SlideShare a Scribd company logo
1 of 22
Download to read offline
Сергей Мастицкий
БГУ, Минск, май 2014
Ewan Birney, глава отдела «Nucleotide Data» в European
Bioinformatics Institute, EMBL
Из сообщения в его блоге “Five statistical things I wished I had been
taught 20 years ago”
 Методы непараметрической статистики
 R
 Проблема множественных сравнений
 Связь между Р-значением, размером
эффекта и объемом выборки
 Линейные модели и PCA
Author: Sergey Mastitsky
 Абсолютно бесплатно – особенно важно для
академических учреждений
 Язык, специально созданный для стат. анализа
 Огромные возможности для визуализации
данных
 Более 5000 пакетов-расширений
 Развивается быстрее любого коммерческого ПО
 Сотни книг, “The R Journal”, “Journal of Statistical
Software”
 Огромное число пользователей (>2 млн., 2012 г.)
= поддержка, быстрое исправление ошибок
Author: Sergey Mastitsky
 Работа из командной строки – не то, что
ожидают пользователи, привыкшие
«нажимать на кнопки»
 R – это язык (требует времени для изучения)
 Справочная информация зачастую написана
сухим техническим [английским] языком –
новички часто теряются и расстраиваются
Author: Sergey Mastitsky
 Книги – в основном издаются Springer,
Cambridge University Press и
Chapman & Hall
 Блоги – чрезвычайно ценный источник:
 r-bloggers.com
 r-analytics.blogspot.com
 Специальные курсы, в т.ч. онлайн:
 coursera.com (бесплатно/платно)
 statistics.com (платно)
Author: Sergey Mastitsky
 Основные принципы работы с R и RStudio
 Описательная статистика, основы R-графики,
классические статистические методы (t-тест,
ANOVA, корреляционный анализ)
 Простая и множественная регрессия
 В конце: вы получите все материалы курса,
включая примеры кода, пригодные для
повторного использования
Author: Sergey Mastitsky
 Я объясняю новые понятия и привожу
примеры – вы повторяете
 Я даю небольшие задания – вы
выполняете
Author: Sergey Mastitsky
Тема 1
Инсталляция R и RStudio
Author: Sergey Mastitsky
Author: Sergey Mastitsky
Author: Sergey Mastitsky
… потом следуйте инструкциям
Author: Sergey Mastitsky
Что выбрать:
- Если у вас есть права
Администратора: C:Program Files
- Если нет: любая директория,
которая вам нравится.
Author: Sergey Mastitsky
• Если система R установлена в C:Program Files,
пропустите этот шаг
• Иначе:
- Заходим в папку, где находится R, например:
C:UsersMastitSER-2.15.0
- Идем в C:UsersMastitSER-2.15.0etc и
открываем файл Rprofile.site в текстовом
редакторе (лучше всего Notepad)
Author: Sergey Mastitsky
Измените путь к папке (ее нужно сначала создать!), куда
вы хотели бы устанавливать все дополнительные пакеты,
например:
# set a site library
.Library.site <- "c:UsersMastitSEMyRlibs"
Командная строка:
здесь мы общаемся с R
Author: Sergey Mastitsky
• Интегрированная
среда разработки
(IDE) для R
• Сочетает
интуитивный
интерфейс с
мощными
средствами для
разработки кода R
Author: Sergey Mastitsky
Author: Sergey Mastitsky
Author: Sergey Mastitsky
Author: Sergey Mastitsky
Поступаем так же, как и
при установке R …
Консоль R: здесь мы
общаемся с R, вводя
команды
Редактор кода
Служебное окно 1
Author: Sergey Mastitsky
Служебное окно 2
 Зайдите на сайт R Project и ознакомьтесь с его
основными разделами
 Из раздела “Documentation/Manuals” загрузите
PDF-файлы “An Introduction to R” и “R Data
Import/Export” – настоятельно рекомендую к
изучению!
 Обратите внимание на раздел “Documentation”
Author: Sergey Mastitsky
 Зайдите на сайт r-analytics.blogspot.com
 Зайдите на страницу “Работа с RStudio” –
здесь вы можете подробнее узнать о работе с
этим инструментом и найти PDF-файл
руководства на русском языке
 Обратите внимание на разделы “Инсталляция
R” и “Библиотека”
Author: Sergey Mastitsky

