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La génétique de la
tolérance à la
chaleur des bovins
Aurélie VINET, S. Mattalia,R. Vallée, S. Aguerre, J. promp
B. Cuyabano, D. Boichard
13 octobre 2022
CAICalor
Contexte
Evolution du climat :
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Fréq des évènements climatiques extrêmes
Pour les bovins, l’exposition à des
températures +++ :
Production
Santé
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© L. DELABY (INRAE)
Contexte
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Températures
Fréq des évènements climatiques extrêmes
Pour les bovins, l’exposition à des
températures +++ :
Production
Santé
Reproduction
Bien-être
Identification d’animaux
tolérants à la chaleur au
sein des races à fort
potentiel de production
utile à long terme
© L. DELABY (INRAE)
Objectifs
Au niveau populationnel
Impact d’un stress de chaleur sur les
performances des vaches laitières de race
Montbéliarde élevées en France
Au niveau individuel
Interactions Génotype x Environnement
environnement = gradient météorologique
1.
© C. MAITRE (INRAE)
2.
Température et humidité
quotidiennes estimées sur une
grille de 9892 carrés de 8x8km
THI= 1.8×T+32 −(0.55−0.0055×HR)×(1.8×T−26)
THI_3j = THI moyen sur une période de 3 jours (2
jours avant le jour de contrôle + le jour de contrôle)
Correspondance avec le code postal de chaque ferme
(AGROCLIM,
INRAE)
Performances de contrôles élémentaires (2016-2020)
 Quantité de lait (Lait)
 Quantités et taux de matières grasses et
protéiques (MG, MP, TB, TP)
 Score de cellules somatiques (SCS)
1ères et 2èmes lactations analysées séparément
Jeu de données complet
Météo
Production
Données
5 Tolérance à la 13 octobre 2022
© D. BOICHARD (INRAE)
Données
THI = 70  22-24°C
70
Distribution des THI moyens sur la période
des 3 jours précédents le jour de contrôle
THI_3j
Nb
d’observations
Rang de
lactation
Humidité
relative
(%)
THI_3j
Température moyenne
(Celsius)
Environ 450 000 contrôles
élémentaires et 55 000
vaches par rang de lactation
6 Tolérance à la 13 octobre 2022
Objectifs
Au niveau populationnel
Impact d’un stress de chaleur sur les
performances des vaches laitières de race
Montbéliarde élevées en France
Au niveau individuel
Interactions Génotype x Environnement
environnement = gradient météorologique
1.
© C. MAITRE (INRAE)
2.
Niveau pop : modèle statistique
𝑦ℎ𝑗𝑘𝑙𝑚𝑛𝑖𝑝 = TAh + STLACj + AGE_VELk + GESTl + SAIS_VELm + 𝐓𝐇𝐈𝐧 + 𝒈𝒊 + 𝒑𝒆𝒑 + 𝑒ℎ𝑗𝑘𝑙𝑚𝑛𝑖𝑝
Le THI est considéré comme un effet fixe
Effet estimé = Effet moyen du THI sur les performances de toutes les femelles
8 Tolérance à la 13 octobre 2022
Niveau pop : résultats - LAIT
Quantité
de
lait
(kg/j)
1ère lactation 2ème lactation
THI_3J
9 Tolérance à la 13 octobre 2022
Niveau pop : résultats - LAIT
Quantité
de
lait
(kg/j)
THI_3J
1ère lactation 2ème lactation
Quantité de lait :
Stress de chaleur
Stress de froid de moindre
intensité
THI optimal : 47-55 (5 à 13°C)
THI optimal
10 Tolérance à la 13 octobre 2022
Niveau pop : résultats - MG et MP
Quantité
de
MG
(g/j)
THI_3J
Quantité
de
MP
(g/j)
THI_3J
Quantités de matières : stress de chaleur à partir de THI 50-55
1ère lactation 2ème lactation
11 Tolérance à la 13 octobre 2022
Niveau pop : résultats - TB et TP
1ère lactation 2ème lactation
TB
(‰)
THI_3J
TP
(‰)
THI_3J
Taux : optimum à THI faible (≤ 35)
Effet cumulé du THI sur la quantité de lait (stress de froid) et sur les quantités de matières (peu d’effet des THI < 50)
➯ à THI faible les MB et MP sont diluées dans une moins grande quantité de lait
12 Tolérance à la 13 octobre 2022
Niveau pop : résultats - Cellules
1ère lactation 2ème lactation
SCS
THI_3J
SCS :
Stress de chaleur uniquement
THI optimal ≤ 45 (≤ 7°C)
13 Tolérance à la 13 octobre 2022
Niveau pop : résultats
Le THI optimal varie entre caractères mais est toujours ≤ THI 55 ( 12 to
13°C)
Intra-caractère, un même optimum en 1ère et 2ème lactation
Une baisse de 5 à 14% des performances entre le THI optimal et THI>70
14 Tolérance à la 13 octobre 2022
Objectifs
Au niveau populationnel
Impact d’un stress de chaleur sur les
performances des vaches laitières de race
Montbéliarde élevées en France
Au niveau individuel
Interactions Génotype x Environnement
environnement = gradient météorologique
1.
