisors
      ADN




                    Producte gènic
                                                                                          de fenilalanina en plasma




                                      Víes/Productes Metabólics                    Desequilibri amb                                                                           D’acids fenilpiruvic i
                                                                                   altres aminoàcids                                                                          fenil làctic
                                                                                                                                                                                     Efecte tòxic sobre el sistema nerviós .
                                                                                  Síntesi de mielina deficient
                                                                                                                                                                                     Olor corporal
La mutació es tradueix en un canvi en el patró del seu producte gènic específic
                                                                    Fenotipo
La pèrdua de funció altera la homeostàsi fisiològica induint les manifestacions
                                                                   (Fenoma)
                                                                    Fenoma)
                            clíniques i la malaltia




                                                                                          Expressió fenotípica per sistemes anatòmic/funcionals
      L’afectació del sistema nerviós és molt frequent perquè
                                                                                                                                                                                                                                                Muscular/Esquelè




    gairebe un 80 % dels nostres gens estàn relacionats directa o
              indirectament amb el seu funcionament
                                                                                                                                                                                                                                                                   Sistema
                                                                                                                                                                                                                                                                   Nerviós




                                                                                        40,0
                                                                                                                                                                                                                                               Ocular




                                                                                        30,0
                                                                                                                                                                                                                         Craneofacial
                                                                                                                                                                                             Genitourinari
                                                                                                                                                                                                             Metabòlic


                                                                                                                                                                                                                                        Pell
                                                                                                                       Ungles, Immune




                                                                                                                                                                       Extremitats
                                                                                                                                                         Circulatori




     MBID 8                                                                             20,0
                                                                                                                                                                                      Sang
                                                                                                             Endocrí


                                                                                                                                        Cabell
                                                                                                                                                 Dents
                                                                                               Respiratori




                                                                                        10,0


                                                                                        0,0
                                                                                           Basat en: MBID 8: Cap.1 pàg. 3-125 (L.Beaudet, Ch.Scriver, N.Sly, D.Valle)




                                                                                                                                                                                                                                                                             9
Un 80% debuta a l’edat pediàtrica
                                                  5%
                                               In utero
                                                          Edad adulta tardía
                                                            >50 años
                                                                                                                            Es coneixen les
                                                      Pubertad - 50 anys
                                                                                                                            bases metabòliques
                    >50%                                                                                                    i moleculars de
                Neonatal - 1 año                                                                                            unes 700 malalties
                                                                                                                            hereditàries
                                                         30%
                                                   1 año - pubertad




Jiménez-Sánchez et al. capítol 4 del MMBID 8




            El coneixement de les bases
      metabòliques , de la fisiopatología i dels                                      L’expressió clínica és molt variable
      mecanismes moleculars, incloent el gen ,
          i els processos de transcripció i                                                             Per què?
         traducció son fonamentals per a
                  dissenyar teràpies




                                                                                    El fenòmen de la heterogeneitat genètica

     Las variacions en un gen no afecten sempre de la                           HETEROGENEITAT NO AL.LÈLICA O DE LOCUS
     mateixa manera a la proteïna                                              Mutacions a diferents locus genètics poden donar lloc a la
                                                                                                  mateixa malaltía
     Les MH presenten una gran heterogeneïtat genètica                                            e.x. gangliosidosis GM2

 • Els pacients amb una mateixa malaltia no
   son un grupo homogèni                                                                 HETEROGENEITAT AL.LÈLICA
 • Fins i tot amb la mateixa mutació poden ser                                   En un mateix locus es poden donar moltes mutacions
   diferents                                                                                           diferents
                                                                                                  e.x. Duchenne i Becker
                                                                                                     Hurler i Scheie




                                                                                                                                                 10
β-hexosaminidasa
Exemple de heterogeneitat de locus: Les gangliosidosis GM2 A                                 LA HETEROGENEITAT AL·LÈLICA es molt més
                                                                                                     freqüent , gairebé general.
                                     Hexosaminidasa A                   β
                                                                                                 En moltes malalties les mutacions arriben a ser
                                                                   α                              “privades” o “propietàries” de cada família.

                                                      β                                   Sovint els pacients que diem homozigots són en realitat
                                                                                            “compostos genètics”. Amb la qual cosa l'individu
                                                 α              Gangliosid                   estarà produint dos tipus de proteïnes diferents.
activador-GM2
                                                                  GM2
                                                                                            A tot això cal afegir les següents consideracions que
                                                                                          contribueixen a la variabilitat de presentació clínica en
                                                                                                   els pacients amb una mateixa malaltia:



Model de la degradació del gangliosid GM2 per la ß-Hex A estimulada per l’activador.
MMBID 8 pàg 3374 (modificada de W. Fürt i K. Sandhoff. BBA 1126:1, 1992




El fenotip clàssic sever es dona p. ex. quan :                                                                                                  Mutació              Mutació
                                                                                                                                                 suau                 severa


No es produeix un producte gènic funcional                                              Efecte de mutacions “missense”            Neutre                                        Sever

Quan la mutació altera severament la funció de la proteïna                                  Efecte de factors cel.lulars:
                                                                                        Control de qualitat/temperature


                                   PERÒ                                                   Funció residual de la proteïna          Alta                                          Baixa


                                                                                                  Efecte d’altres factors
   Sovint hi ha un continuum de expressió mes suau provenint de
     mutacions que permeten una funció residual de la proteïna                           Probabilitat de malaltía clínica         Asimptomàtic                       Malaltia clínica


                                                                                                                                  DINTELL PER A LA MALALTÍA CLÍNICA
                                                                                       J. Inherit. Metab. Dis (2001) 24:189-212




                                                                                                              Transcripció a ARN                           Traducción
                                                                                                                                                     a polipéptid/proteína


