SlideShare a Scribd company logo
1.1Генные мутации
В зависимости от величины структурных изменений в генах и хромосомах мутации
делятся на несколько типов. В разделе 3.2. был введен простейший тип мутаций -
точечная мутация, которая в общем случае q-битовых аллелей e iq ( ) осуществляется в
пределах одного гена, когда аллель, находящаяся в соответствующем локусе
"родительского" генотипа, случайным образом подвергается изменению в одном из q
битов генетической информации. В результате точечной мутации "мутанту" передается
генотип "родителя", в котором один из генов содержит новую "слегка искаженную" аллель
(рис. 4.1).
ген 1 ген 2 ген 3 ген 4
“Родительский” генотип E( ak
t
): 0 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 1
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
Генотип “мутант” E( ml
t
): 0 1 1 0 0 0 1 1 1 0 1 1
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
локус 1 локус 2 локус 3 локус 4
Рис. 4.1. Точечная мутация в пятом бите гена 2 изменяет аллель этого
гена в генотипе "мутанта", оставляя гены 1, 3 и 4 без изменений
Одну из схем воспроизводства из родительской" гаметы E( ) мутанта с
помощью точечной мутации можно представить в виде следующей
процедуры:
1.
2. В генотипе случайным образом с вероятностью (1/n) определяется j-
ый ген (jÎ[1,n]), в котором аллель "родительского" гена будет подвержена
мутации.
3. Для выбранного гена случайным образом с вероятностью (1/q) в j-м
локусе выбирается i-ый бит, в котором должна произойти точечная мутация.
4. В i-м бите j-ого локуса генотипа двоичное число bi принимает
противоположное значение (0 заменяется на 1 или 1 заменяется на 0).
Генотип "мутанта" сформирован.
Более глубокие изменения генной информации происходят в результате
генной мутации, когда в i-м гене "родительского" генотипа E( ) аллель,
находящаяся в i-м локусе, полностью заменяется новой аллельной формой
(рис.6.2).
ген 1 ген 2 ген 3 ген 4
“Родительский” генотип E( ak
t
): 0 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 1
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
Генотип “мутант” E( ml
t
): 0 1 1 0 0 0 1 1 1 0 1 1
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
локус 1 локус 2 локус 3 локус 4
Рис. 4.2. Генная мутация во 2 гене изменяет аллель этого гена в
генотипе "мутанта", оставляя гены 1, 3 и 4 без изменений
Очевидно, что новые аллели должны принадлежать генофонду гена,
подвергающегося мутации, и, как правило, отличаются от аллельных форм,
уже имеющихся в хромосомном наборе популяции Pt
для соответствующего
локуса.
Очевидно, что новые аллели должны принадлежать генофонду гена,
подвергающегося мутации, и, как правило, отличаются от аллельных форм,
уже имеющихся в хромосомном наборе популяции Pt для соответствующего
локуса.
Одна из схем реализации генной мутации в "родительском" генотипе E(
ak
t
) может быть представлена следующим образом:
1. E m E at
k
t
( ): ( ).1 
2. В генотипе E mt
( )1 случайным образом с вероятностью (1/n)
определяется j-ый ген (j Î[1,n]), в котором аллель "родительского" гена будет
подвержена мутации.
3. Из генофонда j-ого гена Г(j) исключаются все аллели хромосомного
набора популяции Pt, находящиеся в j-м локусе:
Г ( j ) := Г ( j ){ ( ),..., ( )}.e j e jq q
1
4. Если Г(j): = Æ, то Г(j):= { ( ),..., ( )} { ( )}.e j e j e jk
q q

