2. Guerras civiles dentro de la Colonia Una vez terminadas las guerras de conquista hubo en frentamientos entre los conquistadores, Francisco Pizarro peleó con Diego de Almagro por el control del Cuzco y el Perú. Almagro fue derrotado y ejecutado su hijo empezo una revuelta, asesinó a Pizarro y tomó el poder. Ademas de esto habia un conflicto el querer dirigir las tierras conquistadas con autonomia, pero la Corona queria tener la autoridad directa del continente, Gonzalo Pizarro agrupo colonos y derroto al Virrey Vaca de Castro en Quito.
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4. Organización Administrativa Para afirmar las tierras los conquistadores fundaron villas o ciudades, asi surgieron Quito(1534), Portoviejo y Guayaquil(1535), Popayán y Cali(1536), Pasto(1539),Loja(1548), Zaruma , etc. Para la administración legal y politica en 1563 se creó la Real Audiencia de Quito como parte del vierreinato del Perú con un presidente que fue el licenciado Hernando de Santillán que se posesiono en 1564. En este periodo (1569-1581), se realizaron fundamentales reformas administrativas y fiscales, que fortalecieron el poder colonial en todo el virreinato y la Real Audiencia de Quito.