         La funció residual de la proteïna pot ser                                             ADN                                                                   Factors epigenétics
                    influenciada per :
   Factors ambientals que estressen las vies metabòliques
   Aconteixements post-traducció i factors cel·lulars                                                             Producte gènic
                                                                                            Procesament
   Gens situats en altres locus                                                           Post-traducción e                                                          Efectes Ambientals
                                                                                             intervenció                                                             + gens altres locus
                                                                                         de factors cel.lulars



                                                                                                                                         Víes/Productes Metabólics


                                                                                       El genotip no sempre prediu el fenotip i
                                                                                       una malaltia monogènica es pot
                                                                                       comportar com un trastorn complexe




                                                                                                                                                                                           11
Concepte de penetrança
                                          G6PD deficiency
                                                            Hemochromatosis
                                                                                                                  Freqüència amb la que la característica que
                                                                                                                  controla un gen (fenotip) es fa visible en els
    Paper creixent de factors
     ambientals i estocàstics




                                                              Acute intermittent porphyria

                                                                                   Type I diabetes mellitus
                                                                                                                         individus que el tenen alterat
                                                  α1-Antitrypsin ZZ

                                                                   Apo E-2/E-2 hyperlipoproteinemia                         ex. malaltía de Tay-Sachs
                                                  Tuberous sclerosis
                                                                      Marfan                                     Els gens amb penetrança baixa requereixen la
                                              Retinoblastoma                             Hartnup
                                          Phenylketonuria       Familial hypercholesterolemia
                                                                                                                       interacció amb factors ambientals
                                                                                                              Ej. genotip lent NAT2 aumenta el risc de cáncer de
                                                             Sickle-cel anemia
                                                  Cystic fibrosis                                             bufeta en individus exposats a arilaminas , però es
                                            Huntington disease
                                         Duchenne distrophy                                                              inefectiu si no hi ha exposició
                                0       Tay Sachs
                                    0
                                        Paper creixent dels genotips d’altres loci




                                                                                                              Quan un gen juga un paper predominant en la determinació
                                                                                                                d’una malaltia , aquesta s’hereta de forma monogènica
                                                                                                                      o mendeliana (segueix les lleis de Mendel)


                                                                                                                                20% AD
                                    Com es transmeten les malalties
                                     genètiques a la descendència?                                                                                         8%

                                                              Herència
                                                                                                                     60% AR         12% XL           Herencia
                                                                                                                                                     materna
                                                                                                                                                      mtDNA




      Herencia Autosòmica Recesiva

                                    A         a                                     A         a




                                A         a                                A              a




     A                          A                 A     a             a        A                  a   a



     1/4
25% No portadors                                          1/2
                                                      50%Portadors                      25%Malalts
                                                                                           1/4
                                                                                          (Homocigots)
                                                        (Heterocigots)




                                                                                                                                                                         12
HERENCIA AUTOSÒMICA DOMINANT                                    Si en la família del esquema anterior la malaltia fos autosòmica
                                                                              dominant , estarien clínicament afectats un 75% dels fills
                                                                            Però és mes comú que només un dels dos progenitors sigui
                                                                             heterozigot i aleshores estaran afectats un 50% dels fills
 Es diu que un caràcter s’hereta en forma dominant
         quan els heterozigots presenten clínica


    Depèn en gran part, de la tolerància del sistema
          biològic a la pertorbació de la proteïna




    Herència gonosómica Lligada al X
             AX X a                                AX Y a




           A X      a X                     Axxx
                                              X        a Y




                          X AY          aX X A               a X Y a
    A X XA                X Y



Nena no portadora     Nen no portador Nena portadora         Nen malalt
                                      (heterozigota)        (hemizigot)
    Estaràn afectats 50% dels nens i serán portadoras 50% de les nenes




       En una malaltía lligada al X , la mutació també pot
       aparèixer per primer cop en el cromosoma X d’un
                             home



         Totes les nenes de la parella portaran un X de la
       mare i el X del pare amb la mutació , per tant seran
       totes heterozigotes i no serà fins la segona generació
                   que apareixeran nens afectats
                                                                          Exemples d’arbres familiars amb els tres tipus d’herència
                                                                                           mendeliana descrits




                                                                                                                                             13
HI HA 3 CATEGORÍES DE MALALTIES GENÈTIQUES                                                     Com es transmeten a la descendència

                                                                                         HERENCIA                              HERÈNCIA NO
• TRASTORNS CROMOSÓMICS : Constitucionals i adquirides
                                                                                       MENDELIANA                              MENDELIANA
                                                                                     Trastorns monogènics
• TRASTORNS MENDELIANS O MONOGÈNICS
                                                                                   Autosòmica Recesiva
                                                                                                                         Anomalies Cromosomiques
                                                                                   Gonosòmica Lligada al X
• TRASTORNS POLIGÈNICS O MULTIFACTORIALS                                                                                 Trastorns Multifactoriales
  Causats per la interacció de múltiples gens i factores ambientals, entre els     Autosòmica Dominante
  quals hi han algunes de las malalties corrents de la edat adulta com la                                                Alteracions del Genoma
  diabetis i les malalties coronaries
                                                                                   Gonosómica Dominant
                                                                                                                         mitocondrial
                                                                                   lligada al X




                                                                                  El zigot te un sol genoma nuclear heretat del pare i de la mare , però
                                                                                 te diversos genomas mitocondrials (poliplasmia) que hereta només de
                                                                                            la mare i no tots tenen la mutació (heteroplasmia)
Moltes malalties mitocondrials son de transmissió
   mendeliana perquè els gens que controlen la                                                                                    S
majoría de les proteïnes mitocondrials son nuclears
 Hi ha un grup més petit de proteïnes , controlades                                                                  O
                                                                                       Poliplasmia y
 pel genoma mitocondrial i aleshores les mutacions
                                                                                       heteroplasmia
  es transmeten amb el que s’anomena “herència
                                                                                                                         Z (Zigot)
     materna”, perquè el zigot conté només les
     mitocondries del òvul matern ja que les del                                                                                         Els teixits reben
             espermatozou es perden                                              Segregació                                              mitocondries
                                                                                                                                         normal i mutades
                                                                                 replicativa                                             de manera aleatòria
                                                                                               A            B             C




 Un noi afectat per una malaltia lligada al genoma mitocondrial , no pot
  transmetre mai la malaltia a la descendència , en canvi si la que està
              afectada es una noia , tots els fills ho estaran



                                                                                        Perquè les malalties hereditàries tenen
                                                                                               prevalences tan baixes?




