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一番好きな論文アドベントカレンダー2017
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- 12. もう少し詳しい「光合成」とは 光 b6/fPS II PSI 光 Pq Pc Fd ATP合成 酵素 光があたると PS II: 光化学系II Pq: プラストキノン Pc: プラストシアニン b6/f: シトクロムb6/f複合体 PS I: 光化学系I Fd: フェレドキシン 本業の⽅は⼤めに⾒てください・・・
- 13. もう少し詳しい「光合成」とは 光 H2O 2H+ 1/2O2 b6/fPS IIPS I 光 Pq Pc Fd e– ATP合成 酵素 PS II: 光化学系II Pq: プラストキノン Pc: プラストシアニン b6/f: シトクロムb6/f複合体 PS I: 光化学系I Fd: フェレドキシン ⽔からH+, 電⼦が 本業の⽅は⼤めに⾒てください・・・
- 14. もう少し詳しい「光合成」とは 光 H2O 2H+ 1/2O2 b6/fPS IIPS I 2H+ 光 Pq Pc Fd e– e– e– ATP合成 酵素2H+ PS II: 光化学系II Pq: プラストキノン Pc: プラストシアニン b6/f: シトクロムb6/f複合体 PS I: 光化学系I Fd: フェレドキシン 電⼦が伝達される 本業の⽅は⼤めに⾒てください・・・
- 15. もう少し詳しい「光合成」とは 光 H2O 2H+ 1/2O2 b6/fPS IIPS I 2H+ 2H+ 光 Pq Pc Fd e– e– e– ATP合成 酵素 PS II: 光化学系II Pq: プラストキノン Pc: プラストシアニン b6/f: シトクロムb6/f複合体 PS I: 光化学系I Fd: フェレドキシン H＋の勾配形成も 本業の⽅は⼤めに⾒てください・・・
- 16. もう少し詳しい「光合成」とは 光 H2O 2H+ 1/2O2 b6/fPS IIPS I 2H+ 光 H+ H+ Pq Pc Fd e– e– e– ADP ATP NADP+ + H+ NADPH PS II: 光化学系II Pq: プラストキノン Pc: プラストシアニン b6/f: シトクロムb6/f複合体 PS I: 光化学系I Fd: フェレドキシン ATP合成 酵素2H+ NADPHやATP獲得(これらとCO2で有機物を作る) 本業の⽅は⼤めに⾒てください・・・
- 17. もう少し詳しい「光合成」とは H2O 2H+ 1/2O2 b6/fPS IIPS I 2H+ H+ H+ Pq Pc Fd e– ADP ATP NADP+ + H+ NADPH PS II: 光化学系II Pq: プラストキノン Pc: プラストシアニン b6/f: シトクロムb6/f複合体 PS I: 光化学系I Fd: フェレドキシン ATP合成 酵素2H+ 本業の⽅は⼤めに⾒てください・・・ PSIだけが関わる電⼦の流れ→ cyclic electron flow
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- 26. 今回の研究は Here, we havedeveloped a targeted isolation strategy in an attempt to find such a PSI-carrying cyanophage. （抜粋）
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- 28. ファージを採るための戦略 （紹介論⽂：Fridman et al.,2017のFig. S1より) Synechococcus や Prochlorococcus といったシアノバクテリアを （シアノファージの⼊った）太平洋の 海⽔と⼀緒に培養
- 29. ファージを採るための戦略 （紹介論⽂：Fridman et al.,2017のFig. S1より) Synechococcus や Prochlorococcus といったシアノバクテリアを （シアノファージの⼊った）太平洋の 海⽔と⼀緒に培養 溶菌（ファージでシアノが死亡）が 起こった中で光合成遺伝⼦を持つと PCRで確認
- 30. ファージを採るための戦略 （紹介論⽂：Fridman et al.,2017のFig. S1より) Synechococcus や Prochlorococcus といったシアノバクテリアを （シアノファージの⼊った）太平洋の 海⽔と⼀緒に培養 溶菌（ファージでシアノが死亡）が 起こった中で光合成遺伝⼦を持つと PCRで確認 その中でまた溶菌するようなものを ⾒つけ、別の光合成遺伝⼦を持つか 確認
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- 34. P-TIM68が持つ光合成関連遺伝⼦ 光 H2O 2H+ 1/2O2 b6/fPS IIPS I 2H+ 光 H+ H+ Pq Pc Fd e– e– e– ADP ATP NADP+ + H+ NADPH ATP合成 酵素2H+ PSI関連 7つ （紹介論⽂：Fridman et al., 2017のFig. 1より)
- 35. P-TIM68が持つ光合成関連遺伝⼦ 光 H2O 2H+ 1/2O2 b6/fPS IIPS I 2H+ 光 H+ H+ Pq Pc Fd e– e– e– ADP ATP NADP+ + H+ NADPH ATP合成 酵素2H+ PSII関連 3つ （紹介論⽂：Fridman et al., 2017のFig. 1より)
- 36. P-TIM68が持つ光合成関連遺伝⼦ 光 H2O 2H+ 1/2O2 b6/fPS IIPS I 2H+ 光 H+ H+ Pq Pc Fd e– e– e– ADP ATP NADP+ + H+ NADPH ATP合成 酵素2H+ NDH-1関連 2つ (type I NAD(P)H dehydrogenase ) （紹介論⽂：Fridman et al., 2017のFig. 1より)
