Ingemar Pongratz började sina Universitetsstudier vid Stockholms Universitet. Där studerade han toxikologi, biokemi och organisk kemi. Han påbörjade sin Ph D uppsats på KI och försvarade framgångsrikt sin Ph D uppsats i december 1996 och började en ny tjänst som forskare vid Institutionen för cell-och molekylärbiologi. Där har han skrivit flera vetenskapliga artiklar som publicerats i vetenskapliga tidskrifter och övervakas också andra doktorander.