                                                                                                                                                               14
Les malalties genètiques pertanyen majoritàriament a
   la categoria de malalties rares o de baixa prevalença,     La freqüència de una malaltia genètica en la població depèn de:
      un 80% fins i tot estan per sota de 1 en 100.000

                                                                                   La tassa de mutacions
                                                                                      El patró d'herència
                                                                          Desavantatges que confereix la mutació
                                                                       Successos distorsionadors ( naturals o socials)




                     www.orpha.net




                                                                Però en el cas d’una malaltia recessiva , el gen mutat està present
                                                                en els heterozigots sans i amb la mateixa tasa de mutació de 10-6 i
  Quan una mutació altera la funció del gen i porta a                la mateixa frequencia de l’homozigot de 1 en 1 milió , la
 una desavantatge , la mutació tendeix a desaparèixer                   freqüència del heterozigot al equilibri es 1 en 1000
  de la població , però contínuament apareixen noves
                                                                Quan la frequencia d’una malaltía es multiplica per 10 o per 100
 mutacions en cada generació i s'arriba a un equilibri
                                                                              en algunes poblacions , pot ser per:
    entre mutació que dona lloc a un gen deletèri i
      selecció natural que l’elimina de la població.           Efecte fundador

 Com a promitg , la tassa de mutació per generació i           Aventatges pel fet d’esser heterozigot :
 gen es molt baixa ap. 10-6 i per un trastorn dominat               Anèmia falciforme     protecció en front la malaria
  letal, la freqüència del gen al equilibri es de 1 en 1
                                                                    Fibrosis quística     protecció en front el tifus i malalties
                           milió
                                                                                          diarreicas
                                                                     Fenilcetonuria         incidencia de pèrdues fetals




Val la pena remarcar que cadascun de nosaltres portem
   de 6 a 8 anomalies genètiques recessives i si alguna
coincideix amb les de la parella podem tenir fills afectats

Tenim uns 25.000 gens i per això es molt difícil coincidir




                                                                                                                                      15

More Related Content

Featured

2024 State of Marketing Report – by Hubspot
2024 State of Marketing Report – by Hubspot2024 State of Marketing Report – by Hubspot
2024 State of Marketing Report – by Hubspot
Marius Sescu
 
Everything You Need To Know About ChatGPT
Everything You Need To Know About ChatGPTEverything You Need To Know About ChatGPT
Everything You Need To Know About ChatGPT
Expeed Software
 
Product Design Trends in 2024 | Teenage Engineerings
Product Design Trends in 2024 | Teenage EngineeringsProduct Design Trends in 2024 | Teenage Engineerings
Product Design Trends in 2024 | Teenage Engineerings
Pixeldarts
 
How Race, Age and Gender Shape Attitudes Towards Mental Health
How Race, Age and Gender Shape Attitudes Towards Mental HealthHow Race, Age and Gender Shape Attitudes Towards Mental Health
How Race, Age and Gender Shape Attitudes Towards Mental Health
ThinkNow
 
AI Trends in Creative Operations 2024 by Artwork Flow.pdf
AI Trends in Creative Operations 2024 by Artwork Flow.pdfAI Trends in Creative Operations 2024 by Artwork Flow.pdf
AI Trends in Creative Operations 2024 by Artwork Flow.pdf
marketingartwork
 
Skeleton Culture Code
Skeleton Culture CodeSkeleton Culture Code
Skeleton Culture Code
Skeleton Technologies
 
PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024
PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024
PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024
Neil Kimberley
 
Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)
Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)
Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)
contently
 
How to Prepare For a Successful Job Search for 2024
How to Prepare For a Successful Job Search for 2024How to Prepare For a Successful Job Search for 2024
How to Prepare For a Successful Job Search for 2024
Albert Qian
 
Social Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie Insights
Social Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie InsightsSocial Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie Insights
Social Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie Insights
Kurio // The Social Media Age(ncy)
 
Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024
Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024
Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024
Search Engine Journal
 
5 Public speaking tips from TED - Visualized summary
5 Public speaking tips from TED - Visualized summary5 Public speaking tips from TED - Visualized summary
5 Public speaking tips from TED - Visualized summary
SpeakerHub
 
ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd
ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd
ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd
Clark Boyd
 
Getting into the tech field. what next
Getting into the tech field. what next Getting into the tech field. what next
Getting into the tech field. what next
Tessa Mero
 
Google's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search Intent
Google's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search IntentGoogle's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search Intent
Google's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search Intent
Lily Ray
 
How to have difficult conversations
How to have difficult conversations How to have difficult conversations
How to have difficult conversations
Rajiv Jayarajah, MAppComm, ACC
 
Introduction to Data Science
Introduction to Data ScienceIntroduction to Data Science
Introduction to Data Science
Christy Abraham Joy
 
Time Management & Productivity - Best Practices
Time Management & Productivity -  Best PracticesTime Management & Productivity -  Best Practices
Time Management & Productivity - Best Practices
Vit Horky
 
The six step guide to practical project management
The six step guide to practical project managementThe six step guide to practical project management
The six step guide to practical project management
MindGenius
 
Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...
Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...
Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...
RachelPearson36
 

Featured (20)

2024 State of Marketing Report – by Hubspot
2024 State of Marketing Report – by Hubspot2024 State of Marketing Report – by Hubspot
2024 State of Marketing Report – by Hubspot
 
