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PLSとは
因⼦ X を説明変数として直接回帰に⽤いず、
潜在変数 t を説明変数として従属変数 y への回帰を⾏う⽅法である
潜在変数 t とは . . .
多変量のX⾏列から情報を集約し少数の変数に置き換えたもの
→つまり、潜在変数 t は X の線形結合のこと
PLS 1
𝑡 = 𝑥$ 𝑤$ + 𝑥' 𝑤' + ・・・ = 𝐗𝐰
2
PLS 2
PLSの基本式は以下の2式である
𝐗 = * 𝐭, 𝐩, + 𝐄 = 𝐓𝐏1
+ 𝐄
2
,3$
𝐲 = * 𝐭, 𝐪, + 𝐟 = 𝐓𝐪 + 𝐟
2
,3$
ローディング
係数
残差
よってPLSでは、
yとtの相関を⼤きくすることと同時に、tの分散を⼤きくし、Xに含まれる情報を
なるべく多量に⽤いることを⽬的とする
yとtの共分散を最⼤にするようなwを求める
3
PLS 3
Lagrangeの未定乗数法より
G = 𝐲8
𝐭 − µ 𝐰
'
− 1 = 𝐲𝐖𝐱 − µ 𝐰
'
− 1 制約条件: 𝐰 = 1
= * * 𝑦? 𝑥?@ 𝑤@ − 𝜇(* 𝑤@
'
C
@3$
− 1)
C
@3$
E
?3$
Gを𝑤@ について偏微分すると
𝜕𝐺
𝜕𝑤@
= * 𝑦? 𝑥?@ − 2𝜇𝑤@ = 0
E
?3$
* 𝑦? 𝑥?@ = 2𝜇𝑤@
E
?3$
4
* 𝑦? 𝑥?@ = 2𝜇𝑤@
E
?3$
PLS 4
両辺に𝑤@ をかけてkについて総和をとる
* * 𝑦? 𝑥?@ 𝑤@
C
@3$
= 2𝜇 * 𝑤@
'
= 2𝜇
C
@3$
E
?3$
制約条件= 𝐲8
𝐭
よって
𝑤@ =
∑ 𝑦? 𝑥?@
E
?3$
2𝜇
ベクトルwのノルムは1なので、 𝐰 =
𝐗1
𝐲
| 𝐗1 𝐲 |
(wが求まるとtも求まる)
5
𝐭$ 𝐭' t
p
𝑝$
𝑝'
PLS 5
X= 𝑡$ 𝑝$ + 𝑡' 𝑝' + 𝐸 とすると
p は X の残差 E の要素の⼆乗和が最⼩になるように求める
残差 E の⼆乗和(G1)が最⼩という条件で p を求める⼿法
最⼩値を取る → 極⼩値を取る
G を p1, p2 で偏微分して0
まとめると・・・
𝐺1 = * 𝐸?
'
= *(𝑋(?)
− 𝑝$ 𝑡$
(?)
− 𝑝' 𝑡'
(?)
)'
E
?3$
OP$
OQR
= −2 ∑ 𝑡$
(?)
(E
?3$ 𝑋? − 𝑝$ 𝑡$
(?)
− 𝑝' 𝑡'
(?)
)=0
OP$
OQS
= −2 ∑ 𝑡'
(?)
(E
?3$ 𝑋? − 𝑝$ 𝑡$
(?)
− 𝑝' 𝑡'
(?)
