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Proteínas de membrana
Dra. Evelin Rojas
Membranas
¿ Relación exacta Lípidos ↔Proteínas ?
Varía según identidad de membrana
Proporción lípidos- proteínas
Membrana Componente en
mayor proporción
Célula nerviosa Lípidos
Mitocondrial interna Proteínas
Plasmática Eucariota 50% proteínas
50% Lípidos
Funciones proteínas de membrana
• Reacciones químicas
• Flujo de nutrientes y desechos
• Transmisión de información
• Transducción de señales
Interacción de las proteínas con la membrana
Centro hidrofóbico
Superficie polar
Clasificación proteínas de membrana
• Proteínas integrales o intrínsecas
• Proteínas ancladas a lípidos
• Proteínas periféricas
Proteínas integrales de membrana
Fuerte interacción a la bicapa: interacciones hidrofóbicas
Separación: Detergentes (SDS, Triton X-100, Brij)
Agentes caotrópicos (alteran estructura agua: ↓ efecto hidrofóbico)
Agentes desnaturalizantes (unión tenáz lípido-proteína)
Purificación
Proteínas integrales. Requerimientos
1.- ”Anfífilos orientados asimétricamente”
Aminoácidos hidrófobos Aminoácidos polares
Porción no polar
de la membrana
Porciones que se
extienden
al ambiente acuoso
Glicoforina A
Ej: Glicoforina A (Proteína transmembrana del eritrocito)
Dominio N-terminal
72 aa lado externo
16 cadenas de
carbohidratos
Dominio hidrofóbico
19 aa
Dominio C-terminal
40 aa
Polares y cargados
Glicoforina A
Proteínas integrales. Requerimientos
2.- Contienen hélices α u hojas β en su conformación
Ej : Bacteriorrodopsina:
Proteína homotrimérica 247 aa
7 α-hélices perpendiculares al plano bicapa
Halobactrium salinarium
Luz Gradiente de protones Bomba de protones
Impulsa síntesis de ATP
Bacteriorrodopsina
Centro de reacción fotosintética
• Proteínas bacterianas fotosintéticas
• 11 α-hélices atraviesan membrana
Porinas
• Proteínas formadoras de canales o poros
• Bacterias Gram –
• Eucariotas: mme y cloroplastos
Proteínas ancladas a lípidos
Proteínas de membrana que contienen 1 o más
grupos lipídicos unidos cavalentemente.
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Proteínas preniladas
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C= Cys
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Y= Determina el tipo de farnesilación
Y= Ala, Met o Ser: ocurre farnesilación
Y= Leu: geranilgeraniladas
Proteínas farnesiladas y geranilgeraniladas
Grupos prenilos
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elimina proteolíticamente
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Proteínas Ras farnesiladas
Proteínas ancladas a ácidos grasos
Miristoilación
• Anclaje de ácido mirístico ( saturado C14) a proteínas de membrana.
• Citosol, RE, membrana plasmática, núcleo
• Enlace amida entre grupo α-amino de Gly terminal
• Estable: permanece unido a lo largo de la vida de la proteína
Miristoilación
Palmitoilación
• Anclaje de ácido palmítico ( saturado C16) a proteínas de membrana.
• Cara citoplasmática de la membrana plasmática
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• Participan en señalización transmembrana
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Palmitoilación
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Proteínas periféricas
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Ribosomas libres
Ribosomas unidos a RE
Solubles y mitocondriales
De membrana
Destinadas a secreción
Funcionan en RE
Incorporan en lisosomas
Vía secretora
Vía secretora
Proteínas de todas las células
~ 25% proteínas integrales
~ 40 % procesadas por la vía
secretora u otra de señalización
Vía secretora
Papel del RE en el procesamiento y selección de proteínas
Vía secretora
Proteínas de secreción
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Muchas TM
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• Sobresale de la superficie del ribosoma
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• Poro acuoso transmembrana (multifuncional)
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Estructura y función similar
Figura translocon Sec 61 y Sec Y
RE
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TM
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1.- TRANSPORTE ANTERÓGRADO: En dirección Cis-Trans: entre
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2.- MADURACIÓN CISTERNAL (PROGRESIÖN): viajan como “pasajeros”
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final
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Vésículas recubiertas
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Tipos de vesículas
Con base a la cubierta existen 3 tipos:
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Vesículas cubiertas COP I y COP II
COP I :
• Proteína coat (para cubierta) = coatómero
• Forman una capa borrosa alrrededor de la vesícula
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COP II :
• Reciclados de COP I que ingresan al RE
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fotos
Transporte a través de vesículas
• Preserva la orientación de proteínas TM.
