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データベース構築・維持・管理
      の現場から
私たちの論文以外の活動はどう評価されている?
∼既存の評価軸に乗りづらい研究者の活動をどう評価するか∼

 大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構(ROIS)
  ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)

           坊農 秀雅
            © ライフサイエンス統合データベースセンター/大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構
坊農秀雅(ぼうのうひでまさ)
     ライフサイエンス統合データベースセンター特任准教授
     埼玉医科大学ゲノム医学研究センター助教授(03/4-07/6)
     その前の3年間、理化学研究所ゲノム科学総合研究センター
     基礎科学特別研究員(00/4-03/3)
          マウスの遺伝子機能アノテーション(FANTOM)
     京都大学化学研究所@宇治で大学隠棲院生時代(-00/3)
          代謝経路のデータベース(KEGG)を使ったゲノム解析
                                                   D.melanogaster   H.sapiens
H.influenzae Synechocystis S.cerevisiae   C.elegans   A.thaliana       draft M.musculus H.sapiens   P.troglodytes




95                     大学院                            00               理研 03 埼玉 07                                     10
                                                                                                                   DBCLS
                                                                                                   医大
データベースセンターの役割
         • 浄水処理場
         • (例えば)出された配列データを
               ‒データベースとして貯える(Bank)
               ‒使いやすく加工して流通させる(Circulate)

SRR001356.1 2023DAAXX:5:1:123:563 length=33
TGTCGGTCCAGCTCGGCCTTGGGCTCCGTTTTC
+SRR001356.1 2023DAAXX:5:1:123:563 length=33
-IIIIIIII8IIIIIIIIIII6IIIIIIIII9I




                                               DB
@SRR001356.2 2023DAAXX:5:1:123:476 length=33
TCTGAACCCGACTCCCTTTCGATCGGCCGCGGG
+SRR001356.2 2023DAAXX:5:1:123:476 length=33
IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIGIIIIIII-III
@SRR001356.3 2023DAAXX:5:1:121:746 length=33
GTGGCAGCGTTTTTGGGCCCGCCGCTTGCCGTT
+SRR001356.3 2023DAAXX:5:1:121:746 length=33
IIIII&IIIIIIIIIIIIIIIIHI1IIIIIIII




                                                    3
文部科学省
 統合データベースプロジェクト
•2006-2010年度の時限プロジェクト
–http://lifesciencedb.mext.go.jp/
•DBCLSはその中核機関としてのちに設立
‒公開サービスは「統合ホームページ」から
  •   http://lifesciencedb.jp/
ブース番号:
             本年度で終了                 4
3-39, 3-40
DBCLS: Database Center for Life Science
• ライフサイエンス統合データベースセンター
 ‒ 特務機関:ライフサイエンス分野のデータベース統合化の拠点
 ‒ @東京大学本郷キャンパス内(理1号館別館 工12号館)
   •が、東大の機関ではありません
 ‒ 2011年度以降も継続して存続




            http://dbcls.rois.ac.jp/


                                      5
DBCLS構成員(2010/12現在)
• 長・教授: 2人        •常勤合計: 38人
• 直接雇用(特任)        • RA(アルバイト): 20人
 ‒研究員(PhD): 15人
                   → 総計: 58人
 ‒技術専門員: 5人
 ‒技術補佐員: 1人
• 外来研究員: 10人
• SE: 2人
• 事務: 3人
                                     6
研究員でもなく事務員でもなく
• 役職は「特任研究員」ですが…
• 論文になることをするのが仕事でない
‒データベースやツールを使いやすくするのが仕事
• 論文を書くこともありますが
‒開発したデータベースやツールを「広く報じる」
 のが目的であって、手段でない
• 大学共同利用機関として公正に
‒特定のグループに肩入れすべきでない 論文に名
 を連ねることは原則なし              7
論文以外の活動:ぼうのうの場合
• 外部発表      • システム維持
 ‒学会発表       ‒ウェブサイト維持
 ‒講演         ‒後進の指導
 ‒統合DB講習会     •「研究員」の後輩
              •RA(アルバイト)
• コンテンツ作成
 ‒統合TV作成
 ‒翻訳、監訳
 ‒ブログ
                       8
結論
評価のための研究で
なく、科学の発展に
どれだけ貢献したか
        9

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