La microbiología estudia los microorganismos como bacterias, virus y hongos. Pasteur fue pionero en demostrar la teoría de la generación espontánea y desarrollar vacunas. Los microorganismos se cultivan en medios adecuados y se identifican usando microscopía y técnicas bioquímicas y moleculares. Juegan un papel clave en ciclos biogeoquímicos y son tanto benéficos como patógenos para la salud.