)=0
PLS 6
PLS 7
𝑡$
$
𝑡$
'
… 𝑡$
E
𝑡'
$
𝑡'
'
… 𝑡'
E
𝑡$
$
𝑡'
$
𝑡$
'
⋮
𝑡$
E
𝑡'
'
⋮
𝑡'
E
𝑝$
𝑝'
=
𝑡$
$
𝑡$
'
… 𝑡$
E
𝑡'
$
𝑡'
'
… 𝑡'
E
(
𝑋($)
𝑋(')
⋮
𝑋(E)
)
両辺に左から tTt の逆⾏列 (tTt)-1 を掛ける
𝐭1
𝐭𝐩 = 𝐗1
𝐭
𝐩 =
𝐗1
𝐭
𝐭1 𝐭
8
q は y の残差 f の要素の⼆乗和が最⼩になるように求める
PLS 8
𝐪 =
𝐲1
𝐭
𝐭1 𝐭
• X2 : X の中で1成分のPLSモデルでは説明できない部分
• y2 : y の中で1成分のPLSモデルでは説明できない部分
2
T
22
T
11 EptptX ++= 22211 ftty ++= qq
T
112 ptXX −= 112 qtyy −=
ただし、w2 の⼤きさ(ノルム)は1
t2 は X2 の線形結合
222 wXt =
PLS 9
第2成分
10
y2 と t2 の共分散 y2
Tt2 を最⼤化するよう t2 を計算する
y2 との関連性が⼤きい t2 を抽出したい
1成分の時と同様にして、
2
T
2
2
T
2
2
yX
yX
w = 22 Xwt =
2
T
2
2
T
2
2
tt
tX
p =
2
T
2
2
T
2
2
tt
ty
=q
PLS 10
pls = PLSRegression( n_components=x )
from sklearn.cross_decomposition import PLSRegression
関数はこれを使う
成分数
実⾏しよう
pls.fit( X, Y )
説明変数 ⽬的変数
回帰係数が得られる
pls. coef_
計算値も得られる
pls.predict( X )
pls.fit で得られた
回帰係数を⽤いて
⼊⼒変数から
計算値を算出してくれる
決定係数𝑅'
も得られる
pls.score( X, Y )
PLS 11
クロスバリデーションから予測値を求める
from sklearn.model_selection import cross_val_predict
predicted = cross_val_predict( pls , X , Y, cv=2 )
分析⽅法を⼊⼒ 説明変数 ⽬的変数
クロスバリデーションの
⽅法を選択
defaultはk-fold
𝑅𝑐𝑣'
を求める
from sklearn.metrics import r2_score
rcv2 = r2_score(t_test, predicted)
オートスケーリング
していない
元データの⽬的変数
なぜか?
推測値
オートスケーリングした状態だと
元データで求められる値よりも
⼩さくなってしまうため
PLS 12
オートスケーリングの式
Autoscale_Data = { data ー 平均値 } / 標準偏差
推測値をオートスケール前のデータと⽐較したい
predicted = { 欲しいdata ー 元のtrainデータの平均値 } / 元のtrainデータの標準偏差
欲しいdata = { predicted×元のtrainデータの標準偏差} + 元のtrainデータの平均値
欲しいdata = { predicted × y_train.std() } + y_train.mean()
PLS 13
つまり

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Pls

  • 1. PLSとは 因⼦ X を説明変数として直接回帰に⽤いず、 潜在変数 t を説明変数として従属変数 y への回帰を⾏う⽅法である 潜在変数 t とは . . . 多変量のX⾏列から情報を集約し少数の変数に置き換えたもの →つまり、潜在変数 t は X の線形結合のこと PLS 1 𝑡 = 𝑥$ 𝑤$ + 𝑥' 𝑤' + ・・・ = 𝐗𝐰
  • 2. 2 PLS 2 PLSの基本式は以下の2式である 𝐗 = * 𝐭, 𝐩, + 𝐄 = 𝐓𝐏1 + 𝐄 2 ,3$ 𝐲 = * 𝐭, 𝐪, + 𝐟 = 𝐓𝐪 + 𝐟 2 ,3$ ローディング 係数 残差 よってPLSでは、 yとtの相関を⼤きくすることと同時に、tの分散を⼤きくし、Xに含まれる情報を なるべく多量に⽤いることを⽬的とする yとtの共分散を最⼤にするようなwを求める
  • 3. 3 PLS 3 Lagrangeの未定乗数法より G = 𝐲8 𝐭 − µ 𝐰 ' − 1 = 𝐲𝐖𝐱 − µ 𝐰 ' − 1 制約条件: 𝐰 = 1 = * * 𝑦? 𝑥?@ 𝑤@ − 𝜇(* 𝑤@ ' C @3$ − 1) C @3$ E ?3$ Gを𝑤@ について偏微分すると 𝜕𝐺 𝜕𝑤@ = * 𝑦? 𝑥?@ − 2𝜇𝑤@ = 0 E ?3$ * 𝑦? 𝑥?@ = 2𝜇𝑤@ E ?3$
