فاژها عموما به ویروس های آلوده کننده ی باکتری گفته می شود که در نهایت موجب تسهیل و برقراری عفونت در انسان (یا جاندار دیگر) می شوند. اما آرکی ها نه تنها مستقیما موجب عفونت سلول های یوکاریوتی نمی شوند بلکه ویروس های در ارتباط با آرکی ها نیز فاقد فاکتورهای بیماریزایی هستند ( تا به امروز). اکثر ویروس ها ی آرکی ها فاقد نقطه اشتراکی با باکتریوفاژها هستند بنابراین بهتر است لفظ آرکی ویروس را در مورد آنها بکار ببریم. هیچ ویروس آرکی با ژنوم RNA دار هنوز شناخته نشده است (تا به امروز). اما احتمال دارد که وجود داشته باشند. در واقع آرکی ویروس ها اکثرا دارای ژنوم dsDNA هستند به جز چند مورد که ssDNA دارند. مثل ارکی ویروس HRPV1 که دارای circular ssDNA است و میزبان آن Halorubrum pleomorphic است. آرکی ویروس ها دارای اشکال متنوع و اختصاصی هستند که حتی برخی اشکال در ویروس های دیگر مشاهده نشده اند. تنوعی از اشکال fusiform ، droplet ، bottle ، spherical ، rod ، linear ، filamentous ، head-tail در آرکی ویروس ها وجود دارد (Fig 1). Domain Archaea شامل 2 kingdom مهم شامل یوری آرکیوتا (شامل: هالوفیل و متانوژن ها) و کرن آرکیوتا (شامل : هایپر ترموفیل ها و اکسید کننده های گوگرد) می باشد (Fig 2 ). در ادامه به ویروس های مطالعه شده هر فرمانروا از دومین آرکی ها می پردازیم.

1. 1
‫خدا‬ ‫نام‬ ‫به‬
‫فاژها‬ ‫آرکی‬(‫ها‬ ‫باکتر‬ ‫آرکی‬ ‫ی‬ ‫کننده‬ ‫آلوده‬ ‫های‬ ‫ویروس‬)
‫تخصصی‬ ‫دکتری‬ ‫مقطع‬
‫یگانه‬ ‫امید‬
Archaea viruses/ or Archaeaphages
‫می‬ ‫گفته‬ ‫باکتری‬ ‫ی‬ ‫کننده‬ ‫آلوده‬ ‫های‬ ‫ویروس‬ ‫به‬ ‫عموما‬ ‫فاژها‬‫که‬ ‫شود‬‫نهایت‬ ‫در‬‫انسان‬ ‫در‬ ‫عفونت‬ ‫برقراری‬ ‫و‬ ‫تسهیل‬ ‫موجب‬
(‫دیگر‬ ‫جاندار‬ ‫یا‬)‫شوند‬ ‫می‬.‫های‬ ‫ویروس‬ ‫بلکه‬ ‫شوند‬ ‫نمی‬ ‫یوکاریوتی‬ ‫های‬ ‫سلول‬ ‫عفونت‬ ‫موجب‬ ‫مستقیما‬ ‫تنها‬ ‫نه‬ ‫ها‬ ‫آرکی‬ ‫اما‬
‫ها‬ ‫آرکی‬ ‫با‬ ‫ارتباط‬ ‫در‬‫هستند‬ ‫بیماریزایی‬ ‫فاکتورهای‬ ‫فاقد‬ ‫نیز‬(‫امروز‬ ‫به‬ ‫تا‬.)‫اکثر‬‫ها‬ ‫ویروس‬‫ی‬‫آرکی‬‫اشتراکی‬ ‫نقطه‬ ‫فاقد‬ ‫ها‬
‫ببریم‬ ‫بکار‬ ‫آنها‬ ‫مورد‬ ‫در‬ ‫را‬ ‫ویروس‬ ‫آرکی‬ ‫لفظ‬ ‫است‬ ‫بهتر‬ ‫بنابراین‬ ‫هستند‬ ‫باکتریوفاژها‬ ‫با‬.
‫ژنوم‬ ‫با‬ ‫آرکی‬ ‫ویروس‬ ‫هیچ‬RNA‫است‬ ‫نشده‬ ‫شناخته‬ ‫هنوز‬ ‫دار‬(‫امروز‬ ‫به‬ ‫تا‬.)‫باشند‬ ‫داشته‬ ‫وجود‬ ‫که‬ ‫دارد‬ ‫احتمال‬ ‫اما‬.
‫ژنوم‬ ‫دارای‬ ‫اکثرا‬ ‫ها‬ ‫ویروس‬ ‫آرکی‬ ‫واقع‬ ‫در‬dsDNA‫هست‬‫که‬ ‫مورد‬ ‫چند‬ ‫جز‬ ‫به‬ ‫ند‬ssDNA‫دارند‬.‫ویروس‬ ‫ارکی‬ ‫مثل‬
HRPV1‫دارای‬ ‫که‬ssDNAcircular‫آن‬ ‫میزبان‬ ‫و‬ ‫است‬Halorubrum pleomorphic‫است‬.
