Dokumen tersebut membahas mengenai berbagai bioindikator dan indeks untuk menilai kualitas perairan, seperti Nilai Nutrisi Coeffecient (NVC), komunitas makroinvertebrata, Indeks Pencemaran Biologik (IPB), Indeks Saprobik, Indeks Coliform, serta alat pengambilan sample seperti Surber Net dan Plankton net. Bioindikator digunakan untuk mengetahui kondisi lingkungan berdasarkan keberadaan atau perilaku organ