Fac pubmed

643 views

Published on

Cómo hacer una búsqueda en Pubmed.

Published in: Education
0 Comments
1 Like
Statistics
Notes
  • Be the first to comment

No Downloads
Views
Total views
643
On SlideShare
0
From Embeds
0
Number of Embeds
3
Actions
Shares
0
Downloads
4
Comments
0
Likes
1
Embeds 0
No embeds

No notes for slide

Fac pubmed

  1. 1. 1Búsqueda de información científica Prof. Dr. Armando Pacher CETIFAC – Centro de Teleinformática de FAC Bioingeniería UNER XXIII Congreso Nacional de Cardiología San Miguel del Tucumán 2004
  2. 2. 2 ContenidosPubMed – Medline BIREME - Lilacs
  3. 3. 3Las charlas de este curso pueden continuar en forma virtual y permanente en el Foro de Informática en Cardiología de FAC: cursofac@fac.org.arEl material proyectado por el Dr. Lombardo y el que se proyectará se colocará en la Web: www.fac.org.ar/fec/cursofac/cong04
  4. 4. 4 Recordemos la necesidad de limitar las búsquedas• Utilización de operadores lógicos • AND • OR • NOT Recordar la Teoría de Conjuntos Conjunto A y Conjunto B Intersección - Unión - Diferencia
  5. 5. 5 Limitar las búsquedas• Operador AND (= Y) Intersección A Y B arrhythmia AND ventricular material que incluya arritmia y ventricular
  6. 6. 6 Limitar las búsquedas• Operador OR (= O) Unión A OR B arrhythmia OR ventricular material que incluya o arritmia o ventricular
  7. 7. 7 Limitar las búsquedas• Operador NOT ( = NO) Diferencia A NOT B arrhythmia NOT ventricular trabajos que incluyan arritmia pero no ventricular
  8. 8. 8 Operadores AND OR NOT• arrhythmia AND ventricular: • encuentra trabajos de arritmia ventricular• arrhythmia OR ventricular: • encuentra tanto trabajos de arritmia como trabajos que tengan la palabra ventricular• arrhythmia NOT ventricular: • encuentra trabajos de arritmia no ventricular *
  9. 9. 9Operadores AND OR NOT: combinaciones• arrhythmia AND ventricular NOT ischemia: • encuentra trabajos de arritmia ventricular sin isquemia• arrhythmia AND ventricular AND treatment NOT ischemia: • encuentra trabajos de tratamiento de arritmia ventricular sin isquemia• arrhythmia AND ventricular NOT sustained AND treatment NOT ischemia : • encuentra trabajos de tratamiento de arritmia ventricular no sostenida sin isquemia *
  10. 10. 10Acceso a PubMed
  11. 11. 11
  12. 12. 12
  13. 13. 13 PubMed (Medline)• Búsquedas simples: con o sin operadores AND OR NOT• Utilización de “Limits”: acotación de los resultados• Journal Browser: para hojear revistas• Citation Matcher: ubica trabajos conocidos• MeSH Browser: búsquedas avanzadas• Clinical Queries: mediante categorías (therapy, diagnosis, etiology, prognosis) y elección de sensibilidad y especificidad.• Cubby: almacenamiento y actualización de búsquedasHabilitar cookies antes de comenzar las búsquedas
  14. 14. 14Búsqueda simple: arrhythmia arrhythmia
  15. 15. 15arrhythmia: 101.249 citas
  16. 16. 16Si están habilitadas las cookies Hystory guardará las búsquedas y las mostrará en orden cronológico
  17. 17. 17 History: combinación de búsquedas• Se utiliza el signo numeral # delante del número de búsqueda: • #2 AND #6 • #3 AND (drug therapy OR diet therapy).• Número máximo de búsquedas a almacenar: 100• Duración de la actividad de la cookie: ocho horas• Limpieza de búsquedas: • Clear History
  18. 18. 18 Guardado de una búsqueda• Click en Details• Clic en URL • aparecerá la URL de la búsqueda• Guardar en Favoritos o Bookmarks• No funciona si se utilizó History (pues dura sólo ocho horas)
  19. 19. 19 arrhythmia AND ventricular: 36.674 citasPor defecto, si hay más de un término el operador es AND
  20. 20. 20arrhythmia AND ventricular AND treatment NOT sustained: 15.608
  21. 21. 21arrhythmia AND ventricular AND treatment NOT sustained AND 2001: 1074
  22. 22. 22 Utilización de “Limits”• campo de búsqueda (título, autor, etc.)• grupo etario• sexo• humano o animal• idioma• disponibilidad de abstracts• fechas de publicación o de indexación• tipo de publicación (ensayo clínico [clinical trial], editorial, etc.)• La mayoría descartan PreMedline
  23. 23. 23Agregando “Limits”
  24. 24. 24Resultado con “Limits”: 31 citas