More Related Content

Similar to Инсталляция системы статистических вычислений R

Start
StartStart
StartIKTO
 
Web20 from zero
Web20 from zeroWeb20 from zero
Web20 from zeroqweasdrty
 
Практическое создание крупного масштабируемого web 2.0 c нуля (Дмитрий Бородин)
Практическое создание крупного масштабируемого web 2.0 c нуля (Дмитрий Бородин)Практическое создание крупного масштабируемого web 2.0 c нуля (Дмитрий Бородин)
Практическое создание крупного масштабируемого web 2.0 c нуля (Дмитрий Бородин)Ontico
 
сайты по информ
сайты по информсайты по информ
сайты по информbukish
 
DBD lection 1. Intro in Database Design. In Russian.
DBD lection 1. Intro in Database Design. In Russian.DBD lection 1. Intro in Database Design. In Russian.
DBD lection 1. Intro in Database Design. In Russian.mikhaelsmirnov
 
рп по у сп практике в
рп по у сп практике врп по у сп практике в
рп по у сп практике вAnastasia Snegina
 
Writing a computer vision paper
Writing a computer vision paperWriting a computer vision paper
Writing a computer vision paperAnton Konushin
 
Мастер-класс по работе с текстами WUD2010
Мастер-класс по работе с текстами WUD2010Мастер-класс по работе с текстами WUD2010
Мастер-класс по работе с текстами WUD2010Evgeniya Zhadyaeva
 
Выступление: инструменты и методы эффективной удалённой работы
Выступление: инструменты и методы эффективной удалённой работыВыступление: инструменты и методы эффективной удалённой работы
Выступление: инструменты и методы эффективной удалённой работыryba4
 
Proverochnaya rabota 22_ksk_2015
Proverochnaya rabota 22_ksk_2015Proverochnaya rabota 22_ksk_2015
Proverochnaya rabota 22_ksk_2015Anton Nedelin
 
Программное обеспечение современного компьютера
Программное обеспечение современного компьютераПрограммное обеспечение современного компьютера
Программное обеспечение современного компьютераZiminDan
 
Lab Management magic, elves, and mushrooms
Lab Management magic, elves, and mushroomsLab Management magic, elves, and mushrooms
Lab Management magic, elves, and mushroomsAlena Begler
 
рп по у сп практике вт
рп по у сп практике втрп по у сп практике вт
рп по у сп практике втAnastasia Snegina
 
рп по у сп практике вт
рп по у сп практике втрп по у сп практике вт
рп по у сп практике втAnastasia Snegina
 

Similar to Инсталляция системы статистических вычислений R (20)

Start
StartStart
Start
 
Start
StartStart
Start
 
Web20 from zero
Web20 from zeroWeb20 from zero
Web20 from zero
 
Практическое создание крупного масштабируемого web 2.0 c нуля (Дмитрий Бородин)
Практическое создание крупного масштабируемого web 2.0 c нуля (Дмитрий Бородин)Практическое создание крупного масштабируемого web 2.0 c нуля (Дмитрий Бородин)
Практическое создание крупного масштабируемого web 2.0 c нуля (Дмитрий Бородин)
 
Stat 7 alpha
Stat 7 alphaStat 7 alpha
Stat 7 alpha
 
сайты по информ
сайты по информсайты по информ
сайты по информ
 
Ustanovka_na_proekt
Ustanovka_na_proektUstanovka_na_proekt
Ustanovka_na_proekt
 
DBD lection 1. Intro in Database Design. In Russian.
DBD lection 1. Intro in Database Design. In Russian.DBD lection 1. Intro in Database Design. In Russian.
DBD lection 1. Intro in Database Design. In Russian.
 
?аывафы
?аывафы?аывафы
?аывафы
 
рп по у сп практике в
рп по у сп практике врп по у сп практике в
рп по у сп практике в
 
Writing a computer vision paper
Writing a computer vision paperWriting a computer vision paper
Writing a computer vision paper
 
Мастер-класс по работе с текстами WUD2010
Мастер-класс по работе с текстами WUD2010Мастер-класс по работе с текстами WUD2010
Мастер-класс по работе с текстами WUD2010
 
Выступление: инструменты и методы эффективной удалённой работы
Выступление: инструменты и методы эффективной удалённой работыВыступление: инструменты и методы эффективной удалённой работы
Выступление: инструменты и методы эффективной удалённой работы
 
Proverochnaya rabota 22_ksk_2015
Proverochnaya rabota 22_ksk_2015Proverochnaya rabota 22_ksk_2015
Proverochnaya rabota 22_ksk_2015
 
Список литературы в MS Word
Список литературы в MS WordСписок литературы в MS Word
Список литературы в MS Word
 
Программное обеспечение современного компьютера
Программное обеспечение современного компьютераПрограммное обеспечение современного компьютера
Программное обеспечение современного компьютера
 
