Ada perbedaan antara Windows dan Linux dalam hal sistem file, dukungan perangkat keras, dan lisensi produk. Linux tidak membedakan drive seperti Windows dan lebih sensitif terhadap huruf besar kecil. Dukungan perangkat keras Linux kadang masih terbatas karena kurangnya driver. Perbedaan lisensi terletak pada Windows berbayar sedangkan Linux gratis.

2. Perbedaan windows dan linux dapat dilihat dari
berbagai segi seperti kelengkapan program,
program aplikasi, konfigurasi sistem,dukungan
perangkat keras, sistem
file, sistem distribusi dan sebagainya

3. Pada sistem operasi Windows anda akan menemukan
pembedaan antara drive A dan B, sedangkan jika
anda masuk pada sistem Linux maka tidak mengenal
pembedaan tersebut sehingga drive A atau B akan hilang.
Selain itu Linux tidak mengeja alphabet dari A hingga Z,
tetapi Linux mengenali komputer dari sistem direktori.

4. Linux
mempunyai sifat case-sensitive, yang berarti huruf besar dan
huruf kecil mempunyai arti yang berbeda. Dukungan perangkat
keras pada Windows sangat mudah, sedangkan pada Linux
terkadang masih ditemukan suatu hardware yang
tidak dapat bekerja secara optimal.
Hal ini terjadi karena perusahaan
pembuat hardware tersebut tidak
menyediakan driver untuk Linux. Perbedaan antara windows
dan linux yang lainnya ialah mengenai
lisensi produk.

5. Pada sistem operasi
Windows memiliki lisensi yang harus dibayar oleh para
penggunanya.
Sementara pada sistem operasi Linux
dan program aplikasi pendukung lainnya berlisensi
gratis.

6. Jenis Aplikasi/ Utility/ layanan yang dibandingkan antara SO
windows & linux

7. Gratisan vs Beli
Sudah sama-sama diketahui, Windows (yang genuine alias asli
tentunya) bisa dimiliki dengan cara dibeli. Anda bisa saja sih
pakai Windows bajakan tapi sudah pasti akan kehilangan
beberapa fasilitasnya. Dan yang pasti, siap-siap kena jika
sewaktu-waktu ada razia. Ini berbeda dengan Linux yang opensource, artinya bisa dipakai tanpa harus bayar. Kalaupun bayar,
paling-paling hanya biaya untuk mengganti kopi CD-nya. Enak
kan?

8. Sekuritas, Virus, dan Spyware
Salah satu masalah utama di Windows yang paling sering Anda
temukan adalah virus dan spyware. Dari tahun ke tahun
permasalahan ini bukan semakin mengecil tetapi malah
semakin membesar. Ini semua terjadi karena banyak lubang
keamanan di Windows yang bisa dieksploitasi oleh orang-orang
yang tidak bertanggungjawab. Karena terlalu banyaknya
masalah keamanan di Windows, tidak mengherankan ketika
kemudian justru muncul olokan untuk nama Windows
Vista, yang dipanjangkan menjadi Virus, Spyware, Trojan dan
Adware

9. Sedangkan Linux diturunkan dari sistem operasi Unix
yang memiliki tingkat sekuriti lebih kuat. Itu sebabnya
tidak ada banyak virus di Linux dan kalaupun ada tidak
bisa berkembang biak dengan pesat dan biasanya
tidak mampu membawa kerusakan yang besar.