© C. MAITRE (INRAE)
2.
Niveau individuel : modèle
Modèles avec régressions aléatoires
La valeur génétique n’est plus supposée constante, elle peut varier selon
l’environnement (THI)
➯ A chaque valeur de THI correspond un caractère différent
16 Tolérance à la 13 octobre 2022
Corrélations génétiques <1
pour le même phénotype
exprimé à différents THI
= interactions GxE
Niveau individuel : modèle
La valeur génétique est modélisée comme une combinaison de valeurs
génétiques pondérées par des covariables dépendantes du THI
17 Tolérance à la 13 octobre 2022
𝒈𝒊 𝑻𝑯𝑰 = 𝒈𝐢𝟎 + 𝑻𝑯𝑰 ∗ 𝒈𝒊𝟏 + 𝑻𝑯𝑰 𝟐
∗ 𝒈𝒊𝟐 + 𝑻𝑯𝑰 𝟑
∗ 𝒈𝒊𝟑
Niveau individuel : corrélations
génétiques
18 Tolérance à la 13 octobre 2022
Corrélations génétiques : MP en 1ère lactation
à différents THI (stade = 150 jours de lactation)
Quel que soit le caractère
:
Aucune correlation < 0,80
La plupart > 0,90
THI
THI
Corrélations génétiques
Niveau individuel : corrélations
génétiques
19 Tolérance à la 13 octobre 2022
Corrélations génétiques : MP en 1ère lactation
à différents THI (stade = 150 jours de lactation)
Quel que soit le caractère
:
Aucune correlation < 0,80
La plupart > 0,90
Pas (peu)
d’interaction GxE
identifiées avec ces
données
THI
THI
Corrélations génétiques
Niveau individuel : valeurs génétiques
De manière générale, intra-caractère, les
meilleurs taureaux sont toujours les
mêmes
Quelques reclassements et de la
variabilité dans les pentes à un THI
donné
Certains taureaux semblent plus
tolérants au stress de chaleur
VG
centrées
/
moy
VG
des
femelles
avec
perf
Trajectoires des valeurs génétiques : MP en 1ère
lactation (taureaux avec au moins 500 filles avec perf, à 150j
lact)
THI
taureau
20 Tolérance à la 13 octobre 2022
Niveau individuel : valeurs génétiques
De manière générale, intra-caractère, les
meilleurs taureaux sont toujours les
mêmes
Quelques reclassements et de la
variabilité dans les pentes à un THI
donné
Certains taureaux semblent plus
tolérants au stress de chaleur
VG
centrées
/
moy
VG
des
femelles
avec
perf
Trajectoires des valeurs génétiques : MP en 1ère
lactation (taureaux avec au moins 500 filles avec perf, à 150j
lact)
THI
taureau
21 Tolérance à la 13 octobre 2022
VG indiquent le classement entre
animaux à un THI donné, pas la
prédiction de production
Toutes les familles voient leur
production diminuer lorsque le
THI augmente
Niveau individuel : valeurs génétiques
VG
centrées
/
moy
VG
des
femelles
avec
perf
Trajectoires des valeurs génétiques : MP en 1ère
lactation (taureaux avec au moins 500 filles avec perf, à 150j
lact)
THI
taureau
MP
prédite
(g/d)
taureau
THI
MP en 1ère lactation : production prédite
production moyenne à chaque THI + VG au THI et 150j
lact)
22 Tolérance à la 13 octobre 2022
23 Tolérance à la 13 octobre 2022
Niveau individuel : pentes à THI élevé
Corrélations Génétiques entre
pente à THI 70 et VG à THI 50 (150j de
lactation)
24 Tolérance à la 13 octobre 2022
Niveau individuel : pentes à THI élevé
Corrélations Génétiques entre
pente à THI 70 et VG à THI 50 (150j de
lactation)
Pour tous les caractères de production
:
Corrélations génétiques défavorables
= VG élevées à THI modéré  pentes
négatives (↘ VG) à THI élevé
Pour SCS :
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moyen sont encore plus sensibles à