Everything You Need To Know About ChatGPT
Everything You Need To Know About ChatGPTEverything You Need To Know About ChatGPT
Everything You Need To Know About ChatGPT
 
Product Design Trends in 2024 | Teenage Engineerings
Product Design Trends in 2024 | Teenage EngineeringsProduct Design Trends in 2024 | Teenage Engineerings
Product Design Trends in 2024 | Teenage Engineerings
 
How Race, Age and Gender Shape Attitudes Towards Mental Health
How Race, Age and Gender Shape Attitudes Towards Mental HealthHow Race, Age and Gender Shape Attitudes Towards Mental Health
How Race, Age and Gender Shape Attitudes Towards Mental Health
 
AI Trends in Creative Operations 2024 by Artwork Flow.pdf
AI Trends in Creative Operations 2024 by Artwork Flow.pdfAI Trends in Creative Operations 2024 by Artwork Flow.pdf
AI Trends in Creative Operations 2024 by Artwork Flow.pdf
 
Skeleton Culture Code
Skeleton Culture CodeSkeleton Culture Code
Skeleton Culture Code
 
PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024
PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024
PEPSICO Presentation to CAGNY Conference Feb 2024
 
Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)
Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)
Content Methodology: A Best Practices Report (Webinar)
 
How to Prepare For a Successful Job Search for 2024
How to Prepare For a Successful Job Search for 2024How to Prepare For a Successful Job Search for 2024
How to Prepare For a Successful Job Search for 2024
 
Social Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie Insights
Social Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie InsightsSocial Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie Insights
Social Media Marketing Trends 2024 // The Global Indie Insights
 
Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024
Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024
Trends In Paid Search: Navigating The Digital Landscape In 2024
 
5 Public speaking tips from TED - Visualized summary
5 Public speaking tips from TED - Visualized summary5 Public speaking tips from TED - Visualized summary
5 Public speaking tips from TED - Visualized summary
 
ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd
ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd
ChatGPT and the Future of Work - Clark Boyd
 
Getting into the tech field. what next
Getting into the tech field. what next Getting into the tech field. what next
Getting into the tech field. what next
 
Google's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search Intent
Google's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search IntentGoogle's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search Intent
Google's Just Not That Into You: Understanding Core Updates & Search Intent
 
How to have difficult conversations
How to have difficult conversations How to have difficult conversations
How to have difficult conversations
 
Introduction to Data Science
Introduction to Data ScienceIntroduction to Data Science
Introduction to Data Science
 
Time Management & Productivity - Best Practices
Time Management & Productivity -  Best PracticesTime Management & Productivity -  Best Practices
Time Management & Productivity - Best Practices
 
The six step guide to practical project management
The six step guide to practical project managementThe six step guide to practical project management
The six step guide to practical project management
 
Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...
Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...
Beginners Guide to TikTok for Search - Rachel Pearson - We are Tilt __ Bright...
 