• Luz del RE y cisternas Golgi: topológicamente equivcalentes
al lado externo de la célula.
• Porciones carbohidratos de glicoproteínas y uniones GPI
localizadas solamente en superficie externa de la membrana
plasmática
Transporte al lisosoma
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Marcadores de carbohidratos
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Transportan hidrolasas desde el Golgi
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Lisosomas
Proteínas que residen en el RE
Proteínas solubles que residen en el RE ( mamíferos)
Poseen una secuencia C- terminal KDEL (KKXX , KXKXXX)
K= Lys
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SNARE
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Asociados a membranas diana (Q-SNARE)
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R-SNARE Q-SNARE
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Estrés mecánico → expulsión de lípidos de las bicapas
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Proteínas de membrana

  • 2. Membranas ¿ Relación exacta Lípidos ↔Proteínas ? Varía según identidad de membrana
  • 3. Proporción lípidos- proteínas Membrana Componente en mayor proporción Célula nerviosa Lípidos Mitocondrial interna Proteínas Plasmática Eucariota 50% proteínas 50% Lípidos
  • 4. Funciones proteínas de membrana • Reacciones químicas • Flujo de nutrientes y desechos • Transmisión de información • Transducción de señales
  • 5. Interacción de las proteínas con la membrana Centro hidrofóbico Superficie polar
  • 6. Clasificación proteínas de membrana • Proteínas integrales o intrínsecas • Proteínas ancladas a lípidos • Proteínas periféricas
  • 7. Proteínas integrales de membrana Fuerte interacción a la bicapa: interacciones hidrofóbicas Separación: Detergentes (SDS, Triton X-100, Brij) Agentes caotrópicos (alteran estructura agua: ↓ efecto hidrofóbico) Agentes desnaturalizantes (unión tenáz lípido-proteína) Purificación
  • 8. Proteínas integrales. Requerimientos 1.- ”Anfífilos orientados asimétricamente” Aminoácidos hidrófobos Aminoácidos polares Porción no polar de la membrana Porciones que se extienden al ambiente acuoso
  • 9. Glicoforina A Ej: Glicoforina A (Proteína transmembrana del eritrocito) Dominio N-terminal 72 aa lado externo 16 cadenas de carbohidratos Dominio hidrofóbico 19 aa Dominio C-terminal 40 aa Polares y cargados
  • 11. Proteínas integrales. Requerimientos 2.- Contienen hélices α u hojas β en su conformación Ej : Bacteriorrodopsina: Proteína homotrimérica 247 aa 7 α-hélices perpendiculares al plano bicapa Halobactrium salinarium Luz Gradiente de protones Bomba de protones Impulsa síntesis de ATP
  • 13. Centro de reacción fotosintética • Proteínas bacterianas fotosintéticas • 11 α-hélices atraviesan membrana
  • 14. Porinas • Proteínas formadoras de canales o poros • Bacterias Gram – • Eucariotas: mme y cloroplastos
  • 15. Proteínas ancladas a lípidos Proteínas de membrana que contienen 1 o más grupos lipídicos unidos cavalentemente. Tres variedades: Proteínas preniladas Proteínas ancladas a ácido graso Proteínas unidas a glucosilfosfatidilinosito (GPI)
  • 16. Proteínas preniladas Unidas a lípido constituido por unidades de isopreno CH2 = C _ CH = CH2 l CH3 Los más comunes: C15 Farnesilo C20 Geranilgeranilo Sitio común de prenilación: tetrapéptido C-terminal C-X-X-Y C= Cys X= aminoácido alifático Y= Determina el tipo de farnesilación Y= Ala, Met o Ser: ocurre farnesilación Y= Leu: geranilgeraniladas
  • 17. Proteínas farnesiladas y geranilgeraniladas Grupos prenilos ↓ Une ezimáticamente ↓ Grupo azufre de Cys (enlace tioester) ↓ El tripéptido X-X-Y se elimina proteolíticamente ↓ Grupo carboxilo: Esterifica con CH3 Produce extremo C-terminal