THI élevé
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En résumé (1/2)
Au niveau populationnel
La température optimale pour les
Montbéliardes élevées en France est
actuellement ≤ 13°C pour les caractères de
production et le SCS
L’augmentation des températures va conduire à
une baisse des performances
1.
© C. MAITRE (INRAE)
En résumé (2/2)
Au niveau individuel
G x THI faibles mais trajectoires des valeurs
génétiques permettraient d’identifier des animaux
plus tolérants au stress de chaleur
Interprétation biologique de la pente ?
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la sensibilité aux mammites
La sélection pour la résistance aux mammites dans
les conditions actuelles est pertinente pour les
conditions futures, plus chaudes
2.
© C. MAITRE (INRAE)
Modifiez le style du titre
Des résultats similaires :
- en Holstein (pop et indiv)
- en Normande (pop)
© M. GABORIT (INRAE)
Merci
UMT e-Bis
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  • 1. La génétique de la tolérance à la chaleur des bovins Aurélie VINET, S. Mattalia,R. Vallée, S. Aguerre, J. promp B. Cuyabano, D. Boichard 13 octobre 2022 CAICalor
  • 2. Contexte Evolution du climat : Températures Fréq des évènements climatiques extrêmes Pour les bovins, l’exposition à des températures +++ : Production Santé Reproduction Bien-être © L. DELABY (INRAE)
  • 3. Contexte Evolution du climat : Températures Fréq des évènements climatiques extrêmes Pour les bovins, l’exposition à des températures +++ : Production Santé Reproduction Bien-être Identification d’animaux tolérants à la chaleur au sein des races à fort potentiel de production utile à long terme © L. DELABY (INRAE)
  • 4. Objectifs Au niveau populationnel Impact d’un stress de chaleur sur les performances des vaches laitières de race Montbéliarde élevées en France Au niveau individuel Interactions Génotype x Environnement environnement = gradient météorologique 1. © C. MAITRE (INRAE) 2.
  • 5. Température et humidité quotidiennes estimées sur une grille de 9892 carrés de 8x8km THI= 1.8×T+32 −(0.55−0.0055×HR)×(1.8×T−26) THI_3j = THI moyen sur une période de 3 jours (2 jours avant le jour de contrôle + le jour de contrôle) Correspondance avec le code postal de chaque ferme (AGROCLIM, INRAE) Performances de contrôles élémentaires (2016-2020)  Quantité de lait (Lait)  Quantités et taux de matières grasses et protéiques (MG, MP, TB, TP)  Score de cellules somatiques (SCS) 1ères et 2èmes lactations analysées séparément Jeu de données complet Météo Production Données 5 Tolérance à la 13 octobre 2022 © D. BOICHARD (INRAE)
  • 6. Données THI = 70  22-24°C 70 Distribution des THI moyens sur la période des 3 jours précédents le jour de contrôle THI_3j Nb d’observations Rang de lactation Humidité relative (%) THI_3j Température moyenne (Celsius) Environ 450 000 contrôles élémentaires et 55 000 vaches par rang de lactation 6 Tolérance à la 13 octobre 2022
  • 7. Objectifs Au niveau populationnel Impact d’un stress de chaleur sur les performances des vaches laitières de race Montbéliarde élevées en France Au niveau individuel Interactions Génotype x Environnement environnement = gradient météorologique 1. © C. MAITRE (INRAE) 2.