Com "parlen els gens".Fundació Dr.Robert.2009 Sl

  • 1. GUIÓ Que és el material genètic? Com es transmet la informació del nucli a la resta de la cèl·lula? Jornades Formatives en MALALTIES MINORITÀRIES Com es tradueix i com s’executa la informació? Curs 2009-210 El codi genètic es pot alterar? Què son les mutacions? Com “parlen” els gens? Quina relació hi ha entre mutació , producte gènic alterat i malaltia? Dra.Teresa Pàmpols i Ros L’expressió clínica és molt variable. Per què? Institut de Bioquímica Clínica. Servei de Bioquímica i Genètica molecular. Com es transmeten les malalties genètiques a la descendència? Hospital Clínic de Barcelona i Perquè les malalties hereditàries tenen prevalences tan (tpampols@clinic.ub.es) baixes? Dins el nucli d’una De fet, els gens “parlen” bioquímica cèlula hi ha enmagatzemada la informació per a la Com ho fan ? constitució del ser viu del qual procedeix : el Que és el material genètic? material genètic Guanina Adenina Timina Citosina El material genètic es l’àcid desoxiribonucleic (ADN)=desoxiribosa + fosfat+ bases nucleotídiques 1
  • 2. 3’ L’ADN es una enciclopedia que enmagatzema tota la A A A 3’ C C T G informació mitjançant un senzill alfabet de 4 lletres T T C T T A G G C ATGTTGACCTGATCGAAATGGATCCTCTCTCGACTATAACCAATGATG G enlace de A GAAATGGATCATGTTGACCTGATCGATCCTCTCTCGACTTTGACCTGC 5’ base hidrógeno 5’ ATGATGCCTAGCATGTTGACCTGATCGAAATGGATCCTCTCTCGACTA GGATCCTCTCTCGACTATAACCAATGATGCCTAGCACATGTTGACCTG CGACTATAACCAATGATGCCTAGCATGTTGACCTGATCGAAATGGATC Una molècula d’ADN, està constituïda per dues cadenes amb CTAGCCAATGATGCCTAGCCAATGATGCCTAGCATGATGCCTAGCTTG seqüències de nucleòtids complementaries, generant una doble hèlix TGGATCCTCTCTCGACTATAACCAATGATGCCTAGATGTTGACCTGAT de aproximadament 10 parelles de nucleòtids per volta de la hèlix. GGATCCTCTCTCGACTATAACCAATGATGCCTAGCACATGTTGACCTG CCTGATCGAAATGGATCCTCTCTCGACTATAACCAATGATGCCTAGCA ATGTTGACCTGATCGAAATGGATCCTCTCTCGACTATAACCAATGATG CTAGCCAATGATGCCTAGCCAATGATGCCTAGCATGATGCCTAGCTTG GACTATAACCAATGATGCCTAGCACATGTTCTAGCCAATGATGCACA TGTTCTAGCCCTAGCCAATGATGCCTAGCATGATGCCTAGCTTGTGATG Biología Molecular de la Célula B. Alberts, D. Bray, J. Lewis, M. Raff, K. Roberts, JD. Watson. Ed. Omega (1994) MAGNITUD DEL ADN oòcit espermatozous El DNA del nucli d’una cèl·lula reproductora és un doble filament en espiral de 1 m de longitud que conte 3 x 109 parells de bases cèl.lula de la pell Les 3 x 109 parells de bases (lletres) del genoma haploide El nucli d’una cèl·lula somàtica te dos filaments , el (d’una cèl·lula germinal) escrites una darrera l’altra procedent del pare i el procedent de la mare, es a dir 2 ocuparien 200 volums de 1000 pàgines cadascun metres de DNA L’ADN está “empaquetat”dins el nucli Quan una cèl·lula es divideix , el material genètic s’ha de replicar i repartir en les dues cèl·lules filles ( mitosis). Per a evitar errors l’ADN es reparteix en paquets petits densament empaquetats (cromosomes) Fibras de cromatina Empaquetamiento Grado 6 60% proteína Cromatina 35% DNA 5% RNA 1879-1872 Arnold y Fleming : Primeres observacions de cromosomes en mitosis Principios de Bioquímica. Lehninger 1986 2
  • 3. 46 cromosomes 2 metres DNA µ 5µm 600mg/mL (70% pes) µ 25µm Cromosoma Metafàsic Empaquetament Cèl·lula somàtica 1.000-10.000 vegades Nucli en metafase Principios de Bioquímica. Lehninger 1986 1956 Tjio & Levan : Tenim 46 cromosomas La informació de la enciclopèdia (l’ADN) està El GEN es la unitat física i funcional de la herència organitzada en frases (gens) i les frases en paraules i la majoria conté informació per a elaborar una (codons ) formats per 3 lletres (les 4 bases proteïna nucleotídiques) Molts gens tenen un tamany de unes 100.000 ATGTTGACCTGATCGAAATGGATCCTCTCTCGACTATAACCAATGATG GAAATGGATCATGTTGACCTGATCGATCCTCTCTCGACTTTGACCTGC parells de bases. ATGATGCCTAGCATGTTGACCTGATCGAAATGGATCCTCTCTCGACTA GGA TCC TCT CTC GAC TAT AAC CAA TGA TGC CTA GCA CAT GTT GAC CGA CTA TAA CCA ATG ATG CCT AGC ATG TTG ACC TGA TCG AAA TGG Hi ha gens molt grans : el gen de la Distrofina te CTA GCC AAT GAT GCC TAG CCA ATG ATG CCT AGC ATGA TGC CTA ATC 2.4 Mb CTC TCT CGA CTA TAA CCA ATG ATG CCT AGA TGT TGA CCT GAT GGATCCTCTCTCGACTATAACCAATGATGCCTAGCACATGTTGACCTG CCTGATCGAAATGGATCCTCTCTCGACTATAACCAATGATGCCTAGCA ( 1 Megabase = 1.000.000 de parells de bases) ATGTTGACCTGATCGAAATGGATCCTCTCTCGACTATAACCAATGATG CTAGCCAATGATGCCTAGCCAATGATGCCTAGCATGATGCCTAGCTTG GAC TAT AAC CAA TGA TGC CTA GCA CAT GTT CTA GCC AAT GAT GCA CA El genoma humà te 3.200 Mb TGT TCT AGC CCT AGC CAA TGA TGC CTA GCA TGA TGC CTA GCT TGT Només 1,4 % del genoma es codificant Tenim també un petit genoma mitocondrial: ADN mt 14 d’abril de 2003 Es circular i te 13.6 Kb “Wellcome to the Genomic Age” S’hereta exclusivament per línia materna www.genome.gov 3
  • 4. Nature, 21 Oct. 2004 ¡¡ Sorpresa, Sorpresa !! Només tenim 19.599 gens codificadors de proteïnes ( de fet son uns 25.000) www.ncbi.nih.gov/Genbank www.genome.ucsc.edu www.ensembl.org www.ddbj.nih.ac.jp www.ebi.ac.uk/embl/index.html Wadsworth Center Els gens es distribueixen en cada un dels cromosomes Diem locus a la posició fixa d’un gen en un sempre de la mateixa manera (MAPA) cromosoma ex. el locus del gen OCA 1 es 11q 1.4-q 2.1 Gen A Gen B metafase La distancia entre gens es medeix en Gen C centimorgans Gen D Gen E 1 centimorgan = 1.000.000 de parells de bases Gen F Gen G La llista ordenada de loci es denomina mapa ¡Recordeu! Cèl·lules somàtiques: 46 cromosomes, formats per genètic Desierto génico gens i proteïnes que es localitzen en el núcli, 23 procedents del pare amb els 25.000 gens paterns i 23 procedents de la mare amb els 25.000 gens materns. Al tenyir el nucli en metafase Diem al.lel a la variant de la secuencia d’ADN en veiem els cromosomes individualitzats i “bandejats” un determinat locus La informació continguda en l’ADNdel nucli es transmet al citoplasma de la cel.lula mitjançant l’ARN Com es transmet la informació del nucli a la resta de la cèl·lula? i Procés Transcripció de l’ADN a ARNp(precursor) Com es tradueix i com s’executa la informació? “Splicing” a ARNm (missatger) Traducció a un producte gènic 4
