El avance y la sofisticación del cómputo actual ha modificado profundamente la práctica taxonómica, en este caso proponemos el uso de una colección digital para el estudio de las publicaciones sobre nuevas especies en México: su descubrimiento y descripción. Esta aplicación electrónica ofrece una plataforma idónea para archivar, preservar, clasificar y compartir en acceso abierto, documentos y sus metadatos asociados disponibles para todos los usuarios interesados, en biología o historia de la biología en México. En el presente trabajo se presenta una colección de los registros bibliográficos sobre nuevas especies en México (http://repositorio.fciencias.unam.mx:8080/xmlui/handle/11154/139839) albergada en el Sistema de Información Ciencias, de la Facultad de Ciencias UNAM (http://repositorio.fciencias.unam.mx:8080/xmlui), la colección abarca descripciones a partir de la publicación del sistema de clasificación binomial linneano de 1758 hasta el año 2012, este recurso es un poderoso aliado para el registro de documentos, además que permite el manejo de gran cantidad de metadatos bibliográficos y taxonómicos relacionados con los documentos. Al sistematizar esta información en una base de datos, se tendrá siempre una referencia, en cuanto a la nomenclatura y la clasificación de los organismos; y también sobre la distribución, la taxonomía y la cronología de las especies descritas. Estos metadatos están en el esquema utilizado mundialmente para estandarizar objetos digitales (Dublin Core), y en muchos de los casos se asocian al documento en texto completo con acceso abierto al que se refieren. Además, este tipo de sistema hace que sea posible extraer toda la información en acceso abierto porque es interoperable y contiene herramientas para manejo de la literatura de la Web 2.0 lo que facilita la investigación historiográfica y permite el uso de métodos cuantitativos para realizar análisis cienciométricos que facilitan la visualización de la información. Si se toma en cuenta que el número de especies descritas para México es cercano a las 108, 000 especies y el estimado total tiende a las 220, 000 especies, sistematizar la información referente a la descripción de nuevas especies con una temporalidad amplia, nos da la oportunidad de obtener una visión histórica del comportamiento de la biología con respecto a este tema, además que nos permite ofrecer tendencias y nuevas perspectivas en el estudio de la historia de la ciencia mexicana.

1. 2º Encuentro de Estudiantes de Historia de la Ciencia
FES Acatlán
15 al 18 de octubre de 2013
La Colección Nuevas
Especies Mexicanas
para la historia de
la biología en
México
Presentan:
Diana Ramírez Alvarez
Layla Michán
Laboratorio de Cienciometría, Información e Informática Biológica (CIIB)
Facultad de Ciencias, UNAM
1

2. Contenido
Introducción
Diversidad mexicana
Herramientas informáticas
Plataforma Dspace
El Sistema de Información Ciencias de la Facultad de Ciencias, UNAM
Material y Método
Elección de la plataforma Dspace
Descriptores de la información. Dublin Core
Colecciones utilizadas
Resultados
Conclusiones
2

3. Introducción
• México: mega diverso
• Taxonomía
• Descripción de nuevas
especies
• Publicaciones
taxonómicas
• Descritas
especies
108,
000
• Estiman
especies
220,
000
3

4. • Avance del cómputo
• Modificación de la práctica taxonómica tradicional
• Objetos digitales
• Repositorios/Sistemas de Información
resguardar
manejar
distribuir
preservar
4

5. Repositorio Institucional:
Deposito de objetos electrónicos alojado en un servidor, que sistematiza, da acceso libre
a los trabajos de una institución y preserva estos recursos digitales a largo plazo.
¿Por qué usar DSpace?
http://www.dspace.org/whos-using-dspace
1, 536 Repositorios a nivel mundial
usan DSpace
•
•
•
•
Interfaz abierta
Robusta
Interoperable
Amigable
5

6. •
•
•
•
Archivar
Preservar
Clasificar
Compartir en acceso abierto
• Documentos
• Metadatos: 15
descriptores básicos
6

7. • Publicaciones dispersas en tiempo y
espacio
• Es difícil la recuperación
• Pocos están disponibles para consulta
• Localizar , reunir, sistematizar y difundir
• Enriquecer el acervo taxonómico
• Herramienta para el estudio de la
historia de la ciencia mexicana
Primera etapa de diseño y prueba de la colección de registros bibliográficos
sobre nuevas especies en México
Establecer estructura y características de datos y metadatos
Posibilidad del sistema para el estudio de la descripción de nuevas
especies en México a través del tiempo
http://repositorio.fciencias.unam.mx:8080/xmlui/handle/11154/139839
7

8. Método
Accesible
Consistente
Interoperable
Eficiente
Fácil
Elección de la plataforma electrónica.
Dspace: ofrece estándares y formatos
Acceso abierto
Interoperable
Web 2.0
Intercambio de
información
Literatura
académica
Revista
Entidad
académica
Multi-idioma
Esquema de metadatos.
Dublin Core: 15 descriptores básicos
Elección de colecciones
1.
2.
3.
Revista de la Sociedad Mexicana de Historia Natural
Nuevas especies descritas por investigadores del
Instituto de Biología, UNAM
Sinopsis de la Herpetofauna de México de H. Smith
8

9. Resultados
• 1, 372 registros sistematizados
• Temporalidad 1758 – 2011
• 26 metadatos que describen a cada uno de los registros
• 17 son metadatos bibliográficos
• 9 son metadatos taxonómicos
• 15 formas diferentes de referirse a una nueva especie en una descripción
dentro de la literatura
9