‫ا‬ ‫نشده‬ ‫مشاهده‬ ‫دیگر‬ ‫های‬ ‫ویروس‬ ‫در‬ ‫اشکال‬ ‫برخی‬ ‫حتی‬ ‫که‬ ‫هستند‬ ‫اختصاصی‬ ‫و‬ ‫متنوع‬ ‫اشکال‬ ‫دارای‬ ‫ها‬ ‫ویروس‬ ‫آرکی‬‫ند‬.
‫اشکال‬ ‫از‬ ‫تنوعی‬fusiform،droplet،bottle،spherical،rod،linear،filamentous،tail-head‫آرکی‬ ‫در‬
‫دارد‬ ‫وجود‬ ‫ها‬ ‫ویروس‬(1Fig.)
Domain Archaea‫شامل‬2kingdom‫آرکیوتا‬ ‫یوری‬ ‫شامل‬ ‫مهم‬(‫شامل‬:‫ها‬ ‫متانوژن‬ ‫و‬ ‫هالوفیل‬)‫آرکیوتا‬ ‫کرن‬ ‫و‬
(‫شامل‬:‫گوگرد‬ ‫های‬ ‫کننده‬ ‫اکسید‬ ‫و‬ ‫ها‬ ‫ترموفیل‬ ‫هایپر‬)‫می‬‫باشد‬(Fig 2.)‫هر‬ ‫شده‬ ‫مطالعه‬ ‫های‬ ‫ویروس‬ ‫به‬ ‫ادامه‬ ‫در‬
‫پردازیم‬ ‫می‬ ‫ها‬ ‫آرکی‬ ‫دومین‬ ‫از‬ ‫فرمانروا‬.
(The viruses of Crenarchaeota) Figure 1
Figure 2

2. 2
‫حدودا‬03‫اند‬ ‫شده‬ ‫معرفی‬ ‫آرکیوتا‬ ‫کرن‬ ‫فرمانروای‬ ‫کننده‬ ‫آلوده‬ ‫ویروس‬.‫تنها‬ ‫نه‬ ‫ها‬ ‫ویروس‬ ‫آرکی‬ ‫این‬‫هایپر‬ ‫کننده‬ ‫زیست‬ ‫های‬ ‫میزبان‬ ‫از‬‫ترموفیل‬
‫باالی‬ ‫دمای‬ ‫در‬03‫در‬ ‫حال‬ ‫به‬ ‫تا‬ ‫که‬ ‫هستند‬ ‫نامتعارفی‬ ‫اشکال‬ ‫از‬ ‫ای‬ ‫آرایه‬ ‫دارای‬ ‫بلکه‬ ‫اند‬ ‫شده‬ ‫سازی‬ ‫جدا‬ ‫گراد‬ ‫سانتی‬‫دیگر‬‫مختص‬ ‫های‬ ‫ویروس‬
‫است‬ ‫نشده‬ ‫دیده‬ ‫یوکاریوتها‬ ‫یا‬ ‫ها‬ ‫باکتری‬ ‫به‬.
SSV1 : Sulfolobus spindle-shaped virus 1:‫اختصاصی‬ ‫های‬ ‫میزبان‬ ‫دارای‬ ،‫فوزلوویریده‬ ‫خانواده‬ ‫به‬ ‫متعلق‬ ، ‫شکل‬ ‫دوکی‬
‫اسیدیانوس‬ ‫احتماال‬ ‫و‬ ‫سولفولوس‬.‫صورت‬ ‫به‬ ‫ویروس‬ ‫این‬temperate‫است‬.‫کننده‬ ‫بیان‬ ‫ژن‬ ‫در‬ ‫ابتدا‬ ‫یعنی‬tRNA‫می‬ ‫اینتگره‬ ‫میزبان‬ ‫کروموزوم‬
‫تابش‬ ‫اثر‬ ‫در‬ ‫ولی‬ ‫برد‬ ‫می‬ ‫بسر‬ ‫لیزوژن‬ ‫حالت‬ ‫به‬ ‫و‬ ‫شود‬UV‫میتومایس‬ ‫محرک‬ ‫یا‬‫شود‬ ‫می‬ ‫لیتیک‬ ‫فاز‬ ‫وارد‬ ‫و‬ ‫شده‬ ‫فعال‬ ‫ویروس‬ ‫این‬ ،‫ین‬.(fig 3.)