Lab Management magic, elves, and mushrooms
Lab Management magic, elves, and mushroomsLab Management magic, elves, and mushrooms
Lab Management magic, elves, and mushrooms
 
рп по у сп практике вт
рп по у сп практике втрп по у сп практике вт
рп по у сп практике вт
 
рп по у сп практике вт
рп по у сп практике втрп по у сп практике вт
рп по у сп практике вт
 
Декомпозиция
ДекомпозицияДекомпозиция
Декомпозиция
 

More from Sergey Mastitsky

Karataev_et_al._2003_Conchophthirus_emergenece.PDF
Karataev_et_al._2003_Conchophthirus_emergenece.PDFKarataev_et_al._2003_Conchophthirus_emergenece.PDF
Karataev_et_al._2003_Conchophthirus_emergenece.PDFSergey Mastitsky
 
AI_2007_2_1_Mastitsky_Makarevich
AI_2007_2_1_Mastitsky_MakarevichAI_2007_2_1_Mastitsky_Makarevich
AI_2007_2_1_Mastitsky_MakarevichSergey Mastitsky
 
Karatayev et al 2008 Aquatic invasions in Belarus
Karatayev et al 2008 Aquatic invasions in BelarusKaratayev et al 2008 Aquatic invasions in Belarus
Karatayev et al 2008 Aquatic invasions in BelarusSergey Mastitsky
 
Дисперсионный анализ (ANOVA) в системе R
Дисперсионный анализ (ANOVA) в системе RДисперсионный анализ (ANOVA) в системе R
Дисперсионный анализ (ANOVA) в системе RSergey Mastitsky
 
Простая линейная регрессия в системе R
Простая линейная регрессия в системе RПростая линейная регрессия в системе R
Простая линейная регрессия в системе RSergey Mastitsky
 
Корреляционный анализ в системе R
Корреляционный анализ в системе RКорреляционный анализ в системе R
Корреляционный анализ в системе RSergey Mastitsky
 
Реализация классических статистических тестов в системе R
Реализация классических статистических тестов в системе RРеализация классических статистических тестов в системе R
Реализация классических статистических тестов в системе RSergey Mastitsky
 
Разведочный анализ данных: создание графиков в системе R
Разведочный анализ данных: создание графиков в системе RРазведочный анализ данных: создание графиков в системе R
Разведочный анализ данных: создание графиков в системе RSergey Mastitsky
 
Загрузка данных в системе R
Загрузка данных в системе RЗагрузка данных в системе R
Загрузка данных в системе RSergey Mastitsky
 
Ковариационный анализ (ANСOVA) в системе R
Ковариационный анализ (ANСOVA) в системе RКовариационный анализ (ANСOVA) в системе R
Ковариационный анализ (ANСOVA) в системе RSergey Mastitsky
 

More from Sergey Mastitsky (12)

Karataev_et_al._2003_Conchophthirus_emergenece.PDF
Karataev_et_al._2003_Conchophthirus_emergenece.PDFKarataev_et_al._2003_Conchophthirus_emergenece.PDF
Karataev_et_al._2003_Conchophthirus_emergenece.PDF
 
AI_2007_2_1_Mastitsky_Makarevich
AI_2007_2_1_Mastitsky_MakarevichAI_2007_2_1_Mastitsky_Makarevich
AI_2007_2_1_Mastitsky_Makarevich
 
mastitsky_article
mastitsky_articlemastitsky_article
mastitsky_article
 
Karatayev et al 2008 Aquatic invasions in Belarus
Karatayev et al 2008 Aquatic invasions in BelarusKaratayev et al 2008 Aquatic invasions in Belarus
Karatayev et al 2008 Aquatic invasions in Belarus
 
AI_2012_1_Claudi_etal
AI_2012_1_Claudi_etalAI_2012_1_Claudi_etal
AI_2012_1_Claudi_etal
 
Дисперсионный анализ (ANOVA) в системе R
Дисперсионный анализ (ANOVA) в системе RДисперсионный анализ (ANOVA) в системе R
Дисперсионный анализ (ANOVA) в системе R
 
Простая линейная регрессия в системе R
Простая линейная регрессия в системе RПростая линейная регрессия в системе R
Простая линейная регрессия в системе R
 
Корреляционный анализ в системе R
Корреляционный анализ в системе RКорреляционный анализ в системе R
Корреляционный анализ в системе R
 
Реализация классических статистических тестов в системе R
Реализация классических статистических тестов в системе RРеализация классических статистических тестов в системе R
Реализация классических статистических тестов в системе R
 