  • 5. L’ARN es un esquelet de ribosa Quan un gen s’ha d’expressar o “encendre” s’obre la doble hèlix de l’ADN a l’ inici del gen i la RNA polimerasa va fosfat i 4 bases nucleotídicas ensamblant les bases nucleotídiques complementaries G C A i U ( en lloc de T) formant un RNA precursor Es diu procés de transcripció Intensificador TRANSCRIPCIÓ Silen ciad or L’expressió dels gens a nivell transcripcional es complexa i Represor regulada per factors controladors In or t en Activador icad sif Inclòs un cop transcrit el RNAp hi ha regulació ( per el ica do nsif r splicing, per a l’exportació del ARNm al citoplasma i per a la Inte Activador seva estabilitat) Activador L'expressió gènica es la base de la diferenciació cel·lular, 250 40 morphogenèsis i adaptabilitat de l’organisme 30 110 60 BETA H Depèn de mecanismes anomenats epigenètics 30 ALFA 150 E 80 Proteína F Polimerasa Metilació del ADN de unión a TATA de ARN Regió A B Xifrada Silenciació de gens Modificacions d’histones Bloque TATA Centre promotor Proteïnes modificadores de la cromatina R.Tjian “Mecanismo molecular del control génico”. Investigación y Ciencia. Abril 1995 Un gen te introns i exons l’ADN del gen es transcriu sencer pero nomes es tradueixen els introns Els mecanismes epigenètics son responsables de la inactivació al atzar d’un dels cromosomes X en les Intró 1 Intró 2 Intró 3 cèl.lules dels fetus de sexe femení en les primeres etapes P exó 1 exó 2 exó 3 del desenvolupament RNAp “splicing” Son malaltíes epigenètiques : Les sídromes de Rett, Angelman , Prader –Willi i Beckwith-Wiedemann RNAm traducció Producte gènic 5
  • 6. CÓDI GENÈTIC Ampliem el concepte traducció: AMINOÁCIDS CODONS A Ala Alanina GCA GCC GCG GCU Un cop fora del nucli la seqüència de l’ARN m C Cys Cisteína UGC UGU es llegida per uns agregats moleculars : D Asp Acid aspártic GAC GAU ribosomes K Lys Lisina AAA AAG Cada triplet o codó te el significat d’un aminoàcid Els aminoàcids es fixen a molècules Y Tyr Tirosina UAC UAU d’ARN petites de RNAt (transferència) i es van ensamblant i formant un polipèptid Hi han 20 aminoàcids i 64 combinacions de triplets possibles , la majoria d'aminoàcids està especificat per mes d’un codò Traducció ¡¡¡¡Un polipèptid de 400 aminoacids es sintetitza en 20 segons!!!!! Els 4 passos de la formació de proteïnes Repàs núcli ADN intró exó TRANSCRIPCIÓ 1. Transcripció y traducció 2. Plegament ARN p “SPLICING” RNAm Producte gènic = TRADUCCIÓ 3. Modificacions post traducció 4. Interacció proteïna-proteïna Polipèptid/Proteïna The Promise of Proteomics. New York Academy of Sciences. January 31, 2001. www.nyas.org 6
  • 7. ¡Hi ha moltes mes proteïnes que gens ! (25.000 gens / 200.000 proteïnes) Un gen pot donar lloc a diversos El codi genètic es pot alterar? “transcrits” o PRODUCTES GÈNICS (polipéptids/proteínes) Què son les mutacions? “Splicing” alternatiu Quan una cèl·lula entra en divisió s’ha de replicar tot l’ADN 50 enzims reparadors Errors de Polimerització :1 en 10 -4 40 enzims correctors Errors de replicació : 1 en 10 -10 La forquilla de replicació avança a la velocitat de 50 nucleotids / segon Al duplicar el genoma s’ensamblen 1,2 x 10 10 El doble filament de l’ DNA se ha de desenrotllar y l’helix paterna gira nucleotids a 50 revolucions/segon (3000 rpm) “ La celula Viva” .C.de Duve.Biblioteca Scientific American . Labor 1998 Amb una freqüència al voltant de 10-6 es produeixen Les mutacions en una cèl·lula somàtica poden errors en la replicació de l’ADN ser rellevants per al càncer o envelliment i només concerneixen a l’individu , però no a la Mutació = canvi estable i hereditari en la seqüència seva descendència* primària de nucleòtids de l’ADN que afecta la salut Les mutacions han d’estar en les cèl·lules germinals per a tenir impacte en la Excepcionalment poden ser inestables i el descendència d’un individu descobriment de la expansió de triplets ens ha permès explicar malalties com el Huntington, la Les mutacions poden ser també produïdes per distròfia miotònica y la síndrome X-fràgil , factors mediambientals ( productes tòxics, radiacions ionitzants) * son excepció els càncers familiars 7
  • 8. El terme mutacions s’empra només per als canvis en l’ADN que afecten la salut Altres canvis es diuen polimorfismes Els essers humans tenim un genoma 99,9% contribueixen a la diversitat humana, permeten idèntic canvis adaptatius i son la base de la evolució El 0,1% del genoma que ens fa diferents pot Si mateix , polimorfismes en el gen o en altres contenir les causes de que les persones locus poden modificar el genotip enmalalteixin per agents infecciosos, exposicions ambientals i comportaments o Hi ha polimorfismes (SNPs) que combinats estils de vida amb factors mediambientals confereixen susceptibilitat a malalties comunes Magnitud de les mutacions Tipus de mutacions puntuals . Hem dit que els gens son Mutacions molt grans (millions de parells de bases) frases amb significat formats per paraules de tres lletres S’altera la morfología i/o número dels cromosomes Son visibles al microscopio observant el nucli en metafase