ATV: Acidianus two-tailed virus:‫کند‬ ‫می‬ ‫طی‬ ‫اسیدیانوس‬ ‫میزبان‬ ‫در‬ ‫را‬ ‫الیتیک‬ ‫چرخه‬ ‫ویروس‬ ‫این‬.‫سلول‬ ‫از‬ ‫وقتی‬ ‫جوان‬ ‫های‬ ‫ویروس‬
‫هستند‬ ‫فرم‬ ‫فوزی‬ ‫ذرات‬ ‫شکل‬ ‫به‬ ‫شوند‬ ‫می‬ ‫خارج‬ ‫میزبان‬ ‫شده‬ ‫لیز‬.‫دمای‬ ‫محیط‬ ‫در‬ ‫ویروس‬ ‫اگر‬‫باالی‬57‫دمای‬ ‫به‬ ‫نزدیک‬ ‫که‬ ‫بگیرد‬ ‫قرار‬ ‫گراد‬ ‫سانتی‬
‫آورد‬ ‫می‬ ‫در‬ ‫خود‬ ‫انتهای‬ ‫هر‬ ‫از‬ ‫بلند‬ ‫دم‬ ‫دو‬ ،‫است‬ ‫هم‬ ‫میزبانش‬ ‫زیست‬.‫آن‬ ‫آلودگی‬ ‫قدرت‬ ‫بردن‬ ‫باال‬ ‫و‬ ‫میزبان‬ ‫سلول‬ ‫سطح‬ ‫به‬ ‫چسبیدن‬ ‫در‬ ‫ها‬ ‫دم‬ ‫نقش‬
‫است‬.(Fig 4.)
ABV: Acidianus bottle-shaped virus:‫ژنوم‬ ،‫شکل‬ ‫بطری‬ ‫اختصاصی‬ ‫شکل‬ ‫دارای‬ ،‫آمپوالویریده‬ ‫خانواده‬ ‫از‬linear dsDNA،
24 kbp(Fig 5.)
SNDV: Sulfolobus neozealandicus droplet-shaped virus:‫تنها‬‫میزبان‬ ‫که‬ ‫گوتاویریده‬ ‫ویروسی‬ ‫ی‬ ‫خانواده‬ ‫عضو‬
‫است‬ ‫نیوزیلندیکوس‬ ‫سولفولوس‬ ‫آن‬ ‫آرکی‬.‫حلقوی‬ ‫ژنوم‬ ‫با‬ ‫شکل‬ ‫ای‬ ‫قطره‬ ‫ویروس‬dsDNA‫با‬ ‫و‬ ‫است‬ ‫شده‬ ‫متیله‬ ‫شدت‬ ‫،به‬DPN1
restriction enzyme‫خورد‬ ‫می‬ ‫برش‬( .‫شکل‬6-d.)Droplet shape
(The viruses of Euryarchaeota)
Figure 3
Figure 4
Figure 5Figure 6-d

3. 3
Salterprovirus:‫خطی‬ ‫های‬ ‫ویروس‬ ‫شامل‬His،‫اینتگراز‬ ‫ژن‬ ‫فاقد‬ ،‫کوچک‬ ‫خطی‬ ‫ژنوم‬ ‫با‬‫از‬ ‫برگرفته‬ ‫آن‬ ‫نام‬‫میزبان‬‫اختصاصی‬‫آن‬
‫است‬ ‫هیسپانیکا‬ ‫هالوآرکوال‬.‫شکل‬ ‫دوکی‬ ‫ویروس‬‫دارد‬ ‫الیتیک‬ ‫چرخه‬ ‫و‬.‫ژنوم‬ ‫انتهای‬ ‫دو‬ ‫در‬ ‫اختصاصی‬ ‫پروتیین‬ ‫دو‬‫دارد‬.(Fig 7).
HRPV1: Halorubrum pleomorphic virus:‫واجد‬ ‫که‬ ‫شده‬ ‫شناخته‬ ‫ویروس‬ ‫آرکی‬ ‫تنها‬ssDNA‫رشته‬ ‫تک‬‫است‬( .Fig8.)
(The Linear Archaeaviruses)
‫حضور‬ ‫گرم‬ ‫های‬ ‫محیط‬ ‫در‬ ‫بیشتر‬ ‫ای‬ ‫رشته‬ ‫های‬ ‫ویروس‬ ‫آرکی‬‫آرکیوتا‬ ‫کرن‬ ‫آنها‬ ‫میزبان‬ ‫و‬ ‫دارند‬‫ها‬‫ی‬:
Sulfolobus،Acidianus‫یا‬ ،Thermoproteous‫هستند‬.
