Este documento proporciona una guía de uso avanzado de PubMed. Explica las funciones básicas de PubMed como la búsqueda simple y con límites. También describe la búsqueda avanzada utilizando campos específicos como autores, revistas o descriptores MeSH. Además, explica las funciones de My NCBI como guardar búsquedas y colecciones de artículos. Por último, menciona otras funciones como enlaces permanentes a artículos o agregadores RSS.
1. Guía de uso avanzado
Duración del tutorial: 30’
22/11/2010
2. ¿Qué es?
● PUBMED permite el acceso gratuito a bases de
dades bibliográficas de ciencias de la salud como
MEDLINE, de la National Library of Medicine de
MEDLINE
los Estados Unidos.
● MEDLINE está formado por unos 17 millones de
referencias de artículos de revistas publicadas
desde 1948 hasta la actualidad, el 92% en inglés.
● My NCBI Permite personalizar el uso de PUBMED
grabando perfiles de interés y agregar alertas a
nuestro correo-e para seguir temas actuales.
4. Autocompletado
Cuando escribimos en el cuadro de
búsqueda el sistema nos sugiere
múltiples propostas de autoescritura.
Elegimos la que más se ajusta con el
puntero.
5. Búsqueda simple de un tema / 1
Introducimos el térrmino o la frase en el cuadro de búsqueda y
presionamos SEARCH
6. Búsqueda simple de un tema / 2
PubMed traducirá de forma automática nuestro planteamiento en los
descriptores por los cuales se indizaría formalmente el artículo y en
otras etiquetas, en todos los sinónimos asociados (Entry term
mappings), los autores, los títulos de las revistas, etc.
7. Búsqueda simple de un tema / 3
El botón URL nos permite generar un
localizador de internet para poder guardarlo y
reproducir una búsqueda idéntica en el futuro:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=%28%22silicosis%22[MeSH%20Terms]%20OR
%20%22silicosis%22[All%20Fields]%29%20AND%20%28%22lung%20neoplasms%22[MeSH%20Terms]
%20OR%20%28%22lung%22[All%20Fields]%20AND%20%22neoplasms%22[All%20Fields]%29%20OR
%20%22lung%20neoplasms%22[All%20Fields]%20OR%20%28%22lung%22[All%20Fields]%20AND
%20%22cancer%22[All%20Fields]%29%20OR%20%22lung%20cancer%22[All%20Fields]
%29&cmd=DetailsSearch
8. Búsqueda simple de un tema / 4
Podemos usar operadores lógicos (AND, OR, NOT), en
mayúscules siempre, para orientar la búsqueda:
percutaneous transluminal angioplasty AND (renal OR kidney)
9. Búsqueda con límites / 1
PubMed prevé la
búsqueda de artículos
usando límites que son
muy habituales.
10. Búsqueda con límites / 2
La búsqueda de artículos
puede limitarse a un
género, una lengua, una
franja de edat, un sector
de publicaciones, una
especie, etc.
En esta búsqueda con
límites buscamos el
término gonarthrosis en
las revistas Core (son
120 revistas del total,
unas 5.500)
12. Campos de Pubmed
Los registros de Pubmed están formados por
unos campos característicos que son
directamente interrogables.
Campos
característicos
de PubMed
13. Búsqueda avanzada
• Búsqueda por autores, revistas,
etc. (campos concretos)
concretos
• Búsqueda a través de los
descriptores MeSH (Medical
Me
Subject Headings)
14. Search Builder / 1
En la ventana de Search builder
podemos obtener con el
desplegable todos los nombres
de los campos y consultar el
Index de cada campo.
15. Search Builder / 2
El Index se abre por la palabra o
frase más aproximada a la frase
que escribimos en el Search
Builder
16. Search Builder / 3
Tal y como vamos encontrando etiquetas con el Search
Builder y el índice las podemos ir incorporando con el
botón en la ventana de búsqueda
(Search Box), donde se combinan:
18. Medical Subject Headings (MeSH) / 1
Me MeSH
Una búsqueda a través de los descriptores MeSH
nos permite capturar información de manera:
b) más consistente,
c) más metódica; y,
d) más rigurosa.
