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Reaxys user guide(korean)
- 2. 새로운 Reaxys의 업데이트
16,000 여 개의
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Query form
학술지 추가
업데이트
(Journal 등)
AutoPlan
(합성 설계 자동화)
Analysis View
Report
(결과 분석)
(정보 공유)
- 3. Copyright© 2013 by BITEK CHEMS Inc.
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Reaxys Workflow
• MarvinSketch
• Create Structure Template
from Names
• Similarity
• Combine Search
Search
•
•
•
•
•
•
•
•
•
Search
Results
Multi-Step Reactions
Reaction Dossiers
Experimental Procedure
SD/Scopus link
PubChem
Analysis View
Filtering/Ranking
Find Similar Reactions
List Manipulation
Refine
Results
•
•
•
•
• Report
• Export
• Alert
Synthesis
Plan
AutoPlan
Synthesis Planner
Commercial Availability
Hazmat Navigator
Export
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Content 확대
새로운 Reaxys
기존 Reaxys
16,000 여 개의
학술지 추가
•
Journal, Conference paper,
Review 등 추가
•
Chemistry, Life sciences ,
Engineering, Pharmacology,
Environmental sciences 등
분야
※ 예를 들어 Hexavalent chromium의
literature 검색 시,
기존 Reaxys:
270 건의 citation
새로운 Reaxys:
2504건의 citation
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Search
1. Search
• Substance/Reactions:
구조 및 반응식을 이용한
반응/물질 정보 검색
• Names & Formulas:
Chemical name, CAS-RN 등
chemical identifier를 이용한
반응/물질 정보 검색
• Literature:
저자, 특허 번호 등을 이용한
서지 정보 검색
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Search
2. Search Type
-Reactions : 반응 (합성) 검색
-Substances : 물질 및 물성 검색
-Literature: 저널 또는 특허 검색
3.Drawing
빈 화면 double click 시 생성되는 drawing editor창에
검색하고자 하는 Reaction 또는 structure drawing
※ 기본 설정 editor는 Marvin sketch이며 다른 editor로 변경 가능
- 8. Search
4. Create Structure Template
from Names
물질명으로 검색하고자 할 때 click하여 아래와 같
은 물질명을 입력.
입력 후 해당되는 구조가 자동 전환되어 Query 창
에 나타나며,
입력된 구조로 검색
IUPAC, Generic Name, Common Name, Code
InChi Key
CAS-RN
SMILES
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5. Search Type
Search as (reaction에서의 역할)
Product /Starting material /
Any role /Reagent or Catalyst
Search by (구조 인식 방법)
As drawn /Substructure/Similarity
- 9. Search
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6.Combine Search
Input한 Reaction/compound 정보 중 찾고자 하는 Reaction
condition/ 물질의 property의 type 또는 value/range를 입력
하여 상세 정보 검색
- 10. Search
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6.Combine Search
Input한 Reaction/compound 정보 중 찾고자 하는
Reaction condition/ 물질의 property의 type 또는
value/range를 입력하여 상세 정보 검색
- 11. Search Results -Reactions
Copyright© 2013 by BITEK CHEMS Inc.
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1.Reaction 정보
•
•
•
Yield
Reaction conditions
Reference
2. Reaction dossiers
같은 reaction의 reference가 journal과
patent 둘 다 있을 경우 해당 reference
정보를 한 페이지에 통합
- 12. Search Results -Reactions
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4.Full Text
해당 journal 의 원문 확인 시
클릭하면 journal site로 link
(원문 확인은 journal 에 대한
별도 계정 필요)
3.Experimental Procedure
Patent에서 발췌한
experimental procedure 확인
5.View citing articles
• 해당 journal 의 서지 인용 정보
• Scopus 로의 link
- 14. Copyright© 2013 by BITEK CHEMS Inc.
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Search Results -Substances
1.Substances 정보
•
•
•
Structure
Structure Data
Available Data
-Identification
-Physical Data
-Spectra
-Bioactivity&Ecotox
- Use&Application
- 15. Search Results -Substances
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2. PubChem
Substance 검색 시 해당Query에 대한
PubChem 검색 결과를 Reaxys에 통합
3. PubChem link
Reaxys에서 PubChem 검색 결과
뿐만 아니라 PubChem site로의 link
기능 지원으로 자세한 data 확인을
가능하게 함 (data type 별 click)
- 16. Refine Results
Copyright© 2013 by BITEK CHEMS Inc.