  • 8. Niveau pop : modèle statistique 𝑦ℎ𝑗𝑘𝑙𝑚𝑛𝑖𝑝 = TAh + STLACj + AGE_VELk + GESTl + SAIS_VELm + 𝐓𝐇𝐈𝐧 + 𝒈𝒊 + 𝒑𝒆𝒑 + 𝑒ℎ𝑗𝑘𝑙𝑚𝑛𝑖𝑝 Le THI est considéré comme un effet fixe Effet estimé = Effet moyen du THI sur les performances de toutes les femelles 8 Tolérance à la 13 octobre 2022
  • 9. Niveau pop : résultats - LAIT Quantité de lait (kg/j) 1ère lactation 2ème lactation THI_3J 9 Tolérance à la 13 octobre 2022
  • 10. Niveau pop : résultats - LAIT Quantité de lait (kg/j) THI_3J 1ère lactation 2ème lactation Quantité de lait : Stress de chaleur Stress de froid de moindre intensité THI optimal : 47-55 (5 à 13°C) THI optimal 10 Tolérance à la 13 octobre 2022
  • 11. Niveau pop : résultats - MG et MP Quantité de MG (g/j) THI_3J Quantité de MP (g/j) THI_3J Quantités de matières : stress de chaleur à partir de THI 50-55 1ère lactation 2ème lactation 11 Tolérance à la 13 octobre 2022
  • 12. Niveau pop : résultats - TB et TP 1ère lactation 2ème lactation TB (‰) THI_3J TP (‰) THI_3J Taux : optimum à THI faible (≤ 35) Effet cumulé du THI sur la quantité de lait (stress de froid) et sur les quantités de matières (peu d’effet des THI < 50) ➯ à THI faible les MB et MP sont diluées dans une moins grande quantité de lait 12 Tolérance à la 13 octobre 2022
  • 13. Niveau pop : résultats - Cellules 1ère lactation 2ème lactation SCS THI_3J SCS : Stress de chaleur uniquement THI optimal ≤ 45 (≤ 7°C) 13 Tolérance à la 13 octobre 2022
  • 14. Niveau pop : résultats Le THI optimal varie entre caractères mais est toujours ≤ THI 55 ( 12 to 13°C) Intra-caractère, un même optimum en 1ère et 2ème lactation Une baisse de 5 à 14% des performances entre le THI optimal et THI>70 14 Tolérance à la 13 octobre 2022
  • 15. Objectifs Au niveau populationnel Impact d’un stress de chaleur sur les performances des vaches laitières de race Montbéliarde élevées en France Au niveau individuel Interactions Génotype x Environnement environnement = gradient météorologique 1. © C. MAITRE (INRAE) 2.