19. Medical Subject Headings (MeSH) / 2
Me MeSH
1) Introducimos el término pathologic fracture en el
cuadro de interrogación,
2) MeSH traduce automáticamente pathologic fracture
al descriptor Fractures, spontaneous,
3) Nos permite limitar la búsqueda p.e. a los artícules
enfocados en la rehabilitación, i
4) Ambos elementos se combinan en el menú
desplegable por la opción “Search Box with AND”
23. Visualización de resultats / 2
El Hospital está
subscrito
Se obtiene el
texto
completo
clicando el
logo del
Hospital
24. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?holding=ieshvadhlib
Este enlace para acceder a
Pubmed nos identifica como
usuarios de la Biblioteca.
Biblioteca
Cuando vemos un registro de
Pubmed nos indica si tenemos
acceso mostrando el logo del
Hospital.
27. ¿Qué es My NCBI?
NCBI
El instrumento My NCBI en
PubMed permite registrarse y
así retener la información
recogida por un usuario y sus
preferencias.
28. Registro en My NCBI
Podemos abrir gratuitamente una cuenta en
My NCBI o bien usar p.e. la de Google o
Gmail
29. Función Collections / 1
Cuando queremos guardar un conjunto de
registros bibliográficos en PubMed podemos
hacerlo con la función Clipboard, que solo nos deja
retener hasta 500 registros i solo se conservan si
no estamos inactivos 8 horas seguidas.
La función Collections es por el contrario para
usuarios que se han registrado a My NCBI y
permite conservar hasta 5000 registros
indefinidamente, y además compartirlos.
30. Función Collections / 2
Podemos compartir una colección de
registros configurándola como “pública” y
proporcionando la URL o enlace directo a
colaboradores nuestros.
31. Función Save search / 1
Tener una cuenta en My NCBI también nos permite
grabar una búsqueda (su estrategia) para poderla
ejecutar en el futuro.
32. Función Save search / 2
La función Save Search genera un
formulario donde podemos inscribir
nuestras preferencias para recibir
continuadamente los resultados que se
vayan incorporando a PubMed sobre
nuestro tema en un correu-e personal.
33. Función My Bibliography /1
Por último, otra función de My NCBI útil es My
Bibliography, diseñada específicamente para
Bibliography
guardar registros de un autor y editarlos en listas
36. Podemos capturar los resultados de la búsqueda,
sea a partir de la lista total, sea haciendo una
selección de la lista marcando los botones de
selección
37. Cuando enviamos registros a una dirección
de correu-e no podemos enviar más de
200 registros por mensaje, pero se pueden
enviar fraccionados.
39. Podemos importar un archivo extraído de Pubmed
Con el registro o registros seleccionados desplegamos
SEND TO, escogemos la opción FILE y el formato MEDLINE
TO
40. Desde el submenú IMPORT REFERENCES de EndNoteWeb
podemos subir el archivo generado por la búsqueda
anterior (pubmed_result.txt) aplicando el filtre PUBMED
(NLM)
44. El icono de documento en la barra de las direcciones nos
indica que Zotero ha detectado los “metadatos” de un
artículo en Pubmed
45. 3
2
• Abrimos Zotero activando su botón en la barra.
• En la columna izquierda activamos la carpeta donde queremos grabar un registro.
• Clicamos el icono que aparece en la barra de direcciones para incorporarlo. 1
48. Enlace permanente a un artículo
Una forma de crear un enlace permanente a un
registro es con un URL que contenga la expresión
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ y el número
PMID. P.e.:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19010894
49. Función Images
En octubre de 2010
PubMed ha incorporado
imágenes en los
artículos que pertenecen
a las publicaciones de
Pubmed Central, de libre
acceso
50. Agregadores RSS
PubMed ofrece diversos canales RSS para obtener
fácilmente informació continuada sobre un tema, etc.
Más información en la
Guía de uso de RSS