q
1
.
5. Случайным образом с вероятностью (1/êГ(j)ê) из множества аллелей
Г(j) выбирается альтернативный аллель e j e j jq q( )[ ( ) ( )]Î  .
6. В j-м локусе генотипа E mt
( )1 аллель "родительского" генотипа e jk
q ( )
заменяется новой аллельной формой e jq ( ) .
Генотип "мутанта" E mt
1 1( ) сформирован.
Для задачи оптимального разбиения графа G на два подграфа G1и G2
порядка n1 и n2, соответственно, точечная и генная мутации совпадают, т.к.
локусы для каждого гена содержат по одному биту (q=1). С другой стороны, к
формируемым генотипам E(ak
t
) предъявляется требование, чтобы число "I" в
них равнялось порядку n1подграфа G1. В связи с этим генная мутация для
рассматриваемого случая сводится к изменению аллельных форм в двух
случайно выбранных генах "родительского" генотипа E( ak
t
): в одном гене
аллель, равная “I" заменяется "0", а в другом гене аллель, равная "0"
заменяется на "1".
Схема, реализующая генную мутацию генотипа E( ak
t
), который
характеризует допустимое дихотомическое разбиение (X1, X2 ), имеет
следующий вид:
1. E m E at
k
t
( ): ( ).1 
2. По генотипу E mt
( )1 образуется список номеров локусов I1 ,
содержащих "I", и список номеров локусов I0, содержащих "0".
3. Случайным образом с вероятностью (1/½ I1½) выбирается номер
локуса iÎI1 , который будет подвержен генной мутации.
4. Случайным образом с вероятностью (1/êI 0 ê) выбирается номер
локуса j ÎI , который будет подвержен генной мутации.
5. Аллель "1", находящаяся в i-м локусе генотипа E mt
( )1 заменяется "0",
а аллель "0", находящаяся в j-м локусе генотипа E mt
( )1 заменяется "1".
Генотип "мутанта" E mt
( )1 сформирован.
Рассмотренный алгоритм генной мутации описывает операцию
однократного обмена вершинами между подмножествами X1 и X2 , которая
заключается в том, что только одна вершина xiÎ X1 перемещается на другую
сторону разреза в часть X2, вместо вершины vjÎX2, которая, в свою очередь,
перемещается в часть X1 :
X1
'
= [X1{xi}] È {vj}; (6.1)
X2
'
= [X2{vj}] È {xi}.
Пример 6.1.
Пусть "родительский" генотип E( ak
t
) задает дихотомическое
распределение
X1 = {x1, x3, x4, x10, x12} , X2 = {x2, x5, x6, x7, x8, x9, x11} :
* *
"Родительский" генотип E(ak
t
):
1 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 1
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
Для случайно выбранных генов 2 и 12, отмеченных звездочкой, генная
мутация позволяет воспроизвести "мутанта" mt
1 с генотипом E mt
( )1
следующего вида:
Генотип "мутанта" E mt
( )1 : 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 (25)
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12

More Related Content

Viewers also liked

431
431431
408
408408
253
253253
Tp 4 base de datos a
Tp 4 base de datos aTp 4 base de datos a
Tp 4 base de datos a
Laura Mabel Cristaldo
 
679
679679
676
676676
Ventajas y desventajas de las redes sociales
Ventajas y desventajas de las redes socialesVentajas y desventajas de las redes sociales
Ventajas y desventajas de las redes sociales
tatikahuertas
 
229
229229
232
232232
Mongolia Strategic Trade Industry Outreach Seminar
Mongolia Strategic Trade Industry Outreach SeminarMongolia Strategic Trade Industry Outreach Seminar
Mongolia Strategic Trade Industry Outreach Seminar
The Business Council of Mongolia
 
กก1
กก1กก1
685
685685
278
278278
335
335335
337
337337
438
438438
презентація 4
презентація 4презентація 4
презентація 4
Alena2016
 

Viewers also liked (17)

431
431431
431
 
408
408408
408
 
253
253253
253
 
Tp 4 base de datos a
Tp 4 base de datos aTp 4 base de datos a
Tp 4 base de datos a
 
679
679679
679
 
676
676676
676
 
Ventajas y desventajas de las redes sociales
Ventajas y desventajas de las redes socialesVentajas y desventajas de las redes sociales
Ventajas y desventajas de las redes sociales
 
229
229229
229
 
232
232232
232
 
Mongolia Strategic Trade Industry Outreach Seminar
Mongolia Strategic Trade Industry Outreach SeminarMongolia Strategic Trade Industry Outreach Seminar
Mongolia Strategic Trade Industry Outreach Seminar
 