  • 4. 4 * 𝑦? 𝑥?@ = 2𝜇𝑤@ E ?3$ PLS 4 両辺に𝑤@ をかけてkについて総和をとる * * 𝑦? 𝑥?@ 𝑤@ C @3$ = 2𝜇 * 𝑤@ ' = 2𝜇 C @3$ E ?3$ 制約条件= 𝐲8 𝐭 よって 𝑤@ = ∑ 𝑦? 𝑥?@ E ?3$ 2𝜇 ベクトルwのノルムは1なので、 𝐰 = 𝐗1 𝐲 | 𝐗1 𝐲 | (wが求まるとtも求まる)
  • 5. 5 𝐭$ 𝐭' t p 𝑝$ 𝑝' PLS 5 X= 𝑡$ 𝑝$ + 𝑡' 𝑝' + 𝐸 とすると p は X の残差 E の要素の⼆乗和が最⼩になるように求める
  • 6. 残差 E の⼆乗和(G1)が最⼩という条件で p を求める⼿法 最⼩値を取る → 極⼩値を取る G を p1, p2 で偏微分して0 まとめると・・・ 𝐺1 = * 𝐸? ' = *(𝑋(?) − 𝑝$ 𝑡$ (?) − 𝑝' 𝑡' (?) )' E ?3$ OP$ OQR = −2 ∑ 𝑡$ (?) (E ?3$ 𝑋? − 𝑝$ 𝑡$ (?) − 𝑝' 𝑡' (?) )=0 OP$ OQS = −2 ∑ 𝑡' (?) (E ?3$ 𝑋? − 𝑝$ 𝑡$ (?) − 𝑝' 𝑡' (?) )=0 PLS 6
  • 7. PLS 7 𝑡$ $ 𝑡$ ' … 𝑡$ E 𝑡' $ 𝑡' ' … 𝑡' E 𝑡$ $ 𝑡' $ 𝑡$ ' ⋮ 𝑡$ E 𝑡' ' ⋮ 𝑡' E 𝑝$ 𝑝' = 𝑡$ $ 𝑡$ ' … 𝑡$ E 𝑡' $ 𝑡' ' … 𝑡' E ( 𝑋($) 𝑋(') ⋮ 𝑋(E) ) 両辺に左から tTt の逆⾏列 (tTt)-1 を掛ける 𝐭1 𝐭𝐩 = 𝐗1 𝐭 𝐩 = 𝐗1 𝐭 𝐭1 𝐭
  • 8. 8 q は y の残差 f の要素の⼆乗和が最⼩になるように求める PLS 8 𝐪 = 𝐲1 𝐭 𝐭1 𝐭
  • 9. • X2 : X の中で1成分のPLSモデルでは説明できない部分 • y2 : y の中で1成分のPLSモデルでは説明できない部分 2 T 22 T 11 EptptX ++= 22211 ftty ++= qq T 112 ptXX −= 112 qtyy −= ただし、w2 の⼤きさ(ノルム)は1 t2 は X2 の線形結合 222 wXt = PLS 9 第2成分
  • 10. 10 y2 と t2 の共分散 y2 Tt2 を最⼤化するよう t2 を計算する y2 との関連性が⼤きい t2 を抽出したい 1成分の時と同様にして、 2 T 2 2 T 2 2 yX yX w = 22 Xwt = 2 T 2 2 T 2 2 tt tX p = 2 T 2 2 T 2 2 tt ty =q PLS 10
  • 11. pls = PLSRegression( n_components=x ) from sklearn.cross_decomposition import PLSRegression 関数はこれを使う 成分数 実⾏しよう pls.fit( X, Y ) 説明変数 ⽬的変数 回帰係数が得られる pls. coef_ 計算値も得られる pls.predict( X ) pls.fit で得られた 回帰係数を⽤いて ⼊⼒変数から 計算値を算出してくれる 決定係数𝑅' も得られる pls.score( X, Y ) PLS 11
  • 12. クロスバリデーションから予測値を求める from sklearn.model_selection import cross_val_predict predicted = cross_val_predict( pls , X , Y, cv=2 ) 分析⽅法を⼊⼒ 説明変数 ⽬的変数 クロスバリデーションの ⽅法を選択 defaultはk-fold 𝑅𝑐𝑣' を求める from sklearn.metrics import r2_score rcv2 = r2_score(t_test, predicted) オートスケーリング していない 元データの⽬的変数 なぜか? 推測値 オートスケーリングした状態だと 元データで求められる値よりも ⼩さくなってしまうため PLS 12
  • 13. オートスケーリングの式 Autoscale_Data = { data ー 平均値 } / 標準偏差 推測値をオートスケール前のデータと⽐較したい predicted = { 欲しいdata ー 元のtrainデータの平均値 } / 元のtrainデータの標準偏差 欲しいdata = { predicted×元のtrainデータの標準偏差} + 元のtrainデータの平均値 欲しいdata = { predicted × y_train.std() } + y_train.mean() PLS 13 つまり