  • 19. Proteínas ancladas a ácidos grasos Miristoilación • Anclaje de ácido mirístico ( saturado C14) a proteínas de membrana. • Citosol, RE, membrana plasmática, núcleo • Enlace amida entre grupo α-amino de Gly terminal • Estable: permanece unido a lo largo de la vida de la proteína
  • 21. Palmitoilación • Anclaje de ácido palmítico ( saturado C16) a proteínas de membrana. • Cara citoplasmática de la membrana plasmática • Enlace tioéster con resíduo de Cys específico • Reversible (palmitoil tioesterasas): Regula asociación proteína –membrana • Participan en señalización transmembrana Proteínas ancladas a ácidos grasos
  • 23. Proteínas unidas a GPI • Observadas en todos los eucariotas • Abundantes en protozoos intestinales • Sólo en superficie exterior de membrana plamática
  • 24. Proteínas periféricas Se disocian de la membrana por procedimientos suaves que dejan la membrana intacta: No se unen a lípidos Al extraerlas Comportan como proteínas solubles Unidas a la superficie de la membrana ( ej citocromo c ) Interacciones electrostáticas Enlaces de hidrógeno
  • 25. Síntesis de proteínas • Ribosomas • Molde de ARNm • Crece desde N-terminal • Adición de aminoácidos
  • 26. Síntesis de proteínas Ribosomas libres Ribosomas unidos a RE Solubles y mitocondriales De membrana Destinadas a secreción Funcionan en RE Incorporan en lisosomas Vía secretora
  • 27. Vía secretora Proteínas de todas las células ~ 25% proteínas integrales ~ 40 % procesadas por la vía secretora u otra de señalización
  • 28. Vía secretora Papel del RE en el procesamiento y selección de proteínas
  • 29. Vía secretora Proteínas de secreción RE Lisosómicas Muchas TM Sintetizan con péptido señal (N-terminal; 13-36 a.a) H2N-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x-x Centro hidrofóbico (6-15 a.a) 1 o más residuos hidrofílicos básicos • Forman α-hélices en ambientes no polares • Tienen poca similitud de secuencia • Sobresale de la superficie del ribosoma COO- NH2 Péptido señal Pre-proteína
  • 30. Partícula de reconocimiento de señal SRP (complejo de 6 polipéptidos, unido a GDP) Une al péptido señal Reemplaza GDP → GTP Cambio conformacional en SRP Ribosoma detiene crecimiento del péptido Evita que proteínas destinadas al RER se libere al citosol
  • 32. Translocón • Poro acuoso transmembrana (multifuncional) • Abarcan completamente la membrana del RE • Forman un conducto → paso de proteínas solubles • Proteína heterotrimérica Sec 61 (mamíferos) Sec Y ( procariotas) • Median la inserción del segmento TM de proteína integral Conservadas en todos los reinos Estructura y función similar Figura translocon Sec 61 y Sec Y
  • 33. RE Lisosómicas Pasan completamente de la membrana RER→ luz Proteínas TM Contienen 1 o más secuencias de anclaje (hidrófobas) ↓ Permanecen incrustadas Vía secretora
  • 34. Tránsito de vesículas Después de síntesis P. Secreción P. Lisosómicas P. TM Aparecen en aparato de Golgi Procesamiento post-traduccional
  • 35. Tránsito de vesículas Aparato de Golgi Red Cis Enfrente del RER Área por donde ingresan Proteínas al Golgi Red trans Área por donde salen las proteínas procesadas ↓ Destino final
  • 36. Tres tipos de cisternas o sacos membranosos Tránsito de vesículas Cisternas Cis Cisternas media Cisternas Trans
  • 37. Tránsito de vesículas Procesamiento o modificación de proteínas ↓ Transitan de un extremo a otro del Golgi ¿Cómo transitan estas proteínas? 1.- TRANSPORTE ANTERÓGRADO: En dirección Cis-Trans: entre compartimentos sucesivos→ vesículas brotan de un compartimento y se fusionan con el siguiente. 2.- MADURACIÓN CISTERNAL (PROGRESIÖN): viajan como “pasajeros” Cisternas cis se vuelven cisternas trans