  25. 25. 25 Id. anterior, trabajos sólo de 2001: 7 citasTraducción: buscar ensayos clínicos que tengan abstracs, publicados en 2001, sobre tratamiento en adultos de arritmia ventricular no sostenida.
  26. 26. 26 Tipos de artículos• Clinical Trial• Editorial• Letter• Meta-Analysis• Practice Guideline• Randomized Controlled Trial• Review
  27. 27. 27 Subgrupos por edad• All Infant: birth-23 months• All Child: 0-18 years• All Adult:19+ years• Newborn: birth-1 month• Infant: 1-23 months• Preschool Child: 2-5 years• Child: 6-12 years• Adolescent: 13-18 years• Adult: 19-44 years• Middle Aged: 45-64 years• Middle Aged + Aged: 45+ years• Aged: 65+ years• 80 and over: 80+ years
  28. 28. 28 Búsqueda por autor• En el campo AUTOR introducir el apellido e iniciales, sin puntos ni comas: • smith ja • jones k• Si se ingresa sólo apellido se buscará en todos los campos, salvo que este dato esté indexado en MESH o que se acompañe de [au]: • Yang encontrará Yin-Yang [MeSH] o Yang [Text Word] • Yang [au] sólo buscará en autores
  29. 29. 29 Descripciones de campo y tags [ ]• Affiliation [AD]: datos de contacto• All Fields [ALL] búsqueda en todos los campos• Author [AU] búsqueda por autor• Entrez Date [EDAT]: fecha en que ingresó el artículo• Journal Title [TA]• Filtro [sb] • loall[sb] – citas con liks externos • free full text[sb] - citas con full-text gratuitos • full text[sb] – citas a artículos full-text• Etc., etc...• Información completa: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query/static/help/pmhelp. html#SearchFieldDescriptionsandTags
  30. 30. 30 Nombre de publicaciones• Campo título• Título completo: • Molecular Biology of the Cell• Abreviatura de Medline: • mol biol cell• El número ISSN (código internacional estandard): • 1059-1524 (ausente en publicaciones antiguas)• Título según aparece en el catálogo de NLM• Si hay [ ] o ( ) quitarlos: • j hand surg [am] debe ingresarse j hand surg am• Exclusivamente títulos: [ta]
  31. 31. 31 Mapeo automático de términos• Orden de búsqueda: • MeSH • Translation Table • Journals Translation Table • Author
  32. 32. 32 MeSH Translation Table• Sistema de traducción automático • MeSH Terms • See-Reference mappings for MeSH terms • MeSH Subheadings • Publication Types • Pharmacologic Action terms • Sinónimos o equivalentes en inglés• Si el término ingresado tiene un equivalente en esta tabla, la búsqueda se hará automáticamente en términos MeSH
  33. 33. 33 Journals Translation Table• Sistema automático de traducción de nombres de publicaciones • Ingresando new england journal of medicine se hará la búsqueda automáticamente como "N Engl J Med"[Journal]
  34. 34. 34 Uso de * y “ ”• * Permite búsquedas de troncos de palabras • card* encontrará cardiac, cardiovascular, etc.• “” buscan frases exactas.• Anulan el mapeo automático de términos
  35. 35. 35 Subcategorías de Journal/Citation• Se obtienen mediante el agregado del prefijo “jsubset” y las letras de la subcategoría: • neoplasms AND jsubsete• E citas o publicaciones sobre bioética• H Publicaciones de administración de salud• IM Index Medicus• N enfermería• Q historia de la medicina• S ciencias del espacioT• X HIV SIDA
  36. 36. 36 PubMed Central• Búsquedas de publicaciones que tienen contenidos full text• Se accede desde PubMed Central o con los comandos: pubmed pmc local[sb] Ejemplo: “sudden death” AND pubmed pmc local[sb] Publicaciones con abstracts• Comando: hasabstract• Ejemplo: “sudden death” AND hasabstract
  37. 37. 37 Journal Browser• Herramienta para hojear publicaciones• Se ingresa el nombre de la publicación, o la abreviatura correspondiente de MEDLINE o el identificador ISSN.• Mediante “Limits” se elige el ejemplar buscado
  38. 38. 38Ingreso del nombre de la publicación
  39. 39. 39Codificación de la publicación
  40. 40. 40Acceso a la totalidad de lo publicado: 17.965 citas
  41. 41. 41Utilización de Limits: fecha de publicación
  42. 42. 42Utilización de Limits: fecha de publicación: 55 citas
  43. 43. 43 Citation Matcher• Herramienta para buscar artículos cuando se dispone de la cita• Se ingresan los datos conocidos en los diferentes campos