ATGCCTACTT ATG CCA TTG ATTCCCAA ( Citogenètica) Mutaciones de < 2.000-3.000Kb aa1 aa2 aa3 POLIPEPTID Visibles emprant sondas moleculars (FISH etc.) Mutaciones puntuals (delecions, insercions o canvis d’una única base) “Visibles” amb els ull de la bioquímica emprant els recursos recursos de la Genètica bioquímica i la Genètica XBNMLANFK SAL DEL MAR ALKSFJLKJ molecular Tipus de mutacions puntuals Que passa quan trobem un canvi en l’ADN d’un pacient . Es una mutació o és un polimorfisme? Vull més SAL DEL MAR seqüència normal • Sabem que les mutaciones que truncan la proteïna , petitess insercione/delecions, mutacions que creen un codón “stop” o Vull més SOL DEL MAR substitució; error de sentit mutacions de “splicing” “missense” Vull més SI L DEL MAR substitució; pèrdua de sentit “nonsense”o absurda* Son causa de la malaltia Vull més SALD ELM AR deleció; pèrdua de sentit “frame shift” o amb desplaçamento de motlle* Vull més SAX LDE LM inserció; pérdua de sentit • Les mutaciones que només cambien un AA son causa de la malaltia o un polimorfisme? Canvi en la proteïna 8
  • 9. 1er es mira si la mutación està descrita a la bibliografía, si no ho està: • Comparem la nostra proteïna amb la d’altres espècies (si es conserva el residu o no) • Mirem la importància del canvi de AA per a la funció de la proteïna Quina relació hi ha entre mutació , producte gènic • Ens assegurem que no hem trobat un altre canvi alterat i malaltia? en el gen • Estudis de expressió • Verifiquem si el canvi es troba en 50 individus de població general ( 100 al.els) Un exemple, la Fenilcetonuria Transcripció a ARN Traducción La de tirosina producció a producte gènic (polipéptid/proteína) pigments i síntesi de neurotransmisors ADN Producte gènic de fenilalanina en plasma Víes/Productes Metabólics Desequilibri amb D’acids fenilpiruvic i altres aminoàcids fenil làctic Efecte tòxic sobre el sistema nerviós . Síntesi de mielina deficient Olor corporal La mutació es tradueix en un canvi en el patró del seu producte gènic específic Fenotipo La pèrdua de funció altera la homeostàsi fisiològica induint les manifestacions (Fenoma) Fenoma) clíniques i la malaltia Expressió fenotípica per sistemes anatòmic/funcionals L’afectació del sistema nerviós és molt frequent perquè Muscular/Esquelè gairebe un 80 % dels nostres gens estàn relacionats directa o indirectament amb el seu funcionament Sistema Nerviós 40,0 Ocular 30,0 Craneofacial Genitourinari Metabòlic Pell Ungles, Immune Extremitats Circulatori MBID 8 20,0 Sang Endocrí Cabell Dents Respiratori 10,0 0,0 Basat en: MBID 8: Cap.1 pàg. 3-125 (L.Beaudet, Ch.Scriver, N.Sly, D.Valle) 9
  • 10. Un 80% debuta a l’edat pediàtrica 5% In utero Edad adulta tardía >50 años Es coneixen les Pubertad - 50 anys bases metabòliques >50% i moleculars de Neonatal - 1 año unes 700 malalties hereditàries 30% 1 año - pubertad Jiménez-Sánchez et al. capítol 4 del MMBID 8 El coneixement de les bases metabòliques , de la fisiopatología i dels L’expressió clínica és molt variable mecanismes moleculars, incloent el gen , i els processos de transcripció i Per què? traducció son fonamentals per a dissenyar teràpies El fenòmen de la heterogeneitat genètica Las variacions en un gen no afecten sempre de la HETEROGENEITAT NO AL.LÈLICA O DE LOCUS mateixa manera a la proteïna Mutacions a diferents locus genètics poden donar lloc a la mateixa malaltía Les MH presenten una gran heterogeneïtat genètica e.x. gangliosidosis GM2 • Els pacients amb una mateixa malaltia no son un grupo homogèni HETEROGENEITAT AL.LÈLICA • Fins i tot amb la mateixa mutació poden ser En un mateix locus es poden donar moltes mutacions diferents diferents e.x. Duchenne i Becker Hurler i Scheie 10
  • 11. β-hexosaminidasa Exemple de heterogeneitat de locus: Les gangliosidosis GM2 A LA HETEROGENEITAT AL·LÈLICA es molt més freqüent , gairebé general. Hexosaminidasa A β En moltes malalties les mutacions arriben a ser α “privades” o “propietàries” de cada família. β Sovint els pacients que diem homozigots són en realitat “compostos genètics”. Amb la qual cosa l'individu α Gangliosid estarà produint dos tipus de proteïnes diferents. activador-GM2 GM2 A tot això cal afegir les següents consideracions que contribueixen a la variabilitat de presentació clínica en els pacients amb una mateixa malaltia: Model de la degradació del gangliosid GM2 per la ß-Hex A estimulada per l’activador. MMBID 8 pàg 3374 (modificada de W. Fürt i K. Sandhoff. BBA 1126:1, 1992 El fenotip clàssic sever es dona p. ex. quan : Mutació Mutació suau severa No es produeix un producte gènic funcional Efecte de mutacions “missense” Neutre Sever Quan la mutació altera severament la funció de la proteïna Efecte de factors cel.lulars: Control de qualitat/temperature PERÒ Funció residual de la proteïna Alta Baixa Efecte d’altres factors Sovint hi ha un continuum de expressió mes suau provenint de mutacions que permeten una funció residual de la proteïna Probabilitat de malaltía clínica Asimptomàtic Malaltia clínica DINTELL PER A LA MALALTÍA CLÍNICA J. Inherit. Metab. Dis (2001) 24:189-212 Transcripció a ARN Traducción a polipéptid/proteína La funció residual de la proteïna pot ser ADN Factors epigenétics influenciada per : Factors ambientals que estressen las vies metabòliques Aconteixements post-traducció i factors cel·lulars Producte gènic Procesament Gens situats en altres locus Post-traducción e Efectes Ambientals intervenció + gens altres locus de factors cel.lulars Víes/Productes Metabólics El genotip no sempre prediu el fenotip i una malaltia monogènica es pot comportar com un trastorn complexe 11
