O manuseio e a aplicação dos agrotóxicos exigem que o tabalhador no campo utilize os equipamentos de proteção individual - EPI'S - para a sua proteção. Com isto ele evita as possíveis contaminações e intoxicações quando não os utilizam. Os principais EPI'S são descritos aqui. A responsabilidade em treinar, instruir e exigir o uso dos EPI'S é do empregador, conforme determina a N-31 que orienta e fiscaliza o trabalho do empregado rural.