  • 38. Procesamiento post-traduccional de proteínas Al llegar a la red Trans → Proteínas maduras→ Clasificadas→ Destino celular final
  • 39. Transporte de proteínas al destino final Vésículas recubiertas Vesícula→ brota→ desde membrana de → Fusiona con membrana origen de destino (diana)
  • 40. Tipos de vesículas Con base a la cubierta existen 3 tipos: 1. Clatrina 2. COP I 3. COP II Contienen receptores: Unen proteínas que se están transportando Unen proteínas que median la fusión vesícula- membrana
  • 41. Vesículas de Clatrina •Están recubiertas de Clatrina •Clatrina: proteína que forma estructura polihédrica (celdas o jaulas) •Transportan proteínas TM, unidas a GPI, secreción desde el Golgi→ memb plasm •Forman trisquelones (estructuras flexibles de 3 patas) Permiten formación de vesículas de ≠ tamaño Brotación de vesículas desde una membrana •Participan en Endocitosis→ Internalizar proteínas medio externo→medio interno Foto vesícula de clatrina
  • 42. Vesículas cubiertas COP I y COP II COP I : • Proteína coat (para cubierta) = coatómero • Forman una capa borrosa alrrededor de la vesícula • En compartimentos sucesivos del Golgi • Devuelven proteínas del RE que escapan a la retención del Golgi COP II : • Reciclados de COP I que ingresan al RE •Transportan proteínas desde el RE al Golgi fotos
  • 43. Transporte a través de vesículas • Preserva la orientación de proteínas TM. • Luz del RE y cisternas Golgi: topológicamente equivcalentes al lado externo de la célula. • Porciones carbohidratos de glicoproteínas y uniones GPI localizadas solamente en superficie externa de la membrana plasmática
  • 44. Transporte al lisosoma ¿ Cómo se dirigen las proteínas al lisosoma ? Marcadores de carbohidratos (residuos de manosa 6-P) ↓ Reconocidos por receptores ↓ Reconocen vesículas recubiertas que Transportan hidrolasas desde el Golgi ↓ Lisosomas
  • 45. Proteínas que residen en el RE Proteínas solubles que residen en el RE ( mamíferos) Poseen una secuencia C- terminal KDEL (KKXX , KXKXXX) K= Lys D= Asp E= Glu L= Leucina X= Cualquier a.a Receptor unido a membrana (une la secuencia) Complejo Proteína- receptor (compartimento post-RE) Devuelta al RE en vesículas COP I
  • 46. Fusión de vesículas Transito de vesícula ↓ Fusión de vesícula que brota con otra Membrana ↓ Libera su contenido lado opuesto membrana diana (EXOCITOSIS) ↓ Expansión de membrana diana existente ↓ Genera membranas nuevas
  • 47. Fusión de vesículas ¿Cómo y porqué las vesículas se fusionan con membranas diana? Proteínas que participan en proceso de fusión NSF = Proteína de fusión sensible a NEM ( N-etilmaleimida) ATPasa citosólica Actúa como chaperona molecular impulsada por ATP Funciona en presencia de Factor Soluble de unión a NSF (SNAP). SNAP= Se unen a las membranas a través de receptores SNARE= Receptor que une SANAP Proteína integral de membrana
  • 48. Fusión de vesículas SNARE Asociados a membranas de vesículas (R-SNARE) Asociados a membranas diana (Q-SNARE) Numerosos Diferentes Alta especificidad
  • 49. Fusión de vesículas R-SNARE Q-SNARE Asociación → Complejo altamente estable ↓ Ancla con firmeza vesícula a célula diana “ATRAQUE” ↓ Estrés mecánico → expulsión de lípidos de las bicapas ↓ Estructura transitoria ↓ Fusión→ Liberación SNARE ↓ Nueva ronda de fusión
  • 50. Fusión de vesículas Toxinas Botulínicas, tétano (proteasas) Incorporan a la s membranas Endocitosis Escinden SNARE diana en sitios específicos Detiene exocitosis de compuestos (ej neurotransmisores, )