กก1
กก1กก1
กก1
 
685
685685
685
 
278
278278
278
 
335
335335
335
 
337
337337
337
 
438
438438
438
 
презентація 4
презентація 4презентація 4
презентація 4
 

488

  • 1. 1.1Генные мутации В зависимости от величины структурных изменений в генах и хромосомах мутации делятся на несколько типов. В разделе 3.2. был введен простейший тип мутаций - точечная мутация, которая в общем случае q-битовых аллелей e iq ( ) осуществляется в пределах одного гена, когда аллель, находящаяся в соответствующем локусе "родительского" генотипа, случайным образом подвергается изменению в одном из q битов генетической информации. В результате точечной мутации "мутанту" передается генотип "родителя", в котором один из генов содержит новую "слегка искаженную" аллель (рис. 4.1). ген 1 ген 2 ген 3 ген 4 “Родительский” генотип E( ak t ): 0 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 1 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 Генотип “мутант” E( ml t ): 0 1 1 0 0 0 1 1 1 0 1 1 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 локус 1 локус 2 локус 3 локус 4 Рис. 4.1. Точечная мутация в пятом бите гена 2 изменяет аллель этого гена в генотипе "мутанта", оставляя гены 1, 3 и 4 без изменений Одну из схем воспроизводства из родительской" гаметы E( ) мутанта с помощью точечной мутации можно представить в виде следующей процедуры: 1. 2. В генотипе случайным образом с вероятностью (1/n) определяется j- ый ген (jÎ[1,n]), в котором аллель "родительского" гена будет подвержена мутации. 3. Для выбранного гена случайным образом с вероятностью (1/q) в j-м локусе выбирается i-ый бит, в котором должна произойти точечная мутация. 4. В i-м бите j-ого локуса генотипа двоичное число bi принимает противоположное значение (0 заменяется на 1 или 1 заменяется на 0).
  • 2. Генотип "мутанта" сформирован. Более глубокие изменения генной информации происходят в результате генной мутации, когда в i-м гене "родительского" генотипа E( ) аллель, находящаяся в i-м локусе, полностью заменяется новой аллельной формой (рис.6.2). ген 1 ген 2 ген 3 ген 4 “Родительский” генотип E( ak t ): 0 1 1 0 1 0 1 1 1 0 1 1 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 Генотип “мутант” E( ml t ): 0 1 1 0 0 0 1 1 1 0 1 1 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 локус 1 локус 2 локус 3 локус 4 Рис. 4.2. Генная мутация во 2 гене изменяет аллель этого гена в генотипе "мутанта", оставляя гены 1, 3 и 4 без изменений Очевидно, что новые аллели должны принадлежать генофонду гена, подвергающегося мутации, и, как правило, отличаются от аллельных форм, уже имеющихся в хромосомном наборе популяции Pt для соответствующего локуса. Очевидно, что новые аллели должны принадлежать генофонду гена, подвергающегося мутации, и, как правило, отличаются от аллельных форм, уже имеющихся в хромосомном наборе популяции Pt для соответствующего локуса. Одна из схем реализации генной мутации в "родительском" генотипе E( ak t ) может быть представлена следующим образом: 1. E m E at k t ( ): ( ).1 
  • 3. 2. В генотипе E mt ( )1 случайным образом с вероятностью (1/n) определяется j-ый ген (j Î[1,n]), в котором аллель "родительского" гена будет подвержена мутации. 3. Из генофонда j-ого гена Г(j) исключаются все аллели хромосомного набора популяции Pt, находящиеся в j-м локусе: Г ( j ) := Г ( j ){ ( ),..., ( )}.e j e jq q 1 4. Если Г(j): = Æ, то Г(j):= { ( ),..., ( )} { ( )}.e j e j e jk q q  q 1 . 5. Случайным образом с вероятностью (1/êГ(j)ê) из множества аллелей Г(j) выбирается альтернативный аллель e j e j jq q( )[ ( ) ( )]Î  . 6. В j-м локусе генотипа E mt ( )1 аллель "родительского" генотипа e jk q ( ) заменяется новой аллельной формой e jq ( ) . Генотип "мутанта" E mt 1 1( ) сформирован. Для задачи оптимального разбиения графа G на два подграфа G1и G2 порядка n1 и n2, соответственно, точечная и генная мутации совпадают, т.к. локусы для каждого гена содержат по одному биту (q=1). С другой стороны, к формируемым генотипам E(ak t ) предъявляется требование, чтобы число "I" в них равнялось порядку n1подграфа G1. В связи с этим генная мутация для рассматриваемого случая сводится к изменению аллельных форм в двух случайно выбранных генах "родительского" генотипа E( ak t ): в одном гене аллель, равная “I" заменяется "0", а в другом гене аллель, равная "0" заменяется на "1". Схема, реализующая генную мутацию генотипа E( ak t ), который характеризует допустимое дихотомическое разбиение (X1, X2 ), имеет следующий вид: 1. E m E at k t ( ): ( ).1  2. По генотипу E mt ( )1 образуется список номеров локусов I1 , содержащих "I", и список номеров локусов I0, содержащих "0". 3. Случайным образом с вероятностью (1/½ I1½) выбирается номер локуса iÎI1 , который будет подвержен генной мутации.
  • 4. 4. Случайным образом с вероятностью (1/êI 0 ê) выбирается номер локуса j ÎI , который будет подвержен генной мутации. 5. Аллель "1", находящаяся в i-м локусе генотипа E mt ( )1 заменяется "0", а аллель "0", находящаяся в j-м локусе генотипа E mt ( )1 заменяется "1". Генотип "мутанта" E mt ( )1 сформирован. Рассмотренный алгоритм генной мутации описывает операцию однократного обмена вершинами между подмножествами X1 и X2 , которая заключается в том, что только одна вершина xiÎ X1 перемещается на другую сторону разреза в часть X2, вместо вершины vjÎX2, которая, в свою очередь, перемещается в часть X1 : X1 ' = [X1{xi}] È {vj}; (6.1) X2 ' = [X2{vj}] È {xi}. Пример 6.1. Пусть "родительский" генотип E( ak t ) задает дихотомическое распределение X1 = {x1, x3, x4, x10, x12} , X2 = {x2, x5, x6, x7, x8, x9, x11} : * * "Родительский" генотип E(ak t ): 1 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 1 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 Для случайно выбранных генов 2 и 12, отмеченных звездочкой, генная мутация позволяет воспроизвести "мутанта" mt 1 с генотипом E mt ( )1 следующего вида: Генотип "мутанта" E mt ( )1 : 1 1 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 (25) 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12