- 37. vPSI-7ファージの分布図 ここ （紹介論⽂：Fridman et al.,2017のFig. 2より)
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- 40. （紹介論⽂：Fridman et al.,2017のFig. 2より) vPSI-7ファージの分布図 vPSI-7ファージに対する P-TIM68の割合 ここ P-TIM68と思われる 遺伝⼦型はvPSI-7の （平均で）20％ たくさんいるだろう！！
- 41. 実際に動いてるん？ （紹介論⽂：Fridman et al.,2017のFig. 3より) （遺伝⼦の発現は6〜8時間でmax。これは図3a） PSI, PSIIのタンパクは8時間ほどで宿主 （Prochlorococcus）の膜に確認
- 42. 実際に動いてるん？ （紹介論⽂：Fridman et al.,2017のFig. 3より) （遺伝⼦の発現は6〜8時間でmax。これは図3a） PSI, PSIIのタンパクは8時間ほどで宿主 （Prochlorococcus）の膜に確認 宿主のPSIIのタンパクは感染後、元の 50％まで減少（紺線）していった。 ファージの⽅は増加（⾚線） 全PsbAタンパクの43％までファージの 寄与が上がる（サプリの図4a）
- 43. 実際に動いてるん？ （紹介論⽂：Fridman et al.,2017のFig. 3より) （遺伝⼦の発現は6〜8時間でmax。これは図3a） PSI, PSIIのタンパクは8時間ほどで宿主 （Prochlorococcus）の膜に確認 宿主のPSIのタンパクは感染後、有意な 減少が⾒られない（紺線） ファージの⽅は増加（⾚線） 全PsaAタンパクの8.6％くらいの寄与 （サプリの図4b）
- 44. 実際に動いてるん？ （紹介論⽂：Fridman et al.,2017のFig. 3より) （遺伝⼦の発現は6〜8時間でmax。これは図3a） PSI, PSIIのタンパクは8時間ほどで宿主 （Prochlorococcus）の膜に確認 感染によって、PSIタンパク を補強している？ 宿主のPSIのタンパクは感染後、有意な 減少が⾒られない（紺線） ファージの⽅は増加（⾚線） 全PsaAタンパクの8.6％くらいの寄与 （サプリの図4b） （著者らの仮説)
- 45. 実際に動いてるん？ （紹介論⽂：Fridman et al.,2017のFig. 3より) （遺伝⼦の発現は6〜8時間でmax。これは図3a） PSI, PSIIのタンパクは8時間ほどで宿主 （Prochlorococcus）の膜に確認 もっと光の強い海域や表層 なら寄与率上がるかも？ 宿主のPSIのタンパクは感染後、有意な 減少が⾒られない（紺線） ファージの⽅は増加（⾚線） 全PsaAタンパクの8.6％くらいの寄与 （サプリの図4b） （著者らの仮説)
- 46. 光合成活性を測ってみる rETRmax: relative maximumelectron transfer rate →electron transferなので、電⼦伝達を 測る
- 47. 光合成活性を測ってみる rETRmax: relative maximumelectron transfer rate →electron transferなので、電⼦伝達を 測る 感染で宿主が死んでいっても（右軸） rETRmaxは感染の有る無し（⾚・紺）に 関わらず維持される
- 48. 光合成活性を測ってみる rETRmax: relative maximumelectron transfer rate →electron transferなので、電⼦伝達を 測る 感染で宿主が死んでいっても（右軸） rETRmaxは感染の有る無し（⾚・紺）に 関わらず維持される ⼀⽅、PSIの還元能(reduction rate)は 感染後、8時間くらいで上昇！！ 感染してない⽅は上がらない・・・
- 49. 光合成活性を測ってみる rETRmax: relative maximumelectron transfer rate →electron transferなので、電⼦伝達を 測る 感染で宿主が死んでいっても（右軸） rETRmaxは感染の有る無し（⾚・紺）に 関わらず維持される ⼀⽅、PSIの還元能(reduction rate)は 感染後、8時間くらいで上昇！！ 感染してない⽅は上がらない・・・ PSIIは変わらなくて、 PSIが上昇する →PSIIとは独⽴の電⼦伝達 がPSIへ !?
- 50. もう少し詳しい「光合成」とは H2O 2H+ 1/2O2 b6/fPS IIPS I 2H+ H+ H+ Pq Pc Fd e– ADP ATP NADP+ + H+ NADPH PS II: 光化学系II Pq: プラストキノン Pc: プラストシアニン b6/f: シトクロムb6/f複合体 PS I: 光化学系I Fd: フェレドキシン ATP合成 酵素2H+ 本業の⽅は⼤めに⾒てください・・・ PSIだけが関わる電⼦の流れ→ cyclic electron flow (仮説) cyclic electron flowを促進し、ATPを より⽣産？
- 51. もう少し詳しい「光合成」とは H2O 2H+ 1/2O2 b6/fPS IIPS I 2H+ H+ H+ Pq Pc Fd e– ADP ATP NADP+ + H+ NADPH PS II: 光化学系II Pq: プラストキノン Pc: プラストシアニン b6/f: シトクロムb6/f複合体 PS I: 光化学系I Fd: フェレドキシン ATP合成 酵素2H+ 本業の⽅は⼤めに⾒てください・・・ PSIだけが関わる電⼦の流れ→ cyclic electron flow (仮説) ただしファージのDNA 複製のため・・・?? ファージが増え出すのは 10〜12時間以降のよう。
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