  • 16. Niveau individuel : modèle Modèles avec régressions aléatoires La valeur génétique n’est plus supposée constante, elle peut varier selon l’environnement (THI) ➯ A chaque valeur de THI correspond un caractère différent 16 Tolérance à la 13 octobre 2022 Corrélations génétiques <1 pour le même phénotype exprimé à différents THI = interactions GxE
  • 17. Niveau individuel : modèle La valeur génétique est modélisée comme une combinaison de valeurs génétiques pondérées par des covariables dépendantes du THI 17 Tolérance à la 13 octobre 2022 𝒈𝒊 𝑻𝑯𝑰 = 𝒈𝐢𝟎 + 𝑻𝑯𝑰 ∗ 𝒈𝒊𝟏 + 𝑻𝑯𝑰 𝟐 ∗ 𝒈𝒊𝟐 + 𝑻𝑯𝑰 𝟑 ∗ 𝒈𝒊𝟑
  • 18. Niveau individuel : corrélations génétiques 18 Tolérance à la 13 octobre 2022 Corrélations génétiques : MP en 1ère lactation à différents THI (stade = 150 jours de lactation) Quel que soit le caractère : Aucune correlation < 0,80 La plupart > 0,90 THI THI Corrélations génétiques
  • 19. Niveau individuel : corrélations génétiques 19 Tolérance à la 13 octobre 2022 Corrélations génétiques : MP en 1ère lactation à différents THI (stade = 150 jours de lactation) Quel que soit le caractère : Aucune correlation < 0,80 La plupart > 0,90 Pas (peu) d’interaction GxE identifiées avec ces données THI THI Corrélations génétiques
  • 20. Niveau individuel : valeurs génétiques De manière générale, intra-caractère, les meilleurs taureaux sont toujours les mêmes Quelques reclassements et de la variabilité dans les pentes à un THI donné Certains taureaux semblent plus tolérants au stress de chaleur VG centrées / moy VG des femelles avec perf Trajectoires des valeurs génétiques : MP en 1ère lactation (taureaux avec au moins 500 filles avec perf, à 150j lact) THI taureau 20 Tolérance à la 13 octobre 2022
  • 21. Niveau individuel : valeurs génétiques De manière générale, intra-caractère, les meilleurs taureaux sont toujours les mêmes Quelques reclassements et de la variabilité dans les pentes à un THI donné Certains taureaux semblent plus tolérants au stress de chaleur VG centrées / moy VG des femelles avec perf Trajectoires des valeurs génétiques : MP en 1ère lactation (taureaux avec au moins 500 filles avec perf, à 150j lact) THI taureau 21 Tolérance à la 13 octobre 2022 VG indiquent le classement entre animaux à un THI donné, pas la prédiction de production Toutes les familles voient leur production diminuer lorsque le THI augmente
  • 22. Niveau individuel : valeurs génétiques VG centrées / moy VG des femelles avec perf Trajectoires des valeurs génétiques : MP en 1ère lactation (taureaux avec au moins 500 filles avec perf, à 150j lact) THI taureau MP prédite (g/d) taureau THI MP en 1ère lactation : production prédite production moyenne à chaque THI + VG au THI et 150j lact) 22 Tolérance à la 13 octobre 2022
  • 23. 23 Tolérance à la 13 octobre 2022 Niveau individuel : pentes à THI élevé Corrélations Génétiques entre pente à THI 70 et VG à THI 50 (150j de lactation)
  • 24. 24 Tolérance à la 13 octobre 2022 Niveau individuel : pentes à THI élevé Corrélations Génétiques entre pente à THI 70 et VG à THI 50 (150j de lactation) Pour tous les caractères de production : Corrélations génétiques défavorables = VG élevées à THI modéré  pentes négatives (↘ VG) à THI élevé Pour SCS : Les animaux les plus sensibles à THI moyen sont encore plus sensibles à THI élevé = VG élevées à THI modéré (= + de cellules)  pentes positives (↗ VG) à THI élevé
  • 25. En résumé (1/2) Au niveau populationnel La température optimale pour les Montbéliardes élevées en France est actuellement ≤ 13°C pour les caractères de production et le SCS L’augmentation des températures va conduire à une baisse des performances 1. © C. MAITRE (INRAE)
  • 26. En résumé (2/2) Au niveau individuel G x THI faibles mais trajectoires des valeurs génétiques permettraient d’identifier des animaux plus tolérants au stress de chaleur Interprétation biologique de la pente ? production durant stress de chaleur = protection ? SCS: stress de chaleur a un rôle amplificateur de la sensibilité aux mammites La sélection pour la résistance aux mammites dans les conditions actuelles est pertinente pour les conditions futures, plus chaudes 2. © C. MAITRE (INRAE)
  • 27. Modifiez le style du titre Des résultats similaires : - en Holstein (pop et indiv) - en Normande (pop) © M. GABORIT (INRAE)