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1.Analysis View
Analysis View 기능은 검색 결과를 histogram으로 display하여
각 기준 간의 상관관계 분석을 용이하게 함
• 그림과 같이, Histogram A에서 선택한 solvent 종류(붉은 색)에 따라
Histogram B에서 해당되는 Reagent/Catalyst가 노란색으로 표시되고
해당 되는 결과만 Limit to/Exclude 로 filtering 하여 확인 가능
- 17. Refine Results
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3.Rank
검색 결과를 특정 기준으로 정렬
• Reaction condition
-Yield/MW of product
• 서지 정보
-Number of References/
Publication Year 등
2. Filter
검색 결과를 특정 조건으로 refine
• Reaction condition
-Substructure(구조)/Yield/Solvent 등
• 서지 정보
- Doc. Type/Publication Year 등
※Substance 검색 시에도 property 및
서지 정보에 의한 filter 기능 지원
※Substance 검색 시에도 property
및 서지 정보에 의한 Rank 기능 지원
- 19. Refine Results
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5.List Manipulation
History에서 확인한 검색 이력 중
여러 항목이 동일하고, 특정 항목이 상이한
이력끼리 비교, 분석할 수 있음
•
2개의 결과를 선택한 후 “Combine
hitsets” 을 Click. 아래와 같은 연산자를
선택하여 비교 분석이 가능함
• Combine option:
Merge/Overlap/Exclude
- 20. Synthesis Planner
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1.Synthesize
검색 결과 중 합성 route를
설계하고자 하는 물질 하단의 “synthesize”를 click
“Manually’ 선택
• Manually: 합성 pathway을 하나씩 선택하여 설계
• By AutoPlan: “My settings”에서 설정된 Plan 수, branch
수, step 수 등에 따라 자동 설계
• By AutoPlan(with options): 해당 화면에서 설정한 Plan
수, branch 수,step 수 등에 따라 자동 설계
- 21. Synthesis Planner
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2.합성 route 설계
Step 수, yield, reactant 구입 가능 여부,
solvent 등의 조건을 고려하여 pathway 선택
• “Add Selected” click
- 22. Synthesis Planner
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3.Commercial Availability
물질 구입 정보 site 로의 link 기능 지원
• CambridgeSoft ACX/ eMolecules/ Accelry’s ACD
4.Hazmat Navigator
물질의 safety data 제공
• 별도 계정 필요
- 24. Autoplan
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1. Autoplan
검색 결과 중 합성 route를 자동 설계하고자 하는
물질 하단의 “synthesize”를 click
“by Autoplan (with options)선택
• Manually: 합성 pathway을 하나씩 선택하여 설계
• By Autoplan: “My settings”에서 설정된 Plan 수, branch
수, step 수 등에 따라 자동 설계
• By Autoplan(with options): 해당 화면에서 설정한 Plan
수, branch 수,step 수 등에 따라 자동 설계
- 25. Copyright© 2013 by BITEK CHEMS Inc.
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Autoplan
2. Autoplan options
• No of plans to create:자동 설계 할 plan 수 지정(최대 10개)
• Max. alternative branches: 각 step 당 설계 가능한 branch 최대 수(최대 10개)
• Max. steps: 하나의 plan 당 설계 가능한 최대 step 수(최대 10개)
• All starting materials commercially available : 반응물 구입 가능 여부
• Default yield for reactions without a given yield:
Yield가 밝혀지지 않은 reaction의 경우 기본 Yield 값 부여 (최대 90%)
- 26. Autoplan
3. 자동 설계된 Synthesis plan(최대 10개)
• 설정한 option에 따라 Yield가 높은 순으로
합성 route 자동 설계
• User가 원하는 pathway로 수정, 추가 ,삭제 할 수 있음
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- 28. Copyright© 2013 by BITEK CHEMS Inc.
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Export
2. Output option 선택
File 포맷 및 추출한 data 종류를 지정한 후 “OK” 클릭
- 29. Export
3. 추출된 file
합성 route 및 각 step 별 yield/
condition/reference 정보 포함
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- 30. Report
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1.Report
연구에 필요한 특정 data 을 선택하여 동료들 과의 data 공유 및 의견 교환을 용이하게 함
• 특정 정보(전체 query, citation data, property, reaction 등)의 왼쪽 하단에
종이가 접힌 그림
이 나타났을 때 “Report”에 copy
•“Report”에 수집한 data에 의견을 포함하여 Reaxys 내에서
동료들에게 Email로 보내는 기능 지원
- 31. Alert
1.Alert 설정
검색 사항(Query)에 대해 업데이트되는
data 알림 서비스 설정 시 검색 결과 화면
또는 History 의 “Create Alert” click
(Email로 알림)
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- 32. Alert
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2. Alert option 설정
Alert 이름 및 업데이트 알림 주기
그리고 E-mail format 등을
설정 한 후 “Save” click
- 33. 본 자료의 모든 내용에 관한 저작권은 ㈜ 바이텍켐스에 있으며,
이를 무단 복제 및 도용하는 것은 관련법에 의해 처벌을 받을 수 있습니다.
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<Reaxys 기술 문의>
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Tel. (031) 463 - 1050~6 Direct (1054)
Fax. (031) 463-1053
Email : hrshin@chems.co.kr