DNAバーコード[Scratchプログラミング体験]の案内 Scratchプログラミングは下記URLから実行できます。 https://scratch.mit.edu/projects/154426647/

1. ①緑色の旗マークをクリック
DNAバーコード [Scratchプログラミング体験]
大量遺伝情報研究室 神沼英里 林史
①DNAは生物の設計図 ②DNAバーコードとは？
商品バーコードのようにDNAで生物種を見分ける仕組み。
DNAバーコード図は、A =緑,C =青,G =黒, T =赤で色をつけます。
塩基の並びに合わせて、色のついた「たて線」をならべます。
国立遺伝学研究所 一般公開 2017.4.8 (9～11時, 13～15時の10分単位整理券をブースで配布)
③カンキツ属のDNAバーコード
⑤DNAバーコード Scratchプログラム
生物種 登録番号 DNAバーコード(BOLD v3)
Citrus unshiu
温州ミカン
AB456088 ATCGTTGSCCCACCCCACCCCCCCAAACCAAGGSGGGGGCCCCGGGGTGCGGGCGGAGATTGG
CCTCCCGTGCGCTGACYGCTCGCGGTTGGCCCAAATMTGAGTCCTCGGCGACCGAAGCCGCGGC
GATCGGTGGTGAAACNAAAGCCTCTCGAGCTCCCGCCGCGYGCCCGGTCTCCRAGTGKGGACTC
TGYGRCCCTGAAGCTCCGCGCAAGCGGCGCTCGCA
Citrus sinensis
スイート
オレンジ
AB456079 ATCGTTGSCCCACCCCACCCCCCCAAACCAAGGCGGGGGCCCYGGGGTGCGGGCGGAGATTGG
CCTCCCGTGCGCTGACYGCTCGCGGTTGGCCCAAATMTGAGTCCTCGGCGACCGAAGCCGCGGC
GATCGGTGGTGAAACNAAAGCCTCTCGWGCTCCCGCCGCGCGCCCGGTCTCCRAGTGKGGACTC
TGMGRCCCTGAAGCTCCGCGCAAGCGGCGCTCGCA
Citrus limon
レモン
AB456060 ATCGTTGCCCCACCCCACCCCCCCAAACCAAGGCGGGGGCCCCGGGGTGCGGGCGGAGATTGG
CCTCCCGTGCGCTGACCGCTCGCGGTTGGCCCAAATMTGAGTCCTCGGCGACCGAAGCCGCGGC
GATCGGTGGTGAAACNAAAGCCTCTCGAGCTCCCGCCGCGCGCCCGGTCTCCRAGTGKGGACTC
TGCGRCCCTGAAGCTCCGYKCMARCGGCGCTCGCA
Citrus junos
ユズ
AB456085 ATCGTTGCCCCACCCCACCCCCCCAAACCAAGGCGGGGGCCCCGGGGTGCGGGCGGAGATTGG
CCTCCCGTGCGCTGACCGCTCGCGGTTGGCCCAAATCKGAGTCCTCGGCGACCGAAGCCGCGGC
GATCGGTGGYGAAACAAAAGCCTCTCGAGCTCCCGCCGCGCGCCCGGTCTCCGAGTGGGGACTC
TGYGRCCCTGAWGCTCCGCGCAAGCGGCGCTCGCA
④Scratchとは？
MIT（アメリカの大学）で作られた子供向けプログラミング言語。
ジグソーパズルのように、部品をつなげてプログラムを作る。
②入力にDNA配列をコピー＆ペーストで
はりつけて、右側ボタンを押してみましょう。
DNA配列（サンプル）を入れてください
ATCGTTGSCCCACCCCACCCCCCCAAACCAAGGCG
GGGGCCCYGGGGTGCGGGCGGAGATTGGCCTCCC
GTGCGCTGACYGCTCGCGGTTGGCCCAAATMTGAG
TCCTCGGCGACCGAAGCCGCGGCGATCGGTGGTG
AAACNAAAGCCTCTCGWGCTCCCGCCGCGCGCCC
GGTCTCCRAGTGKGGACTCTGMGRCCCTGAAGCTC
CGCGCAAGCGGCGCTCGCA
③DNAバーコードが出て来たかな？
https://scratch.mit.edu/
＜体験2＞ BarStep(バーきざみ幅）を変えよう
バーのきざみ幅（BarStep）の値を
「5」に変えてみよう。どうなったかな？
＜体験3＞ 文字を変えてみよう
細胞
染色体
2重らせんDNA
塩基はAとT,
CとGの組み合わせ
http://www.nikkei.com/article/DGXLASDG13HBS_T10C17A1000000/
＜体験1＞ 動かしてみよう！
共同通信配信
Hmmの文字を、好きな文字に
変えてみよう。どうなったかな？
Pixabay.comフリー画像使用
https://scratch.mit.edu/projects/154426647 から公開しています。おうちでリミックス（コピーして好きに変更）してあそんでね！
せっけいず
さいぼう
せんしょくたい
えんき
しょうひん せいぶつしゅ しく
えんき なら あ いろ せん
ぞく
はば
す へんこうこうかい
たいけん
たい けん
だいがく
スクラッチディエヌエー
ディエヌエー
ディエヌエー
ディエヌエー
ディエヌエー スクラッチ
スクラッチ
げんご
ぶひん つく
こども む
バーステップ
うご
みどりいろ はた
にゅうりょく はいれつ
たいけん
みぎがわ お
で き
か
たいけん も じ か
ず いろ
か
はば バーステップ あたい
フーム もじ す もじ
か
じゅう
く