  44. 44. 44Cuando se conoce la cita bibliográfica
  45. 45. 45Cuando se conoce la cita bibliográfica
  46. 46. 46Obtención directa cuando se conoce la cita bibliográfica
  47. 47. 47Busqueda de artículos que contenganen el título, abstract o en MeSH palabrascorrespondientes, seleccionadasmediante un poderoso algoritmo.Posee opciones, incluyendo combinacionescon búsquedas: #3 AND english[la]Books y LinkOut rescatan abstracts de librosy links a sitios Webs relacionados
  48. 48. 48 MeSH Database Encabezados de Temas Médicos• Herramienta de mayor complejidad y eficacia: aplica la lógica que utilizan los bibliotecarios.• Cada cita en la sección de MEDLINE en la base de datos de PubMed es indexada con los Medical Subject Headings (o MeSH) que describen el tema contenido en el artículo.• MeSH Database permite la búsqueda de citas por términos MeSH.• Los términos MeSH se dividen en encabezados y subencabezados *
  49. 49. 49MeSH Browser (actualmente Mesh Database con algunas diferencias)
  50. 50. 50Buscar el término MeSH
  51. 51. 51Muestra los términos que tiene indexados
  52. 52. 52Verificar el árbol y agregarlo (“Add”) a la búsqueda
  53. 53. 53Buscar subencabezados o subtérminos MeSH
  54. 54. 54Incluir subtérminos MeSH, de a uno por vez
  55. 55. 55Realizar la búsqueda en PubMed
  56. 56. 56Incluir límites si son necesarios
  57. 57. 57Verificar el esquema MeSH utilizado (Details)
  58. 58. 58Opción de guardar la búsqueda MeSH
  59. 59. 59 Ej.: Inmunología en la Enfermedad de Chagas congénita• Escribir en "Search for:" el término a buscar (Chagas) y hacer clic en "Go"• Elegir en el listado el término MeSH más adecuado (Chagas Disease) y hacer clic en "Browse this term"• Arbol de categorías MeSH: clic en "Add this term to the Search using operator: AND"• Hacer clic en "Detailed display" y agregar, de a uno por vez, los términos/subtítulos MeSH necesarios para acotar la búsqueda. Si es necesario, incluir "Limits” y/o “Add Terms”• Hacer clic en "PubMed Search"
  60. 60. 60Búsqueda compleja
  61. 61. 61 Traducción de una búsqueda compleja• ((((((Hypertension/drug therapy[MESH] AND Clinical Trial[ptyp]) AND English[Lang]) AND "adult"[MeSH Terms]) AND "human"[MeSH Terms]) AND ("2001/02/16 01.46"[EDat] : "2004/03/18 01.46"[EDat])) AND ("2004/02/16"[EDat] : "2004/03/17"[EDat]))• Esta sería la traducción aproximada: • "Buscar trabajos de marzo de 2004, sólo escritos en idioma inglés, que sean ensayos clínicos en humanos, mayores de 19 años, sobre el tema terapia con drogas de la hipertensión arterial”
  62. 62. 62Almacenamiento y actualización de búsquedas
  63. 63. 63 Registro en Cubby• Nombre de usuario (3-10 caracteres alfanuméricos)• Contraseña: (6-8 caracteres alfanuméricos)• Recordatorio: Nombre de soltera de la madre o nombre de una mascota• Anotar cuidadosamente: importan mayúsculas y minúsculas• El login dura 12 horas (necesita que estén activadas las cookies)
  64. 64. 64• Clinical Queries • Filtros de categorías, sensibilidad y especificidad
  65. 65. 65Filtros de categorías, de sensibilidad y de especificidad
  66. 66. 66
  67. 67. 67
  68. 68. 68BIREME-LILACS - Medline Latinoamericana” Herramientas similares a PubMed Idiomas castellano, portugués e inglés
  69. 69. 69Información general
  70. 70. 70Límites
  71. 71. 71Páginas de ayuda
  72. 72. 72Páginas de ayuda
  73. 73. 73Similar a metodología MESH
  74. 74. 74
  75. 75. 75Categorías y subcategorías
  76. 76. 76Categorías y subcategorías
  77. 77. 77 Conceptos finales (“para no marearse”) Dr. Alberto Vázquez, XX Congreso Nacional de Cardiología, Córdoba, 2001• Planificar una estrategia • No sentarse a la PC sin un plan; • escribir antes la búsqueda, • que no deberá ser ni muy amplia ni muy acotada; • abrir un solo frente por vez y agotarlo; • si se encuentra un buen trabajo, detenerse y leerlo ... al otro día se hará una mejor búsqueda; • en PubMed escribir todo en inglés (ayudarse con un buen diccionario y/o con sitios como HonSelect).• No es difícil, pero hay que sumar “horas de silla”. *

×