  • 12. Concepte de penetrança G6PD deficiency Hemochromatosis Freqüència amb la que la característica que controla un gen (fenotip) es fa visible en els Paper creixent de factors ambientals i estocàstics Acute intermittent porphyria Type I diabetes mellitus individus que el tenen alterat α1-Antitrypsin ZZ Apo E-2/E-2 hyperlipoproteinemia ex. malaltía de Tay-Sachs Tuberous sclerosis Marfan Els gens amb penetrança baixa requereixen la Retinoblastoma Hartnup Phenylketonuria Familial hypercholesterolemia interacció amb factors ambientals Ej. genotip lent NAT2 aumenta el risc de cáncer de Sickle-cel anemia Cystic fibrosis bufeta en individus exposats a arilaminas , però es Huntington disease Duchenne distrophy inefectiu si no hi ha exposició 0 Tay Sachs 0 Paper creixent dels genotips d’altres loci Quan un gen juga un paper predominant en la determinació d’una malaltia , aquesta s’hereta de forma monogènica o mendeliana (segueix les lleis de Mendel) 20% AD Com es transmeten les malalties genètiques a la descendència? 8% Herència 60% AR 12% XL Herencia materna mtDNA Herencia Autosòmica Recesiva A a A a A a A a A A A a a A a a 1/4 25% No portadors 1/2 50%Portadors 25%Malalts 1/4 (Homocigots) (Heterocigots) 12
  • 13. HERENCIA AUTOSÒMICA DOMINANT Si en la família del esquema anterior la malaltia fos autosòmica dominant , estarien clínicament afectats un 75% dels fills Però és mes comú que només un dels dos progenitors sigui heterozigot i aleshores estaran afectats un 50% dels fills Es diu que un caràcter s’hereta en forma dominant quan els heterozigots presenten clínica Depèn en gran part, de la tolerància del sistema biològic a la pertorbació de la proteïna Herència gonosómica Lligada al X AX X a AX Y a A X a X Axxx X a Y X AY aX X A a X Y a A X XA X Y Nena no portadora Nen no portador Nena portadora Nen malalt (heterozigota) (hemizigot) Estaràn afectats 50% dels nens i serán portadoras 50% de les nenes En una malaltía lligada al X , la mutació també pot aparèixer per primer cop en el cromosoma X d’un home Totes les nenes de la parella portaran un X de la mare i el X del pare amb la mutació , per tant seran totes heterozigotes i no serà fins la segona generació que apareixeran nens afectats Exemples d’arbres familiars amb els tres tipus d’herència mendeliana descrits 13
  • 14. HI HA 3 CATEGORÍES DE MALALTIES GENÈTIQUES Com es transmeten a la descendència HERENCIA HERÈNCIA NO • TRASTORNS CROMOSÓMICS : Constitucionals i adquirides MENDELIANA MENDELIANA Trastorns monogènics • TRASTORNS MENDELIANS O MONOGÈNICS Autosòmica Recesiva Anomalies Cromosomiques Gonosòmica Lligada al X • TRASTORNS POLIGÈNICS O MULTIFACTORIALS Trastorns Multifactoriales Causats per la interacció de múltiples gens i factores ambientals, entre els Autosòmica Dominante quals hi han algunes de las malalties corrents de la edat adulta com la Alteracions del Genoma diabetis i les malalties coronaries Gonosómica Dominant mitocondrial lligada al X El zigot te un sol genoma nuclear heretat del pare i de la mare , però te diversos genomas mitocondrials (poliplasmia) que hereta només de la mare i no tots tenen la mutació (heteroplasmia) Moltes malalties mitocondrials son de transmissió mendeliana perquè els gens que controlen la S majoría de les proteïnes mitocondrials son nuclears Hi ha un grup més petit de proteïnes , controlades O Poliplasmia y pel genoma mitocondrial i aleshores les mutacions heteroplasmia es transmeten amb el que s’anomena “herència Z (Zigot) materna”, perquè el zigot conté només les mitocondries del òvul matern ja que les del Els teixits reben espermatozou es perden Segregació mitocondries normal i mutades replicativa de manera aleatòria A B C Un noi afectat per una malaltia lligada al genoma mitocondrial , no pot transmetre mai la malaltia a la descendència , en canvi si la que està afectada es una noia , tots els fills ho estaran Perquè les malalties hereditàries tenen prevalences tan baixes? 14
  • 15. Les malalties genètiques pertanyen majoritàriament a la categoria de malalties rares o de baixa prevalença, La freqüència de una malaltia genètica en la població depèn de: un 80% fins i tot estan per sota de 1 en 100.000 La tassa de mutacions El patró d'herència Desavantatges que confereix la mutació Successos distorsionadors ( naturals o socials) www.orpha.net Però en el cas d’una malaltia recessiva , el gen mutat està present en els heterozigots sans i amb la mateixa tasa de mutació de 10-6 i Quan una mutació altera la funció del gen i porta a la mateixa frequencia de l’homozigot de 1 en 1 milió , la una desavantatge , la mutació tendeix a desaparèixer freqüència del heterozigot al equilibri es 1 en 1000 de la població , però contínuament apareixen noves Quan la frequencia d’una malaltía es multiplica per 10 o per 100 mutacions en cada generació i s'arriba a un equilibri en algunes poblacions , pot ser per: entre mutació que dona lloc a un gen deletèri i selecció natural que l’elimina de la població. Efecte fundador Com a promitg , la tassa de mutació per generació i Aventatges pel fet d’esser heterozigot : gen es molt baixa ap. 10-6 i per un trastorn dominat Anèmia falciforme protecció en front la malaria letal, la freqüència del gen al equilibri es de 1 en 1 Fibrosis quística protecció en front el tifus i malalties milió diarreicas Fenilcetonuria incidencia de pèrdues fetals Val la pena remarcar que cadascun de nosaltres portem de 6 a 8 anomalies genètiques recessives i si alguna coincideix amb les de la parella podem tenir fills afectats Tenim uns 25.000 gens i per això es molt difícil coincidir 15