10. n=1, 372
Numero de publicaciones por año en la colección Nuevas Especies Mexicanas
10

11. Campo
Etiqueta del metadato
Título
dc.title
Título del documento
Ejemplo: A morphologically distinct new species of Pseudoeurycea
(Caudata : Plethodontidae) from the Sierra Madre Oriental of Puebla,
Mexico.
dc.contributor.author
Nombre del investigador o
investigadores que realizaron el
estudio.
Ejemplo: Parra-Olea, G.
dc.date.issued
Año en que se publicó el documento
Ejemplo: 2004
dc.relation.journal
Título de la revista en la que se publicó
Ejemplo: Herpetológica
el artículo
dc.souce.novolpages
Volumen y número del ejemplar de la
revista donde está publicado el
Ejemplo: 60, 478–484
artículo. Numero de paginas
ISSN
dc.identifier.issn
Estándar internacional para revistas
Ejemplo: 1938-5099
DOI
dc.identifier.doi
Identificador de Objetos Digitales
Ejemplo: 10.1655/03-76
Pequeña reseña que abarca todo el
contenido del estudio.
Ejemplo: A new species of Pseudoeurycea is described from cloud
forests of the Sierra Madre Oriental of Puebla, México. The new
species is distinguished from all other Pseudoeurycea by its small size,
stout body, short tail, large nostrils, presence of characteristic
glandular convergent ridges on the pelvic region and the tail, and by its
distinctive limb structure, with very small hands and feet that are
extensively webbed and bear prominent but short and pointy middle
digits. The only apparent close relative of this species is P. praecellens,
from which it differs by the position and distribution of the dorsal and
caudal glands, body proportions, nostril size and coloration. All
specimens of the new species were found in cloud forest, under a
canopy of Liquidambar, Quercus, and arborescent ferns, as well as in a
coffee grove. The elevational range for the species is narrow, between
905 and 1400 m, unusually low elevations for Pseudoeurycea.
Autor (es)
Año
Revista
Volumen,
número,
páginas
Resumen
dc.description.abstract
Definición
Categorías y ejemplos
11
Ejemplo de metadatos bibliográficos de los registros de la colección Nuevas Especies Mexicanas

12. Campo
Disciplina
Etiqueta del metadato
dc.coverage.thematic
Definición
Disciplina a la que se refiere el
taxón estudiado
Categorías y ejemplos
Categorías: Zoología, Botánica, Micología Ejemplo: Zoología
Cantidad de
especies dc.description.sp
descritas
Número de especies descritas o
Ejemplo: 1
analizadas en el artículo
Categoría
dc.description.taxon
taxonómica
Taxón de estudio
Ejemplo:
Animalia|Chordata|Amphibia|Caudata|Plethodontidae|Pseudoeuryc
ea|Pseudoeurycea quetzalanensis
Localidad
dc.description.taxonloc
Localidad donde fue ubicado el
Ejemplo: Xocoyolo, 1400 msnm, Municipio de Cuetzalan del Progreso
holotipo
Latitud
dc.description.taxonlat
Coordenadas geográficas.
Latitud
Ejemplo: 19.9667
Longitud
dc.description.taxonlon
Coordenadas geográficas.
Longitud
Ejemplo: -97.5333
Estado de la República
Mexicana en que se realizó el
estudio
Categorías: Aguascalientes, Baja California, Baja California Sur,
Campeche, Chiapas, Chihuahua, Coahuila, Colima, Distrito Federal,
Durango, Estado de México, Guanajuato, Guerrero, Hidalgo, Jalisco,
Michoacán, Morelos, Nayarit, Nuevo León, Oaxaca, Puebla,
Querétaro, Quintana Roo, San Luis Potosí, Sinaloa, Sonora, Tabasco,
Tamaulipas, Tlaxcala, Veracruz, Yucatán, Zacatecas. Ejemplo: Puebla
Estado de la
República dc.description.taxonstate
Mexicana
País del
estudio
dc.coverage.spatial
País en el que se realizó el
estudio
Ejemplo: México
Colección
dc.description.index
Base de Datos en la que se
encuentra el artículo
Ejemplo: UNIBIO Instituto de Biología, UNAM
12
Ejemplo de metadatos taxonómicos de los registros de la colección Nuevas Especies Mexicanas

13. Nube con las variables usadas para la descripción de nuevas especies mexicanas
dentro de las publicaciones de la colección
13

14. Registro sobre nueva
especie dentro de la
plataforma del Sistema
de Información
Ciencias, UNAM
14

15. Conclusiones
• Las colecciones bibliográficas representan una de las
herramientas más completas, sofisticadas y útiles para el
manejo de información y textos en la actualidad, la
información sobre biodiversidad.
• La información sobre la descripción de nuevas especies es
estratégica y representa un material indispensable para
reconstruir la historia de la biología de nuestro país.
• La inclusión de estas tecnologías ofrece grandes
posibilidades a los historiadores de la ciencia, este es uno
de los propósitos de la colección de Nuevas Especies
Mexicanas del Sistema de Información Ciencias, de la
Facultad de Ciencias UNAM.
15

16. Diana Ramírez Alvarez
dianara@ciencias.unam.mx
Dra. Layla Michán
laylamichan@ciencias.unam.mx
This work is licensed under a Creative Commons AttributionNonCommercial-ShareAlike 3.0 Unported License.
16