Разведочный анализ данных: создание графиков в системе R
Разведочный анализ данных: создание графиков в системе RРазведочный анализ данных: создание графиков в системе R
Разведочный анализ данных: создание графиков в системе R
 
Загрузка данных в системе R
Загрузка данных в системе RЗагрузка данных в системе R
Загрузка данных в системе R
 
Ковариационный анализ (ANСOVA) в системе R
Ковариационный анализ (ANСOVA) в системе RКовариационный анализ (ANСOVA) в системе R
Ковариационный анализ (ANСOVA) в системе R
 

Инсталляция системы статистических вычислений R

  • 2. Ewan Birney, глава отдела «Nucleotide Data» в European Bioinformatics Institute, EMBL Из сообщения в его блоге “Five statistical things I wished I had been taught 20 years ago”  Методы непараметрической статистики  R  Проблема множественных сравнений  Связь между Р-значением, размером эффекта и объемом выборки  Линейные модели и PCA Author: Sergey Mastitsky
  • 3.  Абсолютно бесплатно – особенно важно для академических учреждений  Язык, специально созданный для стат. анализа  Огромные возможности для визуализации данных  Более 5000 пакетов-расширений  Развивается быстрее любого коммерческого ПО  Сотни книг, “The R Journal”, “Journal of Statistical Software”  Огромное число пользователей (>2 млн., 2012 г.) = поддержка, быстрое исправление ошибок Author: Sergey Mastitsky
  • 4.  Работа из командной строки – не то, что ожидают пользователи, привыкшие «нажимать на кнопки»  R – это язык (требует времени для изучения)  Справочная информация зачастую написана сухим техническим [английским] языком – новички часто теряются и расстраиваются Author: Sergey Mastitsky
  • 5.  Книги – в основном издаются Springer, Cambridge University Press и Chapman & Hall  Блоги – чрезвычайно ценный источник:  r-bloggers.com  r-analytics.blogspot.com  Специальные курсы, в т.ч. онлайн:  coursera.com (бесплатно/платно)  statistics.com (платно) Author: Sergey Mastitsky
  • 6.  Основные принципы работы с R и RStudio  Описательная статистика, основы R-графики, классические статистические методы (t-тест, ANOVA, корреляционный анализ)  Простая и множественная регрессия  В конце: вы получите все материалы курса, включая примеры кода, пригодные для повторного использования Author: Sergey Mastitsky
  • 7.  Я объясняю новые понятия и привожу примеры – вы повторяете  Я даю небольшие задания – вы выполняете Author: Sergey Mastitsky
  • 12. … потом следуйте инструкциям Author: Sergey Mastitsky Что выбрать: - Если у вас есть права Администратора: C:Program Files - Если нет: любая директория, которая вам нравится.
  • 13. Author: Sergey Mastitsky • Если система R установлена в C:Program Files, пропустите этот шаг • Иначе: - Заходим в папку, где находится R, например: C:UsersMastitSER-2.15.0 - Идем в C:UsersMastitSER-2.15.0etc и открываем файл Rprofile.site в текстовом редакторе (лучше всего Notepad)
  • 14. Author: Sergey Mastitsky Измените путь к папке (ее нужно сначала создать!), куда вы хотели бы устанавливать все дополнительные пакеты, например: # set a site library .Library.site <- "c:UsersMastitSEMyRlibs"
  • 15. Командная строка: здесь мы общаемся с R Author: Sergey Mastitsky
  • 16. • Интегрированная среда разработки (IDE) для R • Сочетает интуитивный интерфейс с мощными средствами для разработки кода R Author: Sergey Mastitsky
  • 19. Author: Sergey Mastitsky Поступаем так же, как и при установке R …
  • 20. Консоль R: здесь мы общаемся с R, вводя команды Редактор кода Служебное окно 1 Author: Sergey Mastitsky Служебное окно 2
  • 21.  Зайдите на сайт R Project и ознакомьтесь с его основными разделами  Из раздела “Documentation/Manuals” загрузите PDF-файлы “An Introduction to R” и “R Data Import/Export” – настоятельно рекомендую к изучению!  Обратите внимание на раздел “Documentation” Author: Sergey Mastitsky
  • 22.  Зайдите на сайт r-analytics.blogspot.com  Зайдите на страницу “Работа с RStudio” – здесь вы можете подробнее узнать о работе с этим инструментом и найти PDF-файл руководства на русском языке  Обратите внимание на разделы “Инсталляция R” и “Библиотека” Author: Sergey Mastitsky