SIRV virus: rod virus of Sulfolobus islandicus( :Fig 9)
The AFV virus: filamentous virus of Acidianus sp.( :Fig 10)
The SIFV: Sulfolobus islandicus filamentous virus( :Fig 11)
Figure 7: Salterprovirus (His- viruses)
Figure 8
Figure 9
Figure 01

4. 4
TTV virus: Thermoproteus tenax linear virus( :Figure 12)
(The Spherical viruses)-‫کروی‬ ‫های‬ ‫ویروس‬ ‫آرکی‬
PSV virus: Pyrobaculum spherical virus:(Figure 13)
STIV virus: Sulfolobus turreted icosahedral virus:(Figure 14)
SH1 virus: spherical virus of Haloarcula hispanica( :Figure 15)
The Head-tail viruses))
‫سر‬ ‫دارای‬ ‫و‬ ‫انولوپ‬ ‫پوشش‬ ‫بدون‬ ‫های‬ ‫ویروس‬ ‫آرکی‬ ‫شامل‬ ‫گروه‬ ‫این‬02‫هستند‬ ‫مارپیچی‬ ‫دم‬ ‫و‬ ‫وجهی‬.‫ویروس‬
‫های‬ ‫میزبان‬ ‫کننده‬ ‫آلوده‬ ‫همگی‬ ‫گروه‬ ‫این‬ ‫های‬‫هالوفیل‬‫یا‬‫متانوژن‬‫هستند‬ ‫آرکیوتا‬ ‫یوری‬ ‫فرمانروای‬ ‫از‬.‫از‬ ‫همچنین‬
‫دارند‬ ‫متفاوت‬ ‫ژنومی‬ ‫محتویات‬ ‫ولی‬ ‫هستند‬ ‫باکتریوفاژ‬ ‫به‬ ‫شبیه‬ ‫بسیار‬ ‫شکلی‬ ‫نظر‬.(Figure 15)
Figure 00
Figure 02
Figure 03: (Left) Intact virions; arrows indicate spherical virus PSV.
(Right) Partially disrupted virions extruding disordered nucleoprotein core.
The bars represent 100 nm.
Figure 04
Figure 05

5. 5
‫سر‬ ‫های‬ ‫ویروس‬ ‫آرکی‬ ‫باال‬ ‫جدول‬ ‫در‬-‫یا‬ ‫دمی‬head-tail‫اند‬ ‫شده‬ ‫لیست‬ ‫ها‬ ‫آرکی‬ ‫یوری‬ ‫به‬ ‫مختص‬.
‫ی‬ ‫چرخه‬ ‫در‬ ‫تکاملی‬ ‫مسیرهای‬ ‫ایجاد‬ ‫به‬ ‫منجر‬ ‫کنند‬ ‫می‬ ‫زیست‬ ‫میزبانهایشان‬ ‫و‬ ‫فاژها‬ ‫آن‬ ‫در‬ ‫که‬ ‫محیطی‬
‫گردد‬ ‫می‬ ‫ژنی‬ ‫محتوای‬ ‫و‬ ‫زندگی‬.‫سبک‬ ‫انواع‬ ‫تنها‬ ‫نه‬ ‫ویروس‬ ‫آرکی‬‫را‬ ‫معتدل‬ ‫و‬ ‫لیزوژنیک‬ ،‫لیتیک‬‫در‬
‫گذارند‬ ‫می‬ ‫اثر‬ ‫نیز‬ ‫میزبان‬ ‫فنوتیپی‬ ‫و‬ ‫ژنوتیپی‬ ‫ساختار‬ ‫در‬ ‫بلکه‬ ‫دارند‬ ‫ها‬ ‫آرکی‬.
‫تقابل‬ ‫یا‬ ‫تعامل‬ ‫در‬ ‫ها‬ ‫ژن‬ ‫کدام‬ ‫دهند‬ ‫می‬ ‫نشان‬ ‫متاژنومی‬ ‫اطالعات‬(phage-host interaction or
cooperation)‫کنند‬ ‫می‬ ‫عمل‬ ‫موثر‬ ‫کننده‬ ‫آلوده‬ ‫فاژ‬ ‫و‬ ‫میزبان‬ ‫بین‬.
‫درک‬ ‫با‬‫باکتریایی‬ ‫های‬ ‫پاتوژن‬ ‫کنترل‬ ‫در‬ ‫درمانی‬ ‫عوامل‬ ‫عنوان‬ ‫به‬ ‫فاژها‬ ‫از‬ ‫میتوان‬ ‫روابط‬ ‫این‬ ‫بیشتر‬
‫نمود‬ ‫استفاده‬.
‫اکتشاف‬‫های‬‫هیجان‬‫انگیز‬‫از‬‫زیست‬‫شناسی‬‫جدید‬‫را‬‫می‬‫توان‬‫توسط‬‫عالقه‬‫مندان‬‫به‬‫علم‬‫انتظار‬‫داشت‬.
Figure 05: Electron micrographs of head-tail viruses of
archaea and bacteria.
a | The haloarchaeal virus φH1.
b | The bacteriophage P2.