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セキュリティ・ネクストキャンプ2022 オンライン [N9] バイナリ生物学入門

セキュリティ・ネクストキャンプ2022 オンライン https://www.ipa.go.jp/jinzai/camp/2022/next2022_index.html の 「[N9] バイナリ生物学入門」講義 https://www.ipa.go.jp/jinzai/camp/2022/next2022_program_list.html#list_next5 の講義スライドです。

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[N9]
バイナリ生物学入門
2022年8月10日(水)18:30~20:30
講師:大神 祐真
今日やること
● 前回のおさらい
● 演習のつづき
● おわりに
今日やること
● 前回のおさらい
● 演習のつづき
● おわりに
前回の補足
● daisy-toolsの基本機能について
○ syslogにログを出力しています
■ daisy-tools上の細胞変化に関する全てをsyslogへ出力しています
● 主に後の分析用
● これをパースすることで、始まりの細胞からの系統図を描いたりできます
○ 例:daisy-toolsデモ(音声なしYouTube動画)
■ ただし、systemdのjournaldで運用している場合、journaldのRatelimitに引っかかり、
いくらかのログが飛ばされる場合があります
● 例:
● 完全にログを残したい場合は /etc/systemd/journald.conf の RateLimit 設定を変更してみてください
○ 詳しくは"journald ratelimit"などで検索してみてください
Aug 10 08:38:29 xxx dsy-sysenv[15710]: sysenv[f83a409361]: do bin/dsy-eval f83a409361
Aug 10 08:38:29 xxx rsyslogd[821]: imjournal: begin to drop messages due to rate-limiting
Aug 10 08:38:29 xxx dsy-cell2elf[30966]: cell[f83a409361]: load from file.
前回の補足
● daisy-tools実行中の細胞ファイル/コード化合物ファイルの追加について
○ 一旦daisy-toolsを止めて作業を行えば問題ありませんが、以下の方法で daisy-toolsを止めずに追
加することもできます
■ 細胞ファイルについて
■ コード化合物ファイルについて
前回のおさらい
昨日の講義でやったことを振り返ってみます

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